MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Shewanella putrefaciens 200 chromosome

Total Repeats: 215

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017566	AGATTA	2	12	19608	19619	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017566	CTAATG	2	12	30562	30573	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017566	TGAAGG	2	12	41793	41804	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017566	TGCTAT	2	12	57042	57053	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_017566	ATTCTG	2	12	64534	64545	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017566	GATAGT	2	12	69187	69198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017566	GCATTC	2	12	109767	109778	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017566	GTTAGA	2	12	125034	125045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017566	CTGTGG	2	12	130381	130392	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_017566	GTTTGC	2	12	176095	176106	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_017566	AGCCTT	2	12	207054	207065	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017566	TCTTTT	2	12	216255	216266	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017566	TGAAGG	2	12	219829	219840	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017566	AAATGA	2	12	221977	221988	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017566	AATTGA	2	12	222187	222198	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017566	ATATAA	2	12	305138	305149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017566	CATTTA	2	12	360848	360859	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_017566	TGCTGT	2	12	364236	364247	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_017566	CTTTTT	2	12	367648	367659	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_017566	TGAAGG	2	12	394100	394111	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017566	TGAAGG	2	12	469967	469978	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017566	CTTTTG	2	12	504009	504020	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_017566	GTTATT	2	12	599805	599816	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017566	ATCAAA	2	12	627288	627299	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_017566	TATTCA	2	12	653430	653441	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017566	AAACAA	2	12	653702	653713	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_017566	CAGAGC	2	12	693638	693649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017566	CTTGCT	2	12	694315	694326	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017566	AAAGGG	2	12	752046	752057	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017566	CACCCC	2	12	759993	760004	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
31	NC_017566	ACAATG	2	12	763621	763632	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_017566	CAACAC	2	12	776247	776258	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017566	CGATAA	2	12	796172	796183	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_017566	ACAAAC	2	12	808384	808395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017566	CACTTA	2	12	817683	817694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017566	GATCAG	2	12	858772	858783	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_017566	CTACAC	8	48	859067	859114	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017566	ATTGAT	2	12	864394	864405	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017566	ACGATA	2	12	908103	908114	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017566	TCCATA	2	12	924231	924242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017566	TTCATA	2	12	943413	943424	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_017566	AGATCC	2	12	949010	949021	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017566	TTAATA	2	12	954539	954550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017566	CATCTA	2	12	959665	959676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017566	TAAAAG	2	12	964597	964608	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017566	TAGCTA	2	12	983648	983659	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_017566	AAAGTA	2	12	1003552	1003563	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017566	TTTGAT	2	12	1018352	1018363	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017566	AATGAT	2	12	1071399	1071410	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017566	AGCACT	2	12	1087734	1087745	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017566	TGAATT	2	12	1092296	1092307	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017566	AGCACC	2	12	1130054	1130065	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017566	AGCACC	2	12	1130209	1130220	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017566	GCATTA	2	12	1136044	1136055	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_017566	TGAAGG	2	12	1141335	1141346	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017566	TTTATT	2	12	1177436	1177447	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017566	ATAAAA	2	12	1208985	1208996	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017566	TTTTTA	2	12	1215131	1215142	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017566	TAAAGT	2	12	1224382	1224393	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017566	CCGATA	2	12	1267057	1267068	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017566	ACGTTA	2	12	1278563	1278574	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_017566	TTAGTT	2	12	1365962	1365973	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017566	TTTGAT	2	12	1372668	1372679	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017566	TTACAG	2	12	1375530	1375541	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_017566	ACGTAA	2	12	1386617	1386628	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_017566	TTTATA	2	12	1392861	1392872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017566	TTTTGG	2	12	1422453	1422464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017566	TCTGTA	2	12	1427069	1427080	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_017566	AAAATG	2	12	1430096	1430107	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017566	ATTTTG	2	12	1494022	1494033	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017566	CAACCG	2	12	1506717	1506728	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
72	NC_017566	GCATCG	2	12	1511502	1511513	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017566	TAGCGC	2	12	1512275	1512286	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017566	ACGGTC	2	12	1513115	1513126	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017566	AATCAA	2	12	1566070	1566081	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_017566	CCGCTA	2	12	1566424	1566435	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017566	TTAGCT	2	12	1569256	1569267	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_017566	TTTACG	2	12	1580572	1580583	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_017566	CAAGTG	2	12	1603281	1603292	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_017566	AAGAGC	2	12	1630535	1630546	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_017566	GCTTTT	2	12	1653526	1653537	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_017566	TACTTT	2	12	1654895	1654906	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_017566	TTTCTA	2	12	1684599	1684610	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_017566	TTTTTA	2	12	1687747	1687758	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017566	TATTTT	2	12	1687963	1687974	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017566	AAAATA	2	12	1701723	1701734	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017566	AGGTAC	2	12	1735984	1735995	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_017566	GTTTTT	2	12	1749075	1749086	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017566	TTTGTT	2	12	1757117	1757128	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017566	GTTAAT	2	12	1789086	1789097	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017566	GATAAA	2	12	1795881	1795892	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017566	TGTTTT	2	12	1807740	1807751	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017566	TATTTT	2	12	1820294	1820305	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017566	CGTTAG	2	12	1827663	1827674	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_017566	TATTTA	2	12	1842227	1842238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017566	TCATTG	2	12	1855491	1855502	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_017566	ATCGCT	2	12	1860319	1860330	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017566	CAATAT	2	12	1860880	1860891	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_017566	GTAAAG	2	12	1866251	1866262	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017566	TGATTA	2	12	1894986	1894997	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017566	ATAACC	2	12	1925787	1925798	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017566	TATTGA	2	12	1943204	1943215	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017566	GTAAAG	2	12	1982035	1982046	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017566	TTTATG	2	12	1986795	1986806	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017566	GTTATT	2	12	1986852	1986863	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017566	GATCGC	2	12	2204645	2204656	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017566	CGTGAT	2	12	2245127	2245138	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_017566	AATATA	2	12	2268923	2268934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017566	ATCAAA	2	12	2269347	2269358	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_017566	TAAAAG	2	12	2301412	2301423	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017566	CTGAAA	2	12	2370833	2370844	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_017566	AAAAGC	2	12	2382779	2382790	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_017566	CAGCAA	2	12	2430342	2430353	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017566	CCTTTA	2	12	2445335	2445346	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017566	ACTAGC	2	12	2459596	2459607	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017566	ATCCAG	2	12	2479496	2479507	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017566	TTGTTT	2	12	2495763	2495774	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017566	AACGCT	2	12	2515139	2515150	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017566	AAAATA	2	12	2523476	2523487	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017566	TTACGT	2	12	2577228	2577239	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_017566	TCCCAT	2	12	2609830	2609841	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_017566	TTGCAA	2	12	2705631	2705642	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_017566	CCTTCA	2	12	2717713	2717724	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017566	TTTTAA	2	12	2729284	2729295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017566	AAAAAT	2	12	2749435	2749446	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017566	ACATAC	2	12	2809229	2809240	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017566	TTGTTT	2	12	2843685	2843696	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017566	CTCTAT	2	12	2868275	2868286	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017566	TAAAAA	2	12	2888250	2888261	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017566	TTGAAT	2	12	2933922	2933933	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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132	NC_017566	TTAGAT	2	12	2992435	2992446	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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149	NC_017566	CTTAAT	2	12	3342089	3342100	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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154	NC_017566	TCCCTT	2	12	3427005	3427016	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
155	NC_017566	AAAATA	2	12	3448027	3448038	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_017566	CTTTGC	2	12	3455740	3455751	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_017566	TTAAAA	2	12	3463777	3463788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.