MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Mesorhizobium loti MAFF303099 plasmid pMLa

Total Repeats: 4150

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_002679	CGG	2	6	133687	133692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488097
1502	NC_002679	GTG	2	6	133744	133749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488097
1503	NC_002679	GAA	2	6	133760	133765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488097
1504	NC_002679	GCG	2	6	133813	133818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488097
1505	NC_002679	GCT	2	6	133874	133879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488097
1506	NC_002679	ATG	2	6	134207	134212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488098
1507	NC_002679	CGT	2	6	134215	134220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488098
1508	NC_002679	CAG	2	6	134313	134318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488098
1509	NC_002679	CGA	2	6	134443	134448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488098
1510	NC_002679	ACG	2	6	134486	134491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488098
1511	NC_002679	CAA	2	6	134556	134561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488098
1512	NC_002679	TCC	2	6	134638	134643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488099
1513	NC_002679	GAA	2	6	134658	134663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488099
1514	NC_002679	TGG	2	6	134672	134677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488099
1515	NC_002679	CCG	2	6	134703	134708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488099
1516	NC_002679	TGC	2	6	134773	134778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488099
1517	NC_002679	CGA	2	6	134789	134794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488099
1518	NC_002679	CGC	2	6	134984	134989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488099
1519	NC_002679	GCC	2	6	135001	135006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488099
1520	NC_002679	CGT	2	6	135129	135134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488100
1521	NC_002679	CGA	2	6	135187	135192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488100
1522	NC_002679	CGG	2	6	135262	135267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488100
1523	NC_002679	GCC	2	6	135315	135320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488100
1524	NC_002679	GCC	2	6	135428	135433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488100
1525	NC_002679	ATG	2	6	135438	135443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488100
1526	NC_002679	GGT	2	6	135503	135508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488100
1527	NC_002679	TTC	2	6	135545	135550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488100
1528	NC_002679	TCG	2	6	135562	135567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488100
1529	NC_002679	GTC	2	6	135569	135574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488100
1530	NC_002679	TCG	2	6	135619	135624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488100
1531	NC_002679	TGC	2	6	135645	135650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488100
1532	NC_002679	TTC	2	6	135711	135716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488100
1533	NC_002679	CAT	2	6	135779	135784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488100
1534	NC_002679	GCA	2	6	135832	135837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488100
1535	NC_002679	GAG	2	6	135887	135892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488100
1536	NC_002679	CGG	2	6	135895	135900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488100
1537	NC_002679	CGT	2	6	135908	135913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488100
1538	NC_002679	GGC	2	6	136040	136045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488100
1539	NC_002679	GCA	2	6	136126	136131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488100
1540	NC_002679	CGT	2	6	136169	136174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488100
1541	NC_002679	TGA	2	6	136647	136652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488225
1542	NC_002679	CGG	2	6	136787	136792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488225
1543	NC_002679	TGC	2	6	136821	136826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488225
1544	NC_002679	CGT	2	6	137168	137173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488225
1545	NC_002679	GAA	2	6	137210	137215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488225
1546	NC_002679	AAT	2	6	138205	138210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	13488226
1547	NC_002679	TGC	3	9	138242	138250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488226
1548	NC_002679	CGC	2	6	138261	138266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488226
1549	NC_002679	GCT	2	6	138286	138291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488226
1550	NC_002679	GAA	2	6	138342	138347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488226
1551	NC_002679	TGG	2	6	138394	138399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488226
1552	NC_002679	CAC	2	6	138703	138708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488226
1553	NC_002679	TTG	2	6	138806	138811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13488226
1554	NC_002679	AAG	2	6	138842	138847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488226
1555	NC_002679	GGC	2	6	138851	138856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488226
1556	NC_002679	TGA	2	6	138857	138862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488226
1557	NC_002679	ACC	2	6	138866	138871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488226
1558	NC_002679	ACA	2	6	138989	138994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488226
1559	NC_002679	AAC	2	6	139030	139035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488226
1560	NC_002679	GAA	2	6	139125	139130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488226
1561	NC_002679	TGG	2	6	139157	139162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488226
1562	NC_002679	TGC	2	6	139264	139269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488226
1563	NC_002679	TCA	2	6	139361	139366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488226
1564	NC_002679	GAT	2	6	139386	139391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488226
1565	NC_002679	GAT	2	6	139393	139398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488226
1566	NC_002679	CGC	2	6	139401	139406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488226
1567	NC_002679	AAT	2	6	139439	139444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	13488226
1568	NC_002679	CGC	3	9	139538	139546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488227
1569	NC_002679	GAC	2	6	139565	139570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488227
1570	NC_002679	GAC	3	9	139596	139604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488227
1571	NC_002679	CCG	2	6	139674	139679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488227
1572	NC_002679	AGG	3	9	139687	139695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488227
1573	NC_002679	GCC	2	6	139836	139841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488227
1574	NC_002679	GAA	2	6	139878	139883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488227
1575	NC_002679	CTA	2	6	139892	139897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488227
1576	NC_002679	GAC	2	6	140004	140009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488227
1577	NC_002679	AGC	2	6	140026	140031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488227
1578	NC_002679	AGC	2	6	140038	140043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488227
1579	NC_002679	GAC	3	9	140091	140099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488227
1580	NC_002679	CTG	2	6	140145	140150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488227
1581	NC_002679	TCA	2	6	140239	140244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488227
1582	NC_002679	ACA	2	6	140254	140259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488227
1583	NC_002679	AGC	2	6	140447	140452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488227
1584	NC_002679	GCC	2	6	140576	140581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488227
1585	NC_002679	TGT	2	6	140582	140587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13488227
1586	NC_002679	TCG	2	6	140616	140621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488101
1587	NC_002679	GAG	2	6	140700	140705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488101
1588	NC_002679	GCA	2	6	140736	140741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488101
1589	NC_002679	GTG	2	6	140752	140757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488101
1590	NC_002679	CCA	2	6	140814	140819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488101
1591	NC_002679	CCT	2	6	140820	140825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488101
1592	NC_002679	CTC	2	6	140854	140859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488101
1593	NC_002679	AAT	2	6	140917	140922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	13488101
1594	NC_002679	CAA	2	6	141291	141296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488228
1595	NC_002679	CCG	2	6	141336	141341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488228
1596	NC_002679	GTC	2	6	141477	141482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488228
1597	NC_002679	ATT	2	6	141513	141518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	13488228
1598	NC_002679	TCG	2	6	141523	141528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488228
1599	NC_002679	GCA	2	6	141681	141686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488228
1600	NC_002679	CGC	2	6	141909	141914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488102
1601	NC_002679	GCT	2	6	141928	141933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488102
1602	NC_002679	CGA	2	6	142120	142125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488102
1603	NC_002679	TGG	2	6	142158	142163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488102
1604	NC_002679	TCA	2	6	142173	142178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488102
1605	NC_002679	AGG	2	6	142245	142250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488102
1606	NC_002679	TGC	2	6	142294	142299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488102
1607	NC_002679	ACC	2	6	142376	142381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488102
1608	NC_002679	GCG	2	6	142398	142403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488102
1609	NC_002679	CCG	2	6	142452	142457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488102
1610	NC_002679	CGA	2	6	142482	142487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488102
1611	NC_002679	CGA	2	6	142519	142524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488102
1612	NC_002679	GAA	2	6	142639	142644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488102
1613	NC_002679	AGC	2	6	142690	142695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488102
1614	NC_002679	GGC	2	6	142696	142701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488102
1615	NC_002679	AAG	2	6	142717	142722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488102
1616	NC_002679	GGA	2	6	143280	143285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488103
1617	NC_002679	GAG	2	6	143396	143401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488103
1618	NC_002679	TGG	2	6	143480	143485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488103
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1620	NC_002679	GCC	2	6	143515	143520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488103
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1980	NC_002679	GGC	2	6	172648	172653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488234
1981	NC_002679	GTC	2	6	172688	172693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488234
1982	NC_002679	AAC	2	6	172754	172759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488234
1983	NC_002679	CGT	2	6	172762	172767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488234
1984	NC_002679	TCG	2	6	172827	172832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488234
1985	NC_002679	GCT	2	6	172863	172868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488234
1986	NC_002679	GAA	2	6	172939	172944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488234
1987	NC_002679	CCA	2	6	172948	172953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488234
1988	NC_002679	TGC	2	6	172968	172973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488234
1989	NC_002679	AAG	2	6	172997	173002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488234
1990	NC_002679	CTG	2	6	173103	173108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488234
1991	NC_002679	GCG	2	6	173171	173176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488234
1992	NC_002679	ACT	2	6	173409	173414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488234
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1995	NC_002679	GAT	2	6	173596	173601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488234
1996	NC_002679	TCG	2	6	173658	173663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488234
1997	NC_002679	CAC	2	6	173677	173682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488234
1998	NC_002679	GGC	2	6	173910	173915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488234
1999	NC_002679	GCC	2	6	173935	173940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488234
2000	NC_002679	GAT	2	6	173993	173998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488234

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