MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methanosarcina acetivorans C2A chromosome

Total Repeats: 49064

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003552	TTG	2	6	279	284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	20088900
2	NC_003552	AAG	2	6	332	337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088900
3	NC_003552	ATG	2	6	494	499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20088900
4	NC_003552	TTC	2	6	674	679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088900
5	NC_003552	AGG	2	6	729	734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20088900
6	NC_003552	CGG	2	6	744	749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	20088900
7	NC_003552	CGT	2	6	814	819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20088900
8	NC_003552	CAT	2	6	868	873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20088900
9	NC_003552	TTC	3	9	890	898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088900
10	NC_003552	CAT	2	6	1021	1026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20088900
11	NC_003552	TCG	2	6	1053	1058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20088900
12	NC_003552	ATG	2	6	1065	1070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20088900
13	NC_003552	CTT	3	9	1147	1155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088900
14	NC_003552	AAG	2	6	1178	1183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088900
15	NC_003552	ACA	2	6	1221	1226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	20088900
16	NC_003552	TAA	2	6	1400	1405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	20088900
17	NC_003552	AAG	2	6	1420	1425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088900
18	NC_003552	GAA	2	6	1429	1434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088900
19	NC_003552	TCA	2	6	3355	3360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20088901
20	NC_003552	GAA	2	6	3379	3384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088901
21	NC_003552	AAT	2	6	3487	3492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	20088901
22	NC_003552	AGT	2	6	3612	3617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20088901
23	NC_003552	AAC	2	6	3661	3666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	20088901
24	NC_003552	ACA	2	6	3729	3734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	20088901
25	NC_003552	TAT	2	6	3825	3830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	20088902
26	NC_003552	TAT	2	6	3880	3885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	20088902
27	NC_003552	AGG	2	6	3918	3923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20088902
28	NC_003552	TTG	2	6	4082	4087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	20088902
29	NC_003552	CTT	2	6	4219	4224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088902
30	NC_003552	CAA	2	6	4288	4293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	20088902
31	NC_003552	CTT	2	6	4297	4302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088902
32	NC_003552	ATC	2	6	4318	4323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20088902
33	NC_003552	CTG	2	6	4356	4361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20088902
34	NC_003552	GGT	2	6	4510	4515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	20088902
35	NC_003552	ATT	2	6	4627	4632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	20088902
36	NC_003552	ATC	2	6	4681	4686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20088902
37	NC_003552	AAC	2	6	4756	4761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	20088902
38	NC_003552	TAT	2	6	4812	4817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	20088902
39	NC_003552	CTG	2	6	4823	4828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20088902
40	NC_003552	CTT	2	6	4837	4842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088902
41	NC_003552	GCT	2	6	4846	4851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20088902
42	NC_003552	CGG	2	6	5094	5099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	20088902
43	NC_003552	ATC	2	6	5125	5130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20088902
44	NC_003552	AGC	2	6	5135	5140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	20088902
45	NC_003552	AAG	2	6	5228	5233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088902
46	NC_003552	AGA	2	6	5241	5246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088902
47	NC_003552	AGA	2	6	5307	5312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088902
48	NC_003552	TGG	2	6	7449	7454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	20088903
49	NC_003552	CAG	2	6	7471	7476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	20088903
50	NC_003552	CTT	2	6	7594	7599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088903
51	NC_003552	TCA	2	6	7648	7653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20088903
52	NC_003552	GGA	2	6	7803	7808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20088903
53	NC_003552	TTG	2	6	8017	8022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	20088903
54	NC_003552	TTG	2	6	8025	8030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	20088903
55	NC_003552	GCA	2	6	8037	8042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	20088903
56	NC_003552	GTT	2	6	8126	8131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	20088903
57	NC_003552	ACC	2	6	8140	8145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	20088904
58	NC_003552	AGG	2	6	8488	8493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20088904
59	NC_003552	TCC	2	6	8519	8524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20088904
60	NC_003552	GTT	2	6	8552	8557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	20088904
61	NC_003552	ACC	2	6	8586	8591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	20088904
62	NC_003552	CTT	2	6	8630	8635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088904
63	NC_003552	GAA	2	6	8641	8646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088904
64	NC_003552	GAA	2	6	8740	8745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088904
65	NC_003552	CTC	2	6	8746	8751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20088904
66	NC_003552	TGA	2	6	8776	8781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20088904
67	NC_003552	AAC	2	6	8800	8805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	20088904
68	NC_003552	TCC	2	6	8842	8847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20088904
69	NC_003552	CAG	2	6	9051	9056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	20088904
70	NC_003552	TCC	2	6	9109	9114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20088904
71	NC_003552	CAG	2	6	9153	9158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	20088904
72	NC_003552	CTT	2	6	9168	9173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088904
73	NC_003552	TTC	2	6	9297	9302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088904
74	NC_003552	TCC	2	6	9359	9364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20088904
75	NC_003552	AGA	2	6	9630	9635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088905
76	NC_003552	ATT	2	6	9641	9646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	20088905
77	NC_003552	AGG	2	6	9767	9772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20088905
78	NC_003552	TAC	2	6	9861	9866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20088905
79	NC_003552	AGG	2	6	9867	9872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20088905
80	NC_003552	ATG	2	6	10003	10008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20088905
81	NC_003552	AAG	2	6	10416	10421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088905
82	NC_003552	ATA	2	6	10694	10699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	20088905
83	NC_003552	AAG	2	6	10736	10741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088905
84	NC_003552	GGA	2	6	11632	11637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20088906
85	NC_003552	TTC	2	6	11640	11645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088906
86	NC_003552	CTG	2	6	11845	11850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20088906
87	NC_003552	AGA	2	6	11899	11904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088906
88	NC_003552	CTG	2	6	11962	11967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20088906
89	NC_003552	TGA	2	6	12141	12146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20088906
90	NC_003552	GTA	2	6	12190	12195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20088906
91	NC_003552	TTC	2	6	13180	13185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088907
92	NC_003552	CAA	2	6	13189	13194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	20088907
93	NC_003552	TCT	2	6	13223	13228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088907
94	NC_003552	CTG	2	6	13362	13367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20088907
95	NC_003552	GCT	2	6	13594	13599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20088907
96	NC_003552	GGA	2	6	13811	13816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20088907
97	NC_003552	CAG	2	6	13844	13849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	20088907
98	NC_003552	TTG	2	6	13980	13985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	20088907
99	NC_003552	TCC	2	6	14047	14052	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20088907
100	NC_003552	CAG	2	6	14056	14061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	20088907
101	NC_003552	GAA	2	6	14077	14082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088907
102	NC_003552	TTG	2	6	14103	14108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	20088907
103	NC_003552	TTG	2	6	14118	14123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	20088907
104	NC_003552	TGG	2	6	14198	14203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	20088907
105	NC_003552	TCA	2	6	14205	14210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20088907
106	NC_003552	CTG	2	6	14240	14245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20088907
107	NC_003552	GGA	2	6	14249	14254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20088907
108	NC_003552	ATG	2	6	14312	14317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20088907
109	NC_003552	CTA	2	6	14364	14369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20088907
110	NC_003552	ATG	2	6	14504	14509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20088907
111	NC_003552	TCT	2	6	14536	14541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088907
112	NC_003552	GAA	2	6	14827	14832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088908
113	NC_003552	GGA	2	6	14865	14870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20088908
114	NC_003552	ATC	2	6	14894	14899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20088908
115	NC_003552	CTG	2	6	14912	14917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20088908
116	NC_003552	CTA	2	6	15054	15059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20088908
117	NC_003552	AGA	2	6	15446	15451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088909
118	NC_003552	GCC	2	6	15486	15491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	20088909
119	NC_003552	TCT	2	6	15509	15514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088909
120	NC_003552	GCT	2	6	15559	15564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20088909
121	NC_003552	TCA	2	6	15577	15582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20088909
122	NC_003552	GCC	2	6	15738	15743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	20088909
123	NC_003552	TTC	2	6	15771	15776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088909
124	NC_003552	CAG	2	6	15788	15793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	20088909
125	NC_003552	AAG	2	6	15838	15843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088909
126	NC_003552	TTC	2	6	15879	15884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088909
127	NC_003552	GAA	2	6	15966	15971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088909
128	NC_003552	AGC	2	6	16072	16077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	20088909
129	NC_003552	TTC	2	6	16080	16085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088909
130	NC_003552	GCT	2	6	16228	16233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20088909
131	NC_003552	TGG	2	6	16250	16255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	20088909
132	NC_003552	CTG	2	6	16256	16261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20088909
133	NC_003552	ATT	2	6	17144	17149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	20088910
134	NC_003552	TCT	2	6	17302	17307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088910
135	NC_003552	TAT	2	6	17323	17328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	20088910
136	NC_003552	TGG	2	6	17367	17372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	20088910
137	NC_003552	TTA	2	6	17785	17790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	20088911
138	NC_003552	CTT	2	6	17965	17970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088911
139	NC_003552	CTG	2	6	18229	18234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20088911
140	NC_003552	TCT	2	6	18301	18306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088911
141	NC_003552	AGT	2	6	18470	18475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20088912
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143	NC_003552	TGA	2	6	18521	18526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20088912
144	NC_003552	GTT	2	6	18540	18545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	20088912
145	NC_003552	CTT	2	6	18665	18670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088912
146	NC_003552	GCT	2	6	18672	18677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20088912
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151	NC_003552	TCT	2	6	19381	19386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088912
152	NC_003552	CTT	2	6	19512	19517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088912
153	NC_003552	CAG	2	6	19706	19711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	20088913
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155	NC_003552	CAA	2	6	19807	19812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	20088913
156	NC_003552	TCT	2	6	19818	19823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088913
157	NC_003552	CAG	2	6	19831	19836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	20088913
158	NC_003552	AAG	2	6	19862	19867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088913
159	NC_003552	TTA	2	6	19885	19890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	20088913
160	NC_003552	CTT	3	9	19921	19929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088913
161	NC_003552	AGT	2	6	20162	20167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20088913
162	NC_003552	TCT	2	6	20295	20300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088913
163	NC_003552	TGC	2	6	20322	20327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20088913
164	NC_003552	TTC	2	6	20447	20452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088913
165	NC_003552	CTT	2	6	20593	20598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088913
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249	NC_003552	GCA	2	6	29160	29165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	20088920
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252	NC_003552	AGT	2	6	29378	29383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20088920
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