MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Aquifex aeolicus VF5

Total Repeats: 720

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000918	AGGAAA	2	12	164	175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605613
2	NC_000918	AATCGA	2	12	1539	1550	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15605613
3	NC_000918	GTTAGA	2	12	1693	1704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605613
4	NC_000918	CGTAAG	2	12	3478	3489	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15605615
5	NC_000918	CCGTTA	2	12	3735	3746	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15605616
6	NC_000918	GAAAAG	2	12	4801	4812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605617
7	NC_000918	GTAAAG	2	12	5143	5154	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15605618
8	NC_000918	GAAAAG	2	12	5398	5409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605619
9	NC_000918	CCTTGA	2	12	7149	7160	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15605621
10	NC_000918	TTCAAG	2	12	10319	10330	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15605627
11	NC_000918	GCAAGG	2	12	14821	14832	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	15605631
12	NC_000918	AAACTT	2	12	15102	15113	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15605631
13	NC_000918	CTTCCC	2	12	18410	18421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15605634
14	NC_000918	CCCTCG	2	12	18699	18710	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	15605634
15	NC_000918	ATGGTT	2	12	20313	20324	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	15605635
16	NC_000918	TCTTTG	2	12	21661	21672	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	15605636
17	NC_000918	AGCCAT	2	12	24101	24112	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15605639
18	NC_000918	AAAGGT	2	12	30370	30381	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15605647
19	NC_000918	GATAAA	2	12	31482	31493	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15605648
20	NC_000918	AAAGTA	2	12	31918	31929	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15605648
21	NC_000918	TTTTTG	2	12	34587	34598	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	15605650
22	NC_000918	GTCCCT	2	12	35131	35142	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	15605651
23	NC_000918	CTCGTA	2	12	40948	40959	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15605660
24	NC_000918	TTTACC	2	12	42148	42159	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15605664
25	NC_000918	TCCTTA	2	12	42380	42391	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15605664
26	NC_000918	GGAGAG	2	12	45064	45075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15605668
27	NC_000918	GTTTTT	2	12	46281	46292	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	15605669
28	NC_000918	TTTCTT	2	12	46822	46833	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	15605670
29	NC_000918	CCGTCT	2	12	47768	47779	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	15605674
30	NC_000918	CTGTGC	2	12	53307	53318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605680
31	NC_000918	CCAGAA	2	12	54343	54354	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	15605681
32	NC_000918	TTGCGG	2	12	55482	55493	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	15605683
33	NC_000918	CGGGAA	2	12	57153	57164	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	15607134
34	NC_000918	TCCTAT	2	12	58642	58653	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15605686
35	NC_000918	TCGGCG	2	12	61820	61831	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	15605688
36	NC_000918	GGGAGT	2	12	62160	62171	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	15605689
37	NC_000918	CGGAAA	2	12	62220	62231	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	15605689
38	NC_000918	TCGCCC	2	12	64189	64200	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	15605691
39	NC_000918	CCTTCC	2	12	65080	65091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15605692
40	NC_000918	ATAGGC	2	12	67405	67416	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15605696
41	NC_000918	CATAAG	2	12	71986	71997	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15605700
42	NC_000918	TTCCTT	2	12	72941	72952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605701
43	NC_000918	TTTGCG	2	12	75153	75164	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	15605702
44	NC_000918	TTAGCC	2	12	78914	78925	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15605708
45	NC_000918	CTTTTA	2	12	79133	79144	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	15605708
46	NC_000918	CGAAGG	2	12	88275	88286	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	15605720
47	NC_000918	TTCACT	2	12	90180	90191	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15605722
48	NC_000918	AAACGT	2	12	101370	101381	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15605736
49	NC_000918	GTTGTC	2	12	108778	108789	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	15605744
50	NC_000918	ACCTTT	2	12	116769	116780	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15605757
51	NC_000918	AGAAAG	2	12	119303	119314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605760
52	NC_000918	AAAAGG	2	12	119549	119560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605760
53	NC_000918	AACCTG	2	12	120390	120401	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15605761
54	NC_000918	AGGAAA	2	12	121111	121122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605761
55	NC_000918	AGGAAG	2	12	123201	123212	50 %	0 %	50 %	0 %	15605764
56	NC_000918	TGCAAC	2	12	126066	126077	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15605766
57	NC_000918	GTGGAA	2	12	128166	128177	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	15605767
58	NC_000918	CTACGA	2	12	132510	132521	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15605772
59	NC_000918	GGAAAC	2	12	133154	133165	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	15605773
60	NC_000918	CCTTTA	2	12	137355	137366	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15605776
61	NC_000918	TTACGG	2	12	139527	139538	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15605778
62	NC_000918	AAGGAA	2	12	142191	142202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605779
63	NC_000918	GAAATC	2	12	142710	142721	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15605779
64	NC_000918	CCTCCA	2	12	144866	144877	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	15605781
65	NC_000918	AGTACA	2	12	147418	147429	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15605783
66	NC_000918	GCCAGA	2	12	151019	151030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605787
67	NC_000918	CCTTTT	2	12	153741	153752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605789
68	NC_000918	TTTTCT	2	12	155514	155525	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	15605790
69	NC_000918	ACTCAA	2	12	156034	156045	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	15605790
70	NC_000918	TACTCT	2	12	164994	165005	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15605800
71	NC_000918	CTGGAA	2	12	172501	172512	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15605807
72	NC_000918	AGGAAA	2	12	172518	172529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605807
73	NC_000918	TTGATC	2	12	176671	176682	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15605813
74	NC_000918	CTTTCT	2	12	187119	187130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605823
75	NC_000918	GCGGGA	2	12	189026	189037	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	15605825
76	NC_000918	GGAAGA	2	12	189082	189093	50 %	0 %	50 %	0 %	15605825
77	NC_000918	CCCCTG	2	12	189403	189414	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	15605825
78	NC_000918	CTCCTT	2	12	190286	190297	0 %	50 %	0 %	50 %	15605827
79	NC_000918	GGAGAA	2	12	195137	195148	50 %	0 %	50 %	0 %	15605831
80	NC_000918	GAAAAA	2	12	195928	195939	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	15605831
81	NC_000918	CTTAAA	2	12	195992	196003	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15605831
82	NC_000918	CTCTTC	2	12	196373	196384	0 %	50 %	0 %	50 %	15605832
83	NC_000918	TCCCGT	2	12	199646	199657	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	15605834
84	NC_000918	CTTTTC	2	12	199733	199744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605834
85	NC_000918	CTTCCG	3	18	200062	200079	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	15605834
86	NC_000918	GGGAAA	2	12	200886	200897	50 %	0 %	50 %	0 %	15605835
87	NC_000918	AGAGGC	2	12	205054	205065	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	15605837
88	NC_000918	CAAGTC	2	12	206239	206250	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15605839
89	NC_000918	AGGGAA	2	12	211577	211588	50 %	0 %	50 %	0 %	15605844
90	NC_000918	AAAAGG	2	12	213102	213113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605846
91	NC_000918	TCCGCC	2	12	214077	214088	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	15605847
92	NC_000918	TCCGCA	2	12	219090	219101	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	15605853
93	NC_000918	CGTTCC	2	12	219212	219223	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	15605853
94	NC_000918	TAAAAA	2	12	220303	220314	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	15605854
95	NC_000918	AGGAAG	2	12	226639	226650	50 %	0 %	50 %	0 %	15605859
96	NC_000918	AGATGA	2	12	227296	227307	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15605859
97	NC_000918	CTACCG	2	12	228125	228136	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	15605861
98	NC_000918	TCCGAG	2	12	228204	228215	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	15605861
99	NC_000918	AGTTCA	2	12	228732	228743	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15605862
100	NC_000918	TTCCCT	2	12	230622	230633	0 %	50 %	0 %	50 %	15605863
101	NC_000918	ACGGGA	2	12	234719	234730	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	15605867
102	NC_000918	AGGGAA	2	12	234891	234902	50 %	0 %	50 %	0 %	15605867
103	NC_000918	CGAAGA	2	12	235711	235722	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	15605867
104	NC_000918	GTTCCG	2	12	237782	237793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605869
105	NC_000918	ATTTCT	2	12	239879	239890	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	15605872
106	NC_000918	ACGGGA	2	12	240203	240214	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	15605872
107	NC_000918	TTTCTA	2	12	240284	240295	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	15605873
108	NC_000918	AAGTGA	2	12	243643	243654	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15605874
109	NC_000918	GTCAAG	2	12	247452	247463	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15605877
110	NC_000918	CTTTCT	2	12	251975	251986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605880
111	NC_000918	TACGTA	2	12	252645	252656	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15605881
112	NC_000918	AAGATT	2	12	259329	259340	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15605889
113	NC_000918	ATATTC	2	12	261246	261257	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15605891
114	NC_000918	ATTTTA	2	12	262639	262650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15605891
115	NC_000918	GGATTC	2	12	267876	267887	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15605897
116	NC_000918	GTGAAG	2	12	269571	269582	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	15605899
117	NC_000918	GTAAAG	2	12	270116	270127	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15605899
118	NC_000918	GACTCG	2	12	270596	270607	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	15605900
119	NC_000918	GAACAT	2	12	270951	270962	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15605900
120	NC_000918	ACAGAC	2	12	271925	271936	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	15605901
121	NC_000918	CTCGTG	2	12	280041	280052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605911
122	NC_000918	AGATGT	2	12	280601	280612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605911
123	NC_000918	GAAAAG	2	12	284086	284097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605913
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125	NC_000918	GGAATG	2	12	285182	285193	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	15605914
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127	NC_000918	GGACGA	2	12	286762	286773	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	15605916
128	NC_000918	GAGGAA	2	12	286786	286797	50 %	0 %	50 %	0 %	15605916
129	NC_000918	AAAAAG	2	12	290402	290413	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	15605922
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132	NC_000918	CTCTAC	2	12	298494	298505	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	15605931
133	NC_000918	GAACTT	2	12	304623	304634	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15605938
134	NC_000918	GTCTAT	2	12	306451	306462	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15605942
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140	NC_000918	TCAACT	2	12	319130	319141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605953
141	NC_000918	GAAGAG	2	12	319622	319633	50 %	0 %	50 %	0 %	15605954
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147	NC_000918	TTTCAG	2	12	335260	335271	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15605970
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236	NC_000918	CCTTTC	2	12	489142	489153	0 %	50 %	0 %	50 %	15606113
237	NC_000918	TATTCT	2	12	489465	489476	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	15606113
238	NC_000918	AAAGTG	2	12	495648	495659	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15606116
239	NC_000918	AAGTAC	2	12	499010	499021	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15606119
240	NC_000918	TACGAG	2	12	499529	499540	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15606119
241	NC_000918	TCACTT	2	12	500579	500590	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15606119
242	NC_000918	GCAGTA	2	12	503625	503636	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15606121
243	NC_000918	TCCCCT	2	12	509338	509349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15606127
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259	NC_000918	CTCAAG	2	12	549680	549691	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15606167
260	NC_000918	TCCCGC	2	12	549833	549844	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	15606167
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263	NC_000918	TAAAGT	2	12	550205	550216	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15606168
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348	NC_000918	TTCCAG	2	12	771011	771022	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15606373
349	NC_000918	TCTCAG	2	12	771627	771638	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15606373
350	NC_000918	AAACGT	2	12	771640	771651	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15606373
351	NC_000918	AGTTTG	2	12	773907	773918	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	15607139
352	NC_000918	GGGACT	2	12	780035	780046	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	15606381
353	NC_000918	ACTATT	2	12	783743	783754	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15606386
354	NC_000918	CAATCG	2	12	785646	785657	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15606386
355	NC_000918	TGGATA	2	12	787848	787859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15606387
356	NC_000918	CATGTT	2	12	788772	788783	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15606387
357	NC_000918	CTTTTT	2	12	788789	788800	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	15606387
358	NC_000918	GTGTTT	2	12	788806	788817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15606387
359	NC_000918	CCCATA	2	12	790140	790151	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	15606390
360	NC_000918	CCATTC	3	18	790159	790176	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	15606390
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363	NC_000918	ATCCTC	2	12	790619	790630	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	15606390
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368	NC_000918	CCTTTC	2	12	793889	793900	0 %	50 %	0 %	50 %	15606393
369	NC_000918	TCCTTT	2	12	794512	794523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15606393
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381	NC_000918	ATGGTA	2	12	822726	822737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15606416
382	NC_000918	TTCCCG	2	12	826862	826873	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	15606420
383	NC_000918	TTATAG	2	12	827051	827062	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15606420
384	NC_000918	GCGGGA	2	12	829027	829038	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	15606423
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402	NC_000918	CGTACT	2	12	850100	850111	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15606446
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453	NC_000918	ACGTAA	2	12	931871	931882	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15606520
454	NC_000918	CTCTTC	2	12	933898	933909	0 %	50 %	0 %	50 %	15606524
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457	NC_000918	ACCGCC	2	12	943532	943543	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	15606532
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466	NC_000918	GCTATG	2	12	961529	961540	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15606550
467	NC_000918	ATACTC	2	12	965529	965540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15606555
468	NC_000918	CGGGAG	2	12	969449	969460	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	15606559
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470	NC_000918	GTTTTT	2	12	973987	973998	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	15606564
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