MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Aeropyrum pernix K1

Total Repeats: 904

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000854	TAATA	2	10	558	567	60 %	40 %	0 %	0 %	14600380
2	NC_000854	TTTAA	2	10	577	586	40 %	60 %	0 %	0 %	14600380
3	NC_000854	TAGGG	2	10	4813	4822	20 %	20 %	60 %	0 %	118430837
4	NC_000854	CTAGG	2	10	5432	5441	20 %	20 %	40 %	20 %	118430837
5	NC_000854	ATGAA	2	10	5776	5785	60 %	20 %	20 %	0 %	118430838
6	NC_000854	CCTCT	2	10	6315	6324	0 %	40 %	0 %	60 %	118430839
7	NC_000854	CTCTC	2	10	6399	6408	0 %	40 %	0 %	60 %	118430839
8	NC_000854	AGCTT	2	10	7625	7634	20 %	40 %	20 %	20 %	118430839
9	NC_000854	CTCGG	2	10	10633	10642	0 %	20 %	40 %	40 %	118430841
10	NC_000854	TGGCT	2	10	12996	13005	0 %	40 %	40 %	20 %	118430842
11	NC_000854	CCTGC	2	10	14271	14280	0 %	20 %	20 %	60 %	118430843
12	NC_000854	CCTTC	2	10	15607	15616	0 %	40 %	0 %	60 %	118430844
13	NC_000854	CACAG	2	10	16022	16031	40 %	0 %	20 %	40 %	118430845
14	NC_000854	GTCAA	2	10	18402	18411	40 %	20 %	20 %	20 %	14600396
15	NC_000854	TTATG	2	10	22100	22109	20 %	60 %	20 %	0 %	118430848
16	NC_000854	GGCTG	2	10	25678	25687	0 %	20 %	60 %	20 %	118430851
17	NC_000854	CCAGG	2	10	28303	28312	20 %	0 %	40 %	40 %	118430853
18	NC_000854	GAGGT	2	10	30655	30664	20 %	20 %	60 %	0 %	14600407
19	NC_000854	CGATG	2	10	31144	31153	20 %	20 %	40 %	20 %	14600408
20	NC_000854	ACTTG	2	10	33061	33070	20 %	40 %	20 %	20 %	118430856
21	NC_000854	TAATG	2	10	33697	33706	40 %	40 %	20 %	0 %	14600412
22	NC_000854	TAGAA	2	10	34101	34110	60 %	20 %	20 %	0 %	14600412
23	NC_000854	CTGGT	2	10	35179	35188	0 %	40 %	40 %	20 %	118430857
24	NC_000854	TGGCC	2	10	36922	36931	0 %	20 %	40 %	40 %	118430858
25	NC_000854	GTGCT	2	10	37514	37523	0 %	40 %	40 %	20 %	118430858
26	NC_000854	TTGTC	2	10	37610	37619	0 %	60 %	20 %	20 %	118430858
27	NC_000854	AGGCA	2	10	37908	37917	40 %	0 %	40 %	20 %	118430858
28	NC_000854	GCCAT	2	10	38239	38248	20 %	20 %	20 %	40 %	118430858
29	NC_000854	ATCAT	2	10	38323	38332	40 %	40 %	0 %	20 %	118430858
30	NC_000854	CTATC	2	10	38477	38486	20 %	40 %	0 %	40 %	118430858
31	NC_000854	ACATA	2	10	39293	39302	60 %	20 %	0 %	20 %	118430858
32	NC_000854	ATAGG	2	10	43200	43209	40 %	20 %	40 %	0 %	14600419
33	NC_000854	AGCAT	2	10	46252	46261	40 %	20 %	20 %	20 %	118430862
34	NC_000854	TGTGG	2	10	50849	50858	0 %	40 %	60 %	0 %	118430866
35	NC_000854	AGGCG	2	10	51306	51315	20 %	0 %	60 %	20 %	118430866
36	NC_000854	CTGGG	2	10	56092	56101	0 %	20 %	60 %	20 %	118430869
37	NC_000854	AGGTT	2	10	61099	61108	20 %	40 %	40 %	0 %	118430875
38	NC_000854	AAAAG	2	10	61793	61802	80 %	0 %	20 %	0 %	118430875
39	NC_000854	TCTCC	2	10	64689	64698	0 %	40 %	0 %	60 %	14600442
40	NC_000854	CACAA	2	10	64939	64948	60 %	0 %	0 %	40 %	14600442
41	NC_000854	ATATA	2	10	65268	65277	60 %	40 %	0 %	0 %	14600442
42	NC_000854	TCATA	2	10	65313	65322	40 %	40 %	0 %	20 %	14600442
43	NC_000854	GCCAG	2	10	65546	65555	20 %	0 %	40 %	40 %	14602183
44	NC_000854	GTAGG	2	10	70898	70907	20 %	20 %	60 %	0 %	14600448
45	NC_000854	CTGTC	2	10	71626	71635	0 %	40 %	20 %	40 %	14600448
46	NC_000854	CTACT	2	10	72775	72784	20 %	40 %	0 %	40 %	118430880
47	NC_000854	AGGCC	2	10	80185	80194	20 %	0 %	40 %	40 %	118430885
48	NC_000854	AGCCT	2	10	81258	81267	20 %	20 %	20 %	40 %	14600457
49	NC_000854	CTGGA	2	10	83166	83175	20 %	20 %	40 %	20 %	14600457
50	NC_000854	CCTCA	2	10	83397	83406	20 %	20 %	0 %	60 %	14600458
51	NC_000854	TTGCT	2	10	83704	83713	0 %	60 %	20 %	20 %	14600458
52	NC_000854	GCATA	2	10	87281	87290	40 %	20 %	20 %	20 %	118430887
53	NC_000854	CAGAG	2	10	89633	89642	40 %	0 %	40 %	20 %	14600463
54	NC_000854	GAGCC	2	10	90582	90591	20 %	0 %	40 %	40 %	14600464
55	NC_000854	AGGCG	2	10	91077	91086	20 %	0 %	60 %	20 %	118430889
56	NC_000854	CTATG	2	10	92581	92590	20 %	40 %	20 %	20 %	118430890
57	NC_000854	TACCC	2	10	95401	95410	20 %	20 %	0 %	60 %	14600469
58	NC_000854	GAACA	2	10	96079	96088	60 %	0 %	20 %	20 %	118430892
59	NC_000854	AGTCG	2	10	97496	97505	20 %	20 %	40 %	20 %	118430893
60	NC_000854	GTCTT	2	10	101418	101427	0 %	60 %	20 %	20 %	118430897
61	NC_000854	GAGGG	2	10	102578	102587	20 %	0 %	80 %	0 %	14600477
62	NC_000854	AAGCA	2	10	108142	108151	60 %	0 %	20 %	20 %	14600482
63	NC_000854	AGGCA	2	10	108537	108546	40 %	0 %	40 %	20 %	14600482
64	NC_000854	GATAA	2	10	110866	110875	60 %	20 %	20 %	0 %	118430904
65	NC_000854	ATGGA	2	10	113077	113086	40 %	20 %	40 %	0 %	118430906
66	NC_000854	CCCTG	2	10	115408	115417	0 %	20 %	20 %	60 %	14600490
67	NC_000854	GAGTA	2	10	119722	119731	40 %	20 %	40 %	0 %	14600495
68	NC_000854	ACCTC	2	10	123365	123374	20 %	20 %	0 %	60 %	118430913
69	NC_000854	AGCCT	2	10	123872	123881	20 %	20 %	20 %	40 %	118430913
70	NC_000854	GAAGG	2	10	125341	125350	40 %	0 %	60 %	0 %	14600500
71	NC_000854	GGCGT	2	10	128154	128163	0 %	20 %	60 %	20 %	118430917
72	NC_000854	GCCCC	2	10	128514	128523	0 %	0 %	20 %	80 %	118430918
73	NC_000854	AGGGT	2	10	130567	130576	20 %	20 %	60 %	0 %	118430919
74	NC_000854	GTTGA	2	10	133184	133193	20 %	40 %	40 %	0 %	14600510
75	NC_000854	TCCTC	2	10	133606	133615	0 %	40 %	0 %	60 %	14600511
76	NC_000854	GAGGG	2	10	134986	134995	20 %	0 %	80 %	0 %	118430921
77	NC_000854	CTCTT	2	10	136640	136649	0 %	60 %	0 %	40 %	118430923
78	NC_000854	AGGCG	2	10	137522	137531	20 %	0 %	60 %	20 %	14600516
79	NC_000854	AGCAC	2	10	139029	139038	40 %	0 %	20 %	40 %	118430924
80	NC_000854	GTGAG	2	10	141422	141431	20 %	20 %	60 %	0 %	118430925
81	NC_000854	CCCTC	2	10	145744	145753	0 %	20 %	0 %	80 %	118430929
82	NC_000854	AGGGT	2	10	146358	146367	20 %	20 %	60 %	0 %	118430929
83	NC_000854	GAGTC	2	10	147219	147228	20 %	20 %	40 %	20 %	14600524
84	NC_000854	TAAGA	2	10	147361	147370	60 %	20 %	20 %	0 %	14600524
85	NC_000854	AGGAG	2	10	149676	149685	40 %	0 %	60 %	0 %	118430932
86	NC_000854	AGAGG	2	10	151498	151507	40 %	0 %	60 %	0 %	14600529
87	NC_000854	GAGGG	2	10	151690	151699	20 %	0 %	80 %	0 %	14600530
88	NC_000854	GCCTA	2	10	151929	151938	20 %	20 %	20 %	40 %	14600530
89	NC_000854	CCCTC	2	10	153532	153541	0 %	20 %	0 %	80 %	118430934
90	NC_000854	TAGAT	2	10	153558	153567	40 %	40 %	20 %	0 %	118430934
91	NC_000854	TGAGA	2	10	154138	154147	40 %	20 %	40 %	0 %	118430935
92	NC_000854	AAACC	2	10	155714	155723	60 %	0 %	0 %	40 %	118430936
93	NC_000854	CCCTC	2	10	155983	155992	0 %	20 %	0 %	80 %	118430937
94	NC_000854	CTACC	2	10	157103	157112	20 %	20 %	0 %	60 %	118430939
95	NC_000854	ACCCT	2	10	157522	157531	20 %	20 %	0 %	60 %	118430939
96	NC_000854	ACCCT	2	10	158492	158501	20 %	20 %	0 %	60 %	14600539
97	NC_000854	AGGAG	2	10	161447	161456	40 %	0 %	60 %	0 %	118430940
98	NC_000854	CCCTC	2	10	162958	162967	0 %	20 %	0 %	80 %	118430942
99	NC_000854	GGCAG	2	10	163013	163022	20 %	0 %	60 %	20 %	118430942
100	NC_000854	GCCGC	2	10	166594	166603	0 %	0 %	40 %	60 %	118430945
101	NC_000854	TCCGC	2	10	167231	167240	0 %	20 %	20 %	60 %	118430945
102	NC_000854	TATGT	2	10	167985	167994	20 %	60 %	20 %	0 %	14600549
103	NC_000854	TAAAG	2	10	169372	169381	60 %	20 %	20 %	0 %	14600551
104	NC_000854	CCCTG	2	10	171407	171416	0 %	20 %	20 %	60 %	118430947
105	NC_000854	CCTAT	2	10	175570	175579	20 %	40 %	0 %	40 %	14600560
106	NC_000854	CCGGG	2	10	175859	175868	0 %	0 %	60 %	40 %	14600560
107	NC_000854	CCGTG	2	10	177259	177268	0 %	20 %	40 %	40 %	118430952
108	NC_000854	GAGGG	2	10	179230	179239	20 %	0 %	80 %	0 %	118430954
109	NC_000854	GGGAG	2	10	179583	179592	20 %	0 %	80 %	0 %	118430954
110	NC_000854	ACTCT	2	10	180984	180993	20 %	40 %	0 %	40 %	14600565
111	NC_000854	CTGGG	2	10	182140	182149	0 %	20 %	60 %	20 %	14600566
112	NC_000854	GAGGC	2	10	182700	182709	20 %	0 %	60 %	20 %	118430955
113	NC_000854	ACCCT	2	10	182760	182769	20 %	20 %	0 %	60 %	118430955
114	NC_000854	CCCTA	2	10	185182	185191	20 %	20 %	0 %	60 %	118430957
115	NC_000854	GCGAG	2	10	187676	187685	20 %	0 %	60 %	20 %	118430959
116	NC_000854	TGGCC	2	10	188420	188429	0 %	20 %	40 %	40 %	14600575
117	NC_000854	TCTAC	2	10	193023	193032	20 %	40 %	0 %	40 %	14600580
118	NC_000854	GGCGA	2	10	197386	197395	20 %	0 %	60 %	20 %	118430964
119	NC_000854	TCCTC	2	10	200853	200862	0 %	40 %	0 %	60 %	118430968
120	NC_000854	TGATT	2	10	205361	205370	20 %	60 %	20 %	0 %	118430974
121	NC_000854	AGAGG	2	10	207961	207970	40 %	0 %	60 %	0 %	118430976
122	NC_000854	ACACC	2	10	208496	208505	40 %	0 %	0 %	60 %	118430976
123	NC_000854	ATGTA	2	10	210100	210109	40 %	40 %	20 %	0 %	14600601
124	NC_000854	CTCCA	2	10	215941	215950	20 %	20 %	0 %	60 %	118430983
125	NC_000854	CTCTT	2	10	217111	217120	0 %	60 %	0 %	40 %	118430984
126	NC_000854	ACCTC	2	10	217619	217628	20 %	20 %	0 %	60 %	118430985
127	NC_000854	CTTCT	2	10	219778	219787	0 %	60 %	0 %	40 %	14600616
128	NC_000854	TATAT	2	10	220512	220521	40 %	60 %	0 %	0 %	14600616
129	NC_000854	GCTCA	2	10	221445	221454	20 %	20 %	20 %	40 %	118430987
130	NC_000854	GTGAT	2	10	223656	223665	20 %	40 %	40 %	0 %	118430988
131	NC_000854	GGTGC	2	10	224375	224384	0 %	20 %	60 %	20 %	118430988
132	NC_000854	GGTCT	2	10	225963	225972	0 %	40 %	40 %	20 %	118430989
133	NC_000854	GGAGA	2	10	226654	226663	40 %	0 %	60 %	0 %	118430990
134	NC_000854	AGAGG	2	10	226711	226720	40 %	0 %	60 %	0 %	118430990
135	NC_000854	TGGAG	2	10	227543	227552	20 %	20 %	60 %	0 %	14600622
136	NC_000854	AGGCT	2	10	227663	227672	20 %	20 %	40 %	20 %	14600622
137	NC_000854	CGTCA	2	10	230361	230370	20 %	20 %	20 %	40 %	118430993
138	NC_000854	CATCT	2	10	232763	232772	20 %	40 %	0 %	40 %	14600627
139	NC_000854	GTCTG	2	10	233421	233430	0 %	40 %	40 %	20 %	118430996
140	NC_000854	CCTCT	2	10	236620	236629	0 %	40 %	0 %	60 %	118430998
141	NC_000854	CCCTT	2	10	237239	237248	0 %	40 %	0 %	60 %	118430998
142	NC_000854	GGGCT	2	10	242822	242831	0 %	20 %	60 %	20 %	118431002
143	NC_000854	CCAGC	2	10	248521	248530	20 %	0 %	20 %	60 %	118431006
144	NC_000854	CCCTC	2	10	250738	250747	0 %	20 %	0 %	80 %	14600647
145	NC_000854	GGGCC	2	10	256408	256417	0 %	0 %	60 %	40 %	118431012
146	NC_000854	CGTGC	2	10	257660	257669	0 %	20 %	40 %	40 %	118431013
147	NC_000854	TGTTA	2	10	258873	258882	20 %	60 %	20 %	0 %	14600662
148	NC_000854	TCCCC	2	10	261155	261164	0 %	20 %	0 %	80 %	14600666
149	NC_000854	TCCTC	2	10	262303	262312	0 %	40 %	0 %	60 %	118431016
150	NC_000854	GTAGG	2	10	263218	263227	20 %	20 %	60 %	0 %	14600669
151	NC_000854	GTATG	2	10	264576	264585	20 %	40 %	40 %	0 %	14600670
152	NC_000854	CCCTG	2	10	265088	265097	0 %	20 %	20 %	60 %	14600670
153	NC_000854	GTGCC	2	10	265879	265888	0 %	20 %	40 %	40 %	14600670
154	NC_000854	CCGGC	2	10	267592	267601	0 %	0 %	40 %	60 %	14602188
155	NC_000854	TGGAG	2	10	269725	269734	20 %	20 %	60 %	0 %	14600674
156	NC_000854	CAGCA	2	10	269857	269866	40 %	0 %	20 %	40 %	14600674
157	NC_000854	AGGCC	2	10	270725	270734	20 %	0 %	40 %	40 %	118431019
158	NC_000854	TATCC	2	10	273464	273473	20 %	40 %	0 %	40 %	14600678
159	NC_000854	CCATC	2	10	273532	273541	20 %	20 %	0 %	60 %	14600678
160	NC_000854	GGGGT	2	10	273687	273696	0 %	20 %	80 %	0 %	14600678
161	NC_000854	AGAGA	2	10	273881	273890	60 %	0 %	40 %	0 %	14600678
162	NC_000854	CCTCC	2	10	275088	275097	0 %	20 %	0 %	80 %	118431020
163	NC_000854	GGCGG	2	10	277458	277467	0 %	0 %	80 %	20 %	118431022
164	NC_000854	CCTCT	2	10	284628	284637	0 %	40 %	0 %	60 %	14600689
165	NC_000854	AATTA	2	10	285003	285012	60 %	40 %	0 %	0 %	14600689
166	NC_000854	GGATT	2	10	287198	287207	20 %	40 %	40 %	0 %	14600689
167	NC_000854	TTCTC	2	10	289520	289529	0 %	60 %	0 %	40 %	14600691
168	NC_000854	TCCCC	2	10	289861	289870	0 %	20 %	0 %	80 %	14600691
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170	NC_000854	AGCCA	2	10	292837	292846	40 %	0 %	20 %	40 %	118431030
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174	NC_000854	AGCCT	2	10	301964	301973	20 %	20 %	20 %	40 %	118431040
175	NC_000854	ACGCC	2	10	304469	304478	20 %	0 %	20 %	60 %	14600705
176	NC_000854	GGGGA	2	10	312102	312111	20 %	0 %	80 %	0 %	14600718
177	NC_000854	GGCCG	2	10	314866	314875	0 %	0 %	60 %	40 %	14600721
178	NC_000854	CAGGC	2	10	316953	316962	20 %	0 %	40 %	40 %	14600724
179	NC_000854	CCCAG	2	10	317542	317551	20 %	0 %	20 %	60 %	14600724
180	NC_000854	GCTAG	2	10	328366	328375	20 %	20 %	40 %	20 %	118431063
181	NC_000854	AGAGT	2	10	329927	329936	40 %	20 %	40 %	0 %	118431066
182	NC_000854	TTTTA	2	10	329969	329978	20 %	80 %	0 %	0 %	118431066
183	NC_000854	GTCGC	2	10	330947	330956	0 %	20 %	40 %	40 %	118431068
184	NC_000854	CGGTC	2	10	333115	333124	0 %	20 %	40 %	40 %	118431070
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191	NC_000854	CCTCT	2	10	344501	344510	0 %	40 %	0 %	60 %	118431078
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197	NC_000854	GCGAG	2	10	350544	350553	20 %	0 %	60 %	20 %	118431082
198	NC_000854	GTGCT	2	10	352317	352326	0 %	40 %	40 %	20 %	118431084
199	NC_000854	CCCCA	2	10	356918	356927	20 %	0 %	0 %	80 %	118431088
200	NC_000854	ACGCC	2	10	359631	359640	20 %	0 %	20 %	60 %	118431090
201	NC_000854	GGATA	2	10	360253	360262	40 %	20 %	40 %	0 %	118431090
202	NC_000854	CTTAT	2	10	364067	364076	20 %	60 %	0 %	20 %	14600782
203	NC_000854	CCCAG	2	10	365278	365287	20 %	0 %	20 %	60 %	118431093
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205	NC_000854	GCCTA	2	10	366354	366363	20 %	20 %	20 %	40 %	118431095
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209	NC_000854	AGAGG	2	10	370322	370331	40 %	0 %	60 %	0 %	118431097
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213	NC_000854	AGGCT	2	10	373007	373016	20 %	20 %	40 %	20 %	118431100
214	NC_000854	GGCTG	2	10	373048	373057	0 %	20 %	60 %	20 %	118431100
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219	NC_000854	TAGCC	2	10	382269	382278	20 %	20 %	20 %	40 %	118431107
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222	NC_000854	CCCAG	2	10	388349	388358	20 %	0 %	20 %	60 %	118431110
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227	NC_000854	CGATG	2	10	403462	403471	20 %	20 %	40 %	20 %	14600828
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231	NC_000854	CGCTC	2	10	412988	412997	0 %	20 %	20 %	60 %	118431124
232	NC_000854	GATCT	2	10	413850	413859	20 %	40 %	20 %	20 %	118431124
233	NC_000854	GTGGG	2	10	417141	417150	0 %	20 %	80 %	0 %	118431125
234	NC_000854	GCCTG	2	10	420099	420108	0 %	20 %	40 %	40 %	118431127
235	NC_000854	GGCTC	2	10	422595	422604	0 %	20 %	40 %	40 %	118431127
236	NC_000854	TATAG	2	10	423364	423373	40 %	40 %	20 %	0 %	118431127
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238	NC_000854	GGTAC	2	10	427740	427749	20 %	20 %	40 %	20 %	118431131
239	NC_000854	GGGCC	2	10	430919	430928	0 %	0 %	60 %	40 %	118431133
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241	NC_000854	GGGTA	2	10	434455	434464	20 %	20 %	60 %	0 %	14600860
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244	NC_000854	GGAGA	2	10	435836	435845	40 %	0 %	60 %	0 %	118431135
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247	NC_000854	TTCTC	2	10	440075	440084	0 %	60 %	0 %	40 %	118431139
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249	NC_000854	CCCTC	2	10	441140	441149	0 %	20 %	0 %	80 %	118431140
250	NC_000854	TGCCA	2	10	441459	441468	20 %	20 %	20 %	40 %	118431140
251	NC_000854	GGCGT	2	10	446097	446106	0 %	20 %	60 %	20 %	14600877
252	NC_000854	CTGAG	2	10	446181	446190	20 %	20 %	40 %	20 %	14600877
253	NC_000854	GGCTG	2	10	446439	446448	0 %	20 %	60 %	20 %	14600877
254	NC_000854	GGGGT	2	10	447609	447618	0 %	20 %	80 %	0 %	14600879
255	NC_000854	AGGCT	2	10	450704	450713	20 %	20 %	40 %	20 %	118431146
256	NC_000854	GGCCT	2	10	451645	451654	0 %	20 %	40 %	40 %	118431146
257	NC_000854	CCTCC	2	10	453650	453659	0 %	20 %	0 %	80 %	118431148
258	NC_000854	GCCCC	2	10	455103	455112	0 %	0 %	20 %	80 %	118431149
259	NC_000854	GCCTC	2	10	457104	457113	0 %	20 %	20 %	60 %	118431153
260	NC_000854	AGAGG	2	10	460060	460069	40 %	0 %	60 %	0 %	14600894
261	NC_000854	AGGCG	2	10	466986	466995	20 %	0 %	60 %	20 %	118431157
262	NC_000854	CTGGC	2	10	467285	467294	0 %	20 %	40 %	40 %	14600904
263	NC_000854	TCTCC	2	10	469525	469534	0 %	40 %	0 %	60 %	118431159
264	NC_000854	GTGCC	2	10	470859	470868	0 %	20 %	40 %	40 %	118431160
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