MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella putrefaciens 200 chromosome

Total Repeats: 14561

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017566	TGT	2	6	340213	340218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_017566	AAT	2	6	340226	340231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_017566	T	6	6	340235	340240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_017566	ATTT	2	8	340256	340263	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_017566	ATC	2	6	340284	340289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_017566	TAA	2	6	340305	340310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_017566	T	6	6	341120	341125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_017566	AGT	2	6	341268	341273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_017566	CAC	2	6	341280	341285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1010	NC_017566	A	6	6	341329	341334	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_017566	CAAT	2	8	341343	341350	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1012	NC_017566	T	6	6	341358	341363	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_017566	TTCAA	2	10	342381	342390	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1014	NC_017566	GCA	2	6	342394	342399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_017566	GAAGT	2	10	342440	342449	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_017566	CGG	2	6	342468	342473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_017566	TGC	2	6	342490	342495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_017566	ATGG	2	8	342547	342554	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_017566	GTT	2	6	342634	342639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_017566	TGA	2	6	342673	342678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_017566	TTA	2	6	343536	343541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_017566	TAA	2	6	343593	343598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_017566	TAA	2	6	343618	343623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_017566	GA	3	6	343650	343655	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_017566	CT	3	6	344326	344331	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1026	NC_017566	TCC	2	6	344986	344991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1027	NC_017566	ATC	2	6	345035	345040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_017566	GAG	2	6	345089	345094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_017566	CACCG	2	10	345134	345143	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1030	NC_017566	TGTAA	2	10	347236	347245	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_017566	T	6	6	347260	347265	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_017566	AGG	2	6	347305	347310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_017566	A	6	6	347318	347323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_017566	CAT	2	6	349658	349663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_017566	AAT	2	6	349674	349679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_017566	A	6	6	349729	349734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_017566	AGG	2	6	349776	349781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_017566	T	9	9	351044	351052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_017566	T	8	8	351055	351062	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_017566	TCA	2	6	351072	351077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_017566	ATT	2	6	351085	351090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_017566	GCT	2	6	351106	351111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_017566	A	6	6	351132	351137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_017566	TTA	2	6	351189	351194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_017566	TGC	2	6	351291	351296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_017566	ATA	2	6	352706	352711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_017566	TTG	2	6	352717	352722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_017566	TGC	2	6	352751	352756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_017566	TCA	2	6	353285	353290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_017566	GAA	2	6	354220	354225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_017566	CAA	2	6	354226	354231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_017566	GT	3	6	354246	354251	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_017566	CGC	2	6	354274	354279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1054	NC_017566	TCA	3	9	354331	354339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_017566	TGA	2	6	355039	355044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_017566	AGA	2	6	355138	355143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_017566	TAT	2	6	358758	358763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_017566	T	6	6	358803	358808	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_017566	A	6	6	358813	358818	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_017566	T	7	7	358822	358828	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_017566	TGA	2	6	358935	358940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_017566	A	6	6	358963	358968	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_017566	AAT	2	6	359016	359021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_017566	AATA	2	8	359030	359037	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_017566	T	6	6	359175	359180	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_017566	TAAC	2	8	359202	359209	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1067	NC_017566	CATTTA	2	12	360848	360859	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1068	NC_017566	TGGC	2	8	360867	360874	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1069	NC_017566	ATG	2	6	364052	364057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_017566	AAT	2	6	364062	364067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_017566	TTG	2	6	364109	364114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_017566	ATTT	3	12	364148	364159	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_017566	TTA	2	6	364161	364166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_017566	AAT	2	6	364218	364223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_017566	TGCTGT	2	12	364236	364247	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1076	NC_017566	T	6	6	364247	364252	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_017566	ATT	2	6	364275	364280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_017566	TTG	2	6	364287	364292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_017566	T	7	7	364401	364407	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_017566	TCT	2	6	364437	364442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_017566	GTA	2	6	364502	364507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_017566	AGT	2	6	364516	364521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_017566	A	6	6	365916	365921	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_017566	T	6	6	365940	365945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_017566	TCG	2	6	365962	365967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_017566	CGG	2	6	365985	365990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_017566	AT	3	6	366001	366006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_017566	AGT	2	6	366017	366022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_017566	GATAG	2	10	366068	366077	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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1091	NC_017566	TAA	2	6	367616	367621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_017566	CTTTTT	2	12	367648	367659	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1093	NC_017566	TAA	2	6	367663	367668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_017566	CCT	2	6	368007	368012	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1095	NC_017566	TCTA	2	8	368017	368024	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1096	NC_017566	GGTT	2	8	368046	368053	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_017566	TTC	2	6	368079	368084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1099	NC_017566	TTA	2	6	368144	368149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_017566	TTA	2	6	368160	368165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_017566	TGC	2	6	368220	368225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_017566	T	6	6	368226	368231	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_017566	TATT	2	8	368238	368245	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_017566	TGC	2	6	368322	368327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_017566	GGATG	2	10	368444	368453	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_017566	AAG	2	6	368940	368945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_017566	AG	3	6	368944	368949	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_017566	TA	3	6	381082	381087	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_017566	GGC	2	6	381159	381164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_017566	TGG	2	6	381167	381172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_017566	TTGA	2	8	384405	384412	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_017566	CTG	2	6	384492	384497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_017566	GT	3	6	384499	384504	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_017566	ATA	2	6	384519	384524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_017566	ATA	2	6	385928	385933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_017566	CAT	2	6	386875	386880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_017566	CTG	2	6	389643	389648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_017566	GATT	2	8	389680	389687	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_017566	TAA	2	6	389733	389738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_017566	CTT	2	6	389783	389788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_017566	GTT	2	6	389801	389806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_017566	A	7	7	389948	389954	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_017566	A	6	6	389969	389974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_017566	AAAG	2	8	390049	390056	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_017566	A	6	6	390107	390112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_017566	GT	3	6	390175	390180	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_017566	AT	3	6	390207	390212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_017566	TG	3	6	390223	390228	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_017566	GGC	2	6	390449	390454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_017566	GCA	2	6	390480	390485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_017566	GCG	2	6	390513	390518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_017566	AGG	2	6	390608	390613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1134	NC_017566	GAT	2	6	390713	390718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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