MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Coding Repeats of Aeropyrum pernix K1

Total Repeats: 904

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_000854	GGCGA	2	10	898339	898348	20 %	0 %	60 %	20 %	118431445
502	NC_000854	GCTAG	2	10	901162	901171	20 %	20 %	40 %	20 %	118431448
503	NC_000854	GGCTA	2	10	901410	901419	20 %	20 %	40 %	20 %	118431448
504	NC_000854	TGGCT	2	10	902173	902182	0 %	40 %	40 %	20 %	118431448
505	NC_000854	ACCTC	2	10	904635	904644	20 %	20 %	0 %	60 %	118431450
506	NC_000854	CCCAA	2	10	908333	908342	40 %	0 %	0 %	60 %	14601399
507	NC_000854	CAGCC	2	10	908688	908697	20 %	0 %	20 %	60 %	118431453
508	NC_000854	ACTCC	2	10	909969	909978	20 %	20 %	0 %	60 %	14601403
509	NC_000854	CTGCT	2	10	910628	910637	0 %	40 %	20 %	40 %	14601403
510	NC_000854	CGGCG	2	10	910912	910921	0 %	0 %	60 %	40 %	14601403
511	NC_000854	TTGGG	2	10	911280	911289	0 %	40 %	60 %	0 %	14601403
512	NC_000854	CGCCT	2	10	912833	912842	0 %	20 %	20 %	60 %	118431455
513	NC_000854	GTATG	2	10	913061	913070	20 %	40 %	40 %	0 %	118431456
514	NC_000854	GCCGC	2	10	913675	913684	0 %	0 %	40 %	60 %	118431456
515	NC_000854	CGCCT	2	10	913955	913964	0 %	20 %	20 %	60 %	118431456
516	NC_000854	CTCTC	2	10	914658	914667	0 %	40 %	0 %	60 %	118431458
517	NC_000854	GCATG	2	10	920896	920905	20 %	20 %	40 %	20 %	118431461
518	NC_000854	GCCTT	2	10	922651	922660	0 %	40 %	20 %	40 %	14601417
519	NC_000854	TCGCT	2	10	928655	928664	0 %	40 %	20 %	40 %	118431465
520	NC_000854	GCATT	2	10	929383	929392	20 %	40 %	20 %	20 %	14601422
521	NC_000854	CATAG	2	10	929393	929402	40 %	20 %	20 %	20 %	14601422
522	NC_000854	CTAGC	2	10	929959	929968	20 %	20 %	20 %	40 %	14601422
523	NC_000854	ACGGG	2	10	932273	932282	20 %	0 %	60 %	20 %	14601424
524	NC_000854	ATACG	2	10	934689	934698	40 %	20 %	20 %	20 %	118431467
525	NC_000854	AGTAT	2	10	935399	935408	40 %	40 %	20 %	0 %	14601428
526	NC_000854	TCCTC	2	10	935531	935540	0 %	40 %	0 %	60 %	14601428
527	NC_000854	TCCTC	2	10	936558	936567	0 %	40 %	0 %	60 %	118431469
528	NC_000854	AAGCC	2	10	937566	937575	40 %	0 %	20 %	40 %	118431469
529	NC_000854	TCGAA	2	10	937728	937737	40 %	20 %	20 %	20 %	118431469
530	NC_000854	GCTGG	2	10	941610	941619	0 %	20 %	60 %	20 %	118431473
531	NC_000854	CGGGG	2	10	943374	943383	0 %	0 %	80 %	20 %	118431474
532	NC_000854	GGAGC	2	10	945254	945263	20 %	0 %	60 %	20 %	118431476
533	NC_000854	AGTGA	2	10	949179	949188	40 %	20 %	40 %	0 %	14601442
534	NC_000854	GGATG	2	10	953289	953298	20 %	20 %	60 %	0 %	118431483
535	NC_000854	AGGCA	2	10	954100	954109	40 %	0 %	40 %	20 %	118431484
536	NC_000854	GAGGG	2	10	955382	955391	20 %	0 %	80 %	0 %	118431485
537	NC_000854	CAGCC	2	10	956207	956216	20 %	0 %	20 %	60 %	118431486
538	NC_000854	CGTGG	2	10	958927	958936	0 %	20 %	60 %	20 %	14601456
539	NC_000854	CTCTC	2	10	962467	962476	0 %	40 %	0 %	60 %	118431492
540	NC_000854	TCCTG	2	10	963889	963898	0 %	40 %	20 %	40 %	14601461
541	NC_000854	GCGAT	2	10	965516	965525	20 %	20 %	40 %	20 %	118431494
542	NC_000854	GTAGG	2	10	966331	966340	20 %	20 %	60 %	0 %	118431496
543	NC_000854	CTCCC	2	10	966377	966386	0 %	20 %	0 %	80 %	118431496
544	NC_000854	GCCTG	2	10	967565	967574	0 %	20 %	40 %	40 %	118431496
545	NC_000854	GCCTA	2	10	968162	968171	20 %	20 %	20 %	40 %	118431497
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547	NC_000854	CCTCC	2	10	972406	972415	0 %	20 %	0 %	80 %	118431500
548	NC_000854	GCCTG	2	10	972822	972831	0 %	20 %	40 %	40 %	14601473
549	NC_000854	GGCTC	2	10	973538	973547	0 %	20 %	40 %	40 %	14601473
550	NC_000854	CAGGA	2	10	975239	975248	40 %	0 %	40 %	20 %	118431501
551	NC_000854	TCTCC	2	10	975882	975891	0 %	40 %	0 %	60 %	118431502
552	NC_000854	TAGCC	2	10	976870	976879	20 %	20 %	20 %	40 %	118431502
553	NC_000854	GCCTG	2	10	977325	977334	0 %	20 %	40 %	40 %	118431502
554	NC_000854	GCGGG	2	10	978698	978707	0 %	0 %	80 %	20 %	118431503
555	NC_000854	ATATC	2	10	983905	983914	40 %	40 %	0 %	20 %	14601483
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557	NC_000854	AGGAT	2	10	987113	987122	40 %	20 %	40 %	0 %	118431510
558	NC_000854	GACTA	2	10	987598	987607	40 %	20 %	20 %	20 %	14601486
559	NC_000854	TCTAG	2	10	989296	989305	20 %	40 %	20 %	20 %	118431513
560	NC_000854	CCAAG	2	10	991791	991800	40 %	0 %	20 %	40 %	14601492
561	NC_000854	TAGGG	2	10	993359	993368	20 %	20 %	60 %	0 %	118431515
562	NC_000854	TAGGT	2	10	993589	993598	20 %	40 %	40 %	0 %	118431515
563	NC_000854	AGTAG	2	10	995580	995589	40 %	20 %	40 %	0 %	14601494
564	NC_000854	AAGAA	2	10	996552	996561	80 %	0 %	20 %	0 %	118431516
565	NC_000854	CGCTG	2	10	997760	997769	0 %	20 %	40 %	40 %	14601496
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574	NC_000854	GATAG	2	10	1019115	1019124	40 %	20 %	40 %	0 %	118431530
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580	NC_000854	GCCCT	2	10	1025180	1025189	0 %	20 %	20 %	60 %	118431534
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585	NC_000854	GCCCT	2	10	1029553	1029562	0 %	20 %	20 %	60 %	118431535
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589	NC_000854	GGCTA	2	10	1034751	1034760	20 %	20 %	40 %	20 %	118431537
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597	NC_000854	GCCCC	2	10	1054207	1054216	0 %	0 %	20 %	80 %	118431550
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599	NC_000854	GCCCT	2	10	1055263	1055272	0 %	20 %	20 %	60 %	118431550
600	NC_000854	TCCTC	2	10	1056383	1056392	0 %	40 %	0 %	60 %	14601549
601	NC_000854	AGCCT	2	10	1057324	1057333	20 %	20 %	20 %	40 %	14601550
602	NC_000854	CAAGC	2	10	1059457	1059466	40 %	0 %	20 %	40 %	118431552
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611	NC_000854	GACAT	2	10	1070206	1070215	40 %	20 %	20 %	20 %	14601565
612	NC_000854	GCCTA	2	10	1070588	1070597	20 %	20 %	20 %	40 %	118431561
613	NC_000854	AGGCT	2	10	1072004	1072013	20 %	20 %	40 %	20 %	118431562
614	NC_000854	GCGGA	2	10	1073078	1073087	20 %	0 %	60 %	20 %	14601569
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616	NC_000854	GCTAG	2	10	1075595	1075604	20 %	20 %	40 %	20 %	14601571
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622	NC_000854	GCCCA	2	10	1085217	1085226	20 %	0 %	20 %	60 %	118431565
623	NC_000854	AGCAT	2	10	1086768	1086777	40 %	20 %	20 %	20 %	14601583
624	NC_000854	TCGAG	2	10	1091049	1091058	20 %	20 %	40 %	20 %	14601587
625	NC_000854	ATGCA	2	10	1092387	1092396	40 %	20 %	20 %	20 %	14601587
626	NC_000854	CCTAC	2	10	1092520	1092529	20 %	20 %	0 %	60 %	14601587
627	NC_000854	GTACC	2	10	1093008	1093017	20 %	20 %	20 %	40 %	118431569
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629	NC_000854	AGGGT	2	10	1094051	1094060	20 %	20 %	60 %	0 %	14601589
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883	NC_000854	CCTCC	2	10	1624041	1624050	0 %	20 %	0 %	80 %	118431922
884	NC_000854	TCGTC	2	10	1626139	1626148	0 %	40 %	20 %	40 %	118431923
885	NC_000854	GCTGG	2	10	1627632	1627641	0 %	20 %	60 %	20 %	118431923
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887	NC_000854	GTAAG	2	10	1634394	1634403	40 %	20 %	40 %	0 %	118431927
888	NC_000854	ATCCT	2	10	1636709	1636718	20 %	40 %	0 %	40 %	14602153
889	NC_000854	ACGCC	2	10	1637025	1637034	20 %	0 %	20 %	60 %	14602153
890	NC_000854	AGCAC	2	10	1637263	1637272	40 %	0 %	20 %	40 %	14602153
891	NC_000854	TCACC	2	10	1639286	1639295	20 %	20 %	0 %	60 %	118431929
892	NC_000854	CTCAT	2	10	1639995	1640004	20 %	40 %	0 %	40 %	118431929
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895	NC_000854	GCCGT	2	10	1643016	1643025	0 %	20 %	40 %	40 %	118431930
896	NC_000854	CCTCC	2	10	1650158	1650167	0 %	20 %	0 %	80 %	118431933
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902	NC_000854	GCCTC	2	10	1663868	1663877	0 %	20 %	20 %	60 %	118431941
903	NC_000854	GACCC	2	10	1665333	1665342	20 %	0 %	20 %	60 %	118431942
904	NC_000854	CCAAG	2	10	1665499	1665508	40 %	0 %	20 %	40 %	118431942

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