MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Mannheimia haemolytica USMARC_2286

Total Repeats: 3052

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_021883	CGC	2	6	2623930	2623935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3002	NC_021883	ATG	2	6	2623985	2623990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_021883	TCC	2	6	2624011	2624016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3004	NC_021883	CAA	2	6	2624063	2624068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3005	NC_021883	GAC	2	6	2624124	2624129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_021883	GCA	2	6	2624136	2624141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3007	NC_021883	TTC	2	6	2624212	2624217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_021883	TCC	2	6	2624473	2624478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3009	NC_021883	AAC	2	6	2624595	2624600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3010	NC_021883	GCT	2	6	2624663	2624668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3011	NC_021883	CTT	2	6	2624688	2624693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3012	NC_021883	CTT	2	6	2624772	2624777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3013	NC_021883	CTG	2	6	2624831	2624836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3014	NC_021883	AGT	2	6	2625031	2625036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_021883	GCC	2	6	2625145	2625150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3016	NC_021883	CTG	2	6	2625209	2625214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3017	NC_021883	ACG	2	6	2625387	2625392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3018	NC_021883	CGT	2	6	2625428	2625433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3019	NC_021883	TAT	2	6	2625445	2625450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_021883	TGA	2	6	2626400	2626405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_021883	AAT	2	6	2626417	2626422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_021883	TGG	2	6	2629444	2629449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_021883	TTA	2	6	2630225	2630230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_021883	TTG	2	6	2631011	2631016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_021883	CAA	2	6	2631034	2631039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3026	NC_021883	GAC	2	6	2631103	2631108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3027	NC_021883	TTG	2	6	2631112	2631117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_021883	ATA	2	6	2631352	2631357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_021883	GCT	2	6	2631386	2631391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3030	NC_021883	TAC	2	6	2635526	2635531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3031	NC_021883	TAA	2	6	2635535	2635540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_021883	TAC	2	6	2635557	2635562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3033	NC_021883	GAA	2	6	2638661	2638666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_021883	CCA	2	6	2638678	2638683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3035	NC_021883	AGC	2	6	2638808	2638813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3036	NC_021883	CAC	2	6	2638886	2638891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3037	NC_021883	AAT	2	6	2638907	2638912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_021883	GCG	2	6	2639021	2639026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3039	NC_021883	CAA	2	6	2639242	2639247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3040	NC_021883	CAT	2	6	2639275	2639280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3041	NC_021883	ATT	2	6	2639333	2639338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_021883	TAA	3	9	2642279	2642287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_021883	AAT	2	6	2642291	2642296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_021883	TAA	2	6	2645905	2645910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_021883	ATT	2	6	2653331	2653336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_021883	ATT	2	6	2653356	2653361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_021883	CTT	2	6	2658048	2658053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3048	NC_021883	GTT	2	6	2658074	2658079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_021883	TGA	2	6	2658082	2658087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_021883	TCA	2	6	2658124	2658129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3051	NC_021883	GTG	2	6	2658153	2658158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_021883	CTG	2	6	2658309	2658314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.