MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella putrefaciens 200 chromosome

Total Repeats: 14561

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017566	A	6	6	1026463	1026468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_017566	ATT	2	6	1026470	1026475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_017566	ATTT	2	8	1026488	1026495	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_017566	GTA	2	6	1026562	1026567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_017566	A	7	7	1026593	1026599	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_017566	TGA	2	6	1026603	1026608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_017566	AAT	2	6	1026670	1026675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_017566	TA	4	8	1026679	1026686	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_017566	TGA	2	6	1026708	1026713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_017566	TAA	2	6	1026719	1026724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_017566	A	6	6	1026752	1026757	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_017566	T	6	6	1026795	1026800	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_017566	ATT	2	6	1026803	1026808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_017566	GT	3	6	1026858	1026863	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_017566	TG	3	6	1029607	1029612	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_017566	TTGA	2	8	1029658	1029665	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_017566	TTG	2	6	1031163	1031168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_017566	GCT	2	6	1031215	1031220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3019	NC_017566	AAGG	2	8	1031227	1031234	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_017566	TTA	2	6	1032584	1032589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_017566	GCC	2	6	1032608	1032613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3022	NC_017566	GGC	2	6	1032630	1032635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3023	NC_017566	T	6	6	1032636	1032641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_017566	TTG	2	6	1035944	1035949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_017566	A	6	6	1036018	1036023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_017566	TAA	2	6	1037932	1037937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_017566	TGA	2	6	1037955	1037960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_017566	CTG	2	6	1038361	1038366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3029	NC_017566	ATTTG	2	10	1039661	1039670	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_017566	TTA	2	6	1039691	1039696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_017566	ATTT	2	8	1039705	1039712	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_017566	CAT	2	6	1040298	1040303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3033	NC_017566	GAA	2	6	1040360	1040365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_017566	T	9	9	1040381	1040389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_017566	AAAT	2	8	1040391	1040398	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_017566	TAA	2	6	1040416	1040421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_017566	ATT	2	6	1040442	1040447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_017566	GC	3	6	1042776	1042781	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3039	NC_017566	CTT	2	6	1047489	1047494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3040	NC_017566	AGT	2	6	1048863	1048868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_017566	T	7	7	1050198	1050204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_017566	TTA	2	6	1050214	1050219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_017566	TCTA	2	8	1051429	1051436	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3044	NC_017566	TTA	2	6	1051478	1051483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_017566	CTTT	2	8	1051516	1051523	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3046	NC_017566	GTT	2	6	1051531	1051536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_017566	T	6	6	1051541	1051546	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_017566	TGT	2	6	1051561	1051566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_017566	TGT	2	6	1051622	1051627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_017566	TCA	2	6	1053666	1053671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3051	NC_017566	GT	3	6	1053721	1053726	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_017566	TA	3	6	1053750	1053755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_017566	GGA	2	6	1053771	1053776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_017566	TCA	2	6	1054883	1054888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3055	NC_017566	TAA	2	6	1055836	1055841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_017566	TCCC	2	8	1055876	1055883	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3057	NC_017566	TTGA	2	8	1058590	1058597	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_017566	TA	3	6	1058640	1058645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_017566	CAT	2	6	1058651	1058656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3060	NC_017566	TGTA	2	8	1059250	1059257	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_017566	AAC	2	6	1059315	1059320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3062	NC_017566	TAG	2	6	1059323	1059328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_017566	TAAAT	2	10	1059382	1059391	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_017566	AAT	2	6	1061002	1061007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_017566	AAT	2	6	1061114	1061119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_017566	AAT	2	6	1061128	1061133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_017566	CAA	2	6	1062695	1062700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3068	NC_017566	AAT	2	6	1062706	1062711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_017566	TTA	2	6	1062727	1062732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_017566	GGT	2	6	1062733	1062738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_017566	ATT	2	6	1062745	1062750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_017566	TAATT	2	10	1062798	1062807	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_017566	A	8	8	1062827	1062834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_017566	TAA	2	6	1062850	1062855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_017566	CT	3	6	1062905	1062910	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3076	NC_017566	GGAT	2	8	1062921	1062928	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_017566	GTC	2	6	1062956	1062961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3079	NC_017566	CAT	2	6	1063170	1063175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3080	NC_017566	CAT	2	6	1063177	1063182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3081	NC_017566	CAT	2	6	1063184	1063189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3082	NC_017566	T	6	6	1063210	1063215	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_017566	T	9	9	1063345	1063353	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_017566	TGT	2	6	1063364	1063369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_017566	A	6	6	1063419	1063424	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_017566	CGG	2	6	1063443	1063448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3087	NC_017566	CTA	2	6	1063502	1063507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3088	NC_017566	GGA	2	6	1063529	1063534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_017566	ATC	3	9	1064628	1064636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3090	NC_017566	AAGCC	2	10	1064692	1064701	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3091	NC_017566	TGT	3	9	1064714	1064722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_017566	ATTT	2	8	1064741	1064748	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_017566	ATC	3	9	1064760	1064768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3094	NC_017566	AAGCC	2	10	1064824	1064833	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3095	NC_017566	TGT	3	9	1064846	1064854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_017566	TGT	3	9	1064886	1064894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_017566	AAG	2	6	1064968	1064973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_017566	CAT	2	6	1065600	1065605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3099	NC_017566	TTAA	2	8	1065776	1065783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_017566	CGG	2	6	1066157	1066162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3101	NC_017566	CCG	2	6	1069201	1069206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3102	NC_017566	GTTT	2	8	1070466	1070473	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_017566	CCT	2	6	1071324	1071329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3104	NC_017566	ATAA	2	8	1071384	1071391	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_017566	AATGAT	2	12	1071399	1071410	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_017566	TAT	2	6	1071428	1071433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_017566	A	6	6	1071472	1071477	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_017566	AAT	2	6	1071492	1071497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_017566	GAG	2	6	1073677	1073682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_017566	CAA	2	6	1074899	1074904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3111	NC_017566	TTC	2	6	1074983	1074988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3112	NC_017566	GCA	2	6	1074997	1075002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3113	NC_017566	TAT	2	6	1075007	1075012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_017566	TTTG	2	8	1076959	1076966	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_017566	GAT	2	6	1078610	1078615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_017566	GTT	2	6	1078624	1078629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_017566	ATT	2	6	1078630	1078635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_017566	TTAGA	2	10	1078654	1078663	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_017566	TTG	2	6	1078834	1078839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_017566	TATT	2	8	1078848	1078855	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_017566	TTTA	2	8	1078872	1078879	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_017566	GAT	2	6	1078914	1078919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_017566	GTG	2	6	1078943	1078948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_017566	TAA	2	6	1080495	1080500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_017566	AT	3	6	1080598	1080603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_017566	AT	3	6	1080616	1080621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_017566	TTA	2	6	1080634	1080639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_017566	AT	3	6	1082169	1082174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_017566	AT	3	6	1082209	1082214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_017566	GTC	2	6	1082265	1082270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3132	NC_017566	TAG	2	6	1083045	1083050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3265	NC_017566	GCA	2	6	1137634	1137639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3391	NC_017566	TGT	2	6	1144900	1144905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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