MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Agrobacterium fabrum str. C58 chromosome linear

Total Repeats: 1510

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_003063	GTCGA	2	10	1341788	1341797	20 %	20 %	40 %	20 %	15890763
1002	NC_003063	TGCCG	2	10	1342165	1342174	0 %	20 %	40 %	40 %	15890763
1003	NC_003063	CCCGT	2	10	1344935	1344944	0 %	20 %	20 %	60 %	15890762
1004	NC_003063	AAGGC	2	10	1344974	1344983	40 %	0 %	40 %	20 %	15890762
1005	NC_003063	GTCGA	2	10	1345796	1345805	20 %	20 %	40 %	20 %	15890760
1006	NC_003063	TCGGC	2	10	1348413	1348422	0 %	20 %	40 %	40 %	15890760
1007	NC_003063	TGGGC	2	10	1348922	1348931	0 %	20 %	60 %	20 %	15890758
1008	NC_003063	GCCCC	2	10	1349327	1349336	0 %	0 %	20 %	80 %	15890758
1009	NC_003063	GGAAT	2	10	1351981	1351990	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_003063	TTCGG	2	10	1352832	1352841	0 %	40 %	40 %	20 %	15890755
1011	NC_003063	TGAAT	2	10	1353015	1353024	40 %	40 %	20 %	0 %	15890754
1012	NC_003063	CGCGC	2	10	1355975	1355984	0 %	0 %	40 %	60 %	15890752
1013	NC_003063	TGCGC	2	10	1356254	1356263	0 %	20 %	40 %	40 %	15890752
1014	NC_003063	GGATG	2	10	1357367	1357376	20 %	20 %	60 %	0 %	159186072
1015	NC_003063	GTCCG	2	10	1359510	1359519	0 %	20 %	40 %	40 %	159186075
1016	NC_003063	GCATG	2	10	1361704	1361713	20 %	20 %	40 %	20 %	15890746
1017	NC_003063	ATGAG	2	10	1365303	1365312	40 %	20 %	40 %	0 %	15890742
1018	NC_003063	CCGCA	2	10	1371834	1371843	20 %	0 %	20 %	60 %	15890735
1019	NC_003063	TGCCG	2	10	1376399	1376408	0 %	20 %	40 %	40 %	15890730
1020	NC_003063	TGTCG	2	10	1377142	1377151	0 %	40 %	40 %	20 %	15890730
1021	NC_003063	GCCAG	2	10	1377156	1377165	20 %	0 %	40 %	40 %	15890730
1022	NC_003063	CCGCG	2	10	1377821	1377830	0 %	0 %	40 %	60 %	159186082
1023	NC_003063	GGCCA	2	10	1377918	1377927	20 %	0 %	40 %	40 %	159186082
1024	NC_003063	AGCGT	2	10	1379247	1379256	20 %	20 %	40 %	20 %	15890728
1025	NC_003063	GCTTT	2	10	1380272	1380281	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1026	NC_003063	CACCG	2	10	1383032	1383041	20 %	0 %	20 %	60 %	159186085
1027	NC_003063	CTTCG	2	10	1385586	1385595	0 %	40 %	20 %	40 %	159186086
1028	NC_003063	TTCAC	2	10	1386964	1386973	20 %	40 %	0 %	40 %	159186087
1029	NC_003063	CCTTG	2	10	1387986	1387995	0 %	40 %	20 %	40 %	15890721
1030	NC_003063	GGTCA	2	10	1392141	1392150	20 %	20 %	40 %	20 %	15890716
1031	NC_003063	GATGA	2	10	1392403	1392412	40 %	20 %	40 %	0 %	15890716
1032	NC_003063	CCGGC	2	10	1392661	1392670	0 %	0 %	40 %	60 %	15890716
1033	NC_003063	CCGGC	2	10	1396242	1396251	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1034	NC_003063	GCCGG	2	10	1398091	1398100	0 %	0 %	60 %	40 %	15890709
1035	NC_003063	GCCGC	2	10	1398289	1398298	0 %	0 %	40 %	60 %	15890709
1036	NC_003063	CGCGG	2	10	1398620	1398629	0 %	0 %	60 %	40 %	15890708
1037	NC_003063	ATCGT	2	10	1401999	1402008	20 %	40 %	20 %	20 %	159186093
1038	NC_003063	GATGT	2	10	1403982	1403991	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_003063	ATTTC	2	10	1410081	1410090	20 %	60 %	0 %	20 %	159186097
1040	NC_003063	CGCGC	2	10	1410969	1410978	0 %	0 %	40 %	60 %	15890694
1041	NC_003063	AGGAA	2	10	1411000	1411009	60 %	0 %	40 %	0 %	15890694
1042	NC_003063	CTGGA	2	10	1412375	1412384	20 %	20 %	40 %	20 %	159186098
1043	NC_003063	CATGC	2	10	1414227	1414236	20 %	20 %	20 %	40 %	159186099
1044	NC_003063	AATTC	2	10	1414778	1414787	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1045	NC_003063	CGGCA	2	10	1416495	1416504	20 %	0 %	40 %	40 %	159186101
1046	NC_003063	GACTG	2	10	1416892	1416901	20 %	20 %	40 %	20 %	159186101
1047	NC_003063	GGAGG	2	10	1418045	1418054	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_003063	GCCCA	2	10	1418811	1418820	20 %	0 %	20 %	60 %	159186102
1049	NC_003063	CCGGC	2	10	1420138	1420147	0 %	0 %	40 %	60 %	15890686
1050	NC_003063	CCGCG	2	10	1421231	1421240	0 %	0 %	40 %	60 %	159186103
1051	NC_003063	ATCAC	2	10	1423359	1423368	40 %	20 %	0 %	40 %	15890684
1052	NC_003063	TCAAA	2	10	1425602	1425611	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1053	NC_003063	GATTG	2	10	1428404	1428413	20 %	40 %	40 %	0 %	15890678
1054	NC_003063	GGTAC	2	10	1429608	1429617	20 %	20 %	40 %	20 %	15890677
1055	NC_003063	CGGGC	2	10	1432927	1432936	0 %	0 %	60 %	40 %	159186108
1056	NC_003063	CGGCG	2	10	1436366	1436375	0 %	0 %	60 %	40 %	15890672
1057	NC_003063	CGCGG	2	10	1442584	1442593	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1058	NC_003063	GCCCG	2	10	1442660	1442669	0 %	0 %	40 %	60 %	159186111
1059	NC_003063	CGGGA	2	10	1442801	1442810	20 %	0 %	60 %	20 %	159186111
1060	NC_003063	GGTTC	2	10	1442825	1442834	0 %	40 %	40 %	20 %	159186111
1061	NC_003063	TTCGG	2	10	1444234	1444243	0 %	40 %	40 %	20 %	15890666
1062	NC_003063	GCAAG	2	10	1451696	1451705	40 %	0 %	40 %	20 %	15890659
1063	NC_003063	GTGAC	2	10	1452771	1452780	20 %	20 %	40 %	20 %	15890658
1064	NC_003063	CGGCA	2	10	1453177	1453186	20 %	0 %	40 %	40 %	15890658
1065	NC_003063	CATTT	2	10	1454949	1454958	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1066	NC_003063	GTCAG	2	10	1454973	1454982	20 %	20 %	40 %	20 %	159186117
1067	NC_003063	GTTTG	2	10	1455012	1455021	0 %	60 %	40 %	0 %	159186117
1068	NC_003063	GATGA	2	10	1455457	1455466	40 %	20 %	40 %	0 %	159186117
1069	NC_003063	CGTCA	2	10	1456447	1456456	20 %	20 %	20 %	40 %	159186117
1070	NC_003063	GCGGT	2	10	1457726	1457735	0 %	20 %	60 %	20 %	15890654
1071	NC_003063	GCCTT	2	10	1458540	1458549	0 %	40 %	20 %	40 %	159186119
1072	NC_003063	AGGCC	2	10	1458835	1458844	20 %	0 %	40 %	40 %	159186119
1073	NC_003063	GAAAT	2	10	1460579	1460588	60 %	20 %	20 %	0 %	159186120
1074	NC_003063	GCAGG	2	10	1460766	1460775	20 %	0 %	60 %	20 %	15890651
1075	NC_003063	TCCAT	2	10	1462246	1462255	20 %	40 %	0 %	40 %	15890651
1076	NC_003063	TTCTG	2	10	1464337	1464346	0 %	60 %	20 %	20 %	159186121
1077	NC_003063	TCGGC	2	10	1464398	1464407	0 %	20 %	40 %	40 %	159186121
1078	NC_003063	GCCGG	2	10	1466759	1466768	0 %	0 %	60 %	40 %	15890649
1079	NC_003063	TCCCG	2	10	1468222	1468231	0 %	20 %	20 %	60 %	15890648
1080	NC_003063	ATTGC	2	10	1472215	1472224	20 %	40 %	20 %	20 %	15890644
1081	NC_003063	GCTTT	2	10	1472298	1472307	0 %	60 %	20 %	20 %	15890644
1082	NC_003063	GCACA	2	10	1472730	1472739	40 %	0 %	20 %	40 %	159186123
1083	NC_003063	CGGTT	2	10	1476140	1476149	0 %	40 %	40 %	20 %	15890640
1084	NC_003063	CTAAT	2	10	1477153	1477162	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1085	NC_003063	CACGT	2	10	1477218	1477227	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1086	NC_003063	CGAGG	2	10	1478232	1478241	20 %	0 %	60 %	20 %	159186125
1087	NC_003063	GAACT	2	10	1478592	1478601	40 %	20 %	20 %	20 %	159186125
1088	NC_003063	GAAGT	2	10	1480383	1480392	40 %	20 %	40 %	0 %	15890638
1089	NC_003063	TGGTG	2	10	1480813	1480822	0 %	40 %	60 %	0 %	159186126
1090	NC_003063	GGCGA	2	10	1483730	1483739	20 %	0 %	60 %	20 %	15890635
1091	NC_003063	ACAAG	2	10	1484002	1484011	60 %	0 %	20 %	20 %	159186128
1092	NC_003063	GGAAG	2	10	1485553	1485562	40 %	0 %	60 %	0 %	15890633
1093	NC_003063	TACGA	2	10	1486832	1486841	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1094	NC_003063	GGTTA	2	10	1489020	1489029	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_003063	CGAGG	2	10	1489820	1489829	20 %	0 %	60 %	20 %	159186130
1096	NC_003063	CCGTC	2	10	1490166	1490175	0 %	20 %	20 %	60 %	159186130
1097	NC_003063	CGGCG	2	10	1492874	1492883	0 %	0 %	60 %	40 %	15890627
1098	NC_003063	GAAGC	2	10	1495022	1495031	40 %	0 %	40 %	20 %	15890625
1099	NC_003063	AAGGC	2	10	1497441	1497450	40 %	0 %	40 %	20 %	15890623
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1101	NC_003063	CTGCC	2	10	1501305	1501314	0 %	20 %	20 %	60 %	15890619
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1104	NC_003063	CGCTG	2	10	1502860	1502869	0 %	20 %	40 %	40 %	159186132
1105	NC_003063	GCCGG	2	10	1504313	1504322	0 %	0 %	60 %	40 %	159186134
1106	NC_003063	GCCGA	2	10	1504809	1504818	20 %	0 %	40 %	40 %	159186134
1107	NC_003063	CGATC	2	10	1505983	1505992	20 %	20 %	20 %	40 %	15890614
1108	NC_003063	GACAT	2	10	1508253	1508262	40 %	20 %	20 %	20 %	159186136
1109	NC_003063	GTAAT	2	10	1509138	1509147	40 %	40 %	20 %	0 %	15890612
1110	NC_003063	GCATC	2	10	1512421	1512430	20 %	20 %	20 %	40 %	159186137
1111	NC_003063	GCCGG	2	10	1513039	1513048	0 %	0 %	60 %	40 %	159186137
1112	NC_003063	TCGTC	2	10	1514589	1514598	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1113	NC_003063	GGCTG	2	10	1515318	1515327	0 %	20 %	60 %	20 %	15890606
1114	NC_003063	CAGAA	2	10	1516655	1516664	60 %	0 %	20 %	20 %	159186139
1115	NC_003063	CAAAA	2	10	1521924	1521933	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1116	NC_003063	CCTGA	2	10	1522334	1522343	20 %	20 %	20 %	40 %	15890599
1117	NC_003063	GCGCC	2	10	1523197	1523206	0 %	0 %	40 %	60 %	15890597
1118	NC_003063	TGGCG	2	10	1523334	1523343	0 %	20 %	60 %	20 %	15890597
1119	NC_003063	CGGGT	2	10	1523812	1523821	0 %	20 %	60 %	20 %	15890597
1120	NC_003063	CCCGG	2	10	1524684	1524693	0 %	0 %	40 %	60 %	15890597
1121	NC_003063	GTGCG	2	10	1525800	1525809	0 %	20 %	60 %	20 %	159186145
1122	NC_003063	TGGGC	2	10	1527396	1527405	0 %	20 %	60 %	20 %	159186146
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1124	NC_003063	CCAGA	2	10	1528213	1528222	40 %	0 %	20 %	40 %	159186147
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1126	NC_003063	GGCGA	2	10	1530445	1530454	20 %	0 %	60 %	20 %	159186148
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1240	NC_003063	CTTCA	2	10	1682176	1682185	20 %	40 %	0 %	40 %	159186207
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1500	NC_003063	GCTTT	2	10	2051449	2051458	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding

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