MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella putrefaciens 200 chromosome

Total Repeats: 85921

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017566	GTA	2	6	278856	278861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386312049
5002	NC_017566	AGG	2	6	279101	279106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386312049
5003	NC_017566	ATC	2	6	279156	279161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386312049
5004	NC_017566	TTAA	2	8	279214	279221	50 %	50 %	0 %	0 %	386312049
5005	NC_017566	GTA	2	6	279310	279315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386312049
5006	NC_017566	GAA	2	6	279406	279411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386312049
5007	NC_017566	ATA	2	6	279426	279431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386312049
5008	NC_017566	CGC	2	6	279455	279460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386312049
5009	NC_017566	CCA	2	6	279520	279525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386312049
5010	NC_017566	GTT	2	6	279566	279571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386312049
5011	NC_017566	GTC	2	6	279610	279615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386312049
5012	NC_017566	GTT	2	6	279621	279626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386312049
5013	NC_017566	GGTT	2	8	279640	279647	0 %	50 %	50 %	0 %	386312049
5014	NC_017566	TGT	2	6	279722	279727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386312049
5015	NC_017566	AAG	2	6	279784	279789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386312049
5016	NC_017566	TGT	2	6	279822	279827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386312049
5017	NC_017566	ATT	2	6	279870	279875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386312049
5018	NC_017566	TTC	2	6	280021	280026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386312049
5019	NC_017566	TGCAT	2	10	280066	280075	20 %	40 %	20 %	20 %	386312049
5020	NC_017566	AAT	2	6	280086	280091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386312049
5021	NC_017566	CGCC	2	8	280135	280142	0 %	0 %	25 %	75 %	386312049
5022	NC_017566	ATG	2	6	280180	280185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386312049
5023	NC_017566	GGA	2	6	280189	280194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386312049
5024	NC_017566	T	6	6	280226	280231	0 %	100 %	0 %	0 %	386312049
5025	NC_017566	AAT	2	6	280323	280328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386312049
5026	NC_017566	T	6	6	280388	280393	0 %	100 %	0 %	0 %	386312049
5027	NC_017566	TGT	2	6	280415	280420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386312049
5028	NC_017566	GCG	3	9	280435	280443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386312049
5029	NC_017566	GAA	2	6	280617	280622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_017566	GTCGT	2	10	280634	280643	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5031	NC_017566	AAT	2	6	280679	280684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_017566	AGA	2	6	280832	280837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386312050
5033	NC_017566	GAA	2	6	280851	280856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386312050
5034	NC_017566	A	6	6	280864	280869	100 %	0 %	0 %	0 %	386312050
5035	NC_017566	AT	3	6	280905	280910	50 %	50 %	0 %	0 %	386312050
5036	NC_017566	CAG	2	6	280940	280945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386312050
5037	NC_017566	GCT	2	6	280975	280980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386312050
5038	NC_017566	TATC	2	8	281065	281072	25 %	50 %	0 %	25 %	386312051
5039	NC_017566	TAA	2	6	281087	281092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386312051
5040	NC_017566	TC	3	6	281164	281169	0 %	50 %	0 %	50 %	386312051
5041	NC_017566	CGG	2	6	281194	281199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386312051
5042	NC_017566	CCT	2	6	281265	281270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386312051
5043	NC_017566	GAA	2	6	281273	281278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386312051
5044	NC_017566	GCC	2	6	281279	281284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386312051
5045	NC_017566	CGG	2	6	281320	281325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386312051
5046	NC_017566	T	6	6	281328	281333	0 %	100 %	0 %	0 %	386312051
5047	NC_017566	TAC	2	6	281413	281418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386312051
5048	NC_017566	GAT	2	6	281435	281440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386312051
5049	NC_017566	ATTTCA	2	12	281500	281511	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386312051
5050	NC_017566	TTAT	2	8	281512	281519	25 %	75 %	0 %	0 %	386312051
5051	NC_017566	AAT	2	6	281638	281643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386312052
5052	NC_017566	AC	3	6	281821	281826	50 %	0 %	0 %	50 %	386312052
5053	NC_017566	TTA	2	6	281848	281853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386312052
5054	NC_017566	CGGAG	2	10	281864	281873	20 %	0 %	60 %	20 %	386312052
5055	NC_017566	CTG	2	6	282008	282013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386312052
5056	NC_017566	CTTG	2	8	282073	282080	0 %	50 %	25 %	25 %	386312052
5057	NC_017566	GAT	2	6	282081	282086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386312052
5058	NC_017566	GAG	2	6	282213	282218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386312053
5059	NC_017566	AAT	2	6	282331	282336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386312053
5060	NC_017566	ATC	2	6	282385	282390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386312053
5061	NC_017566	GCA	2	6	282426	282431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386312053
5062	NC_017566	A	6	6	282475	282480	100 %	0 %	0 %	0 %	386312053
5063	NC_017566	TGA	2	6	282518	282523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386312053
5064	NC_017566	ACC	2	6	282622	282627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386312053
5065	NC_017566	GAG	2	6	282736	282741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386312053
5066	NC_017566	GT	3	6	282856	282861	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_017566	TAAA	2	8	282916	282923	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_017566	GAT	2	6	283125	283130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386312054
5069	NC_017566	TCG	2	6	283147	283152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386312054
5070	NC_017566	TTA	2	6	283178	283183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386312054
5071	NC_017566	GGC	2	6	283346	283351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386312054
5072	NC_017566	GTC	2	6	283354	283359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386312054
5073	NC_017566	ACC	2	6	283389	283394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386312054
5074	NC_017566	CAC	2	6	283396	283401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386312054
5075	NC_017566	CA	4	8	283481	283488	50 %	0 %	0 %	50 %	386312054
5076	NC_017566	TGA	2	6	283532	283537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386312054
5077	NC_017566	ATT	2	6	283700	283705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386312054
5078	NC_017566	CTT	2	6	283727	283732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386312054
5079	NC_017566	TG	3	6	283737	283742	0 %	50 %	50 %	0 %	386312054
5080	NC_017566	TAC	2	6	283749	283754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386312054
5081	NC_017566	GTT	2	6	283776	283781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386312054
5082	NC_017566	TGG	2	6	283879	283884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386312054
5083	NC_017566	TA	3	6	283894	283899	50 %	50 %	0 %	0 %	386312054
5084	NC_017566	AGA	2	6	283907	283912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386312054
5085	NC_017566	CAG	2	6	283914	283919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386312054
5086	NC_017566	CTA	2	6	283920	283925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386312054
5087	NC_017566	ATGC	2	8	283931	283938	25 %	25 %	25 %	25 %	386312054
5088	NC_017566	GCC	2	6	283939	283944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386312054
5089	NC_017566	GAT	2	6	283956	283961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386312054
5090	NC_017566	T	6	6	283961	283966	0 %	100 %	0 %	0 %	386312054
5091	NC_017566	GAA	2	6	283973	283978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386312054
5092	NC_017566	AT	3	6	284084	284089	50 %	50 %	0 %	0 %	386312054
5093	NC_017566	CAA	2	6	284115	284120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386312054
5094	NC_017566	CCA	2	6	284148	284153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386312054
5095	NC_017566	TGC	2	6	284161	284166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386312054
5096	NC_017566	ATG	2	6	284233	284238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386312054
5097	NC_017566	AG	3	6	284255	284260	50 %	0 %	50 %	0 %	386312054
5098	NC_017566	TTG	2	6	284323	284328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386312055
5099	NC_017566	T	6	6	284383	284388	0 %	100 %	0 %	0 %	386312055
5100	NC_017566	TGAT	2	8	284438	284445	25 %	50 %	25 %	0 %	386312055
5101	NC_017566	GTG	2	6	284572	284577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386312055
5102	NC_017566	TGA	2	6	284579	284584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386312055
5103	NC_017566	GCA	2	6	284757	284762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386312055
5104	NC_017566	ATT	2	6	284842	284847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386312055
5105	NC_017566	GGTT	2	8	284980	284987	0 %	50 %	50 %	0 %	386312055
5106	NC_017566	GCC	2	6	285091	285096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386312055
5107	NC_017566	ATT	2	6	285107	285112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386312055
5108	NC_017566	ATTG	2	8	285156	285163	25 %	50 %	25 %	0 %	386312055
5109	NC_017566	AAC	2	6	285251	285256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386312055
5110	NC_017566	AAT	2	6	285264	285269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386312055
5111	NC_017566	GTA	2	6	285308	285313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386312055
5112	NC_017566	CGC	2	6	285329	285334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386312055
5113	NC_017566	TGG	2	6	285413	285418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_017566	CA	3	6	285433	285438	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5115	NC_017566	TTAT	2	8	285462	285469	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_017566	CGA	2	6	285583	285588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386312056
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5118	NC_017566	AGC	2	6	285633	285638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386312056
5119	NC_017566	GCC	2	6	285648	285653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386312056
5120	NC_017566	CTC	2	6	285674	285679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386312056
5121	NC_017566	TCT	2	6	285732	285737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386312056
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5123	NC_017566	CAAC	2	8	285797	285804	50 %	0 %	0 %	50 %	386312056
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