MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanobacterium sp. SWAN-1 chromosome

Total Repeats: 6728

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015574	TAT	2	6	41	46	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015574	GGA	2	6	101	106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015574	AAT	2	6	1560	1565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015574	GTT	2	6	2753	2758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015574	ATA	3	9	2837	2845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015574	AAT	2	6	2878	2883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015574	GTA	2	6	3492	3497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015574	CTT	2	6	5374	5379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_015574	TTA	2	6	5466	5471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015574	CAA	2	6	5502	5507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_015574	TAC	2	6	5525	5530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_015574	ATT	2	6	6939	6944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015574	ATT	2	6	8129	8134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015574	ATT	2	6	8308	8313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015574	ATG	2	6	8323	8328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015574	TCC	2	6	9173	9178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_015574	GCT	2	6	9194	9199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_015574	ATG	2	6	9470	9475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015574	ATA	2	6	11489	11494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015574	TTG	2	6	11590	11595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015574	TAT	2	6	11736	11741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015574	ATA	2	6	11832	11837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015574	TGA	2	6	13870	13875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015574	TAA	2	6	13878	13883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015574	CTT	2	6	13892	13897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015574	AAC	2	6	14793	14798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_015574	ACC	2	6	15628	15633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_015574	TTA	2	6	15684	15689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015574	CTT	2	6	15697	15702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_015574	CAT	2	6	15717	15722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_015574	TAA	2	6	16586	16591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015574	TCT	2	6	16594	16599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_015574	GTT	2	6	16730	16735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015574	CTA	2	6	17362	17367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015574	AAT	2	6	17387	17392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015574	AGA	2	6	17410	17415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015574	ATT	2	6	17420	17425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015574	ATA	2	6	17429	17434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015574	AAG	2	6	17527	17532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015574	ATT	2	6	18819	18824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015574	TCC	2	6	18826	18831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_015574	ATT	2	6	18899	18904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015574	CTT	2	6	20439	20444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_015574	TAA	2	6	20551	20556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015574	TCT	2	6	20641	20646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_015574	TAA	2	6	21753	21758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015574	GAT	2	6	21770	21775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015574	TTA	2	6	22474	22479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015574	ATT	2	6	22494	22499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015574	TCT	2	6	22605	22610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_015574	TAA	2	6	22637	22642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015574	ATT	2	6	22747	22752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015574	TAA	2	6	22766	22771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015574	TAA	2	6	22798	22803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015574	GCA	2	6	25294	25299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_015574	TCT	3	9	26376	26384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_015574	ACC	2	6	27723	27728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_015574	AAG	2	6	27740	27745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015574	TAC	2	6	28202	28207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_015574	TAT	2	6	28229	28234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015574	TCA	2	6	29835	29840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_015574	ATT	2	6	29846	29851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015574	CAT	2	6	32671	32676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_015574	GGT	2	6	32783	32788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015574	TTA	2	6	32861	32866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015574	CTA	2	6	33155	33160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_015574	AAT	2	6	33196	33201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015574	CAA	2	6	33205	33210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015574	TAA	2	6	33249	33254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015574	ATA	2	6	33263	33268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015574	TCT	2	6	33624	33629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_015574	ATT	2	6	33641	33646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015574	AAT	2	6	33687	33692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015574	ATA	2	6	33725	33730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015574	AAT	2	6	33744	33749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015574	TAG	2	6	33820	33825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015574	ATT	2	6	35809	35814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015574	TAA	3	9	35917	35925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015574	AAG	2	6	35934	35939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015574	AAT	2	6	36010	36015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015574	AAT	2	6	36104	36109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015574	ACA	2	6	36116	36121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_015574	ATC	2	6	36148	36153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_015574	ATC	2	6	36168	36173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_015574	TTG	2	6	37093	37098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015574	CAA	2	6	37126	37131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_015574	TTG	2	6	37200	37205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015574	CAA	2	6	37971	37976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_015574	TTA	2	6	38120	38125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015574	CTA	2	6	38129	38134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_015574	ATA	2	6	38155	38160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015574	TTA	2	6	38161	38166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015574	TTG	2	6	38357	38362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015574	TAA	2	6	39530	39535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015574	GTA	2	6	39620	39625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015574	TGA	2	6	40471	40476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015574	ACT	2	6	40570	40575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_015574	TAA	2	6	40614	40619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015574	CAA	2	6	40629	40634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_015574	TTG	2	6	41293	41298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015574	AGA	2	6	42854	42859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015574	AGT	2	6	44612	44617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015574	CTT	2	6	44622	44627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_015574	AAT	2	6	44700	44705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015574	ATC	2	6	44736	44741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_015574	ATC	2	6	44754	44759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_015574	ATC	2	6	44772	44777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_015574	ATC	2	6	44790	44795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_015574	ATC	2	6	44808	44813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_015574	ATC	2	6	44826	44831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_015574	ATC	2	6	44844	44849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_015574	GAA	2	6	44968	44973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015574	GTT	2	6	45869	45874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015574	TAC	2	6	46398	46403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_015574	TAT	2	6	46446	46451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015574	CAA	2	6	46536	46541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_015574	CAT	2	6	46603	46608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_015574	TAA	2	6	48870	48875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015574	TTG	2	6	49143	49148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015574	AAC	2	6	54463	54468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_015574	TAA	2	6	54543	54548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015574	TAA	2	6	54556	54561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015574	AAT	2	6	58794	58799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015574	ATT	2	6	58814	58819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015574	TTG	2	6	58910	58915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015574	ATG	2	6	58992	58997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015574	AGG	2	6	59038	59043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015574	TGA	2	6	61318	61323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015574	CAT	2	6	61333	61338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_015574	CAA	2	6	61370	61375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_015574	AAG	2	6	61376	61381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015574	ATA	2	6	61426	61431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015574	AGA	2	6	61459	61464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015574	ATT	2	6	61523	61528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015574	ATT	2	6	61550	61555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015574	TAA	2	6	61563	61568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015574	CTT	2	6	62913	62918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_015574	CTT	2	6	62964	62969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_015574	ATA	3	9	64039	64047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015574	TAA	2	6	68698	68703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015574	TAA	2	6	68965	68970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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