MICAS: Microsatellite Analysis Server

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Aquifex aeolicus VF5

Total Repeats: 720

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_000918	TGCACC	2	12	1048241	1048252	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	15606634
502	NC_000918	GGCAAG	2	12	1048397	1048408	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	15606634
503	NC_000918	AAAGGA	2	12	1049951	1049962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15606635
504	NC_000918	CTTTAC	2	12	1058826	1058837	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15606647
505	NC_000918	ATTATC	2	12	1060042	1060053	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15606648
506	NC_000918	CTTTCT	2	12	1061350	1061361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15606649
507	NC_000918	CTGGAG	2	12	1061843	1061854	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	15606649
508	NC_000918	TTTCTT	2	12	1062398	1062409	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	15606650
509	NC_000918	CTTTAC	2	12	1063949	1063960	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15606651
510	NC_000918	ACAAGA	2	12	1066811	1066822	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	15606655
511	NC_000918	TTTCGG	2	12	1075956	1075967	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	15606664
512	NC_000918	AGGAAA	2	12	1076948	1076959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15606665
513	NC_000918	CAAGGA	2	12	1079868	1079879	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	15606668
514	NC_000918	CTTCCT	2	12	1085140	1085151	0 %	50 %	0 %	50 %	15606673
515	NC_000918	CAACTT	2	12	1090951	1090962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15606680
516	NC_000918	TCCACC	2	12	1091422	1091433	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	15606681
517	NC_000918	TATGCC	2	12	1091490	1091501	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15606681
518	NC_000918	ATTCTC	2	12	1096844	1096855	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15606687
519	NC_000918	CCCTGC	2	12	1099831	1099842	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	15606691
520	NC_000918	TTCCTG	2	12	1101124	1101135	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	15606693
521	NC_000918	ACCTGA	2	12	1102820	1102831	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15606695
522	NC_000918	CCCATA	2	12	1108386	1108397	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	15606697
523	NC_000918	TAAGGG	2	12	1109056	1109067	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	15606697
524	NC_000918	TTTAAC	2	12	1110892	1110903	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15606698
525	NC_000918	CTTCAC	2	12	1111724	1111735	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	15606700
526	NC_000918	CCTATG	2	12	1112486	1112497	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15606701
527	NC_000918	TAGAAG	2	12	1113968	1113979	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15606703
528	NC_000918	CTGAAA	2	12	1114186	1114197	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15606703
529	NC_000918	CAAAGG	2	12	1117589	1117600	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	15606708
530	NC_000918	CTTGAA	2	12	1118646	1118657	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15606709
531	NC_000918	GTAAAG	2	12	1118730	1118741	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15606709
532	NC_000918	CGGAAA	2	12	1119855	1119866	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	15606711
533	NC_000918	AAAGGA	2	12	1120151	1120162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15606712
534	NC_000918	CTCCTG	2	12	1123320	1123331	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	15606716
535	NC_000918	GGGCGA	2	12	1127285	1127296	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	15606721
536	NC_000918	GGAAAA	2	12	1131367	1131378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15606725
537	NC_000918	AGTCCG	2	12	1132383	1132394	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	15606727
538	NC_000918	TTGTCC	2	12	1132986	1132997	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	15606727
539	NC_000918	TCTTAC	2	12	1136829	1136840	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15606730
540	NC_000918	TATCCT	2	12	1143523	1143534	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15606737
541	NC_000918	GGCTAC	2	12	1146294	1146305	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	15606740
542	NC_000918	AGTACG	2	12	1150875	1150886	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15606743
543	NC_000918	TGTCCC	2	12	1151668	1151679	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	15606744
544	NC_000918	GTTTGA	2	12	1156089	1156100	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	15606751
545	NC_000918	CTCTTC	2	12	1156811	1156822	0 %	50 %	0 %	50 %	15606752
546	NC_000918	TTCCCG	2	12	1159508	1159519	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	15606758
547	NC_000918	TTCAAG	2	12	1160991	1161002	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15606760
548	NC_000918	CAGAGC	2	12	1161639	1161650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15606761
549	NC_000918	GGGAGC	2	12	1162497	1162508	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	15606762
550	NC_000918	CCTCTG	2	12	1162771	1162782	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	15606763
551	NC_000918	CCATTA	2	12	1163277	1163288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15606763
552	NC_000918	AACTTT	2	12	1163718	1163729	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15606764
553	NC_000918	TGAAAT	2	12	1165406	1165417	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15606765
554	NC_000918	CCGAGG	2	12	1168335	1168346	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	15606767
555	NC_000918	TCTTTG	2	12	1168729	1168740	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	15606768
556	NC_000918	TTTAAG	2	12	1172525	1172536	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15606771
557	NC_000918	GCTCCC	2	12	1176182	1176193	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	15606774
558	NC_000918	TTTCCC	2	12	1176483	1176494	0 %	50 %	0 %	50 %	15606774
559	NC_000918	TAGAAA	2	12	1178053	1178064	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15606775
560	NC_000918	GAAGAG	2	12	1178880	1178891	50 %	0 %	50 %	0 %	15606775
561	NC_000918	GGAAGA	2	12	1178963	1178974	50 %	0 %	50 %	0 %	15606775
562	NC_000918	AAAGGA	2	12	1179937	1179948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15606777
563	NC_000918	CCGCGT	2	12	1181135	1181146	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	15606778
564	NC_000918	TGCGGT	2	12	1182355	1182366	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	15606779
565	NC_000918	CTACCC	2	12	1183338	1183349	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	15606779
566	NC_000918	CCCTTT	2	12	1183757	1183768	0 %	50 %	0 %	50 %	15606780
567	NC_000918	TTTAAC	2	12	1183796	1183807	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15606780
568	NC_000918	AACACC	2	12	1186852	1186863	50 %	0 %	0 %	50 %	15606781
569	NC_000918	ATGAGT	2	12	1200854	1200865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15606791
570	NC_000918	ACCTAT	2	12	1201632	1201643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15606792
571	NC_000918	TCGTGG	2	12	1202408	1202419	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	15606792
572	NC_000918	GGTAGT	2	12	1203368	1203379	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	15606792
573	NC_000918	TTTACT	2	12	1204810	1204821	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	15606794
574	NC_000918	GACAGG	2	12	1208070	1208081	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	15606798
575	NC_000918	CACCTA	2	12	1210366	1210377	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	15606801
576	NC_000918	CTGGAG	2	12	1210748	1210759	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	15606801
577	NC_000918	CGTTGA	2	12	1212689	1212700	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15606803
578	NC_000918	GAGAGG	2	12	1213602	1213613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15606804
579	NC_000918	AGGTTC	2	12	1217596	1217607	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15606806
580	NC_000918	TCTTCC	2	12	1218947	1218958	0 %	50 %	0 %	50 %	15606806
581	NC_000918	GGAACT	2	12	1219349	1219360	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15606806
582	NC_000918	GAAATA	2	12	1219383	1219394	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15606806
583	NC_000918	AGGGAA	2	12	1220884	1220895	50 %	0 %	50 %	0 %	15606808
584	NC_000918	CGTACT	2	12	1223882	1223893	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15606810
585	NC_000918	GTAAGT	2	12	1228089	1228100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15606815
586	NC_000918	GTCTAT	2	12	1235287	1235298	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15606821
587	NC_000918	GTTTTC	2	12	1235632	1235643	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	15606821
588	NC_000918	CTTGCC	2	12	1237051	1237062	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	15606823
589	NC_000918	GTCTTC	2	12	1237848	1237859	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	15606824
590	NC_000918	GAGAAA	2	12	1242729	1242740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15606827
591	NC_000918	GATGGC	2	12	1243506	1243517	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	15606828
592	NC_000918	CTTTGA	2	12	1248726	1248737	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15606832
593	NC_000918	CCTTTT	2	12	1252690	1252701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15606837
594	NC_000918	CAAGGT	2	12	1252726	1252737	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15606837
595	NC_000918	CATTCC	2	12	1259979	1259990	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	15606842
596	NC_000918	TCCTTT	2	12	1262295	1262306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15606844
597	NC_000918	AAAAAG	2	12	1266184	1266195	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	15606848
598	NC_000918	GGAAAA	2	12	1268294	1268305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15606851
599	NC_000918	ATCCTT	2	12	1271017	1271028	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15606854
600	NC_000918	GCGGTG	2	12	1272503	1272514	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	15606857
601	NC_000918	GGGGTT	2	12	1276135	1276146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15606861
602	NC_000918	CCTTTA	2	12	1276245	1276256	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15606861
603	NC_000918	GGATAC	2	12	1279264	1279275	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15606865
604	NC_000918	GAAAAG	2	12	1291156	1291167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15606878
605	NC_000918	GATAAC	2	12	1292995	1293006	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15606881
606	NC_000918	CGGGAG	2	12	1294194	1294205	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	15606882
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608	NC_000918	CTTTTT	2	12	1296100	1296111	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	15606884
609	NC_000918	AAAGGA	2	12	1297826	1297837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15606886
610	NC_000918	AAAAAT	2	12	1298861	1298872	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	15606888
611	NC_000918	TAAAGG	2	12	1305301	1305312	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15606894
612	NC_000918	TCCGCA	2	12	1307619	1307630	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	15606896
613	NC_000918	GCAAAT	2	12	1308876	1308887	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15606898
614	NC_000918	CGGAGC	2	12	1308989	1309000	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	15606898
615	NC_000918	TACAGG	2	12	1313585	1313596	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15606902
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