MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanobacterium sp. SWAN-1 chromosome

Total Repeats: 6728

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_015574	TTC	2	6	1418657	1418662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4002	NC_015574	ATT	2	6	1419594	1419599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_015574	CCA	2	6	1419684	1419689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4004	NC_015574	AAC	2	6	1420202	1420207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4005	NC_015574	GAT	2	6	1420253	1420258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_015574	ATG	2	6	1421187	1421192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_015574	ATT	2	6	1422377	1422382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_015574	CAA	2	6	1422447	1422452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4009	NC_015574	TAA	2	6	1422456	1422461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_015574	ATT	2	6	1422534	1422539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_015574	ATA	2	6	1422546	1422551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_015574	CAA	2	6	1423171	1423176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_015574	TAA	2	6	1423180	1423185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_015574	TCT	2	6	1423357	1423362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4015	NC_015574	CCT	2	6	1423563	1423568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4016	NC_015574	CAT	2	6	1423606	1423611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_015574	TCC	2	6	1423624	1423629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4018	NC_015574	ATA	3	9	1423663	1423671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_015574	ATT	3	9	1423763	1423771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_015574	GAT	2	6	1423815	1423820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_015574	ATC	2	6	1423865	1423870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4022	NC_015574	AAG	2	6	1423880	1423885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_015574	ACG	2	6	1423898	1423903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4024	NC_015574	TTA	2	6	1423944	1423949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_015574	TGA	2	6	1423953	1423958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_015574	TAT	2	6	1424193	1424198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_015574	GAA	2	6	1424237	1424242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_015574	AAG	2	6	1424265	1424270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_015574	GTA	2	6	1424278	1424283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_015574	GTT	2	6	1424326	1424331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_015574	TGG	2	6	1424416	1424421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_015574	TTA	2	6	1424517	1424522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_015574	CAG	3	9	1424614	1424622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4034	NC_015574	AAT	2	6	1424665	1424670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_015574	TTG	2	6	1424705	1424710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_015574	ACT	2	6	1424747	1424752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4037	NC_015574	AGA	2	6	1424756	1424761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_015574	TAA	2	6	1424774	1424779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_015574	ATT	2	6	1424837	1424842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_015574	TGT	2	6	1424977	1424982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_015574	GAA	2	6	1425014	1425019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_015574	ACA	2	6	1425062	1425067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4043	NC_015574	GTA	2	6	1425092	1425097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_015574	GAT	2	6	1425128	1425133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_015574	TTG	2	6	1425182	1425187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_015574	GAT	2	6	1425269	1425274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_015574	TTG	2	6	1425413	1425418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_015574	TTA	2	6	1425467	1425472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_015574	ATT	2	6	1425478	1425483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_015574	TGG	2	6	1425537	1425542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_015574	ATT	2	6	1425676	1425681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_015574	TAT	2	6	1425723	1425728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_015574	ACA	2	6	1425737	1425742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4054	NC_015574	CAG	2	6	1425750	1425755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4055	NC_015574	TCT	2	6	1425767	1425772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4056	NC_015574	TAT	2	6	1425789	1425794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_015574	TAT	2	6	1425855	1425860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_015574	TTA	2	6	1425923	1425928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_015574	CTG	2	6	1425945	1425950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4060	NC_015574	CAT	2	6	1426035	1426040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4061	NC_015574	CAT	3	9	1426100	1426108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4062	NC_015574	ACT	2	6	1426215	1426220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4063	NC_015574	GCC	2	6	1426240	1426245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4064	NC_015574	AAT	2	6	1426282	1426287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_015574	CAA	2	6	1426292	1426297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4066	NC_015574	AAT	2	6	1426377	1426382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_015574	CCA	2	6	1426413	1426418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4068	NC_015574	AAT	2	6	1426466	1426471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_015574	ATT	3	9	1426487	1426495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_015574	TAT	2	6	1426652	1426657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_015574	TTA	2	6	1426678	1426683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_015574	TTA	2	6	1427568	1427573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_015574	ATT	2	6	1427579	1427584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_015574	TTA	2	6	1427714	1427719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_015574	AAT	2	6	1427887	1427892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_015574	GAA	2	6	1427929	1427934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_015574	TAT	2	6	1428004	1428009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_015574	GAT	2	6	1428151	1428156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_015574	ATA	2	6	1428338	1428343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_015574	ATT	2	6	1428359	1428364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_015574	TTA	2	6	1428381	1428386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_015574	TTA	2	6	1428486	1428491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_015574	AGG	2	6	1428798	1428803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_015574	TTC	2	6	1431145	1431150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4085	NC_015574	ATT	2	6	1431443	1431448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_015574	TAT	2	6	1431450	1431455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_015574	ATA	2	6	1431478	1431483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_015574	TTC	2	6	1431558	1431563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4089	NC_015574	ATT	2	6	1431592	1431597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_015574	ATA	2	6	1431624	1431629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_015574	AGT	2	6	1431700	1431705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_015574	ATT	2	6	1431789	1431794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_015574	TTA	2	6	1431935	1431940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_015574	ATT	2	6	1432040	1432045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_015574	ACA	2	6	1432961	1432966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4096	NC_015574	TCA	2	6	1433025	1433030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4097	NC_015574	ATA	2	6	1433049	1433054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_015574	ATT	2	6	1433063	1433068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_015574	TAT	2	6	1433069	1433074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_015574	ATT	2	6	1433158	1433163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_015574	ATA	2	6	1433180	1433185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_015574	TTA	2	6	1433267	1433272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_015574	TTC	2	6	1434210	1434215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4104	NC_015574	TTG	2	6	1434308	1434313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_015574	AAC	2	6	1434674	1434679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4106	NC_015574	TAC	2	6	1434743	1434748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4107	NC_015574	AAT	2	6	1434995	1435000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_015574	ATA	2	6	1435023	1435028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_015574	TAT	2	6	1437567	1437572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_015574	CTG	2	6	1437573	1437578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4111	NC_015574	GCC	2	6	1437624	1437629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4112	NC_015574	CAT	2	6	1437666	1437671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4113	NC_015574	TTA	2	6	1437672	1437677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_015574	ATT	2	6	1437713	1437718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_015574	AAT	2	6	1437749	1437754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_015574	TAG	2	6	1437883	1437888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_015574	TAA	3	9	1437893	1437901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_015574	TAC	2	6	1437917	1437922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4119	NC_015574	GAA	2	6	1437928	1437933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_015574	TAT	2	6	1440582	1440587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_015574	AAT	2	6	1440608	1440613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_015574	TTG	2	6	1442476	1442481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_015574	ATT	2	6	1444691	1444696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_015574	ATT	2	6	1444711	1444716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_015574	ATT	2	6	1450197	1450202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_015574	TAT	2	6	1450203	1450208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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