MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella putrefaciens 200 chromosome

Total Repeats: 85921

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_017566	GT	3	6	109468	109473	0 %	50 %	50 %	0 %	386311886
2002	NC_017566	GTG	2	6	109514	109519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386311886
2003	NC_017566	CAT	2	6	109645	109650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2004	NC_017566	TAA	2	6	109701	109706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2005	NC_017566	TGTTT	2	10	109726	109735	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
2006	NC_017566	GCATTC	2	12	109767	109778	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2007	NC_017566	TA	3	6	109787	109792	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2008	NC_017566	A	6	6	109873	109878	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2009	NC_017566	GA	3	6	109881	109886	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2010	NC_017566	TGA	2	6	109893	109898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386311887
2011	NC_017566	TGG	2	6	109924	109929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386311887
2012	NC_017566	GGCGCT	2	12	109984	109995	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386311887
2013	NC_017566	CAC	2	6	110004	110009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386311887
2014	NC_017566	TCA	2	6	110058	110063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386311887
2015	NC_017566	CCA	2	6	110064	110069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386311887
2016	NC_017566	GCC	2	6	110114	110119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386311887
2017	NC_017566	GCTG	2	8	110140	110147	0 %	25 %	50 %	25 %	386311887
2018	NC_017566	GCC	2	6	110209	110214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386311887
2019	NC_017566	CTGG	2	8	110311	110318	0 %	25 %	50 %	25 %	386311887
2020	NC_017566	CTG	2	6	110512	110517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311887
2021	NC_017566	CCCAA	2	10	110622	110631	40 %	0 %	0 %	60 %	386311887
2022	NC_017566	ACG	2	6	110646	110651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386311887
2023	NC_017566	GC	3	6	110713	110718	0 %	0 %	50 %	50 %	386311887
2024	NC_017566	CT	3	6	110728	110733	0 %	50 %	0 %	50 %	386311887
2025	NC_017566	GGC	2	6	110738	110743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386311887
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2030	NC_017566	CGC	2	6	110968	110973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386311888
2031	NC_017566	TGG	2	6	111054	111059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386311888
2032	NC_017566	T	6	6	111061	111066	0 %	100 %	0 %	0 %	386311888
2033	NC_017566	CCA	2	6	111093	111098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386311888
2034	NC_017566	GTG	2	6	111104	111109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386311888
2035	NC_017566	CGC	2	6	111130	111135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386311888
2036	NC_017566	GGC	2	6	111193	111198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386311888
2037	NC_017566	CTG	2	6	111236	111241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311888
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2039	NC_017566	GGC	2	6	111262	111267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386311888
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2041	NC_017566	GCT	2	6	111307	111312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311888
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2043	NC_017566	CGG	2	6	111360	111365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386311888
2044	NC_017566	G	6	6	111370	111375	0 %	0 %	100 %	0 %	386311888
2045	NC_017566	GGC	2	6	111457	111462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386311888
2046	NC_017566	GTG	2	6	111521	111526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386311888
2047	NC_017566	TGC	2	6	111534	111539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311888
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2049	NC_017566	CTGC	2	8	111838	111845	0 %	25 %	25 %	50 %	386311888
2050	NC_017566	GCT	2	6	111856	111861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311888
2051	NC_017566	CTG	2	6	111881	111886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311888
2052	NC_017566	CTG	2	6	111920	111925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311888
2053	NC_017566	GCT	2	6	112018	112023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311888
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2055	NC_017566	CTG	2	6	112046	112051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311888
2056	NC_017566	TGC	2	6	112059	112064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311888
2057	NC_017566	CGGGC	2	10	112069	112078	0 %	0 %	60 %	40 %	386311888
2058	NC_017566	CTG	3	9	112079	112087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311888
2059	NC_017566	GCC	2	6	112098	112103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386311888
2060	NC_017566	CTG	2	6	112145	112150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311888
2061	NC_017566	ATGG	2	8	112211	112218	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2062	NC_017566	T	6	6	112248	112253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2063	NC_017566	TTAT	2	8	112294	112301	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2064	NC_017566	CAT	2	6	112334	112339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2065	NC_017566	CA	3	6	112382	112387	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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2091	NC_017566	GTGG	2	8	114362	114369	0 %	25 %	75 %	0 %	386311889
2092	NC_017566	AGG	2	6	114426	114431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386311889
2093	NC_017566	CTG	2	6	114506	114511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311889
2094	NC_017566	AT	3	6	114560	114565	50 %	50 %	0 %	0 %	386311889
2095	NC_017566	TGC	2	6	114625	114630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2096	NC_017566	TGG	2	6	114635	114640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2097	NC_017566	ACC	2	6	114654	114659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2098	NC_017566	GTTT	2	8	114776	114783	0 %	75 %	25 %	0 %	386311890
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2104	NC_017566	A	6	6	115584	115589	100 %	0 %	0 %	0 %	386311890
2105	NC_017566	ATG	2	6	115620	115625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386311890
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2121	NC_017566	GCGCT	2	10	116271	116280	0 %	20 %	40 %	40 %	386311892
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2123	NC_017566	TGT	2	6	116389	116394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386311892
2124	NC_017566	GCCAT	2	10	116415	116424	20 %	20 %	20 %	40 %	386311892
2125	NC_017566	TAC	2	6	116431	116436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386311892
2126	NC_017566	GGC	2	6	116447	116452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386311892
2127	NC_017566	CCGT	2	8	116505	116512	0 %	25 %	25 %	50 %	386311892
2128	NC_017566	CAAA	2	8	116551	116558	75 %	0 %	0 %	25 %	386311892
2129	NC_017566	TCA	2	6	116569	116574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386311892
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2131	NC_017566	TGA	2	6	116625	116630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386311892
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2133	NC_017566	CTG	2	6	116656	116661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311892
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2137	NC_017566	TTTC	2	8	116945	116952	0 %	75 %	0 %	25 %	386311893
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2144	NC_017566	GGC	2	6	117530	117535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386311893
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2240	NC_017566	T	7	7	123144	123150	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2241	NC_017566	A	6	6	123341	123346	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2242	NC_017566	AGC	2	6	123410	123415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2244	NC_017566	AAC	2	6	123716	123721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2245	NC_017566	GGA	2	6	123738	123743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2246	NC_017566	CAG	2	6	123799	123804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2247	NC_017566	ATT	2	6	123841	123846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2248	NC_017566	CAT	2	6	123897	123902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2249	NC_017566	TGA	2	6	124046	124051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2250	NC_017566	CGT	2	6	124056	124061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2251	NC_017566	TGA	2	6	124065	124070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2252	NC_017566	TGAG	2	8	124127	124134	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2253	NC_017566	TTG	2	6	124174	124179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2254	NC_017566	CAT	2	6	124306	124311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2255	NC_017566	ATT	2	6	124323	124328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2256	NC_017566	A	6	6	124350	124355	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2257	NC_017566	TTG	2	6	124358	124363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2258	NC_017566	ATA	2	6	124364	124369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2259	NC_017566	TTG	2	6	124376	124381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2263	NC_017566	ATTAC	2	10	124719	124728	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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2271	NC_017566	GACC	2	8	125229	125236	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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2337	NC_017566	CTGTGG	2	12	130381	130392	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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2357	NC_017566	GAC	2	6	131171	131176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386311902
2358	NC_017566	AGGT	2	8	131230	131237	25 %	25 %	50 %	0 %	386311902
2359	NC_017566	CGA	2	6	131267	131272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386311902
2360	NC_017566	GATA	2	8	131273	131280	50 %	25 %	25 %	0 %	386311902
2361	NC_017566	GAA	2	6	131343	131348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386311902
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2364	NC_017566	CTT	2	6	131436	131441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2365	NC_017566	A	6	6	131607	131612	100 %	0 %	0 %	0 %	386311903
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2370	NC_017566	GTA	2	6	131907	131912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386311903
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2372	NC_017566	GTG	2	6	132085	132090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386311904
2373	NC_017566	TCT	2	6	132129	132134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386311904
2374	NC_017566	CTG	2	6	132140	132145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311904
2375	NC_017566	CTT	2	6	132148	132153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386311904
2376	NC_017566	TGT	2	6	132171	132176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386311904
2377	NC_017566	GTAC	2	8	132213	132220	25 %	25 %	25 %	25 %	386311904
2378	NC_017566	GAGC	2	8	132257	132264	25 %	0 %	50 %	25 %	386311904
2379	NC_017566	GCT	2	6	132350	132355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311904
2380	NC_017566	TGC	2	6	132414	132419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311904
2381	NC_017566	TCG	2	6	132477	132482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311904
2382	NC_017566	CGA	2	6	132484	132489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386311904
2383	NC_017566	GCA	2	6	132534	132539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386311904
2384	NC_017566	GAGG	2	8	132629	132636	25 %	0 %	75 %	0 %	386311904
2385	NC_017566	GCTTCA	2	12	132687	132698	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386311904
2386	NC_017566	GCG	2	6	132732	132737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386311904
2387	NC_017566	AG	3	6	132848	132853	50 %	0 %	50 %	0 %	386311904
2388	NC_017566	CCA	2	6	132868	132873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386311904
2389	NC_017566	CTG	2	6	132905	132910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311904
2390	NC_017566	TAA	2	6	132944	132949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386311904
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2392	NC_017566	TTCGC	2	10	133017	133026	0 %	40 %	20 %	40 %	386311904
2393	NC_017566	TTG	2	6	133079	133084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386311904
2394	NC_017566	ATG	2	6	133116	133121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386311904
2395	NC_017566	T	6	6	133170	133175	0 %	100 %	0 %	0 %	386311904
2396	NC_017566	TGT	2	6	133206	133211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386311904
2397	NC_017566	GTT	2	6	133267	133272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386311904
2398	NC_017566	GGTG	2	8	133273	133280	0 %	25 %	75 %	0 %	386311904
2399	NC_017566	CTT	2	6	133288	133293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386311904
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2401	NC_017566	CTT	2	6	133390	133395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386311904
2402	NC_017566	AT	3	6	133403	133408	50 %	50 %	0 %	0 %	386311904
2403	NC_017566	CAAT	2	8	133411	133418	50 %	25 %	0 %	25 %	386311904
2404	NC_017566	TTG	2	6	133597	133602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386311904
2405	NC_017566	GGC	2	6	133627	133632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386311904
2406	NC_017566	CAT	2	6	133643	133648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386311904
2407	NC_017566	GCAA	2	8	133665	133672	50 %	0 %	25 %	25 %	386311904
2408	NC_017566	GCG	2	6	133701	133706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386311904
2409	NC_017566	GCT	2	6	133736	133741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311904
2410	NC_017566	TGA	2	6	133816	133821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386311904
2411	NC_017566	CGG	2	6	133884	133889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386311904
2412	NC_017566	TTG	2	6	133934	133939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386311904
2413	NC_017566	TGC	2	6	133960	133965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311904
2414	NC_017566	ACT	2	6	133974	133979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386311904
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2416	NC_017566	CTG	2	6	134156	134161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2417	NC_017566	TCC	2	6	134209	134214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386311905
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2420	NC_017566	TCA	2	6	134357	134362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386311905
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2422	NC_017566	ATTTCA	2	12	134531	134542	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386311905
2423	NC_017566	TA	3	6	134629	134634	50 %	50 %	0 %	0 %	386311905
2424	NC_017566	TCT	2	6	134705	134710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386311905
2425	NC_017566	CAT	2	6	134716	134721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386311905
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2437	NC_017566	TGT	2	6	135212	135217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386311905
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2441	NC_017566	TGAT	2	8	135404	135411	25 %	50 %	25 %	0 %	386311905
2442	NC_017566	TAA	2	6	135415	135420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386311905
2443	NC_017566	ACGCA	2	10	135523	135532	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
2444	NC_017566	TGC	2	6	135544	135549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311906
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2446	NC_017566	TCA	2	6	135699	135704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386311906
2447	NC_017566	TCA	2	6	135788	135793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386311906
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2450	NC_017566	ATC	2	6	135955	135960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386311906
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2452	NC_017566	TTG	2	6	136039	136044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386311906
2453	NC_017566	ATC	3	9	136219	136227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386311906
2454	NC_017566	GAC	2	6	136228	136233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386311906
2455	NC_017566	TGC	2	6	136299	136304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2456	NC_017566	CAT	2	6	136385	136390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2457	NC_017566	GGT	2	6	136546	136551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2458	NC_017566	ATC	2	6	136575	136580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2459	NC_017566	TTTA	2	8	136613	136620	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2460	NC_017566	GGTT	2	8	136664	136671	0 %	50 %	50 %	0 %	386311907
2461	NC_017566	CGC	2	6	136869	136874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386311907
2462	NC_017566	ACG	2	6	136920	136925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386311907
2463	NC_017566	TCG	2	6	136950	136955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311907
2464	NC_017566	GC	4	8	137009	137016	0 %	0 %	50 %	50 %	386311907
2465	NC_017566	GCAA	2	8	137025	137032	50 %	0 %	25 %	25 %	386311907
2466	NC_017566	GAT	2	6	137036	137041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386311907
2467	NC_017566	AGA	2	6	137191	137196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2468	NC_017566	TTTA	2	8	137293	137300	25 %	75 %	0 %	0 %	386311908
2469	NC_017566	AGC	2	6	137370	137375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386311908
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2472	NC_017566	AAG	2	6	137442	137447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386311908
2473	NC_017566	GCTG	2	8	137737	137744	0 %	25 %	50 %	25 %	386311908
2474	NC_017566	AGG	2	6	137916	137921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386311908
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2478	NC_017566	TAG	2	6	138118	138123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386311908
2479	NC_017566	GTA	2	6	138146	138151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386311908
2480	NC_017566	ATTGC	2	10	138173	138182	20 %	40 %	20 %	20 %	386311908
2481	NC_017566	GAAGCC	2	12	138224	138235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386311908
2482	NC_017566	GGC	2	6	138274	138279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386311908
2483	NC_017566	A	6	6	138292	138297	100 %	0 %	0 %	0 %	386311908
2484	NC_017566	GTG	2	6	138344	138349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386311908
2485	NC_017566	TGC	2	6	138511	138516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311908
2486	NC_017566	AATT	2	8	138519	138526	50 %	50 %	0 %	0 %	386311908
2487	NC_017566	CGCC	2	8	138664	138671	0 %	0 %	25 %	75 %	386311908
2488	NC_017566	GTCA	2	8	138746	138753	25 %	25 %	25 %	25 %	386311908
2489	NC_017566	GCG	2	6	138974	138979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386311908
2490	NC_017566	T	6	6	138982	138987	0 %	100 %	0 %	0 %	386311908
2491	NC_017566	TGG	2	6	139050	139055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386311908
2492	NC_017566	ACGA	2	8	139117	139124	50 %	0 %	25 %	25 %	386311908
2493	NC_017566	GAA	2	6	139253	139258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386311908
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