MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella putrefaciens 200 chromosome

Total Repeats: 71360

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_017566	TGGCG	2	10	165618	165627	0 %	20 %	60 %	20 %	386311934
2502	NC_017566	AAT	2	6	165986	165991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386311935
2503	NC_017566	CT	3	6	166004	166009	0 %	50 %	0 %	50 %	386311935
2504	NC_017566	GTT	2	6	166206	166211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386311935
2505	NC_017566	GTT	2	6	166218	166223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386311935
2506	NC_017566	GTT	2	6	166233	166238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386311935
2507	NC_017566	AGA	2	6	166394	166399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386311935
2508	NC_017566	CGC	2	6	166593	166598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386311935
2509	NC_017566	TGA	2	6	166609	166614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386311935
2510	NC_017566	ATT	2	6	166643	166648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386311935
2511	NC_017566	AAG	2	6	166690	166695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386311935
2512	NC_017566	TGA	2	6	166754	166759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386311935
2513	NC_017566	AGC	2	6	166763	166768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386311935
2514	NC_017566	ATT	2	6	166771	166776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386311935
2515	NC_017566	T	6	6	166805	166810	0 %	100 %	0 %	0 %	386311935
2516	NC_017566	CCG	2	6	166974	166979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386311935
2517	NC_017566	GCA	2	6	166986	166991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386311935
2518	NC_017566	CCG	2	6	167030	167035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386311935
2519	NC_017566	TGG	2	6	167036	167041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386311935
2520	NC_017566	CGT	2	6	167055	167060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311935
2521	NC_017566	TAA	2	6	167072	167077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386311935
2522	NC_017566	CGGT	2	8	167156	167163	0 %	25 %	50 %	25 %	386311935
2523	NC_017566	CAATGA	2	12	167206	167217	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386311935
2524	NC_017566	TGC	2	6	167224	167229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311935
2525	NC_017566	A	6	6	167325	167330	100 %	0 %	0 %	0 %	386311935
2526	NC_017566	GC	3	6	167456	167461	0 %	0 %	50 %	50 %	386311935
2527	NC_017566	GAT	2	6	167472	167477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386311935
2528	NC_017566	TGA	2	6	167533	167538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386311935
2529	NC_017566	ATG	2	6	167548	167553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386311935
2530	NC_017566	GTT	2	6	167623	167628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386311935
2531	NC_017566	GCT	2	6	167660	167665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311935
2532	NC_017566	TAT	2	6	167820	167825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386311935
2533	NC_017566	AAT	2	6	167829	167834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386311935
2534	NC_017566	TTAT	2	8	167844	167851	25 %	75 %	0 %	0 %	386311935
2535	NC_017566	GTT	2	6	167872	167877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386311935
2536	NC_017566	TCAA	2	8	167989	167996	50 %	25 %	0 %	25 %	386311935
2537	NC_017566	TAA	2	6	168025	168030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386311935
2538	NC_017566	CAGT	2	8	168068	168075	25 %	25 %	25 %	25 %	386311935
2539	NC_017566	CAT	2	6	168122	168127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386311935
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2541	NC_017566	GTTAA	2	10	168270	168279	40 %	40 %	20 %	0 %	386311935
2542	NC_017566	GAT	2	6	168306	168311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386311935
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2544	NC_017566	GAC	2	6	168490	168495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386311936
2545	NC_017566	GGGC	2	8	168501	168508	0 %	0 %	75 %	25 %	386311936
2546	NC_017566	TGG	2	6	168525	168530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386311936
2547	NC_017566	TGC	2	6	168564	168569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311936
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2549	NC_017566	AACAA	2	10	168658	168667	80 %	0 %	0 %	20 %	386311936
2550	NC_017566	GGT	2	6	168749	168754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386311936
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2552	NC_017566	CTTT	2	8	168912	168919	0 %	75 %	0 %	25 %	386311936
2553	NC_017566	GCT	2	6	168961	168966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311936
2554	NC_017566	TAT	2	6	169093	169098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386311936
2555	NC_017566	GGC	2	6	169208	169213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386311936
2556	NC_017566	GT	3	6	169221	169226	0 %	50 %	50 %	0 %	386311936
2557	NC_017566	TGGT	2	8	169227	169234	0 %	50 %	50 %	0 %	386311936
2558	NC_017566	TCG	2	6	169307	169312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311936
2559	NC_017566	GTTT	2	8	169332	169339	0 %	75 %	25 %	0 %	386311936
2560	NC_017566	TGA	2	6	169366	169371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386311936
2561	NC_017566	GCT	2	6	169397	169402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311936
2562	NC_017566	TCC	2	6	169414	169419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386311936
2563	NC_017566	T	6	6	169450	169455	0 %	100 %	0 %	0 %	386311936
2564	NC_017566	GGC	2	6	169480	169485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386311936
2565	NC_017566	ATCGTC	2	12	169586	169597	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386311936
2566	NC_017566	ATC	2	6	169610	169615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386311936
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2568	NC_017566	GCT	2	6	169755	169760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311937
2569	NC_017566	TTAT	2	8	169770	169777	25 %	75 %	0 %	0 %	386311937
2570	NC_017566	TTG	2	6	169812	169817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386311937
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2573	NC_017566	AGCG	2	8	170137	170144	25 %	0 %	50 %	25 %	386311937
2574	NC_017566	CTT	2	6	170155	170160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386311937
2575	NC_017566	TACTG	2	10	170231	170240	20 %	40 %	20 %	20 %	386311937
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2578	NC_017566	CTGTA	2	10	170678	170687	20 %	40 %	20 %	20 %	386311937
2579	NC_017566	GTTT	2	8	170727	170734	0 %	75 %	25 %	0 %	386311937
2580	NC_017566	TGA	2	6	170839	170844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386311937
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2586	NC_017566	TTGAGG	2	12	171430	171441	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	386311938
2587	NC_017566	GCA	2	6	171534	171539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386311938
2588	NC_017566	ATCTTG	2	12	171601	171612	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386311938
2589	NC_017566	T	6	6	171623	171628	0 %	100 %	0 %	0 %	386311938
2590	NC_017566	TAA	2	6	171809	171814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386311938
2591	NC_017566	T	7	7	171875	171881	0 %	100 %	0 %	0 %	386311938
2592	NC_017566	AGTG	2	8	171893	171900	25 %	25 %	50 %	0 %	386311938
2593	NC_017566	TGCT	2	8	171902	171909	0 %	50 %	25 %	25 %	386311938
2594	NC_017566	CGA	2	6	171934	171939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386311938
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2598	NC_017566	GCAG	2	8	171998	172005	25 %	0 %	50 %	25 %	386311938
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2602	NC_017566	GAGT	2	8	172281	172288	25 %	25 %	50 %	0 %	386311939
2603	NC_017566	TGC	2	6	172302	172307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311939
2604	NC_017566	ATTG	2	8	172398	172405	25 %	50 %	25 %	0 %	386311939
2605	NC_017566	ATC	2	6	172433	172438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386311939
2606	NC_017566	TGA	2	6	172452	172457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386311939
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2609	NC_017566	A	6	6	172744	172749	100 %	0 %	0 %	0 %	386311939
2610	NC_017566	CTGG	2	8	172750	172757	0 %	25 %	50 %	25 %	386311939
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2612	NC_017566	AGAC	2	8	172904	172911	50 %	0 %	25 %	25 %	386311939
2613	NC_017566	AAC	2	6	172931	172936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386311939
2614	NC_017566	ATTT	2	8	173006	173013	25 %	75 %	0 %	0 %	386311939
2615	NC_017566	CCG	2	6	173105	173110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386311939
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2622	NC_017566	ATAG	2	8	173438	173445	50 %	25 %	25 %	0 %	386311940
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2744	NC_017566	GAA	2	6	181208	181213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386311948
2745	NC_017566	CAT	2	6	181214	181219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386311948
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2982	NC_017566	TGC	2	6	194983	194988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311957
2983	NC_017566	TCG	2	6	195006	195011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311957
2984	NC_017566	GCG	2	6	195012	195017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386311957
2985	NC_017566	TTA	2	6	195049	195054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386311958
2986	NC_017566	GTC	2	6	195076	195081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311958
2987	NC_017566	GTG	2	6	195096	195101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386311958
2988	NC_017566	A	6	6	195147	195152	100 %	0 %	0 %	0 %	386311958
2989	NC_017566	GTG	2	6	195160	195165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386311958
2990	NC_017566	GGT	3	9	195204	195212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386311958
2991	NC_017566	AGC	2	6	195217	195222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386311958
2992	NC_017566	CGT	2	6	195342	195347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311958
2993	NC_017566	TGC	2	6	195356	195361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311958
2994	NC_017566	GTA	2	6	195459	195464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386311958
2995	NC_017566	GTT	2	6	195531	195536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386311958
2996	NC_017566	CG	3	6	195606	195611	0 %	0 %	50 %	50 %	386311958
2997	NC_017566	GTG	2	6	195703	195708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386311958
2998	NC_017566	GGT	3	9	195738	195746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386311958
2999	NC_017566	TGG	2	6	195761	195766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386311958
3000	NC_017566	GTA	2	6	195817	195822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386311958

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