MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Shewanella putrefaciens 200 chromosome

Total Repeats: 2440

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017566	AGTGA	2	10	4906	4915	40 %	20 %	40 %	0 %	386311796
2	NC_017566	GTATT	2	10	5812	5821	20 %	60 %	20 %	0 %	386311796
3	NC_017566	TTTCG	2	10	9327	9336	0 %	60 %	20 %	20 %	386311798
4	NC_017566	GCTGA	2	10	9577	9586	20 %	20 %	40 %	20 %	386311798
5	NC_017566	TGGCG	2	10	9834	9843	0 %	20 %	60 %	20 %	386311799
6	NC_017566	CTTGG	2	10	12787	12796	0 %	40 %	40 %	20 %	386311801
7	NC_017566	GTTCA	2	10	16087	16096	20 %	40 %	20 %	20 %	386311804
8	NC_017566	ACATC	2	10	17458	17467	40 %	20 %	0 %	40 %	386311805
9	NC_017566	AGTTT	2	10	18759	18768	20 %	60 %	20 %	0 %	386311805
10	NC_017566	AGCGA	2	10	19068	19077	40 %	0 %	40 %	20 %	386311805
11	NC_017566	GCGCC	2	10	20177	20186	0 %	0 %	40 %	60 %	386311806
12	NC_017566	TAGAA	2	10	23772	23781	60 %	20 %	20 %	0 %	386311810
13	NC_017566	CAACA	2	10	25710	25719	60 %	0 %	0 %	40 %	386311812
14	NC_017566	TTGTC	2	10	27790	27799	0 %	60 %	20 %	20 %	386311814
15	NC_017566	TGCGC	2	10	28342	28351	0 %	20 %	40 %	40 %	386311814
16	NC_017566	TTGTG	2	10	29907	29916	0 %	60 %	40 %	0 %	386311815
17	NC_017566	CGAAA	2	10	32393	32402	60 %	0 %	20 %	20 %	386311818
18	NC_017566	TTCGT	2	10	33065	33074	0 %	60 %	20 %	20 %	386311819
19	NC_017566	GGATC	2	10	36077	36086	20 %	20 %	40 %	20 %	386311823
20	NC_017566	CAGCA	2	10	46334	46343	40 %	0 %	20 %	40 %	386311827
21	NC_017566	GACTC	2	10	47220	47229	20 %	20 %	20 %	40 %	386311828
22	NC_017566	TGGCT	2	10	47392	47401	0 %	40 %	40 %	20 %	386311828
23	NC_017566	GATCT	2	10	48940	48949	20 %	40 %	20 %	20 %	386311829
24	NC_017566	ATCTT	2	10	48968	48977	20 %	60 %	0 %	20 %	386311829
25	NC_017566	GCAAC	2	10	50445	50454	40 %	0 %	20 %	40 %	386311830
26	NC_017566	TTTTG	2	10	51179	51188	0 %	80 %	20 %	0 %	386311831
27	NC_017566	CATGC	2	10	55068	55077	20 %	20 %	20 %	40 %	386311835
28	NC_017566	TGCGC	2	10	55269	55278	0 %	20 %	40 %	40 %	386311835
29	NC_017566	CCATG	2	10	55363	55372	20 %	20 %	20 %	40 %	386311835
30	NC_017566	GCATT	2	10	57415	57424	20 %	40 %	20 %	20 %	386311837
31	NC_017566	CTGTT	2	10	57659	57668	0 %	60 %	20 %	20 %	386311837
32	NC_017566	GATTG	2	10	61512	61521	20 %	40 %	40 %	0 %	386311839
33	NC_017566	GCCTG	2	10	63621	63630	0 %	20 %	40 %	40 %	386311842
34	NC_017566	CCATT	2	10	65837	65846	20 %	40 %	0 %	40 %	386311844
35	NC_017566	GATTT	2	10	67087	67096	20 %	60 %	20 %	0 %	386311845
36	NC_017566	AGCCC	2	10	72949	72958	20 %	0 %	20 %	60 %	386311850
37	NC_017566	AAACT	2	10	73945	73954	60 %	20 %	0 %	20 %	386311852
38	NC_017566	TCAGT	2	10	74602	74611	20 %	40 %	20 %	20 %	386311852
39	NC_017566	AGAAA	2	10	75118	75127	80 %	0 %	20 %	0 %	386311853
40	NC_017566	GCTTG	2	10	76387	76396	0 %	40 %	40 %	20 %	386311854
41	NC_017566	AGCAG	2	10	76924	76933	40 %	0 %	40 %	20 %	386311855
42	NC_017566	GTTGT	2	10	77868	77877	0 %	60 %	40 %	0 %	386311856
43	NC_017566	AGCTA	2	10	78761	78770	40 %	20 %	20 %	20 %	386311857
44	NC_017566	AGTTG	2	10	79114	79123	20 %	40 %	40 %	0 %	386311857
45	NC_017566	TAGGT	2	10	79283	79292	20 %	40 %	40 %	0 %	386311857
46	NC_017566	TTTAA	2	10	80073	80082	40 %	60 %	0 %	0 %	386311857
47	NC_017566	CTCAA	2	10	82328	82337	40 %	20 %	0 %	40 %	386311859
48	NC_017566	GGTAT	2	10	83626	83635	20 %	40 %	40 %	0 %	386311861
49	NC_017566	GCAGG	2	10	85271	85280	20 %	0 %	60 %	20 %	386311863
50	NC_017566	AGTTT	2	10	89023	89032	20 %	60 %	20 %	0 %	386311867
51	NC_017566	CCTTA	2	10	91387	91396	20 %	40 %	0 %	40 %	386311869
52	NC_017566	AGTTT	2	10	91421	91430	20 %	60 %	20 %	0 %	386311869
53	NC_017566	AACGT	2	10	92649	92658	40 %	20 %	20 %	20 %	386311869
54	NC_017566	TGAGT	2	10	93013	93022	20 %	40 %	40 %	0 %	386311869
55	NC_017566	TGGTA	2	10	94756	94765	20 %	40 %	40 %	0 %	386311871
56	NC_017566	TGGCT	2	10	96740	96749	0 %	40 %	40 %	20 %	386311873
57	NC_017566	TCTGC	2	10	104057	104066	0 %	40 %	20 %	40 %	386311880
58	NC_017566	CATTT	2	10	104526	104535	20 %	60 %	0 %	20 %	386311880
59	NC_017566	AAGCT	2	10	105005	105014	40 %	20 %	20 %	20 %	386311881
60	NC_017566	AAGTT	2	10	105253	105262	40 %	40 %	20 %	0 %	386311881
61	NC_017566	CCCAA	2	10	110622	110631	40 %	0 %	0 %	60 %	386311887
62	NC_017566	CGGGC	2	10	112069	112078	0 %	0 %	60 %	40 %	386311888
63	NC_017566	CTAAG	2	10	115892	115901	40 %	20 %	20 %	20 %	386311891
64	NC_017566	GCGCT	2	10	116271	116280	0 %	20 %	40 %	40 %	386311892
65	NC_017566	GCCAT	2	10	116415	116424	20 %	20 %	20 %	40 %	386311892
66	NC_017566	AAGCC	2	10	116933	116942	40 %	0 %	20 %	40 %	386311893
67	NC_017566	TCCAG	2	10	119308	119317	20 %	20 %	20 %	40 %	386311894
68	NC_017566	CACTG	2	10	122414	122423	20 %	20 %	20 %	40 %	386311896
69	NC_017566	GGCTT	2	10	127455	127464	0 %	40 %	40 %	20 %	386311898
70	NC_017566	TTCAC	2	10	129270	129279	20 %	40 %	0 %	40 %	386311900
71	NC_017566	TTCGC	2	10	133017	133026	0 %	40 %	20 %	40 %	386311904
72	NC_017566	TGACT	2	10	135321	135330	20 %	40 %	20 %	20 %	386311905
73	NC_017566	ATTGC	2	10	138173	138182	20 %	40 %	20 %	20 %	386311908
74	NC_017566	AACAA	2	10	139503	139512	80 %	0 %	0 %	20 %	386311908
75	NC_017566	TTTAG	2	10	141224	141233	20 %	60 %	20 %	0 %	386311909
76	NC_017566	GTTCA	2	10	141235	141244	20 %	40 %	20 %	20 %	386311909
77	NC_017566	TGGGC	2	10	141620	141629	0 %	20 %	60 %	20 %	386311909
78	NC_017566	GCATC	2	10	142652	142661	20 %	20 %	20 %	40 %	386311911
79	NC_017566	AGAGA	2	10	145598	145607	60 %	0 %	40 %	0 %	386311914
80	NC_017566	AAAGT	2	10	146272	146281	60 %	20 %	20 %	0 %	386311915
81	NC_017566	GGTTT	2	10	146887	146896	0 %	60 %	40 %	0 %	386311915
82	NC_017566	AAAAT	2	10	152089	152098	80 %	20 %	0 %	0 %	386311920
83	NC_017566	CTGTG	2	10	153239	153248	0 %	40 %	40 %	20 %	386311921
84	NC_017566	ATCCT	2	10	154630	154639	20 %	40 %	0 %	40 %	386311922
85	NC_017566	ACTGC	2	10	155302	155311	20 %	20 %	20 %	40 %	386311922
86	NC_017566	TAGGC	2	10	155587	155596	20 %	20 %	40 %	20 %	386311923
87	NC_017566	GCCAA	2	10	160057	160066	40 %	0 %	20 %	40 %	386311929
88	NC_017566	CGGCA	2	10	161572	161581	20 %	0 %	40 %	40 %	386311931
89	NC_017566	TGGCG	2	10	165618	165627	0 %	20 %	60 %	20 %	386311934
90	NC_017566	GTTAA	2	10	168270	168279	40 %	40 %	20 %	0 %	386311935
91	NC_017566	AACAA	2	10	168658	168667	80 %	0 %	0 %	20 %	386311936
92	NC_017566	TACTG	2	10	170231	170240	20 %	40 %	20 %	20 %	386311937
93	NC_017566	CTGTA	2	10	170678	170687	20 %	40 %	20 %	20 %	386311937
94	NC_017566	AGCGA	2	10	176396	176405	40 %	0 %	40 %	20 %	386311942
95	NC_017566	CAGTT	2	10	178331	178340	20 %	40 %	20 %	20 %	386311945
96	NC_017566	TACTC	2	10	180561	180570	20 %	40 %	0 %	40 %	386311948
97	NC_017566	AGCAA	2	10	184062	184071	60 %	0 %	20 %	20 %	386311949
98	NC_017566	CTGAT	2	10	184113	184122	20 %	40 %	20 %	20 %	386311949
99	NC_017566	TCTGT	2	10	184198	184207	0 %	60 %	20 %	20 %	386311949
100	NC_017566	GAAAA	2	10	189039	189048	80 %	0 %	20 %	0 %	386311951
101	NC_017566	GTTCT	2	10	189522	189531	0 %	60 %	20 %	20 %	386311952
102	NC_017566	TGGCG	2	10	194349	194358	0 %	20 %	60 %	20 %	386311956
103	NC_017566	AAGCC	2	10	199996	200005	40 %	0 %	20 %	40 %	386311969
104	NC_017566	TCGCG	2	10	202043	202052	0 %	20 %	40 %	40 %	386311974
105	NC_017566	CATTG	2	10	203923	203932	20 %	40 %	20 %	20 %	386311977
106	NC_017566	ATGGC	2	10	204303	204312	20 %	20 %	40 %	20 %	386311978
107	NC_017566	CGTGA	2	10	206017	206026	20 %	20 %	40 %	20 %	386311980
108	NC_017566	GCTTT	2	10	213153	213162	0 %	60 %	20 %	20 %	386311989
109	NC_017566	GCTGA	2	10	214912	214921	20 %	20 %	40 %	20 %	386311990
110	NC_017566	CCATG	2	10	222257	222266	20 %	20 %	20 %	40 %	386311993
111	NC_017566	TGGTT	2	10	224824	224833	0 %	60 %	40 %	0 %	386311995
112	NC_017566	TGGAA	2	10	226710	226719	40 %	20 %	40 %	0 %	386311996
113	NC_017566	TTCTT	2	10	228262	228271	0 %	80 %	0 %	20 %	386311998
114	NC_017566	GCATG	2	10	229569	229578	20 %	20 %	40 %	20 %	386311999
115	NC_017566	CAAAC	2	10	229734	229743	60 %	0 %	0 %	40 %	386311999
116	NC_017566	TTTGT	2	10	231880	231889	0 %	80 %	20 %	0 %	386312002
117	NC_017566	TTTGA	2	10	235039	235048	20 %	60 %	20 %	0 %	386312005
118	NC_017566	TCTGC	2	10	239934	239943	0 %	40 %	20 %	40 %	386312012
119	NC_017566	GGGTA	2	10	242721	242730	20 %	20 %	60 %	0 %	386312013
120	NC_017566	ATTTA	2	10	244589	244598	40 %	60 %	0 %	0 %	386312014
121	NC_017566	TTCAA	2	10	246179	246188	40 %	40 %	0 %	20 %	386312016
122	NC_017566	TCCTG	2	10	247308	247317	0 %	40 %	20 %	40 %	386312018
123	NC_017566	GCTGT	2	10	248943	248952	0 %	40 %	40 %	20 %	386312019
124	NC_017566	TTGAT	2	10	249947	249956	20 %	60 %	20 %	0 %	386312020
125	NC_017566	ATAGC	2	10	250432	250441	40 %	20 %	20 %	20 %	386312021
126	NC_017566	TTGAA	2	10	250920	250929	40 %	40 %	20 %	0 %	386312022
127	NC_017566	AACGA	2	10	253129	253138	60 %	0 %	20 %	20 %	386312024
128	NC_017566	CGGGT	2	10	253274	253283	0 %	20 %	60 %	20 %	386312024
129	NC_017566	TGGAG	2	10	257995	258004	20 %	20 %	60 %	0 %	386312028
130	NC_017566	TTGCT	2	10	258242	258251	0 %	60 %	20 %	20 %	386312028
131	NC_017566	CAAGC	2	10	258408	258417	40 %	0 %	20 %	40 %	386312028
132	NC_017566	TGGGC	2	10	261517	261526	0 %	20 %	60 %	20 %	386312031
133	NC_017566	TTATT	2	10	261951	261960	20 %	80 %	0 %	0 %	386312031
134	NC_017566	TATTT	2	10	263440	263449	20 %	80 %	0 %	0 %	386312032
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