MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140070010 complete genome

Total Repeats: 3154

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019951	TCATC	2	10	902	911	20 %	40 %	0 %	40 %	433629071
2	NC_019951	TGATC	2	10	1200	1209	20 %	40 %	20 %	20 %	433629071
3	NC_019951	CGTTT	2	10	2092	2101	0 %	60 %	20 %	20 %	433629072
4	NC_019951	CGGTT	2	10	3241	3250	0 %	40 %	40 %	20 %	433629072
5	NC_019951	CGTTG	2	10	4584	4593	0 %	40 %	40 %	20 %	433629074
6	NC_019951	AACGC	2	10	7267	7276	40 %	0 %	20 %	40 %	433629075
7	NC_019951	GCAGC	2	10	7374	7383	20 %	0 %	40 %	40 %	433629076
8	NC_019951	CGGTG	2	10	9282	9291	0 %	20 %	60 %	20 %	433629076
9	NC_019951	CAGAC	2	10	9800	9809	40 %	0 %	20 %	40 %	433629076
10	NC_019951	CGCAA	2	10	10271	10280	40 %	0 %	20 %	40 %	433629077
11	NC_019951	CGGCG	2	10	10397	10406	0 %	0 %	60 %	40 %	433629077
12	NC_019951	GTCCT	2	10	12735	12744	0 %	40 %	20 %	40 %	433629078
13	NC_019951	CGTTC	2	10	12806	12815	0 %	40 %	20 %	40 %	433629078
14	NC_019951	GCGCC	2	10	13283	13292	0 %	0 %	40 %	60 %	433629078
15	NC_019951	CGCCC	2	10	15277	15286	0 %	0 %	20 %	80 %	433629081
16	NC_019951	CGCGC	2	10	15544	15553	0 %	0 %	40 %	60 %	433629081
17	NC_019951	GCACC	2	10	18968	18977	20 %	0 %	20 %	60 %	433629084
18	NC_019951	GGGCG	2	10	22709	22718	0 %	0 %	80 %	20 %	433629093
19	NC_019951	AGGCC	2	10	23055	23064	20 %	0 %	40 %	40 %	433629093
20	NC_019951	GGCGT	2	10	24958	24967	0 %	20 %	60 %	20 %	433629097
21	NC_019951	GGGCC	2	10	25241	25250	0 %	0 %	60 %	40 %	433629097
22	NC_019951	GCGTT	2	10	25986	25995	0 %	40 %	40 %	20 %	433629098
23	NC_019951	CCAGC	2	10	26526	26535	20 %	0 %	20 %	60 %	433629099
24	NC_019951	ACCGA	2	10	27289	27298	40 %	0 %	20 %	40 %	433629099
25	NC_019951	ATCGG	2	10	27681	27690	20 %	20 %	40 %	20 %	433629099
26	NC_019951	CGGCC	2	10	28693	28702	0 %	0 %	40 %	60 %	433629100
27	NC_019951	TTAGC	2	10	29921	29930	20 %	40 %	20 %	20 %	433629101
28	NC_019951	GGTCC	2	10	29993	30002	0 %	20 %	40 %	40 %	433629101
29	NC_019951	GTCGT	2	10	32512	32521	0 %	40 %	40 %	20 %	433629102
30	NC_019951	GGTTG	2	10	32726	32735	0 %	40 %	60 %	0 %	433629103
31	NC_019951	ATCAC	2	10	34839	34848	40 %	20 %	0 %	40 %	433629105
32	NC_019951	GCCGG	2	10	35526	35535	0 %	0 %	60 %	40 %	433629105
33	NC_019951	GGCAA	2	10	40226	40235	40 %	0 %	40 %	20 %	433629110
34	NC_019951	CGATC	2	10	41052	41061	20 %	20 %	20 %	40 %	433629111
35	NC_019951	CGCGG	2	10	41532	41541	0 %	0 %	60 %	40 %	433629111
36	NC_019951	CGACG	2	10	43239	43248	20 %	0 %	40 %	40 %	433629115
37	NC_019951	GACAC	2	10	43391	43400	40 %	0 %	20 %	40 %	433629115
38	NC_019951	TCCTG	2	10	48396	48405	0 %	40 %	20 %	40 %	433629121
39	NC_019951	GGCGC	2	10	49032	49041	0 %	0 %	60 %	40 %	433629121
40	NC_019951	TGGCC	2	10	49180	49189	0 %	20 %	40 %	40 %	433629121
41	NC_019951	CGGCG	2	10	49712	49721	0 %	0 %	60 %	40 %	433629121
42	NC_019951	GTCCA	2	10	50381	50390	20 %	20 %	20 %	40 %	433629122
43	NC_019951	GCCAA	2	10	52515	52524	40 %	0 %	20 %	40 %	433629124
44	NC_019951	GCACA	2	10	53314	53323	40 %	0 %	20 %	40 %	433629125
45	NC_019951	GGTAC	2	10	55849	55858	20 %	20 %	40 %	20 %	433629127
46	NC_019951	TCGAA	2	10	56081	56090	40 %	20 %	20 %	20 %	433629127
47	NC_019951	GCACC	2	10	57011	57020	20 %	0 %	20 %	60 %	433629127
48	NC_019951	CGGTG	2	10	57966	57975	0 %	20 %	60 %	20 %	433629128
49	NC_019951	TCATG	2	10	58112	58121	20 %	40 %	20 %	20 %	433629128
50	NC_019951	CCCGA	2	10	59592	59601	20 %	0 %	20 %	60 %	433629130
51	NC_019951	CAGCG	2	10	60717	60726	20 %	0 %	40 %	40 %	433629131
52	NC_019951	GTCGC	2	10	63000	63009	0 %	20 %	40 %	40 %	433629134
53	NC_019951	AAGCC	2	10	63849	63858	40 %	0 %	20 %	40 %	433629135
54	NC_019951	CGGCG	2	10	67599	67608	0 %	0 %	60 %	40 %	433629137
55	NC_019951	CTGTG	2	10	68392	68401	0 %	40 %	40 %	20 %	433629138
56	NC_019951	CGACC	2	10	69131	69140	20 %	0 %	20 %	60 %	433629139
57	NC_019951	CTTCG	2	10	69818	69827	0 %	40 %	20 %	40 %	433629140
58	NC_019951	CGGTG	2	10	70826	70835	0 %	20 %	60 %	20 %	433629143
59	NC_019951	TCAGG	2	10	73273	73282	20 %	20 %	40 %	20 %	433629144
60	NC_019951	CGGCG	2	10	76813	76822	0 %	0 %	60 %	40 %	433629147
61	NC_019951	GGCGA	2	10	77234	77243	20 %	0 %	60 %	20 %	433629147
62	NC_019951	CGGGT	2	10	78629	78638	0 %	20 %	60 %	20 %	433629148
63	NC_019951	CAAGA	2	10	80442	80451	60 %	0 %	20 %	20 %	433629149
64	NC_019951	CGGCC	2	10	82040	82049	0 %	0 %	40 %	60 %	433629151
65	NC_019951	GGTGT	2	10	83190	83199	0 %	40 %	60 %	0 %	433629153
66	NC_019951	TGTGT	2	10	83621	83630	0 %	60 %	40 %	0 %	433629153
67	NC_019951	ATCGG	2	10	83827	83836	20 %	20 %	40 %	20 %	433629153
68	NC_019951	GGTCG	2	10	85518	85527	0 %	20 %	60 %	20 %	433629153
69	NC_019951	GATGC	2	10	86269	86278	20 %	20 %	40 %	20 %	433629155
70	NC_019951	GTCCA	2	10	87143	87152	20 %	20 %	20 %	40 %	433629156
71	NC_019951	TGACC	2	10	89765	89774	20 %	20 %	20 %	40 %	433629158
72	NC_019951	GCCAA	2	10	90079	90088	40 %	0 %	20 %	40 %	433629158
73	NC_019951	GTCGC	2	10	90156	90165	0 %	20 %	40 %	40 %	433629158
74	NC_019951	GCGCG	2	10	91244	91253	0 %	0 %	60 %	40 %	433629159
75	NC_019951	TCTGT	2	10	91403	91412	0 %	60 %	20 %	20 %	433629159
76	NC_019951	CGCCA	2	10	95011	95020	20 %	0 %	20 %	60 %	433629161
77	NC_019951	CGGGC	2	10	95082	95091	0 %	0 %	60 %	40 %	433629161
78	NC_019951	GAGCA	2	10	96918	96927	40 %	0 %	40 %	20 %	433629163
79	NC_019951	CCGGG	2	10	97018	97027	0 %	0 %	60 %	40 %	433629163
80	NC_019951	CGACG	2	10	97094	97103	20 %	0 %	40 %	40 %	433629163
81	NC_019951	CACCG	2	10	98595	98604	20 %	0 %	20 %	60 %	433629165
82	NC_019951	TGGGC	2	10	101370	101379	0 %	20 %	60 %	20 %	433629168
83	NC_019951	TGGGT	2	10	104427	104436	0 %	40 %	60 %	0 %	433629173
84	NC_019951	GGGTC	2	10	105141	105150	0 %	20 %	60 %	20 %	433629174
85	NC_019951	CGGGC	2	10	105606	105615	0 %	0 %	60 %	40 %	433629174
86	NC_019951	GGCCG	2	10	106926	106935	0 %	0 %	60 %	40 %	433629175
87	NC_019951	GCGCC	2	10	107578	107587	0 %	0 %	40 %	60 %	433629175
88	NC_019951	CGCAC	2	10	108903	108912	20 %	0 %	20 %	60 %	433629177
89	NC_019951	GGTTG	2	10	109301	109310	0 %	40 %	60 %	0 %	433629177
90	NC_019951	AGATC	2	10	110121	110130	40 %	20 %	20 %	20 %	433629178
91	NC_019951	TCAGT	2	10	111987	111996	20 %	40 %	20 %	20 %	433629180
92	NC_019951	CGGCG	2	10	115251	115260	0 %	0 %	60 %	40 %	433629184
93	NC_019951	GTCGA	2	10	116709	116718	20 %	20 %	40 %	20 %	433629186
94	NC_019951	GTCGA	2	10	119514	119523	20 %	20 %	40 %	20 %	433629187
95	NC_019951	CTGGC	2	10	121532	121541	0 %	20 %	40 %	40 %	433629189
96	NC_019951	GCACA	2	10	122653	122662	40 %	0 %	20 %	40 %	433629189
97	NC_019951	ATCGC	2	10	125478	125487	20 %	20 %	20 %	40 %	433629192
98	NC_019951	CGGTC	2	10	127087	127096	0 %	20 %	40 %	40 %	433629194
99	NC_019951	GACCA	2	10	128225	128234	40 %	0 %	20 %	40 %	433629194
100	NC_019951	GGCTG	2	10	131797	131806	0 %	20 %	60 %	20 %	433629194
101	NC_019951	CCGCG	2	10	134709	134718	0 %	0 %	40 %	60 %	433629195
102	NC_019951	TCGTG	2	10	138660	138669	0 %	40 %	40 %	20 %	433629197
103	NC_019951	CAGCG	2	10	138903	138912	20 %	0 %	40 %	40 %	433629197
104	NC_019951	ACGGC	2	10	139715	139724	20 %	0 %	40 %	40 %	433629197
105	NC_019951	CCGGA	2	10	140327	140336	20 %	0 %	40 %	40 %	433629199
106	NC_019951	GGCCG	2	10	142688	142697	0 %	0 %	60 %	40 %	433629200
107	NC_019951	TGCGC	2	10	142800	142809	0 %	20 %	40 %	40 %	433629200
108	NC_019951	GCGAG	2	10	143311	143320	20 %	0 %	60 %	20 %	433629200
109	NC_019951	GGGGT	2	10	144320	144329	0 %	20 %	80 %	0 %	433629200
110	NC_019951	CCCAC	2	10	144882	144891	20 %	0 %	0 %	80 %	433629200
111	NC_019951	CCGGC	2	10	145392	145401	0 %	0 %	40 %	60 %	433629200
112	NC_019951	TGCGG	2	10	145802	145811	0 %	20 %	60 %	20 %	433629200
113	NC_019951	ATCAC	2	10	147275	147284	40 %	20 %	0 %	40 %	433629202
114	NC_019951	ATCGG	2	10	147323	147332	20 %	20 %	40 %	20 %	433629202
115	NC_019951	CGGGC	2	10	148414	148423	0 %	0 %	60 %	40 %	433629202
116	NC_019951	GCGAT	2	10	150219	150228	20 %	20 %	40 %	20 %	433629204
117	NC_019951	GTTCG	2	10	150440	150449	0 %	40 %	40 %	20 %	433629204
118	NC_019951	CCTGG	2	10	150832	150841	0 %	20 %	40 %	40 %	433629204
119	NC_019951	CGACC	2	10	151522	151531	20 %	0 %	20 %	60 %	433629204
120	NC_019951	GAGAT	2	10	154542	154551	40 %	20 %	40 %	0 %	433629208
121	NC_019951	CGGCG	2	10	156695	156704	0 %	0 %	60 %	40 %	433629210
122	NC_019951	TGCGG	2	10	157326	157335	0 %	20 %	60 %	20 %	433629211
123	NC_019951	CGCTG	2	10	158033	158042	0 %	20 %	40 %	40 %	433629212
124	NC_019951	GTTGC	2	10	158579	158588	0 %	40 %	40 %	20 %	433629212
125	NC_019951	CCGAT	2	10	159327	159336	20 %	20 %	20 %	40 %	433629212
126	NC_019951	AACCG	2	10	160757	160766	40 %	0 %	20 %	40 %	433629213
127	NC_019951	CCGCC	2	10	161987	161996	0 %	0 %	20 %	80 %	433629214
128	NC_019951	GCGCC	2	10	162997	163006	0 %	0 %	40 %	60 %	433629214
129	NC_019951	ATCGG	2	10	164587	164596	20 %	20 %	40 %	20 %	433629216
130	NC_019951	CCGAC	2	10	167597	167606	20 %	0 %	20 %	60 %	433629218
131	NC_019951	TCGTC	2	10	169579	169588	0 %	40 %	20 %	40 %	433629219
132	NC_019951	CACGC	2	10	170043	170052	20 %	0 %	20 %	60 %	433629219
133	NC_019951	AGGCG	2	10	171415	171424	20 %	0 %	60 %	20 %	433629220
134	NC_019951	GTCTG	2	10	173786	173795	0 %	40 %	40 %	20 %	433629223
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261	NC_019951	CCGGC	2	10	349278	349287	0 %	0 %	40 %	60 %	433629369
262	NC_019951	CCGGC	2	10	349326	349335	0 %	0 %	40 %	60 %	433629369
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