MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Mesorhizobium loti MAFF303099 chromosome

Total Repeats: 107086

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002678	TGC	2	6	327	332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470331
2	NC_002678	AAT	2	6	340	345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	13470331
3	NC_002678	CGG	2	6	354	359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470331
4	NC_002678	CGG	2	6	426	431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470331
5	NC_002678	TGC	2	6	465	470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470331
6	NC_002678	TAT	2	6	488	493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	13470331
7	NC_002678	CGA	2	6	601	606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470331
8	NC_002678	TGA	2	6	609	614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13470331
9	NC_002678	TCG	2	6	636	641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470331
10	NC_002678	TGA	2	6	732	737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13470331
11	NC_002678	CAA	2	6	784	789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13470331
12	NC_002678	GAA	2	6	1064	1069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13470331
13	NC_002678	GCG	2	6	1141	1146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470332
14	NC_002678	TGG	2	6	1234	1239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13470332
15	NC_002678	CAC	2	6	1242	1247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13470332
16	NC_002678	GCG	2	6	1260	1265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470332
17	NC_002678	GCG	2	6	1363	1368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470332
18	NC_002678	GCA	2	6	1440	1445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470332
19	NC_002678	GGC	2	6	1459	1464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470332
20	NC_002678	CTG	2	6	1489	1494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470332
21	NC_002678	CTG	2	6	1516	1521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470332
22	NC_002678	ACC	2	6	1559	1564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13470332
23	NC_002678	GTC	2	6	1585	1590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470332
24	NC_002678	AAG	2	6	1633	1638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13470332
25	NC_002678	GGA	2	6	1674	1679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13470332
26	NC_002678	CTG	2	6	1702	1707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470332
27	NC_002678	GAC	2	6	1714	1719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470332
28	NC_002678	CGC	2	6	1821	1826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470332
29	NC_002678	CGA	2	6	1881	1886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470332
30	NC_002678	ATC	2	6	1891	1896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13470332
31	NC_002678	AGC	2	6	1916	1921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470332
32	NC_002678	GAT	2	6	1929	1934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13470332
33	NC_002678	CAC	2	6	1944	1949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13470332
34	NC_002678	TGA	2	6	1991	1996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13470332
35	NC_002678	GCG	3	9	2051	2059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470332
36	NC_002678	GCG	2	6	2070	2075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470332
37	NC_002678	GTC	2	6	2100	2105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470332
38	NC_002678	GAT	2	6	2106	2111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13470332
39	NC_002678	CGC	2	6	2139	2144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470332
40	NC_002678	CGA	2	6	2214	2219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470332
41	NC_002678	CTC	2	6	2433	2438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13470333
42	NC_002678	CGG	2	6	2441	2446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470333
43	NC_002678	CTT	2	6	2490	2495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13470333
44	NC_002678	TTG	2	6	2588	2593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13470333
45	NC_002678	GTC	2	6	2595	2600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470333
46	NC_002678	CAC	2	6	2619	2624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13470333
47	NC_002678	GCC	3	9	2658	2666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470333
48	NC_002678	GCG	2	6	2687	2692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470333
49	NC_002678	GCA	2	6	2833	2838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470334
50	NC_002678	CCA	2	6	2906	2911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13470334
51	NC_002678	TCG	2	6	3138	3143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470334
52	NC_002678	GAC	2	6	3179	3184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470334
53	NC_002678	GCT	2	6	3235	3240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470334
54	NC_002678	GGC	2	6	3295	3300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470334
55	NC_002678	CGA	2	6	3313	3318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470334
56	NC_002678	TCG	2	6	3351	3356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470334
57	NC_002678	TGC	2	6	3462	3467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470334
58	NC_002678	CGT	2	6	3511	3516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470334
59	NC_002678	GCC	2	6	3584	3589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470334
60	NC_002678	GGC	2	6	3649	3654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470334
61	NC_002678	CGA	2	6	3658	3663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470334
62	NC_002678	GCC	2	6	3752	3757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470334
63	NC_002678	CCG	2	6	3765	3770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470334
64	NC_002678	TGC	2	6	3801	3806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470334
65	NC_002678	CCG	2	6	3807	3812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470334
66	NC_002678	GCA	2	6	3843	3848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470334
67	NC_002678	GCT	3	9	3868	3876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470334
68	NC_002678	CGG	2	6	3904	3909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470334
69	NC_002678	GCG	2	6	3938	3943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470334
70	NC_002678	TGG	2	6	4074	4079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13470334
71	NC_002678	CCG	2	6	4101	4106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470334
72	NC_002678	CGG	2	6	4273	4278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470334
73	NC_002678	CGT	2	6	4282	4287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470334
74	NC_002678	GAG	2	6	4352	4357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13470334
75	NC_002678	CCG	2	6	4412	4417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470334
76	NC_002678	CTC	2	6	4474	4479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13470334
77	NC_002678	GGC	2	6	4513	4518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470334
78	NC_002678	GGC	2	6	4543	4548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470334
79	NC_002678	CCT	2	6	4620	4625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13470334
80	NC_002678	GGA	2	6	4666	4671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13470334
81	NC_002678	CGA	2	6	4960	4965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470334
82	NC_002678	CGC	2	6	4998	5003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470334
83	NC_002678	GCG	2	6	5040	5045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470334
84	NC_002678	GCA	2	6	5220	5225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470334
85	NC_002678	CGG	2	6	5239	5244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470334
86	NC_002678	GTC	2	6	5248	5253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470334
87	NC_002678	TCA	2	6	5370	5375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13470334
88	NC_002678	GAC	2	6	5410	5415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470334
89	NC_002678	ACA	2	6	5424	5429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13470334
90	NC_002678	AGC	2	6	5451	5456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470334
91	NC_002678	ACC	2	6	5582	5587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13470334
92	NC_002678	GGC	2	6	5672	5677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470334
93	NC_002678	CTT	2	6	5743	5748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13470334
94	NC_002678	TGC	2	6	5919	5924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470334
95	NC_002678	ACG	2	6	5942	5947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470334
96	NC_002678	AAC	2	6	5972	5977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13470334
97	NC_002678	TCG	2	6	6045	6050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470334
98	NC_002678	CAA	2	6	6118	6123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13470334
99	NC_002678	GAC	2	6	6251	6256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470335
100	NC_002678	GCG	2	6	6290	6295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470335
101	NC_002678	GTC	2	6	6296	6301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470335
102	NC_002678	CGC	2	6	6331	6336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470335
103	NC_002678	GCC	2	6	6346	6351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470335
104	NC_002678	CCG	2	6	6379	6384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470335
105	NC_002678	CAG	2	6	6389	6394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470335
106	NC_002678	CGT	2	6	6536	6541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470335
107	NC_002678	TCT	2	6	6556	6561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13470335
108	NC_002678	GCC	2	6	6581	6586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470335
109	NC_002678	CGA	2	6	6758	6763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470335
110	NC_002678	CGT	2	6	6764	6769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470335
111	NC_002678	AGC	2	6	6771	6776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470335
112	NC_002678	GCG	2	6	6799	6804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470335
113	NC_002678	TGA	2	6	6835	6840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13470335
114	NC_002678	GGC	2	6	6874	6879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470335
115	NC_002678	CGA	2	6	6901	6906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470335
116	NC_002678	TCA	2	6	7057	7062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13470335
117	NC_002678	TTG	2	6	7074	7079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13470335
118	NC_002678	ATG	2	6	7083	7088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13470335
119	NC_002678	CGT	2	6	7090	7095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470335
120	NC_002678	TGG	2	6	7153	7158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13470335
121	NC_002678	GTC	2	6	7190	7195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470335
122	NC_002678	ATC	2	6	7215	7220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13470335
123	NC_002678	GCC	3	9	7226	7234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470335
124	NC_002678	TGG	2	6	7315	7320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13470335
125	NC_002678	CGT	2	6	7327	7332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470335
126	NC_002678	TGG	2	6	7398	7403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13470335
127	NC_002678	CGA	2	6	7733	7738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470336
128	NC_002678	GGC	2	6	7800	7805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470336
129	NC_002678	CGA	2	6	7824	7829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470336
130	NC_002678	GGC	2	6	7836	7841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470336
131	NC_002678	ATC	2	6	7867	7872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13470336
132	NC_002678	GGC	2	6	7920	7925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470336
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135	NC_002678	CGG	2	6	8013	8018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470336
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254	NC_002678	GCG	2	6	15586	15591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57165208
255	NC_002678	CGA	2	6	15649	15654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57165208
256	NC_002678	AGC	2	6	16143	16148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470343
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258	NC_002678	TCG	2	6	16583	16588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470344
259	NC_002678	ATC	2	6	16603	16608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13470344
260	NC_002678	CGC	2	6	16644	16649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470344
261	NC_002678	AGC	2	6	16871	16876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470344
262	NC_002678	CGG	2	6	16998	17003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470344
263	NC_002678	GAA	2	6	17007	17012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13470344
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283	NC_002678	AGG	2	6	18096	18101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13470345
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290	NC_002678	CGA	2	6	18472	18477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470345
291	NC_002678	CTG	2	6	18494	18499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470345
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497	NC_002678	CGG	2	6	32220	32225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470359
498	NC_002678	ATC	2	6	32233	32238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13470359
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500	NC_002678	CGC	3	9	32358	32366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470359

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