MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella putrefaciens 200 chromosome

Total Repeats: 71360

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017566	CGT	3	9	195849	195857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311958
3002	NC_017566	AATA	2	8	195858	195865	75 %	25 %	0 %	0 %	386311958
3003	NC_017566	TC	3	6	195890	195895	0 %	50 %	0 %	50 %	386311959
3004	NC_017566	GAA	2	6	195928	195933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386311959
3005	NC_017566	GTC	2	6	196041	196046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311959
3006	NC_017566	TGC	2	6	196129	196134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311959
3007	NC_017566	GAA	2	6	196147	196152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386311959
3008	NC_017566	A	6	6	196295	196300	100 %	0 %	0 %	0 %	386311960
3009	NC_017566	GCC	2	6	196301	196306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386311960
3010	NC_017566	A	6	6	196316	196321	100 %	0 %	0 %	0 %	386311960
3011	NC_017566	TGA	2	6	196372	196377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386311960
3012	NC_017566	AAT	2	6	196607	196612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386311961
3013	NC_017566	GCTG	2	8	196795	196802	0 %	25 %	50 %	25 %	386311961
3014	NC_017566	AGTT	2	8	196857	196864	25 %	50 %	25 %	0 %	386311961
3015	NC_017566	CGT	2	6	196907	196912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311961
3016	NC_017566	GC	3	6	196921	196926	0 %	0 %	50 %	50 %	386311961
3017	NC_017566	TGA	2	6	197008	197013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386311961
3018	NC_017566	TGC	2	6	197148	197153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311961
3019	NC_017566	AGC	3	9	197172	197180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386311961
3020	NC_017566	TGC	2	6	197222	197227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311962
3021	NC_017566	GGCCGT	2	12	197329	197340	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386311962
3022	NC_017566	CGT	2	6	197368	197373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311962
3023	NC_017566	GTAAAG	2	12	197468	197479	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386311962
3024	NC_017566	GCT	2	6	197578	197583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311962
3025	NC_017566	AGCG	2	8	197636	197643	25 %	0 %	50 %	25 %	386311963
3026	NC_017566	GA	3	6	197648	197653	50 %	0 %	50 %	0 %	386311963
3027	NC_017566	GAA	2	6	197664	197669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386311963
3028	NC_017566	ACT	2	6	197681	197686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386311963
3029	NC_017566	CTG	2	6	197691	197696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311963
3030	NC_017566	GACTCA	2	12	197741	197752	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386311963
3031	NC_017566	GC	3	6	197781	197786	0 %	0 %	50 %	50 %	386311963
3032	NC_017566	ATT	2	6	197796	197801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386311963
3033	NC_017566	CAA	2	6	197863	197868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386311964
3034	NC_017566	TAG	2	6	197994	197999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386311964
3035	NC_017566	GTC	2	6	198012	198017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311964
3036	NC_017566	AGT	2	6	198052	198057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386311964
3037	NC_017566	GCG	2	6	198289	198294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386311965
3038	NC_017566	TCG	2	6	198335	198340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311965
3039	NC_017566	AAG	2	6	198379	198384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386311965
3040	NC_017566	GAA	2	6	198404	198409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386311965
3041	NC_017566	GGT	2	6	198428	198433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386311965
3042	NC_017566	CGT	2	6	198456	198461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311965
3043	NC_017566	AAC	3	9	198510	198518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386311965
3044	NC_017566	CGT	2	6	198644	198649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311966
3045	NC_017566	TCCT	2	8	198711	198718	0 %	50 %	0 %	50 %	386311966
3046	NC_017566	A	6	6	198755	198760	100 %	0 %	0 %	0 %	386311966
3047	NC_017566	TTG	2	6	198801	198806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386311966
3048	NC_017566	AGAA	2	8	198807	198814	75 %	0 %	25 %	0 %	386311966
3049	NC_017566	A	6	6	198899	198904	100 %	0 %	0 %	0 %	386311966
3050	NC_017566	TTC	2	6	198911	198916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386311966
3051	NC_017566	TGT	2	6	198988	198993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386311967
3052	NC_017566	A	6	6	199094	199099	100 %	0 %	0 %	0 %	386311967
3053	NC_017566	GCGT	2	8	199347	199354	0 %	25 %	50 %	25 %	386311967
3054	NC_017566	TGA	2	6	199441	199446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386311967
3055	NC_017566	TAT	2	6	199592	199597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386311968
3056	NC_017566	CTT	2	6	199609	199614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386311968
3057	NC_017566	TGA	2	6	199616	199621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386311968
3058	NC_017566	GTG	2	6	199774	199779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386311968
3059	NC_017566	GCT	2	6	199890	199895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311969
3060	NC_017566	AGA	2	6	199958	199963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386311969
3061	NC_017566	AAGCC	2	10	199996	200005	40 %	0 %	20 %	40 %	386311969
3062	NC_017566	GTC	2	6	200071	200076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311969
3063	NC_017566	TGA	2	6	200164	200169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386311969
3064	NC_017566	GCC	2	6	200178	200183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386311969
3065	NC_017566	CAA	2	6	200349	200354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386311970
3066	NC_017566	TGT	2	6	200364	200369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386311970
3067	NC_017566	TTC	2	6	200393	200398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386311970
3068	NC_017566	GTT	2	6	200410	200415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386311970
3069	NC_017566	TAC	2	6	200436	200441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386311970
3070	NC_017566	ACA	2	6	200456	200461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386311970
3071	NC_017566	GTT	2	6	200464	200469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386311970
3072	NC_017566	AGTT	2	8	200501	200508	25 %	50 %	25 %	0 %	386311970
3073	NC_017566	TCG	2	6	200531	200536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311970
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3075	NC_017566	GCT	2	6	200671	200676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311970
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3080	NC_017566	AAG	2	6	200828	200833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386311971
3081	NC_017566	GGT	2	6	200917	200922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386311971
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3083	NC_017566	TTG	2	6	201009	201014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386311971
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3085	NC_017566	GCT	2	6	201089	201094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311971
3086	NC_017566	TGC	2	6	201103	201108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311971
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3088	NC_017566	AGT	2	6	201217	201222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386311972
3089	NC_017566	AGT	2	6	201259	201264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386311972
3090	NC_017566	GGCTAT	2	12	201287	201298	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386311972
3091	NC_017566	GC	3	6	201305	201310	0 %	0 %	50 %	50 %	386311972
3092	NC_017566	CAG	2	6	201318	201323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386311972
3093	NC_017566	CGT	2	6	201350	201355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311972
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3097	NC_017566	CG	3	6	201560	201565	0 %	0 %	50 %	50 %	386311972
3098	NC_017566	CAA	2	6	201802	201807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386311973
3099	NC_017566	CTA	2	6	201811	201816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386311973
3100	NC_017566	GGA	2	6	201829	201834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386311973
3101	NC_017566	TGG	2	6	201967	201972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386311974
3102	NC_017566	GGT	2	6	201995	202000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386311974
3103	NC_017566	TCGCG	2	10	202043	202052	0 %	20 %	40 %	40 %	386311974
3104	NC_017566	TTA	2	6	202140	202145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386311974
3105	NC_017566	GCA	2	6	202238	202243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386311974
3106	NC_017566	GCT	2	6	202250	202255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311974
3107	NC_017566	AAT	2	6	202272	202277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386311974
3108	NC_017566	CCT	2	6	202346	202351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386311975
3109	NC_017566	GTG	2	6	202486	202491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386311975
3110	NC_017566	TAT	2	6	202523	202528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386311975
3111	NC_017566	A	6	6	202596	202601	100 %	0 %	0 %	0 %	386311975
3112	NC_017566	GTCG	2	8	202673	202680	0 %	25 %	50 %	25 %	386311975
3113	NC_017566	TTG	2	6	202747	202752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386311975
3114	NC_017566	TTG	2	6	202858	202863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386311975
3115	NC_017566	TTG	3	9	202932	202940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386311975
3116	NC_017566	CGT	2	6	202998	203003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311975
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3118	NC_017566	CAG	2	6	203028	203033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386311975
3119	NC_017566	C	6	6	203099	203104	0 %	0 %	0 %	100 %	386311975
3120	NC_017566	CAT	2	6	203120	203125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386311975
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3235	NC_017566	A	6	6	209574	209579	100 %	0 %	0 %	0 %	386311985
3236	NC_017566	ATC	2	6	209660	209665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386311986
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3239	NC_017566	T	6	6	209759	209764	0 %	100 %	0 %	0 %	386311986
3240	NC_017566	GCCA	2	8	209864	209871	25 %	0 %	25 %	50 %	386311986
3241	NC_017566	CTT	2	6	209875	209880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386311986
3242	NC_017566	TCA	2	6	209928	209933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386311986
3243	NC_017566	TCA	2	6	210189	210194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386311986
3244	NC_017566	TTC	2	6	210206	210211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386311986
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3261	NC_017566	T	7	7	211289	211295	0 %	100 %	0 %	0 %	386311988
3262	NC_017566	TCA	3	9	211320	211328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386311988
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3343	NC_017566	TTA	2	6	216019	216024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386311992
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3352	NC_017566	GGAA	2	8	222623	222630	50 %	0 %	50 %	0 %	386311993
3353	NC_017566	AAC	2	6	222692	222697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386311993
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3355	NC_017566	A	6	6	223257	223262	100 %	0 %	0 %	0 %	386311994
3356	NC_017566	A	6	6	223266	223271	100 %	0 %	0 %	0 %	386311994
3357	NC_017566	TCG	2	6	223322	223327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311994
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3359	NC_017566	GCA	2	6	223824	223829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386311995
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3361	NC_017566	A	7	7	223869	223875	100 %	0 %	0 %	0 %	386311995
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3482	NC_017566	TTGC	2	8	231297	231304	0 %	50 %	25 %	25 %	386312002
3483	NC_017566	GTAC	2	8	231362	231369	25 %	25 %	25 %	25 %	386312002
3484	NC_017566	GCG	2	6	231476	231481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386312002
3485	NC_017566	ACA	2	6	231518	231523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386312002
3486	NC_017566	GAA	2	6	231575	231580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386312002
3487	NC_017566	TTTGT	2	10	231880	231889	0 %	80 %	20 %	0 %	386312002
3488	NC_017566	TCA	2	6	231990	231995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386312002
3489	NC_017566	GCC	2	6	232102	232107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386312002
3490	NC_017566	GCCACC	2	12	232132	232143	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386312002
3491	NC_017566	GAA	2	6	232252	232257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386312002
3492	NC_017566	GT	3	6	232307	232312	0 %	50 %	50 %	0 %	386312002
3493	NC_017566	CCA	2	6	232367	232372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386312002
3494	NC_017566	GCG	2	6	232375	232380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386312002
3495	NC_017566	CGA	2	6	232461	232466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386312002
3496	NC_017566	CTG	2	6	232647	232652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386312002
3497	NC_017566	TGC	2	6	232660	232665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386312002
3498	NC_017566	CCA	2	6	232679	232684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386312002
3499	NC_017566	TGC	2	6	233033	233038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386312003
3500	NC_017566	ACG	2	6	233197	233202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386312003

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