MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Mesorhizobium loti MAFF303099 plasmid pMLa

Total Repeats: 4150

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002679	GCG	2	6	2220	2225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488180
2	NC_002679	TCC	2	6	2249	2254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488180
3	NC_002679	CGC	2	6	2270	2275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488180
4	NC_002679	CCA	2	6	2334	2339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488180
5	NC_002679	CCG	2	6	2440	2445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488180
6	NC_002679	GCT	2	6	2510	2515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488180
7	NC_002679	AGT	2	6	2746	2751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488180
8	NC_002679	CGC	2	6	2882	2887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488180
9	NC_002679	GGT	2	6	2966	2971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488180
10	NC_002679	GCC	2	6	3072	3077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488180
11	NC_002679	GCA	2	6	3165	3170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488180
12	NC_002679	GCT	2	6	3203	3208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488180
13	NC_002679	AGC	2	6	3237	3242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488180
14	NC_002679	ACC	2	6	3900	3905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488323
15	NC_002679	TGC	2	6	3954	3959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488323
16	NC_002679	CCA	2	6	4034	4039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488323
17	NC_002679	CGT	3	9	4057	4065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488323
18	NC_002679	GAT	2	6	4070	4075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488323
19	NC_002679	TGA	2	6	4467	4472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488342
20	NC_002679	TTC	2	6	4499	4504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488342
21	NC_002679	CGG	2	6	4513	4518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488342
22	NC_002679	CCG	2	6	4541	4546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488342
23	NC_002679	TGC	2	6	4679	4684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488051
24	NC_002679	ATG	2	6	4710	4715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488051
25	NC_002679	GTC	2	6	5030	5035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488051
26	NC_002679	CAA	2	6	5053	5058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488051
27	NC_002679	CGC	2	6	5158	5163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488051
28	NC_002679	TCA	2	6	5295	5300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488051
29	NC_002679	TGT	2	6	5509	5514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13488051
30	NC_002679	CAG	2	6	5531	5536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488051
31	NC_002679	CCG	2	6	5746	5751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488051
32	NC_002679	TCC	2	6	5876	5881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488051
33	NC_002679	CGG	2	6	5929	5934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488051
34	NC_002679	TCC	2	6	5939	5944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488051
35	NC_002679	GCT	2	6	5955	5960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488051
36	NC_002679	TGA	3	9	5990	5998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488051
37	NC_002679	CTT	2	6	6013	6018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488051
38	NC_002679	CAG	2	6	6040	6045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488051
39	NC_002679	CAC	2	6	6070	6075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488051
40	NC_002679	AGA	2	6	6550	6555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488179
41	NC_002679	ATA	2	6	6556	6561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	13488179
42	NC_002679	GTA	2	6	6621	6626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488179
43	NC_002679	CAC	2	6	6717	6722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488179
44	NC_002679	GCA	2	6	6853	6858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488179
45	NC_002679	TGC	2	6	6930	6935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488052
46	NC_002679	GAT	2	6	7013	7018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488052
47	NC_002679	GCC	2	6	7257	7262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488052
48	NC_002679	TGC	2	6	7298	7303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488052
49	NC_002679	ATC	2	6	7322	7327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488052
50	NC_002679	GGC	2	6	7423	7428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488052
51	NC_002679	CCT	2	6	7489	7494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488052
52	NC_002679	CAG	2	6	7537	7542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488052
53	NC_002679	GAA	2	6	7602	7607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488052
54	NC_002679	TCG	2	6	7644	7649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488052
55	NC_002679	TTG	2	6	7671	7676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13488052
56	NC_002679	CAA	2	6	7880	7885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488052
57	NC_002679	CCG	2	6	7905	7910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488052
58	NC_002679	TCG	2	6	9655	9660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488053
59	NC_002679	GAT	2	6	9765	9770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488053
60	NC_002679	GCA	2	6	9938	9943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488053
61	NC_002679	GCC	2	6	10026	10031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488053
62	NC_002679	CGT	2	6	10146	10151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488053
63	NC_002679	GTC	2	6	10212	10217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488053
64	NC_002679	TGA	2	6	10250	10255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488053
65	NC_002679	CCG	2	6	10315	10320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488053
66	NC_002679	GAT	2	6	10337	10342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488053
67	NC_002679	CCA	2	6	10618	10623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488054
68	NC_002679	TGC	2	6	10638	10643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488054
69	NC_002679	CCT	2	6	10735	10740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488054
70	NC_002679	GTT	2	6	10979	10984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13488054
71	NC_002679	CAA	2	6	11100	11105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488054
72	NC_002679	GAG	2	6	11159	11164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488054
73	NC_002679	CAG	2	6	11195	11200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488054
74	NC_002679	GTC	2	6	11201	11206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488054
75	NC_002679	GCC	2	6	11397	11402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488054
76	NC_002679	GTC	2	6	11442	11447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488054
77	NC_002679	GTA	2	6	11512	11517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488054
78	NC_002679	GCT	2	6	11544	11549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488054
79	NC_002679	GCC	2	6	11592	11597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488054
80	NC_002679	CAT	2	6	11608	11613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488054
81	NC_002679	TGC	2	6	11706	11711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488054
82	NC_002679	ATC	2	6	11715	11720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488054
83	NC_002679	TGC	2	6	11735	11740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488054
84	NC_002679	CCG	2	6	11794	11799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488054
85	NC_002679	TGC	2	6	12404	12409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488181
86	NC_002679	CTA	2	6	12426	12431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488181
87	NC_002679	CCA	2	6	12441	12446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488181
88	NC_002679	CGT	2	6	12474	12479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488181
89	NC_002679	ACT	2	6	12504	12509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488181
90	NC_002679	CGA	2	6	12537	12542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488181
91	NC_002679	GCC	2	6	12628	12633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488181
92	NC_002679	CCG	2	6	12770	12775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488181
93	NC_002679	GCA	2	6	12796	12801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488181
94	NC_002679	AGC	2	6	12818	12823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488181
95	NC_002679	TGC	3	9	12870	12878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488181
96	NC_002679	ATC	2	6	12985	12990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488181
97	NC_002679	GCC	2	6	13099	13104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488181
98	NC_002679	GTT	2	6	13111	13116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13488181
99	NC_002679	TGC	2	6	13137	13142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488181
100	NC_002679	CCG	2	6	13255	13260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488181
101	NC_002679	GTC	2	6	13375	13380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488181
102	NC_002679	GCC	2	6	13652	13657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488182
103	NC_002679	ATG	2	6	13776	13781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488182
104	NC_002679	TCG	2	6	13782	13787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488182
105	NC_002679	ACC	2	6	13964	13969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488182
106	NC_002679	TAA	2	6	14058	14063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	13488182
107	NC_002679	CTG	2	6	14120	14125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488182
108	NC_002679	GCA	2	6	14207	14212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488182
109	NC_002679	TGG	2	6	14269	14274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488182
110	NC_002679	TTC	2	6	14297	14302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488182
111	NC_002679	TGC	2	6	14347	14352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488182
112	NC_002679	GTG	2	6	14390	14395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488182
113	NC_002679	GAC	2	6	14549	14554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488182
114	NC_002679	GAC	2	6	14809	14814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488183
115	NC_002679	CAT	2	6	14824	14829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488183
116	NC_002679	GCC	2	6	14893	14898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488183
117	NC_002679	GAC	2	6	15072	15077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488183
118	NC_002679	CGA	2	6	15160	15165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488183
119	NC_002679	GGC	2	6	15172	15177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488183
120	NC_002679	AGC	2	6	15231	15236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488183
121	NC_002679	ATG	2	6	15284	15289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488183
122	NC_002679	TCA	3	9	15300	15308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488183
123	NC_002679	GGA	2	6	15343	15348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488183
124	NC_002679	CCG	2	6	15552	15557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488183
125	NC_002679	CGG	2	6	15562	15567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488183
126	NC_002679	GTG	2	6	15584	15589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488183
127	NC_002679	TCG	2	6	15590	15595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488183
128	NC_002679	CCG	2	6	15687	15692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488183
129	NC_002679	GCC	2	6	15810	15815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488184
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250	NC_002679	GAA	2	6	26143	26148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488190
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381	NC_002679	GTC	2	6	36499	36504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488196
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499	NC_002679	ACC	2	6	47695	47700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488203
500	NC_002679	GAC	2	6	47815	47820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488203

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