MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella putrefaciens 200 chromosome

Total Repeats: 71360

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017566	ATC	2	6	97004	97009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386311873
1502	NC_017566	TGC	2	6	97049	97054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311873
1503	NC_017566	GTT	2	6	97143	97148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386311873
1504	NC_017566	ATA	2	6	97667	97672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386311874
1505	NC_017566	TGA	2	6	97673	97678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386311874
1506	NC_017566	TTAGTT	2	12	97721	97732	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386311874
1507	NC_017566	TGA	2	6	97746	97751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386311874
1508	NC_017566	TCA	2	6	97787	97792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386311874
1509	NC_017566	GAA	2	6	97852	97857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386311874
1510	NC_017566	A	6	6	97899	97904	100 %	0 %	0 %	0 %	386311874
1511	NC_017566	TA	3	6	97916	97921	50 %	50 %	0 %	0 %	386311874
1512	NC_017566	GTGG	2	8	97927	97934	0 %	25 %	75 %	0 %	386311874
1513	NC_017566	AGC	2	6	98011	98016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386311874
1514	NC_017566	CGA	2	6	98019	98024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386311874
1515	NC_017566	GTG	2	6	98114	98119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386311874
1516	NC_017566	ATT	2	6	98137	98142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386311874
1517	NC_017566	ATA	2	6	98198	98203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386311874
1518	NC_017566	CCCG	2	8	98452	98459	0 %	0 %	25 %	75 %	386311874
1519	NC_017566	ATA	2	6	98549	98554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386311874
1520	NC_017566	ACTCAA	2	12	98638	98649	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	386311874
1521	NC_017566	GTT	2	6	98662	98667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386311874
1522	NC_017566	TCA	2	6	98700	98705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386311874
1523	NC_017566	GAA	2	6	98737	98742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386311874
1524	NC_017566	GTA	2	6	98798	98803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386311874
1525	NC_017566	GGCTCG	2	12	98821	98832	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386311874
1526	NC_017566	TGG	3	9	98850	98858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386311874
1527	NC_017566	AGG	2	6	98862	98867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386311874
1528	NC_017566	GGT	2	6	98890	98895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386311874
1529	NC_017566	AGG	2	6	98898	98903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386311874
1530	NC_017566	GGT	2	6	98923	98928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386311874
1531	NC_017566	TGG	3	9	98940	98948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386311874
1532	NC_017566	TA	3	6	98993	98998	50 %	50 %	0 %	0 %	386311874
1533	NC_017566	GCA	2	6	99004	99009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386311874
1534	NC_017566	AGTATC	2	12	99011	99022	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386311874
1535	NC_017566	GGC	2	6	99052	99057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386311874
1536	NC_017566	CACT	2	8	99064	99071	25 %	25 %	0 %	50 %	386311874
1537	NC_017566	GAT	2	6	99091	99096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386311874
1538	NC_017566	CG	3	6	99162	99167	0 %	0 %	50 %	50 %	386311874
1539	NC_017566	GAA	2	6	99235	99240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386311874
1540	NC_017566	GAA	2	6	99321	99326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386311874
1541	NC_017566	TAA	2	6	99402	99407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386311874
1542	NC_017566	CTT	2	6	99447	99452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386311874
1543	NC_017566	CGA	2	6	99474	99479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386311874
1544	NC_017566	A	6	6	99621	99626	100 %	0 %	0 %	0 %	386311874
1545	NC_017566	GC	3	6	99717	99722	0 %	0 %	50 %	50 %	386311874
1546	NC_017566	ACT	2	6	99743	99748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386311874
1547	NC_017566	GTC	2	6	99776	99781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311874
1548	NC_017566	TTG	2	6	99788	99793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386311874
1549	NC_017566	TTAACT	2	12	99840	99851	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386311875
1550	NC_017566	AGG	2	6	99879	99884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386311875
1551	NC_017566	TG	3	6	99917	99922	0 %	50 %	50 %	0 %	386311875
1552	NC_017566	GGC	2	6	100005	100010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386311875
1553	NC_017566	CGGT	2	8	100071	100078	0 %	25 %	50 %	25 %	386311875
1554	NC_017566	ATT	2	6	100165	100170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386311875
1555	NC_017566	AAGT	2	8	100188	100195	50 %	25 %	25 %	0 %	386311875
1556	NC_017566	TGA	2	6	100224	100229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386311875
1557	NC_017566	TGA	2	6	100270	100275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386311875
1558	NC_017566	TGA	2	6	100291	100296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386311875
1559	NC_017566	ATT	2	6	100394	100399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386311875
1560	NC_017566	AG	4	8	100417	100424	50 %	0 %	50 %	0 %	386311875
1561	NC_017566	A	6	6	100499	100504	100 %	0 %	0 %	0 %	386311875
1562	NC_017566	AGCC	2	8	100559	100566	25 %	0 %	25 %	50 %	386311875
1563	NC_017566	TAT	2	6	100569	100574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386311875
1564	NC_017566	GCAG	2	8	100600	100607	25 %	0 %	50 %	25 %	386311875
1565	NC_017566	GAA	2	6	100716	100721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386311875
1566	NC_017566	TTA	2	6	100757	100762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386311875
1567	NC_017566	TGA	2	6	101073	101078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386311875
1568	NC_017566	GT	3	6	101136	101141	0 %	50 %	50 %	0 %	386311875
1569	NC_017566	GGA	2	6	101164	101169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386311875
1570	NC_017566	GTC	2	6	101188	101193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311876
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1572	NC_017566	TG	3	6	101248	101253	0 %	50 %	50 %	0 %	386311876
1573	NC_017566	TTA	2	6	101343	101348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386311876
1574	NC_017566	CAT	2	6	101378	101383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386311876
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1579	NC_017566	TG	3	6	101730	101735	0 %	50 %	50 %	0 %	386311876
1580	NC_017566	A	6	6	101860	101865	100 %	0 %	0 %	0 %	386311876
1581	NC_017566	CT	3	6	101886	101891	0 %	50 %	0 %	50 %	386311877
1582	NC_017566	TTG	2	6	101914	101919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386311877
1583	NC_017566	TGA	2	6	101978	101983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386311877
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1585	NC_017566	GCTG	2	8	102202	102209	0 %	25 %	50 %	25 %	386311877
1586	NC_017566	GT	3	6	102293	102298	0 %	50 %	50 %	0 %	386311877
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1590	NC_017566	CTT	2	6	102497	102502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386311878
1591	NC_017566	TA	4	8	102549	102556	50 %	50 %	0 %	0 %	386311878
1592	NC_017566	GA	3	6	102661	102666	50 %	0 %	50 %	0 %	386311878
1593	NC_017566	CTG	3	9	102675	102683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311878
1594	NC_017566	ATG	2	6	102720	102725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386311878
1595	NC_017566	GCT	2	6	102782	102787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311878
1596	NC_017566	ATT	2	6	102848	102853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386311878
1597	NC_017566	TGA	2	6	102993	102998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386311878
1598	NC_017566	AAGC	2	8	103127	103134	50 %	0 %	25 %	25 %	386311878
1599	NC_017566	AGC	2	6	103180	103185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386311879
1600	NC_017566	TGA	2	6	103195	103200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386311879
1601	NC_017566	AAG	2	6	103247	103252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386311879
1602	NC_017566	GATGAA	2	12	103287	103298	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386311879
1603	NC_017566	GAT	2	6	103305	103310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386311879
1604	NC_017566	TCG	2	6	103340	103345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311879
1605	NC_017566	GAT	2	6	103349	103354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386311879
1606	NC_017566	TGAG	2	8	103611	103618	25 %	25 %	50 %	0 %	386311880
1607	NC_017566	TGTT	2	8	103674	103681	0 %	75 %	25 %	0 %	386311880
1608	NC_017566	GTC	2	6	103870	103875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311880
1609	NC_017566	GA	3	6	103884	103889	50 %	0 %	50 %	0 %	386311880
1610	NC_017566	AAC	2	6	103890	103895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386311880
1611	NC_017566	GC	3	6	103995	104000	0 %	0 %	50 %	50 %	386311880
1612	NC_017566	TTA	2	6	104027	104032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386311880
1613	NC_017566	TCTGC	2	10	104057	104066	0 %	40 %	20 %	40 %	386311880
1614	NC_017566	TGC	2	6	104157	104162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311880
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1618	NC_017566	TCG	2	6	104433	104438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311880
1619	NC_017566	AAG	2	6	104475	104480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386311880
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1621	NC_017566	CATTT	2	10	104526	104535	20 %	60 %	0 %	20 %	386311880
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1990	NC_017566	CAAT	2	8	133411	133418	50 %	25 %	0 %	25 %	386311904
1991	NC_017566	TTG	2	6	133597	133602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386311904
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1994	NC_017566	GCAA	2	8	133665	133672	50 %	0 %	25 %	25 %	386311904
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2000	NC_017566	TGC	2	6	133960	133965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311904

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