MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140070010 complete genome

Total Repeats: 3154

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_019951	CGGCC	2	10	1391604	1391613	0 %	0 %	40 %	60 %	433630293
1002	NC_019951	GGCCC	2	10	1391677	1391686	0 %	0 %	40 %	60 %	433630293
1003	NC_019951	GCACG	2	10	1393596	1393605	20 %	0 %	40 %	40 %	433630295
1004	NC_019951	GCCCA	2	10	1397134	1397143	20 %	0 %	20 %	60 %	433630298
1005	NC_019951	GGTGG	2	10	1397416	1397425	0 %	20 %	80 %	0 %	433630298
1006	NC_019951	TCGGC	2	10	1398667	1398676	0 %	20 %	40 %	40 %	433630301
1007	NC_019951	CCACA	2	10	1400519	1400528	40 %	0 %	0 %	60 %	433630302
1008	NC_019951	GTGCT	2	10	1401540	1401549	0 %	40 %	40 %	20 %	433630303
1009	NC_019951	GCCTG	2	10	1401796	1401805	0 %	20 %	40 %	40 %	433630303
1010	NC_019951	GCCCG	2	10	1402275	1402284	0 %	0 %	40 %	60 %	433630304
1011	NC_019951	GCCGC	2	10	1403934	1403943	0 %	0 %	40 %	60 %	433630304
1012	NC_019951	TGGTC	2	10	1408050	1408059	0 %	40 %	40 %	20 %	433630308
1013	NC_019951	TCGGG	2	10	1411196	1411205	0 %	20 %	60 %	20 %	433630312
1014	NC_019951	GTCTG	2	10	1411764	1411773	0 %	40 %	40 %	20 %	433630313
1015	NC_019951	GCGCG	2	10	1412598	1412607	0 %	0 %	60 %	40 %	433630313
1016	NC_019951	CCCGG	2	10	1414108	1414117	0 %	0 %	40 %	60 %	433630315
1017	NC_019951	CGAGC	2	10	1416107	1416116	20 %	0 %	40 %	40 %	433630317
1018	NC_019951	GACCT	2	10	1420744	1420753	20 %	20 %	20 %	40 %	433630321
1019	NC_019951	GTTCC	2	10	1421232	1421241	0 %	40 %	20 %	40 %	433630322
1020	NC_019951	GCGCC	2	10	1421784	1421793	0 %	0 %	40 %	60 %	433630323
1021	NC_019951	GCGTC	2	10	1421820	1421829	0 %	20 %	40 %	40 %	433630323
1022	NC_019951	CCATC	2	10	1421996	1422005	20 %	20 %	0 %	60 %	433630323
1023	NC_019951	CCGTT	2	10	1422736	1422745	0 %	40 %	20 %	40 %	433630323
1024	NC_019951	GGGCT	2	10	1422900	1422909	0 %	20 %	60 %	20 %	433630323
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1027	NC_019951	CAGCG	2	10	1430579	1430588	20 %	0 %	40 %	40 %	433630331
1028	NC_019951	CGCAC	2	10	1430589	1430598	20 %	0 %	20 %	60 %	433630331
1029	NC_019951	CATCA	2	10	1431101	1431110	40 %	20 %	0 %	40 %	433630331
1030	NC_019951	CCCAG	2	10	1432946	1432955	20 %	0 %	20 %	60 %	433630333
1031	NC_019951	CGGAC	2	10	1433526	1433535	20 %	0 %	40 %	40 %	433630333
1032	NC_019951	GCCGC	2	10	1433617	1433626	0 %	0 %	40 %	60 %	433630333
1033	NC_019951	CGGCG	2	10	1434398	1434407	0 %	0 %	60 %	40 %	433630334
1034	NC_019951	GTATG	2	10	1436092	1436101	20 %	40 %	40 %	0 %	433630336
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1038	NC_019951	GGGCA	2	10	1440690	1440699	20 %	0 %	60 %	20 %	433630341
1039	NC_019951	GGTGA	2	10	1441024	1441033	20 %	20 %	60 %	0 %	433630341
1040	NC_019951	CGGCG	2	10	1443302	1443311	0 %	0 %	60 %	40 %	433630343
1041	NC_019951	AGCGC	2	10	1443742	1443751	20 %	0 %	40 %	40 %	433630343
1042	NC_019951	TGCGC	2	10	1443947	1443956	0 %	20 %	40 %	40 %	433630344
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1044	NC_019951	GCCGA	2	10	1446181	1446190	20 %	0 %	40 %	40 %	433630346
1045	NC_019951	CGAGC	2	10	1455778	1455787	20 %	0 %	40 %	40 %	433630354
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1047	NC_019951	TCGAT	2	10	1456692	1456701	20 %	40 %	20 %	20 %	433630354
1048	NC_019951	CGTCG	3	15	1458530	1458544	0 %	20 %	40 %	40 %	433630354
1049	NC_019951	GCGAG	2	10	1459219	1459228	20 %	0 %	60 %	20 %	433630355
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1051	NC_019951	ACCGT	2	10	1459473	1459482	20 %	20 %	20 %	40 %	433630355
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1055	NC_019951	CGCCC	2	10	1465415	1465424	0 %	0 %	20 %	80 %	433630360
1056	NC_019951	TGCTG	2	10	1465883	1465892	0 %	40 %	40 %	20 %	433630361
1057	NC_019951	CATCG	2	10	1466668	1466677	20 %	20 %	20 %	40 %	433630361
1058	NC_019951	ACCGG	2	10	1467333	1467342	20 %	0 %	40 %	40 %	433630362
1059	NC_019951	CACCG	2	10	1467466	1467475	20 %	0 %	20 %	60 %	433630362
1060	NC_019951	GCGCA	2	10	1468589	1468598	20 %	0 %	40 %	40 %	433630363
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1064	NC_019951	GCTGG	2	10	1474661	1474670	0 %	20 %	60 %	20 %	433630369
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1066	NC_019951	CGCTG	2	10	1476129	1476138	0 %	20 %	40 %	40 %	433630370
1067	NC_019951	TTGCG	2	10	1477475	1477484	0 %	40 %	40 %	20 %	433630371
1068	NC_019951	GCCGC	2	10	1478844	1478853	0 %	0 %	40 %	60 %	433630371
1069	NC_019951	GCTGG	2	10	1480892	1480901	0 %	20 %	60 %	20 %	433630372
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1091	NC_019951	CACAC	2	10	1515550	1515559	40 %	0 %	0 %	60 %	433630400
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1094	NC_019951	GCGCG	2	10	1518522	1518531	0 %	0 %	60 %	40 %	433630403
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1097	NC_019951	CGGGT	2	10	1521502	1521511	0 %	20 %	60 %	20 %	433630405
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1102	NC_019951	GCAAG	2	10	1531061	1531070	40 %	0 %	40 %	20 %	433630413
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1106	NC_019951	CGGTG	2	10	1535207	1535216	0 %	20 %	60 %	20 %	433630418
1107	NC_019951	GGCCG	2	10	1535687	1535696	0 %	0 %	60 %	40 %	433630418
1108	NC_019951	TTTGC	2	10	1535730	1535739	0 %	60 %	20 %	20 %	433630418
1109	NC_019951	GCCAA	2	10	1537343	1537352	40 %	0 %	20 %	40 %	433630420
1110	NC_019951	CGATG	2	10	1538872	1538881	20 %	20 %	40 %	20 %	433630423
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1112	NC_019951	CGGCG	2	10	1539550	1539559	0 %	0 %	60 %	40 %	433630423
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1119	NC_019951	CATTC	2	10	1553882	1553891	20 %	40 %	0 %	40 %	433630432
1120	NC_019951	AGGCG	2	10	1553901	1553910	20 %	0 %	60 %	20 %	433630432
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1495	NC_019951	GTGGA	2	10	2113527	2113536	20 %	20 %	60 %	0 %	433630889
1496	NC_019951	ATGCG	2	10	2116108	2116117	20 %	20 %	40 %	20 %	433630892
1497	NC_019951	TGACG	2	10	2117218	2117227	20 %	20 %	40 %	20 %	433630894
1498	NC_019951	GCCCG	2	10	2118632	2118641	0 %	0 %	40 %	60 %	433630895
1499	NC_019951	CGACC	2	10	2118939	2118948	20 %	0 %	20 %	60 %	433630895
1500	NC_019951	GATGT	2	10	2120452	2120461	20 %	40 %	40 %	0 %	433630896

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