MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Mesorhizobium loti MAFF303099 plasmid pMLa

Total Repeats: 4150

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_002679	CGG	2	6	337832	337837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488315
4002	NC_002679	TCG	2	6	337846	337851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488315
4003	NC_002679	CGG	2	6	337943	337948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488315
4004	NC_002679	GCG	2	6	338004	338009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488315
4005	NC_002679	GCT	2	6	338162	338167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488315
4006	NC_002679	GTG	2	6	338173	338178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488315
4007	NC_002679	TTC	2	6	338226	338231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488315
4008	NC_002679	CGG	3	9	338276	338284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488315
4009	NC_002679	CCG	2	6	338710	338715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488315
4010	NC_002679	ACG	2	6	338752	338757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488315
4011	NC_002679	CGG	2	6	338886	338891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488316
4012	NC_002679	TCA	2	6	338907	338912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488316
4013	NC_002679	CGT	2	6	338977	338982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488316
4014	NC_002679	GCC	2	6	338987	338992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488316
4015	NC_002679	GCC	2	6	339014	339019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488316
4016	NC_002679	CTT	2	6	339049	339054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488316
4017	NC_002679	GCC	2	6	339101	339106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488316
4018	NC_002679	TGA	2	6	339148	339153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488316
4019	NC_002679	GAG	2	6	339239	339244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488316
4020	NC_002679	CGC	2	6	339250	339255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488316
4021	NC_002679	GCC	2	6	339318	339323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488316
4022	NC_002679	TGC	2	6	339358	339363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488316
4023	NC_002679	CCG	2	6	339379	339384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488316
4024	NC_002679	AGG	2	6	339483	339488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488316
4025	NC_002679	AAC	2	6	339779	339784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488316
4026	NC_002679	TCA	2	6	339909	339914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488316
4027	NC_002679	AGC	2	6	340126	340131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488316
4028	NC_002679	TGC	2	6	340345	340350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488317
4029	NC_002679	AAG	2	6	340432	340437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488317
4030	NC_002679	CGG	2	6	340582	340587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488317
4031	NC_002679	TTC	2	6	340635	340640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488317
4032	NC_002679	GAT	2	6	340752	340757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488317
4033	NC_002679	TGT	2	6	340829	340834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13488317
4034	NC_002679	GTG	2	6	340845	340850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488317
4035	NC_002679	CGA	2	6	340880	340885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488317
4036	NC_002679	CGC	2	6	340979	340984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488317
4037	NC_002679	TGT	2	6	341622	341627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13488173
4038	NC_002679	CGG	2	6	341672	341677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488173
4039	NC_002679	GGC	2	6	341759	341764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488173
4040	NC_002679	GCG	2	6	341804	341809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488173
4041	NC_002679	CGA	2	6	341906	341911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488173
4042	NC_002679	GGA	2	6	341928	341933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488173
4043	NC_002679	AAG	2	6	341944	341949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488173
4044	NC_002679	TCT	2	6	341957	341962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488173
4045	NC_002679	CCA	2	6	342147	342152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488173
4046	NC_002679	GCC	2	6	342244	342249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488173
4047	NC_002679	TGA	2	6	342306	342311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488173
4048	NC_002679	GTT	2	6	342417	342422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13488173
4049	NC_002679	CTG	2	6	342439	342444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488173
4050	NC_002679	CGA	2	6	342462	342467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488173
4051	NC_002679	TCA	2	6	342509	342514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488173
4052	NC_002679	TGG	2	6	342594	342599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488173
4053	NC_002679	GCC	2	6	342601	342606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488173
4054	NC_002679	GCC	2	6	342629	342634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488173
4055	NC_002679	GCC	2	6	342670	342675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488173
4056	NC_002679	GCC	2	6	342743	342748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488173
4057	NC_002679	GGC	2	6	342768	342773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488173
4058	NC_002679	TCC	2	6	342784	342789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488173
4059	NC_002679	GAT	2	6	342814	342819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488173
4060	NC_002679	GCC	2	6	342836	342841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488173
4061	NC_002679	GAA	2	6	343078	343083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488173
4062	NC_002679	GAG	2	6	343216	343221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488173
4063	NC_002679	CCG	2	6	343232	343237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488173
4064	NC_002679	GCC	2	6	343244	343249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488173
4065	NC_002679	GCG	2	6	343274	343279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488173
4066	NC_002679	GGA	2	6	343461	343466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488174
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4069	NC_002679	TTC	2	6	343613	343618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488174
4070	NC_002679	CTT	2	6	343621	343626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488174
4071	NC_002679	TTG	2	6	343645	343650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13488174
4072	NC_002679	GCT	2	6	343742	343747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488174
4073	NC_002679	GAC	2	6	343799	343804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488174
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4077	NC_002679	ACC	2	6	344411	344416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488174
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4080	NC_002679	GTC	2	6	344629	344634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488175
4081	NC_002679	TGG	2	6	344680	344685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488175
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4083	NC_002679	TCG	2	6	344782	344787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488175
4084	NC_002679	TGA	2	6	344847	344852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488175
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4087	NC_002679	CCT	2	6	345254	345259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488176
4088	NC_002679	CCG	2	6	345260	345265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488176
4089	NC_002679	TGC	2	6	345278	345283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488176
4090	NC_002679	GCC	2	6	345357	345362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488176
4091	NC_002679	AAT	2	6	345372	345377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	13488176
4092	NC_002679	TCG	2	6	345382	345387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488176
4093	NC_002679	CGT	2	6	345477	345482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488176
4094	NC_002679	GTC	2	6	345562	345567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488176
4095	NC_002679	ATC	2	6	345595	345600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488176
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4099	NC_002679	GAT	2	6	345969	345974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488176
4100	NC_002679	TCT	3	9	345992	346000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488176
4101	NC_002679	AGG	2	6	346085	346090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488177
4102	NC_002679	CTG	2	6	346313	346318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488177
4103	NC_002679	CTC	2	6	346321	346326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488177
4104	NC_002679	CCT	2	6	346508	346513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488177
4105	NC_002679	GGT	2	6	346534	346539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488177
4106	NC_002679	CAG	2	6	346561	346566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488177
4107	NC_002679	CGT	2	6	346675	346680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488177
4108	NC_002679	TCG	2	6	346715	346720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488177
4109	NC_002679	GCG	2	6	346724	346729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488177
4110	NC_002679	ACC	2	6	346781	346786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488177
4111	NC_002679	CAT	2	6	346828	346833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488177
4112	NC_002679	TCC	2	6	346948	346953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488177
4113	NC_002679	GCC	2	6	346957	346962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488177
4114	NC_002679	GAT	2	6	346969	346974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488177
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4116	NC_002679	GCG	2	6	347027	347032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488177
4117	NC_002679	CTC	2	6	347056	347061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488177
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4119	NC_002679	ACG	2	6	347162	347167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488177
4120	NC_002679	TTG	2	6	347256	347261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13488177
4121	NC_002679	TCC	2	6	347262	347267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488177
4122	NC_002679	CGC	2	6	347433	347438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488318
4123	NC_002679	CGA	2	6	347445	347450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488318
4124	NC_002679	TCT	2	6	347553	347558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488318
4125	NC_002679	CGC	2	6	347629	347634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488318
4126	NC_002679	GTC	2	6	347680	347685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488318
4127	NC_002679	GAC	2	6	347754	347759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488318
4128	NC_002679	CTG	2	6	347770	347775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488318
4129	NC_002679	AAG	2	6	347837	347842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488318
4130	NC_002679	GAC	2	6	347928	347933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488318
4131	NC_002679	GCC	2	6	348769	348774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488178
4132	NC_002679	GGC	2	6	348838	348843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488178
4133	NC_002679	GGC	2	6	348946	348951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488178
4134	NC_002679	CTT	2	6	349473	349478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161621456
4135	NC_002679	CTT	2	6	349485	349490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161621456
4136	NC_002679	GGC	2	6	349711	349716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161621456
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4138	NC_002679	GCC	2	6	349825	349830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161621456
4139	NC_002679	GGC	2	6	349848	349853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161621456
4140	NC_002679	TTG	2	6	350078	350083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161621456
4141	NC_002679	ATC	2	6	350113	350118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161621456
4142	NC_002679	TGC	2	6	350178	350183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161621456
4143	NC_002679	GTT	2	6	350367	350372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161621456
4144	NC_002679	TTC	3	9	350449	350457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161621456
4145	NC_002679	TCA	2	6	350600	350605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161621456
4146	NC_002679	TGC	2	6	350606	350611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161621456
4147	NC_002679	CGG	2	6	350678	350683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161621456
4148	NC_002679	ACG	2	6	350738	350743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161621456
4149	NC_002679	TTG	2	6	350779	350784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161621456
4150	NC_002679	CAT	2	6	350793	350798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161621456

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