MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Mannheimia haemolytica USMARC_2286

Total Repeats: 3052

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021883	CAG	2	6	494914	494919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_021883	GTT	2	6	494983	494988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
503	NC_021883	GGA	2	6	495105	495110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
504	NC_021883	GAA	2	6	495366	495371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_021883	TGC	2	6	495442	495447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_021883	GTC	2	6	495454	495459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_021883	TTG	2	6	495515	495520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_021883	GGA	2	6	495567	495572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
509	NC_021883	TCA	2	6	495592	495597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_021883	GCG	2	6	495648	495653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_021883	CCT	2	6	495928	495933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
512	NC_021883	TGT	2	6	496099	496104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_021883	CGG	2	6	496141	496146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_021883	GAT	2	6	496185	496190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
515	NC_021883	TCT	2	6	496199	496204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_021883	GAA	2	6	496468	496473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
517	NC_021883	GAA	2	6	496557	496562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_021883	CTA	2	6	496564	496569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_021883	TAG	2	6	496660	496665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
520	NC_021883	AAC	2	6	496786	496791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_021883	TCC	2	6	496838	496843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
522	NC_021883	GGA	2	6	497147	497152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
523	NC_021883	AAC	2	6	497401	497406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_021883	AGC	2	6	497491	497496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_021883	CTG	2	6	497650	497655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_021883	TAA	2	6	497828	497833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_021883	TGA	2	6	497940	497945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
528	NC_021883	TTA	2	6	498009	498014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_021883	GGT	2	6	498039	498044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
530	NC_021883	TTA	2	6	498197	498202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_021883	CGG	2	6	498321	498326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_021883	ATG	2	6	498397	498402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
533	NC_021883	ACC	2	6	498592	498597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
534	NC_021883	TGG	2	6	498652	498657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
535	NC_021883	TCC	2	6	498678	498683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
536	NC_021883	GGA	2	6	498695	498700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
537	NC_021883	GGT	2	6	498815	498820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
538	NC_021883	CGG	2	6	498902	498907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_021883	TCA	2	6	498930	498935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_021883	CGT	2	6	499010	499015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_021883	GCT	2	6	499064	499069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_021883	GTT	2	6	499228	499233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_021883	ACG	2	6	499241	499246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_021883	GAA	3	9	499358	499366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_021883	AGA	2	6	499376	499381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
546	NC_021883	CGA	2	6	499483	499488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_021883	GTG	2	6	499559	499564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
548	NC_021883	TCG	2	6	499588	499593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_021883	GCC	2	6	499702	499707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
550	NC_021883	GTT	2	6	499731	499736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_021883	TAA	2	6	499875	499880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_021883	TCA	2	6	506670	506675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_021883	GCA	2	6	506729	506734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_021883	GCC	2	6	506806	506811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
555	NC_021883	GAT	2	6	509984	509989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
556	NC_021883	AAT	2	6	510073	510078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_021883	TGT	2	6	510101	510106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
558	NC_021883	GTT	2	6	510147	510152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
559	NC_021883	ATG	2	6	510216	510221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_021883	GCT	2	6	510222	510227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_021883	AGG	2	6	511282	511287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
562	NC_021883	CCT	2	6	512967	512972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
563	NC_021883	TAA	2	6	514576	514581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_021883	ATT	2	6	514592	514597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_021883	AAT	2	6	514601	514606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_021883	TTC	2	6	514658	514663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_021883	ATA	2	6	514739	514744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_021883	TCA	2	6	514800	514805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_021883	AGC	2	6	516482	516487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_021883	ATT	2	6	519571	519576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_021883	ATT	2	6	520193	520198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_021883	ATA	2	6	520221	520226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_021883	TTA	2	6	520231	520236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_021883	ATA	2	6	520237	520242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_021883	GGC	2	6	520750	520755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_021883	TAA	2	6	520803	520808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_021883	TAA	2	6	520845	520850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_021883	ATA	2	6	524559	524564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_021883	CAA	2	6	524682	524687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_021883	CCT	2	6	528257	528262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
581	NC_021883	CTT	2	6	529715	529720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_021883	TAC	2	6	529728	529733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_021883	CAG	2	6	529793	529798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_021883	CTG	2	6	529814	529819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_021883	GGC	2	6	530942	530947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_021883	TGA	2	6	530964	530969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
587	NC_021883	TGC	2	6	531197	531202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_021883	CAA	2	6	531298	531303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_021883	TGC	2	6	531404	531409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_021883	CAA	2	6	531505	531510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_021883	CAC	2	6	531618	531623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
592	NC_021883	TAT	2	6	532517	532522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_021883	CAA	2	6	532523	532528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_021883	TTG	2	6	534248	534253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
595	NC_021883	CCT	2	6	535921	535926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
596	NC_021883	ATG	2	6	535978	535983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
597	NC_021883	TAA	2	6	536152	536157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_021883	ATT	3	9	538055	538063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_021883	TCT	2	6	538102	538107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_021883	TGT	2	6	538160	538165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
601	NC_021883	TTA	2	6	541097	541102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_021883	TTC	2	6	541733	541738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_021883	ATT	2	6	543930	543935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_021883	TAC	2	6	544047	544052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_021883	ATA	2	6	546828	546833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_021883	GGT	2	6	547079	547084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
607	NC_021883	CGT	2	6	547094	547099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_021883	ATT	2	6	551738	551743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_021883	GAA	2	6	551821	551826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
610	NC_021883	TGT	2	6	553797	553802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_021883	TAT	2	6	553817	553822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_021883	CAT	2	6	553899	553904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_021883	TAC	2	6	553952	553957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_021883	TTA	2	6	554068	554073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_021883	ATT	2	6	554106	554111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_021883	ATT	2	6	558091	558096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_021883	TCT	2	6	558119	558124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_021883	GAA	2	6	558129	558134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_021883	GAT	2	6	561839	561844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
620	NC_021883	ATT	2	6	563424	563429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_021883	TTA	2	6	563479	563484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_021883	ACA	2	6	565625	565630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_021883	ATT	3	9	567012	567020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_021883	TCT	2	6	568994	568999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_021883	AGT	2	6	569008	569013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
626	NC_021883	AGT	2	6	569582	569587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
627	NC_021883	TGT	2	6	570428	570433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
628	NC_021883	TTA	2	6	570880	570885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_021883	TTG	2	6	572847	572852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
630	NC_021883	AAC	2	6	575764	575769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_021883	TAT	2	6	576624	576629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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633	NC_021883	AGT	2	6	576662	576667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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