MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Shewanella putrefaciens 200 chromosome

Total Repeats: 57826

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017566	TGA	2	6	51	56	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017566	CAA	2	6	93	98	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386311793
3	NC_017566	GAC	2	6	106	111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386311793
4	NC_017566	CAG	2	6	132	137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386311793
5	NC_017566	GTC	2	6	313	318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311793
6	NC_017566	TCG	2	6	478	483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311793
7	NC_017566	TGG	2	6	539	544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386311793
8	NC_017566	ATT	2	6	557	562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386311793
9	NC_017566	TGG	2	6	569	574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386311793
10	NC_017566	TTG	2	6	597	602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386311793
11	NC_017566	ATC	2	6	621	626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386311793
12	NC_017566	AAT	2	6	630	635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386311793
13	NC_017566	AAT	2	6	702	707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386311793
14	NC_017566	GAA	2	6	714	719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386311793
15	NC_017566	TAC	2	6	729	734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386311793
16	NC_017566	AAG	2	6	796	801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386311793
17	NC_017566	TTC	2	6	804	809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386311793
18	NC_017566	ACC	2	6	838	843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386311793
19	NC_017566	ATT	2	6	846	851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386311793
20	NC_017566	CTT	2	6	1022	1027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386311793
21	NC_017566	TAC	2	6	1212	1217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386311793
22	NC_017566	TGT	2	6	1237	1242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386311793
23	NC_017566	TGG	2	6	1343	1348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386311793
24	NC_017566	CAC	2	6	1358	1363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386311793
25	NC_017566	AGA	2	6	1421	1426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386311793
26	NC_017566	TCT	2	6	1452	1457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386311793
27	NC_017566	TTG	2	6	1638	1643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386311794
28	NC_017566	GAA	2	6	1670	1675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386311794
29	NC_017566	ACA	2	6	1682	1687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386311794
30	NC_017566	AAG	2	6	1697	1702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386311794
31	NC_017566	AGC	2	6	1752	1757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386311794
32	NC_017566	GCT	2	6	1771	1776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311794
33	NC_017566	AGA	2	6	1819	1824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386311794
34	NC_017566	TTA	2	6	1936	1941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386311794
35	NC_017566	GTG	2	6	2316	2321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386311794
36	NC_017566	GAA	2	6	2378	2383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386311794
37	NC_017566	ATC	2	6	2393	2398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386311794
38	NC_017566	GAT	2	6	2480	2485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386311794
39	NC_017566	GAA	2	6	2540	2545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386311794
40	NC_017566	TAT	2	6	2729	2734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017566	TAA	2	6	2960	2965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386311795
42	NC_017566	TCG	2	6	3239	3244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311795
43	NC_017566	ACT	2	6	3473	3478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386311795
44	NC_017566	ATT	2	6	3602	3607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386311795
45	NC_017566	ACA	2	6	3647	3652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386311795
46	NC_017566	GAT	2	6	3681	3686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386311795
47	NC_017566	CTG	2	6	3778	3783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311795
48	NC_017566	ATA	2	6	3872	3877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386311796
49	NC_017566	TTC	2	6	3897	3902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386311796
50	NC_017566	CGA	2	6	3969	3974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386311796
51	NC_017566	CAT	2	6	3988	3993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386311796
52	NC_017566	AGT	2	6	4005	4010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386311796
53	NC_017566	GAT	2	6	4096	4101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386311796
54	NC_017566	GAA	2	6	4132	4137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386311796
55	NC_017566	GCA	2	6	4147	4152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386311796
56	NC_017566	TTA	2	6	4157	4162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386311796
57	NC_017566	CGG	2	6	4179	4184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386311796
58	NC_017566	GAT	2	6	4192	4197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386311796
59	NC_017566	TGG	2	6	4215	4220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386311796
60	NC_017566	TCG	2	6	4281	4286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311796
61	NC_017566	TCG	2	6	4550	4555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311796
62	NC_017566	ATT	2	6	4556	4561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386311796
63	NC_017566	TAA	2	6	4569	4574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386311796
64	NC_017566	GAC	2	6	4618	4623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386311796
65	NC_017566	CAA	2	6	4689	4694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386311796
66	NC_017566	TGG	2	6	4710	4715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386311796
67	NC_017566	CAA	2	6	4758	4763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386311796
68	NC_017566	GAT	2	6	4816	4821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386311796
69	NC_017566	CTG	2	6	4960	4965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311796
70	NC_017566	TCG	2	6	4991	4996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311796
71	NC_017566	GCG	2	6	5029	5034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386311796
72	NC_017566	CGT	2	6	5056	5061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311796
73	NC_017566	GGT	2	6	5080	5085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386311796
74	NC_017566	CTG	2	6	5159	5164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311796
75	NC_017566	TGT	2	6	5261	5266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386311796
76	NC_017566	AAG	2	6	5273	5278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386311796
77	NC_017566	CAT	4	12	5355	5366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386311796
78	NC_017566	CTT	3	9	5415	5423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386311796
79	NC_017566	GCC	2	6	5472	5477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386311796
80	NC_017566	TTG	2	6	5657	5662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386311796
81	NC_017566	AGC	2	6	5672	5677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386311796
82	NC_017566	TGA	2	6	5742	5747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386311796
83	NC_017566	TGG	2	6	5789	5794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386311796
84	NC_017566	TTC	2	6	5920	5925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386311796
85	NC_017566	GCG	2	6	5962	5967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386311796
86	NC_017566	GAA	2	6	5983	5988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386311796
87	NC_017566	GGC	2	6	5989	5994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386311796
88	NC_017566	GTG	2	6	6005	6010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386311796
89	NC_017566	AAG	2	6	6020	6025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386311796
90	NC_017566	TGA	2	6	6180	6185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386311796
91	NC_017566	GTT	2	6	6204	6209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386311796
92	NC_017566	TGT	2	6	6297	6302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017566	TGT	2	6	6307	6312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017566	ATT	2	6	6362	6367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017566	AGC	2	6	6385	6390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017566	TAT	2	6	6391	6396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017566	GTT	2	6	6397	6402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017566	TAA	2	6	6523	6528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386311797
99	NC_017566	ATT	2	6	6529	6534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386311797
100	NC_017566	CAG	2	6	6629	6634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386311797
101	NC_017566	CTG	2	6	6645	6650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311797
102	NC_017566	GTT	2	6	6653	6658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386311797
103	NC_017566	ATG	2	6	6711	6716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386311797
104	NC_017566	CAA	2	6	6730	6735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386311797
105	NC_017566	ACA	2	6	6976	6981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386311797
106	NC_017566	CAC	2	6	7024	7029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386311797
107	NC_017566	CGT	2	6	7073	7078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311797
108	NC_017566	CTC	2	6	7211	7216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386311797
109	NC_017566	TGA	2	6	7275	7280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386311797
110	NC_017566	CGA	2	6	7281	7286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386311797
111	NC_017566	TGC	2	6	7396	7401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311797
112	NC_017566	TGC	2	6	7440	7445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311797
113	NC_017566	GCA	2	6	7489	7494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386311797
114	NC_017566	GCT	2	6	7537	7542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311797
115	NC_017566	ATT	2	6	7640	7645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386311798
116	NC_017566	ATT	2	6	7689	7694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386311798
117	NC_017566	CAA	2	6	7695	7700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386311798
118	NC_017566	TCA	2	6	7726	7731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386311798
119	NC_017566	TTG	2	6	7803	7808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386311798
120	NC_017566	GCC	2	6	7864	7869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386311798
121	NC_017566	TAG	2	6	7910	7915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386311798
122	NC_017566	GCT	2	6	7966	7971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311798
123	NC_017566	CAG	2	6	8036	8041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386311798
124	NC_017566	TCG	2	6	8143	8148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311798
125	NC_017566	GCA	2	6	8246	8251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386311798
126	NC_017566	GGC	2	6	8259	8264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386311798
127	NC_017566	TCA	2	6	8516	8521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386311798
128	NC_017566	GGC	2	6	8592	8597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386311798
129	NC_017566	GCT	2	6	8639	8644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311798
130	NC_017566	CAT	2	6	8831	8836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386311798
131	NC_017566	TTC	2	6	8910	8915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386311798
132	NC_017566	CGG	2	6	8987	8992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386311798
133	NC_017566	CCA	2	6	8995	9000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386311798
134	NC_017566	GCG	2	6	9007	9012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386311798
135	NC_017566	TAT	2	6	9251	9256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386311798
136	NC_017566	AGC	2	6	9312	9317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386311798
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147	NC_017566	GCG	2	6	10432	10437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386311799
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152	NC_017566	CTT	2	6	10713	10718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_017566	TGA	2	6	10773	10778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386311800
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159	NC_017566	ATC	2	6	11270	11275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386311800
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249	NC_017566	GCC	2	6	18833	18838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386311805
250	NC_017566	TTG	2	6	18894	18899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386311805
251	NC_017566	CAT	2	6	18940	18945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386311805
252	NC_017566	CCA	2	6	19215	19220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
253	NC_017566	CAG	2	6	19255	19260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
254	NC_017566	CAT	2	6	19268	19273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
255	NC_017566	ACA	2	6	19316	19321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
256	NC_017566	ATT	2	6	19498	19503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
257	NC_017566	ATG	2	6	19514	19519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
258	NC_017566	AGC	2	6	19544	19549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
259	NC_017566	TGT	2	6	19594	19599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
260	NC_017566	ATA	2	6	19638	19643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
261	NC_017566	TCA	2	6	19688	19693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386311806
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263	NC_017566	GAT	2	6	19803	19808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386311806
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275	NC_017566	CAT	2	6	20825	20830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386311806
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285	NC_017566	AAT	2	6	21697	21702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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371	NC_017566	ACC	2	6	28272	28277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386311814
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499	NC_017566	CTT	2	6	38598	38603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
500	NC_017566	ACA	2	6	38663	38668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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