MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella putrefaciens 200 chromosome

Total Repeats: 71360

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017566	GCCA	2	8	268471	268478	25 %	0 %	25 %	50 %	386312036
4002	NC_017566	CGG	2	6	268513	268518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386312036
4003	NC_017566	TTGC	2	8	268598	268605	0 %	50 %	25 %	25 %	386312036
4004	NC_017566	GCA	2	6	268764	268769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386312036
4005	NC_017566	TTC	2	6	268796	268801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386312036
4006	NC_017566	AGCC	2	8	268811	268818	25 %	0 %	25 %	50 %	386312036
4007	NC_017566	ATA	2	6	268842	268847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386312036
4008	NC_017566	CGT	2	6	268855	268860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386312036
4009	NC_017566	GCTGA	2	10	268911	268920	20 %	20 %	40 %	20 %	386312036
4010	NC_017566	TCG	2	6	268932	268937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386312036
4011	NC_017566	TCG	2	6	268992	268997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386312036
4012	NC_017566	GC	3	6	269035	269040	0 %	0 %	50 %	50 %	386312036
4013	NC_017566	CAG	2	6	269131	269136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386312036
4014	NC_017566	AAC	2	6	269153	269158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386312036
4015	NC_017566	ATC	2	6	269658	269663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386312037
4016	NC_017566	A	6	6	269739	269744	100 %	0 %	0 %	0 %	386312037
4017	NC_017566	CCTAC	2	10	269765	269774	20 %	20 %	0 %	60 %	386312037
4018	NC_017566	ATT	2	6	269792	269797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386312037
4019	NC_017566	CGT	2	6	269897	269902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386312037
4020	NC_017566	AAAT	2	8	269959	269966	75 %	25 %	0 %	0 %	386312037
4021	NC_017566	TGC	2	6	269992	269997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386312037
4022	NC_017566	CGAG	2	8	270013	270020	25 %	0 %	50 %	25 %	386312037
4023	NC_017566	AC	3	6	270091	270096	50 %	0 %	0 %	50 %	386312037
4024	NC_017566	ATT	2	6	270193	270198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386312037
4025	NC_017566	AAT	2	6	270305	270310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386312037
4026	NC_017566	GCA	2	6	270406	270411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386312037
4027	NC_017566	AGA	2	6	270462	270467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386312037
4028	NC_017566	TGG	2	6	270526	270531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386312037
4029	NC_017566	GAT	2	6	270761	270766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386312038
4030	NC_017566	CCA	2	6	270779	270784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386312038
4031	NC_017566	CG	3	6	270806	270811	0 %	0 %	50 %	50 %	386312038
4032	NC_017566	A	8	8	270833	270840	100 %	0 %	0 %	0 %	386312038
4033	NC_017566	CCAT	2	8	270863	270870	25 %	25 %	0 %	50 %	386312038
4034	NC_017566	GGC	2	6	270998	271003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386312038
4035	NC_017566	CTAT	2	8	271009	271016	25 %	50 %	0 %	25 %	386312038
4036	NC_017566	GGC	2	6	271080	271085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386312038
4037	NC_017566	GTT	2	6	271144	271149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386312039
4038	NC_017566	T	6	6	271148	271153	0 %	100 %	0 %	0 %	386312039
4039	NC_017566	ATT	2	6	271168	271173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386312039
4040	NC_017566	GCGA	2	8	271199	271206	25 %	0 %	50 %	25 %	386312039
4041	NC_017566	GGC	2	6	271243	271248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386312039
4042	NC_017566	CGA	2	6	271252	271257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386312039
4043	NC_017566	TGG	2	6	271293	271298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386312039
4044	NC_017566	TGA	2	6	271345	271350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386312039
4045	NC_017566	CCA	2	6	271364	271369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386312039
4046	NC_017566	AGG	2	6	271375	271380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386312039
4047	NC_017566	TAC	2	6	271393	271398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386312040
4048	NC_017566	GAT	2	6	271461	271466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386312040
4049	NC_017566	TCG	2	6	271489	271494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386312040
4050	NC_017566	TGAC	2	8	271528	271535	25 %	25 %	25 %	25 %	386312040
4051	NC_017566	TTG	2	6	271585	271590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386312040
4052	NC_017566	TGC	2	6	271712	271717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386312040
4053	NC_017566	GGC	2	6	271823	271828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386312040
4054	NC_017566	GGCA	2	8	271837	271844	25 %	0 %	50 %	25 %	386312040
4055	NC_017566	ACA	2	6	271899	271904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386312041
4056	NC_017566	T	7	7	271921	271927	0 %	100 %	0 %	0 %	386312041
4057	NC_017566	T	7	7	271935	271941	0 %	100 %	0 %	0 %	386312041
4058	NC_017566	TGTT	2	8	271945	271952	0 %	75 %	25 %	0 %	386312041
4059	NC_017566	TAT	2	6	271956	271961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386312041
4060	NC_017566	GCG	2	6	271985	271990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386312041
4061	NC_017566	AT	3	6	272185	272190	50 %	50 %	0 %	0 %	386312041
4062	NC_017566	TTG	2	6	272259	272264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386312041
4063	NC_017566	TTGCTA	2	12	272346	272357	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386312041
4064	NC_017566	ATT	2	6	272504	272509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386312041
4065	NC_017566	ATT	2	6	272646	272651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386312041
4066	NC_017566	TCG	2	6	272668	272673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386312041
4067	NC_017566	ATG	2	6	272713	272718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386312041
4068	NC_017566	GGCA	2	8	272723	272730	25 %	0 %	50 %	25 %	386312042
4069	NC_017566	CTA	2	6	272889	272894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386312042
4070	NC_017566	TGG	2	6	272900	272905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386312042
4071	NC_017566	TGGTT	2	10	272979	272988	0 %	60 %	40 %	0 %	386312042
4072	NC_017566	ATG	2	6	273059	273064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386312042
4073	NC_017566	TTG	2	6	273081	273086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386312042
4074	NC_017566	TATGG	2	10	273129	273138	20 %	40 %	40 %	0 %	386312042
4075	NC_017566	TGA	2	6	273203	273208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386312042
4076	NC_017566	GGC	2	6	273211	273216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386312042
4077	NC_017566	GCA	2	6	273286	273291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386312042
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4079	NC_017566	ATC	2	6	273386	273391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386312042
4080	NC_017566	TGCT	2	8	273468	273475	0 %	50 %	25 %	25 %	386312043
4081	NC_017566	GGC	2	6	273491	273496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386312043
4082	NC_017566	GAT	2	6	273517	273522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386312043
4083	NC_017566	ATC	2	6	273534	273539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386312043
4084	NC_017566	TGA	2	6	273580	273585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386312043
4085	NC_017566	GCA	2	6	273610	273615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386312043
4086	NC_017566	GCA	2	6	273637	273642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386312043
4087	NC_017566	GTG	2	6	273680	273685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386312043
4088	NC_017566	CG	4	8	273723	273730	0 %	0 %	50 %	50 %	386312043
4089	NC_017566	GCCAGC	2	12	273798	273809	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386312043
4090	NC_017566	TTG	2	6	273854	273859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386312043
4091	NC_017566	GC	3	6	273917	273922	0 %	0 %	50 %	50 %	386312043
4092	NC_017566	TGC	2	6	273981	273986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386312043
4093	NC_017566	GAT	2	6	273997	274002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386312043
4094	NC_017566	TGC	2	6	274023	274028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386312043
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4099	NC_017566	GAAATG	2	12	274850	274861	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386312044
4100	NC_017566	CAG	2	6	275222	275227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386312045
4101	NC_017566	GAT	2	6	275281	275286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386312045
4102	NC_017566	CGA	3	9	275288	275296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386312045
4103	NC_017566	ATG	2	6	275351	275356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386312045
4104	NC_017566	CCA	2	6	275358	275363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386312045
4105	NC_017566	TC	3	6	275371	275376	0 %	50 %	0 %	50 %	386312045
4106	NC_017566	ATT	2	6	275442	275447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386312045
4107	NC_017566	GGC	2	6	275448	275453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386312045
4108	NC_017566	TGA	2	6	275511	275516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386312045
4109	NC_017566	GCGG	3	12	275532	275543	0 %	0 %	75 %	25 %	386312045
4110	NC_017566	TGA	2	6	275544	275549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386312045
4111	NC_017566	CGAC	2	8	275633	275640	25 %	0 %	25 %	50 %	386312045
4112	NC_017566	TGGT	2	8	275645	275652	0 %	50 %	50 %	0 %	386312045
4113	NC_017566	GGAC	2	8	275691	275698	25 %	0 %	50 %	25 %	386312045
4114	NC_017566	TCA	2	6	275765	275770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386312045
4115	NC_017566	TAT	2	6	275780	275785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386312045
4116	NC_017566	TG	3	6	275793	275798	0 %	50 %	50 %	0 %	386312045
4117	NC_017566	GAG	2	6	275866	275871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386312045
4118	NC_017566	GTT	2	6	276007	276012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386312046
4119	NC_017566	ATC	2	6	276035	276040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386312046
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4121	NC_017566	CAG	2	6	276092	276097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386312046
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4123	NC_017566	TGC	2	6	276231	276236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386312046
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4152	NC_017566	GCAC	2	8	278224	278231	25 %	0 %	25 %	50 %	386312048
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4243	NC_017566	GAT	2	6	283956	283961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386312054
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4246	NC_017566	AT	3	6	284084	284089	50 %	50 %	0 %	0 %	386312054
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4283	NC_017566	T	6	6	287544	287549	0 %	100 %	0 %	0 %	386312058
4284	NC_017566	A	6	6	287619	287624	100 %	0 %	0 %	0 %	386312058
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4353	NC_017566	TGG	2	6	290834	290839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386312061
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4362	NC_017566	ACA	2	6	291157	291162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386312061
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4487	NC_017566	GAA	2	6	300758	300763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386312067
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