MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella putrefaciens 200 chromosome

Total Repeats: 85921

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017566	TTGAA	2	10	250920	250929	40 %	40 %	20 %	0 %	386312022
4502	NC_017566	GAT	2	6	251203	251208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386312022
4503	NC_017566	GCCT	2	8	251340	251347	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4504	NC_017566	GAT	2	6	251433	251438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386312023
4505	NC_017566	CGA	2	6	251473	251478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386312023
4506	NC_017566	ATC	2	6	251492	251497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386312023
4507	NC_017566	GCA	2	6	251527	251532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386312023
4508	NC_017566	TGAG	2	8	251559	251566	25 %	25 %	50 %	0 %	386312023
4509	NC_017566	CTT	3	9	251575	251583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386312023
4510	NC_017566	GCA	2	6	251650	251655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386312023
4511	NC_017566	GCA	2	6	251658	251663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386312023
4512	NC_017566	TCAA	2	8	251712	251719	50 %	25 %	0 %	25 %	386312023
4513	NC_017566	CAT	2	6	251785	251790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386312023
4514	NC_017566	ATTG	2	8	251801	251808	25 %	50 %	25 %	0 %	386312023
4515	NC_017566	GC	3	6	251864	251869	0 %	0 %	50 %	50 %	386312023
4516	NC_017566	TCA	2	6	251895	251900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386312023
4517	NC_017566	GTG	2	6	251914	251919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386312023
4518	NC_017566	TTC	2	6	251993	251998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386312023
4519	NC_017566	AT	3	6	252061	252066	50 %	50 %	0 %	0 %	386312023
4520	NC_017566	TG	3	6	252105	252110	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_017566	CCA	2	6	252213	252218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386312024
4522	NC_017566	TGGC	2	8	252257	252264	0 %	25 %	50 %	25 %	386312024
4523	NC_017566	AGAT	2	8	252280	252287	50 %	25 %	25 %	0 %	386312024
4524	NC_017566	GAA	2	6	252310	252315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386312024
4525	NC_017566	GCA	2	6	252335	252340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386312024
4526	NC_017566	GCA	2	6	252432	252437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386312024
4527	NC_017566	CAGT	2	8	252489	252496	25 %	25 %	25 %	25 %	386312024
4528	NC_017566	CG	3	6	252586	252591	0 %	0 %	50 %	50 %	386312024
4529	NC_017566	TCAA	2	8	252635	252642	50 %	25 %	0 %	25 %	386312024
4530	NC_017566	CGG	2	6	252678	252683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386312024
4531	NC_017566	CTG	2	6	252981	252986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386312024
4532	NC_017566	CAA	2	6	252993	252998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386312024
4533	NC_017566	ACC	2	6	253021	253026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386312024
4534	NC_017566	GAG	2	6	253036	253041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386312024
4535	NC_017566	AACGA	2	10	253129	253138	60 %	0 %	20 %	20 %	386312024
4536	NC_017566	GCT	2	6	253186	253191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386312024
4537	NC_017566	CCA	2	6	253193	253198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386312024
4538	NC_017566	ATC	2	6	253205	253210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386312024
4539	NC_017566	CGGGT	2	10	253274	253283	0 %	20 %	60 %	20 %	386312024
4540	NC_017566	GTA	2	6	253285	253290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386312024
4541	NC_017566	TAA	2	6	253331	253336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_017566	TAG	2	6	253349	253354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_017566	GTC	2	6	253359	253364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4544	NC_017566	AAAT	2	8	253381	253388	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_017566	GATT	2	8	253596	253603	25 %	50 %	25 %	0 %	386312025
4546	NC_017566	GAT	2	6	253644	253649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386312025
4547	NC_017566	GAC	2	6	253719	253724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386312025
4548	NC_017566	CATC	2	8	253744	253751	25 %	25 %	0 %	50 %	386312025
4549	NC_017566	TTG	2	6	253770	253775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386312025
4550	NC_017566	TTA	2	6	253816	253821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386312025
4551	NC_017566	ATCTAA	2	12	253830	253841	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386312025
4552	NC_017566	AAT	2	6	253856	253861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386312025
4553	NC_017566	TGA	2	6	253865	253870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386312025
4554	NC_017566	CTT	2	6	253934	253939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386312025
4555	NC_017566	AG	3	6	253950	253955	50 %	0 %	50 %	0 %	386312025
4556	NC_017566	GTC	2	6	254071	254076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4557	NC_017566	ATA	2	6	254157	254162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_017566	TAA	2	6	254174	254179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_017566	ATAA	2	8	254205	254212	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_017566	TCG	2	6	254247	254252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4561	NC_017566	AGC	2	6	254258	254263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4562	NC_017566	ATTA	2	8	254323	254330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_017566	GAT	2	6	254332	254337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386312026
4564	NC_017566	AAC	2	6	254455	254460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386312026
4565	NC_017566	ACA	2	6	254533	254538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386312026
4566	NC_017566	TGCT	2	8	254548	254555	0 %	50 %	25 %	25 %	386312026
4567	NC_017566	GCTA	2	8	254580	254587	25 %	25 %	25 %	25 %	386312026
4568	NC_017566	T	6	6	254613	254618	0 %	100 %	0 %	0 %	386312026
4569	NC_017566	ATT	2	6	254647	254652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386312026
4570	NC_017566	GTT	2	6	254711	254716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_017566	TAT	2	6	254785	254790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4572	NC_017566	CGA	2	6	254806	254811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4573	NC_017566	TTA	2	6	254832	254837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_017566	ATT	2	6	254841	254846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_017566	TTTA	2	8	254847	254854	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_017566	AAT	2	6	254857	254862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4577	NC_017566	TGA	2	6	254889	254894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4578	NC_017566	TAC	2	6	254905	254910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4579	NC_017566	TTC	3	9	254926	254934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4580	NC_017566	TCC	2	6	255001	255006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4581	NC_017566	TTA	2	6	255040	255045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386312027
4582	NC_017566	AGC	2	6	255152	255157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386312027
4583	NC_017566	GCCA	2	8	255220	255227	25 %	0 %	25 %	50 %	386312027
4584	NC_017566	A	6	6	255227	255232	100 %	0 %	0 %	0 %	386312027
4585	NC_017566	TAAA	2	8	255275	255282	75 %	25 %	0 %	0 %	386312027
4586	NC_017566	TC	3	6	255283	255288	0 %	50 %	0 %	50 %	386312027
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4589	NC_017566	TA	3	6	255332	255337	50 %	50 %	0 %	0 %	386312027
4590	NC_017566	ATT	2	6	255408	255413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386312027
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4592	NC_017566	CGG	2	6	255431	255436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386312027
4593	NC_017566	TTG	2	6	255445	255450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386312027
4594	NC_017566	GGC	2	6	255540	255545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386312027
4595	NC_017566	TATC	2	8	255551	255558	25 %	50 %	0 %	25 %	386312027
4596	NC_017566	AAT	2	6	255631	255636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386312027
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4599	NC_017566	AGTG	2	8	255771	255778	25 %	25 %	50 %	0 %	386312027
4600	NC_017566	TAA	3	9	255783	255791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386312027
4601	NC_017566	TAT	2	6	255797	255802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386312027
4602	NC_017566	CGT	2	6	255816	255821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386312027
4603	NC_017566	TG	3	6	255916	255921	0 %	50 %	50 %	0 %	386312027
4604	NC_017566	GCC	2	6	255922	255927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386312027
4605	NC_017566	CGG	2	6	255984	255989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386312027
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4608	NC_017566	GTTG	2	8	256085	256092	0 %	50 %	50 %	0 %	386312027
4609	NC_017566	ATC	2	6	256120	256125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386312027
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4611	NC_017566	CCG	3	9	256160	256168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386312027
4612	NC_017566	GAA	2	6	256252	256257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386312027
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4614	NC_017566	TCA	2	6	256407	256412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386312027
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4622	NC_017566	GGC	2	6	256854	256859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386312027
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