MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Mesorhizobium loti MAFF303099 chromosome

Total Repeats: 107086

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_002678	CAG	2	6	100104	100109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470435
1502	NC_002678	CAG	2	6	100146	100151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470435
1503	NC_002678	GTC	2	6	100188	100193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470435
1504	NC_002678	GCC	2	6	100203	100208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470435
1505	NC_002678	CGG	2	6	100274	100279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470435
1506	NC_002678	TCG	2	6	100291	100296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470435
1507	NC_002678	TCT	2	6	100331	100336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13470435
1508	NC_002678	GAT	2	6	100344	100349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13470435
1509	NC_002678	GGC	2	6	100368	100373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470435
1510	NC_002678	CCT	2	6	100382	100387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13470435
1511	NC_002678	TGC	2	6	100388	100393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470435
1512	NC_002678	AGC	2	6	100405	100410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470435
1513	NC_002678	GTG	2	6	100423	100428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13470435
1514	NC_002678	CAC	2	6	100449	100454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13470435
1515	NC_002678	CGC	2	6	100508	100513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470435
1516	NC_002678	GGC	2	6	100527	100532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470435
1517	NC_002678	CGG	2	6	100544	100549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470435
1518	NC_002678	GGC	2	6	100969	100974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470436
1519	NC_002678	CCA	2	6	100983	100988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13470436
1520	NC_002678	GAT	2	6	101092	101097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13470436
1521	NC_002678	CAG	2	6	101392	101397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470436
1522	NC_002678	CGG	2	6	101454	101459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470436
1523	NC_002678	GTC	2	6	101464	101469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470436
1524	NC_002678	GCC	2	6	101485	101490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470436
1525	NC_002678	GGT	2	6	101491	101496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13470436
1526	NC_002678	CCG	2	6	101532	101537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470436
1527	NC_002678	GAT	2	6	101539	101544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13470436
1528	NC_002678	TCT	2	6	101549	101554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13470436
1529	NC_002678	TCG	2	6	101555	101560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470436
1530	NC_002678	TCA	2	6	101601	101606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13470436
1531	NC_002678	GGC	2	6	101677	101682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470436
1532	NC_002678	GCT	2	6	101887	101892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470437
1533	NC_002678	CTG	2	6	101906	101911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470437
1534	NC_002678	GCC	2	6	101980	101985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470437
1535	NC_002678	GGC	2	6	102045	102050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470437
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1537	NC_002678	GGC	2	6	102208	102213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470437
1538	NC_002678	CTG	2	6	102389	102394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470437
1539	NC_002678	CGC	2	6	102492	102497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470437
1540	NC_002678	GGC	3	9	102527	102535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470437
1541	NC_002678	AGC	2	6	102615	102620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470437
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1543	NC_002678	TCG	2	6	102768	102773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470437
1544	NC_002678	GCA	2	6	102942	102947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470438
1545	NC_002678	TGG	2	6	103023	103028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13470438
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1547	NC_002678	CTG	2	6	103416	103421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470439
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1550	NC_002678	CGA	2	6	103523	103528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470439
1551	NC_002678	GTC	2	6	103592	103597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470440
1552	NC_002678	GTC	2	6	103607	103612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470440
1553	NC_002678	GGC	2	6	103637	103642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470440
1554	NC_002678	TCA	2	6	103753	103758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13470440
1555	NC_002678	GCT	2	6	103767	103772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470440
1556	NC_002678	TGC	2	6	103780	103785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470440
1557	NC_002678	TGT	2	6	103846	103851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13470440
1558	NC_002678	CAT	2	6	103853	103858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13470440
1559	NC_002678	GCC	2	6	104014	104019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470441
1560	NC_002678	CGG	2	6	104045	104050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470441
1561	NC_002678	ATC	2	6	104090	104095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13470441
1562	NC_002678	CGC	2	6	104414	104419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470442
1563	NC_002678	TCG	2	6	104437	104442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470442
1564	NC_002678	GCG	2	6	104461	104466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470442
1565	NC_002678	GGC	2	6	104492	104497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470442
1566	NC_002678	CCA	2	6	104545	104550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13470442
1567	NC_002678	TCG	2	6	104595	104600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470442
1568	NC_002678	GCC	2	6	104705	104710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470442
1569	NC_002678	AGC	2	6	104716	104721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470442
1570	NC_002678	GCC	2	6	104786	104791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470442
1571	NC_002678	CTT	2	6	104846	104851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13470442
1572	NC_002678	CGA	2	6	104869	104874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470442
1573	NC_002678	GCC	2	6	104900	104905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470442
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1575	NC_002678	TGC	2	6	104966	104971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470442
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1577	NC_002678	CGT	2	6	105237	105242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470442
1578	NC_002678	GCG	2	6	105257	105262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470442
1579	NC_002678	GTC	2	6	105278	105283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470442
1580	NC_002678	CGC	2	6	105321	105326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470442
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1582	NC_002678	CGA	2	6	105713	105718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470443
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1584	NC_002678	CGA	2	6	105932	105937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470443
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1587	NC_002678	CGA	2	6	106154	106159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470443
1588	NC_002678	TCG	2	6	106189	106194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470443
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1590	NC_002678	TCG	2	6	106362	106367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470444
1591	NC_002678	CAG	2	6	106514	106519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470444
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1593	NC_002678	CGC	2	6	106576	106581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470444
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1599	NC_002678	GGA	2	6	106904	106909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13470444
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1601	NC_002678	GCC	3	9	107130	107138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470444
1602	NC_002678	CAA	2	6	107153	107158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13470444
1603	NC_002678	GGC	2	6	107296	107301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470444
1604	NC_002678	ATG	2	6	107490	107495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13470444
1605	NC_002678	CGC	2	6	107503	107508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470444
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1607	NC_002678	CGA	2	6	107650	107655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470444
1608	NC_002678	CGA	2	6	107662	107667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470444
1609	NC_002678	TGC	2	6	107696	107701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470444
1610	NC_002678	TGT	2	6	108241	108246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13470445
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1618	NC_002678	CGC	2	6	109564	109569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470446
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1620	NC_002678	CCG	2	6	109770	109775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470446
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1742	NC_002678	TCA	2	6	116562	116567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13470452
1743	NC_002678	CGG	2	6	116613	116618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470453
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1980	NC_002678	GCC	2	6	134860	134865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470477
1981	NC_002678	CGA	2	6	134894	134899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470477
1982	NC_002678	ATC	3	9	134947	134955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13470477
1983	NC_002678	CGT	2	6	134973	134978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470477
1984	NC_002678	CGC	2	6	135092	135097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470477
1985	NC_002678	CGG	2	6	135103	135108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470477
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1990	NC_002678	CCG	2	6	135587	135592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470479
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1998	NC_002678	CGC	2	6	136199	136204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470480
1999	NC_002678	GAG	2	6	136231	136236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13470480
2000	NC_002678	TCG	2	6	136253	136258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470480

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