MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella putrefaciens 200 chromosome

Total Repeats: 85921

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017566	CAC	2	6	26846	26851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386311813
502	NC_017566	GTT	2	6	26873	26878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386311813
503	NC_017566	GCTC	2	8	26893	26900	0 %	25 %	25 %	50 %	386311813
504	NC_017566	CCA	2	6	26974	26979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386311813
505	NC_017566	ATA	2	6	26986	26991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386311813
506	NC_017566	GGTA	2	8	26996	27003	25 %	25 %	50 %	0 %	386311813
507	NC_017566	TCA	2	6	27026	27031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386311813
508	NC_017566	CGA	2	6	27056	27061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386311813
509	NC_017566	TCA	2	6	27070	27075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386311813
510	NC_017566	AAT	2	6	27084	27089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386311813
511	NC_017566	CG	3	6	27098	27103	0 %	0 %	50 %	50 %	386311813
512	NC_017566	ACC	2	6	27201	27206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386311813
513	NC_017566	CAA	2	6	27281	27286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386311813
514	NC_017566	CCA	2	6	27346	27351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386311813
515	NC_017566	TTG	2	6	27443	27448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386311813
516	NC_017566	GGC	2	6	27480	27485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386311813
517	NC_017566	CTT	2	6	27545	27550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386311813
518	NC_017566	ATT	2	6	27654	27659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386311813
519	NC_017566	CACC	2	8	27662	27669	25 %	0 %	0 %	75 %	386311813
520	NC_017566	TAA	2	6	27772	27777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386311814
521	NC_017566	TTGTC	2	10	27790	27799	0 %	60 %	20 %	20 %	386311814
522	NC_017566	TCTA	2	8	27873	27880	25 %	50 %	0 %	25 %	386311814
523	NC_017566	AAG	2	6	27936	27941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386311814
524	NC_017566	CCT	2	6	27946	27951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386311814
525	NC_017566	TTC	2	6	28005	28010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386311814
526	NC_017566	T	6	6	28021	28026	0 %	100 %	0 %	0 %	386311814
527	NC_017566	CGG	2	6	28051	28056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386311814
528	NC_017566	CCA	2	6	28116	28121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386311814
529	NC_017566	ACC	2	6	28272	28277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386311814
530	NC_017566	CGC	2	6	28332	28337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386311814
531	NC_017566	TGCGC	2	10	28342	28351	0 %	20 %	40 %	40 %	386311814
532	NC_017566	ACT	2	6	28434	28439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386311814
533	NC_017566	TCGC	2	8	28444	28451	0 %	25 %	25 %	50 %	386311814
534	NC_017566	ATG	2	6	28552	28557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386311814
535	NC_017566	CTT	2	6	28580	28585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386311814
536	NC_017566	GT	3	6	28610	28615	0 %	50 %	50 %	0 %	386311814
537	NC_017566	GAC	2	6	28718	28723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386311814
538	NC_017566	CGG	2	6	28730	28735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386311814
539	NC_017566	TGG	2	6	28804	28809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386311814
540	NC_017566	CTG	2	6	28944	28949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311814
541	NC_017566	CAGC	2	8	29009	29016	25 %	0 %	25 %	50 %	386311814
542	NC_017566	GC	4	8	29015	29022	0 %	0 %	50 %	50 %	386311814
543	NC_017566	ATT	2	6	29032	29037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386311815
544	NC_017566	CGG	2	6	29158	29163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386311815
545	NC_017566	ATA	2	6	29196	29201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386311815
546	NC_017566	CTT	2	6	29311	29316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386311815
547	NC_017566	CTT	3	9	29356	29364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386311815
548	NC_017566	GGCT	2	8	29491	29498	0 %	25 %	50 %	25 %	386311815
549	NC_017566	AGC	2	6	29535	29540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386311815
550	NC_017566	CGCC	2	8	29599	29606	0 %	0 %	25 %	75 %	386311815
551	NC_017566	CGA	2	6	29725	29730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386311815
552	NC_017566	CCA	2	6	29731	29736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386311815
553	NC_017566	TTG	2	6	29814	29819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386311815
554	NC_017566	T	6	6	29855	29860	0 %	100 %	0 %	0 %	386311815
555	NC_017566	TTGTG	2	10	29907	29916	0 %	60 %	40 %	0 %	386311815
556	NC_017566	AGC	2	6	29942	29947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386311815
557	NC_017566	ATG	2	6	29970	29975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386311815
558	NC_017566	CAAATC	2	12	29987	29998	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	386311815
559	NC_017566	CTT	2	6	30004	30009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386311816
560	NC_017566	TTTG	2	8	30040	30047	0 %	75 %	25 %	0 %	386311816
561	NC_017566	GATA	2	8	30069	30076	50 %	25 %	25 %	0 %	386311816
562	NC_017566	ACAA	2	8	30081	30088	75 %	0 %	0 %	25 %	386311816
563	NC_017566	GGT	2	6	30100	30105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386311816
564	NC_017566	CAA	2	6	30148	30153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386311816
565	NC_017566	ACT	2	6	30266	30271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386311816
566	NC_017566	GTT	2	6	30340	30345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386311816
567	NC_017566	GCA	2	6	30366	30371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386311816
568	NC_017566	TCA	2	6	30477	30482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386311816
569	NC_017566	AGTT	2	8	30547	30554	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
570	NC_017566	CTAATG	2	12	30562	30573	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
571	NC_017566	AAT	2	6	30601	30606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_017566	ACA	2	6	30632	30637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386311817
573	NC_017566	GTTT	2	8	30693	30700	0 %	75 %	25 %	0 %	386311817
574	NC_017566	A	6	6	30751	30756	100 %	0 %	0 %	0 %	386311817
575	NC_017566	TTAT	2	8	30854	30861	25 %	75 %	0 %	0 %	386311817
576	NC_017566	A	6	6	30945	30950	100 %	0 %	0 %	0 %	386311817
577	NC_017566	AGC	2	6	31064	31069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386311817
578	NC_017566	ATT	2	6	31108	31113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386311817
579	NC_017566	T	6	6	31186	31191	0 %	100 %	0 %	0 %	386311817
580	NC_017566	AGT	2	6	31288	31293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386311817
581	NC_017566	GA	3	6	31298	31303	50 %	0 %	50 %	0 %	386311817
582	NC_017566	GGA	2	6	31332	31337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386311817
583	NC_017566	GAA	2	6	31516	31521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386311817
584	NC_017566	ATG	2	6	31535	31540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386311817
585	NC_017566	CAT	2	6	31581	31586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386311817
586	NC_017566	TGA	2	6	31713	31718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386311817
587	NC_017566	ATT	2	6	31736	31741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386311817
588	NC_017566	CAA	2	6	31828	31833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386311818
589	NC_017566	TTA	2	6	31834	31839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386311818
590	NC_017566	GAC	2	6	31855	31860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386311818
591	NC_017566	GA	3	6	31882	31887	50 %	0 %	50 %	0 %	386311818
592	NC_017566	ATC	2	6	31907	31912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386311818
593	NC_017566	TGAT	2	8	31928	31935	25 %	50 %	25 %	0 %	386311818
594	NC_017566	GCA	2	6	31965	31970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386311818
595	NC_017566	CTC	2	6	31974	31979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386311818
596	NC_017566	GTT	2	6	32022	32027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386311818
597	NC_017566	CTT	2	6	32090	32095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386311818
598	NC_017566	TGC	2	6	32220	32225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386311818
599	NC_017566	ATA	2	6	32246	32251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386311818
600	NC_017566	CAG	2	6	32329	32334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386311818
601	NC_017566	CGAAA	2	10	32393	32402	60 %	0 %	20 %	20 %	386311818
602	NC_017566	ATT	2	6	32407	32412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386311818
603	NC_017566	TTA	2	6	32560	32565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386311818
604	NC_017566	GAA	2	6	32641	32646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386311818
605	NC_017566	CCA	2	6	32658	32663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386311818
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607	NC_017566	ACA	2	6	32731	32736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386311818
608	NC_017566	GGT	2	6	32833	32838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386311818
609	NC_017566	ACT	2	6	32918	32923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386311819
610	NC_017566	TGA	2	6	32927	32932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386311819
611	NC_017566	ACTC	2	8	32951	32958	25 %	25 %	0 %	50 %	386311819
612	NC_017566	TCA	2	6	32969	32974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386311819
613	NC_017566	AAG	2	6	33025	33030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386311819
614	NC_017566	TTCGT	2	10	33065	33074	0 %	60 %	20 %	20 %	386311819
615	NC_017566	TTG	2	6	33126	33131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386311819
616	NC_017566	AACC	2	8	33205	33212	50 %	0 %	0 %	50 %	386311819
617	NC_017566	AGA	2	6	33221	33226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386311819
618	NC_017566	TTG	2	6	33339	33344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_017566	GA	3	6	33360	33365	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
620	NC_017566	AGG	2	6	33367	33372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
621	NC_017566	CCT	2	6	33379	33384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
622	NC_017566	T	6	6	33384	33389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_017566	GGT	2	6	33444	33449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
624	NC_017566	TGA	2	6	33469	33474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386311820
625	NC_017566	ATT	2	6	33478	33483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386311820
626	NC_017566	CGG	2	6	33568	33573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386311820
627	NC_017566	TAA	2	6	33586	33591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386311820
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629	NC_017566	TAA	2	6	33778	33783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386311820
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