MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methanosarcina acetivorans C2A chromosome

Total Repeats: 49064

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_003552	AGC	2	6	174317	174322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	20089044
1502	NC_003552	GGA	2	6	174537	174542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20089044
1503	NC_003552	CCG	2	6	174620	174625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	20089044
1504	NC_003552	ATG	2	6	174653	174658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20089044
1505	NC_003552	TTC	2	6	174941	174946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20089044
1506	NC_003552	GCT	3	9	174969	174977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20089044
1507	NC_003552	TGT	2	6	175654	175659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	20089045
1508	NC_003552	TCT	2	6	175679	175684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20089045
1509	NC_003552	TGA	2	6	175840	175845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20089045
1510	NC_003552	TGG	2	6	175907	175912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	20089045
1511	NC_003552	CCG	2	6	176040	176045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	20089045
1512	NC_003552	CAT	2	6	176098	176103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20089045
1513	NC_003552	AAT	2	6	176120	176125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	20089045
1514	NC_003552	ATG	2	6	176370	176375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20089046
1515	NC_003552	GAA	2	6	176411	176416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20089046
1516	NC_003552	ATG	2	6	176600	176605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20089046
1517	NC_003552	AAG	2	6	176617	176622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20089046
1518	NC_003552	ATG	2	6	176691	176696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20089046
1519	NC_003552	ATG	2	6	176756	176761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20089046
1520	NC_003552	GAA	2	6	176769	176774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20089046
1521	NC_003552	GAA	2	6	176792	176797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20089046
1522	NC_003552	TGT	2	6	176818	176823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	20089046
1523	NC_003552	CTT	2	6	176829	176834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20089046
1524	NC_003552	GAA	2	6	176909	176914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20089046
1525	NC_003552	AGA	2	6	176932	176937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20089046
1526	NC_003552	TCT	2	6	176968	176973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20089046
1527	NC_003552	AAT	2	6	177042	177047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	20089046
1528	NC_003552	TAA	2	6	177196	177201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	20089047
1529	NC_003552	GTT	2	6	177237	177242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	20089047
1530	NC_003552	TAC	2	6	177262	177267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20089047
1531	NC_003552	TCC	2	6	177292	177297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20089047
1532	NC_003552	GTA	2	6	177405	177410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20089047
1533	NC_003552	GAA	2	6	177416	177421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20089047
1534	NC_003552	ATG	2	6	177510	177515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20089047
1535	NC_003552	AAG	2	6	177553	177558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20089047
1536	NC_003552	AAC	2	6	177642	177647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	20089047
1537	NC_003552	TTA	2	6	177956	177961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	20089047
1538	NC_003552	GAA	2	6	178016	178021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20089047
1539	NC_003552	AGA	2	6	178118	178123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20089047
1540	NC_003552	ATG	2	6	178203	178208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20089047
1541	NC_003552	GAT	2	6	178231	178236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20089047
1542	NC_003552	TAT	2	6	178313	178318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	20089047
1543	NC_003552	AAG	3	9	178343	178351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20089047
1544	NC_003552	ATT	2	6	178453	178458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	20089047
1545	NC_003552	ATT	2	6	178934	178939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	20089048
1546	NC_003552	ACC	2	6	179013	179018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	20089048
1547	NC_003552	AGG	2	6	179078	179083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20089048
1548	NC_003552	TTC	2	6	179286	179291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20089048
1549	NC_003552	ATG	2	6	179354	179359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20089048
1550	NC_003552	GCT	2	6	179465	179470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20089048
1551	NC_003552	GAA	2	6	179795	179800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20089048
1552	NC_003552	GCT	2	6	179828	179833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20089048
1553	NC_003552	GCT	2	6	179927	179932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20089048
1554	NC_003552	GAC	2	6	180035	180040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	20089048
1555	NC_003552	ACC	2	6	180072	180077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	20089048
1556	NC_003552	TGA	2	6	180078	180083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20089048
1557	NC_003552	CAA	2	6	180103	180108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	20089048
1558	NC_003552	AGA	2	6	180346	180351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20089048
1559	NC_003552	TAG	2	6	180375	180380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20089048
1560	NC_003552	CCA	2	6	181400	181405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	20089049
1561	NC_003552	CTT	2	6	181414	181419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20089049
1562	NC_003552	AAT	2	6	181553	181558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	20089049
1563	NC_003552	ATA	2	6	181626	181631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	20089049
1564	NC_003552	TGT	2	6	181659	181664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	20089049
1565	NC_003552	CAA	2	6	181769	181774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	20089049
1566	NC_003552	TGT	2	6	181885	181890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	20089049
1567	NC_003552	CAT	2	6	182029	182034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20089049
1568	NC_003552	ATA	2	6	182312	182317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	20089049
1569	NC_003552	CTT	2	6	182359	182364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20089049
1570	NC_003552	AAT	2	6	183243	183248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	20089050
1571	NC_003552	TCT	2	6	183255	183260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20089050
1572	NC_003552	AAG	2	6	183312	183317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20089050
1573	NC_003552	CAT	2	6	183329	183334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20089050
1574	NC_003552	GCT	2	6	183370	183375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20089050
1575	NC_003552	TAT	2	6	183663	183668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	20089050
1576	NC_003552	CTT	2	6	183980	183985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20089051
1577	NC_003552	AGA	2	6	184001	184006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20089051
1578	NC_003552	ATA	2	6	184065	184070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	20089051
1579	NC_003552	GAA	2	6	184243	184248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20089051
1580	NC_003552	TAG	2	6	184249	184254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20089051
1581	NC_003552	TGC	2	6	184362	184367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20089051
1582	NC_003552	TTC	2	6	184527	184532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20089051
1583	NC_003552	CTC	2	6	184563	184568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20089051
1584	NC_003552	CTG	2	6	184597	184602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20089051
1585	NC_003552	GGC	2	6	184630	184635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	20089051
1586	NC_003552	CTG	2	6	184705	184710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20089051
1587	NC_003552	TTA	2	6	184856	184861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	20089051
1588	NC_003552	TCG	2	6	184879	184884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20089051
1589	NC_003552	ACT	2	6	184927	184932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20089051
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1591	NC_003552	ATT	2	6	185279	185284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	20089052
1592	NC_003552	TTG	2	6	185406	185411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	20089052
1593	NC_003552	TCT	2	6	185447	185452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20089052
1594	NC_003552	GCG	2	6	185479	185484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	20089052
1595	NC_003552	GAA	2	6	185566	185571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20089052
1596	NC_003552	CTC	2	6	185692	185697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20089052
1597	NC_003552	TAA	2	6	185702	185707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	20089052
1598	NC_003552	TCT	2	6	185711	185716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20089052
1599	NC_003552	TAG	2	6	185825	185830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20089052
1600	NC_003552	CTT	2	6	185949	185954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20089052
1601	NC_003552	TCA	3	9	185984	185992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20089052
1602	NC_003552	ATT	2	6	186011	186016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	20089052
1603	NC_003552	CAG	2	6	186381	186386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161484944
1604	NC_003552	AGA	2	6	186468	186473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161484944
1605	NC_003552	GTC	2	6	186483	186488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161484944
1606	NC_003552	GGT	2	6	186557	186562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161484944
1607	NC_003552	TCG	2	6	187109	187114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161484944
1608	NC_003552	AGC	2	6	187122	187127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161484944
1609	NC_003552	GCA	2	6	187135	187140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161484944
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1611	NC_003552	GGT	2	6	187356	187361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161484944
1612	NC_003552	GTT	2	6	187389	187394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161484944
1613	NC_003552	CTG	2	6	187468	187473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161484944
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1615	NC_003552	TCT	2	6	188263	188268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20089054
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1617	NC_003552	AGT	2	6	188514	188519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20089054
1618	NC_003552	GAG	2	6	188743	188748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20089054
1619	NC_003552	CAG	2	6	188752	188757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	20089054
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1621	NC_003552	AAG	2	6	188778	188783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20089054
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1982	NC_003552	CAA	2	6	231530	231535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	20089091
1983	NC_003552	GAA	2	6	231561	231566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20089091
1984	NC_003552	ATT	2	6	231633	231638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	20089091
1985	NC_003552	ATT	2	6	231646	231651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	20089091
1986	NC_003552	AAC	2	6	231988	231993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	20089092
1987	NC_003552	TTC	2	6	232030	232035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20089092
1988	NC_003552	TAC	2	6	232147	232152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20089092
1989	NC_003552	CTT	2	6	232158	232163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20089092
1990	NC_003552	TCC	3	9	232284	232292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20089092
1991	NC_003552	GCC	2	6	232361	232366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	20089092
1992	NC_003552	ATG	2	6	232384	232389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20089092
1993	NC_003552	TCA	2	6	232392	232397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20089092
1994	NC_003552	CAA	2	6	232404	232409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	20089092
1995	NC_003552	CGA	2	6	232455	232460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	20089092
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1998	NC_003552	CTC	2	6	233096	233101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20089092
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2000	NC_003552	ATC	2	6	233236	233241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20089092

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