MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mannheimia haemolytica USMARC_2286

Total Repeats: 32021

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021883	TAA	2	6	274	279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021883	GAT	2	6	365	370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021883	CAG	2	6	403	408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_021883	TAG	2	6	420	425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021883	CGG	2	6	468	473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526467398
6	NC_021883	AAC	2	6	685	690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526467398
7	NC_021883	AAG	2	6	800	805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526467398
8	NC_021883	TGG	2	6	818	823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526467398
9	NC_021883	AAC	2	6	826	831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526467398
10	NC_021883	GGT	2	6	946	951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526467398
11	NC_021883	CTG	2	6	965	970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526467398
12	NC_021883	CAA	2	6	971	976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526467398
13	NC_021883	ACC	2	6	1035	1040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526467398
14	NC_021883	TCT	2	6	1109	1114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526467398
15	NC_021883	TAT	2	6	1233	1238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467398
16	NC_021883	CCA	2	6	1308	1313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526467398
17	NC_021883	CCA	2	6	1370	1375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526467398
18	NC_021883	CAT	2	6	1437	1442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467398
19	NC_021883	ACT	2	6	1469	1474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467398
20	NC_021883	TGG	2	6	1670	1675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526467398
21	NC_021883	TGC	2	6	1745	1750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526467398
22	NC_021883	CCG	2	6	1971	1976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526467398
23	NC_021883	GAA	2	6	2289	2294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526467398
24	NC_021883	TAC	2	6	2327	2332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_021883	CCG	2	6	2406	2411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_021883	AAT	2	6	2633	2638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526467399
27	NC_021883	CAA	2	6	2711	2716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526467400
28	NC_021883	ATT	2	6	2743	2748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467400
29	NC_021883	TGA	2	6	2794	2799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467400
30	NC_021883	TTG	2	6	2829	2834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526467400
31	NC_021883	GTC	2	6	2838	2843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526467400
32	NC_021883	CTA	2	6	2936	2941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467400
33	NC_021883	GGA	2	6	3028	3033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526467400
34	NC_021883	ATG	2	6	3156	3161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467400
35	NC_021883	AAT	2	6	3169	3174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526467400
36	NC_021883	AAC	2	6	3183	3188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526467400
37	NC_021883	TAG	2	6	3249	3254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467400
38	NC_021883	TAA	2	6	3368	3373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021883	TAT	2	6	3394	3399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021883	GTA	2	6	3456	3461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021883	GAG	2	6	3526	3531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021883	TGG	2	6	3646	3651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526467401
43	NC_021883	ACT	2	6	3671	3676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467401
44	NC_021883	ACT	2	6	3850	3855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467401
45	NC_021883	TTC	2	6	3858	3863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526467401
46	NC_021883	CAC	2	6	4083	4088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526467401
47	NC_021883	CTG	3	9	4149	4157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526467401
48	NC_021883	ATT	2	6	4247	4252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467401
49	NC_021883	GAA	2	6	4262	4267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526467401
50	NC_021883	TTC	2	6	4340	4345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526467401
51	NC_021883	TTC	2	6	4367	4372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526467401
52	NC_021883	ATA	2	6	4404	4409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526467401
53	NC_021883	TTA	2	6	4442	4447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467401
54	NC_021883	ACA	2	6	4627	4632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526467401
55	NC_021883	GTT	2	6	4682	4687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526467401
56	NC_021883	TAT	2	6	4726	4731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467401
57	NC_021883	TAT	2	6	4780	4785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467401
58	NC_021883	ATT	2	6	4886	4891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467401
59	NC_021883	ATT	2	6	4898	4903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467401
60	NC_021883	TGA	2	6	4914	4919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467401
61	NC_021883	AAT	2	6	4983	4988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526467401
62	NC_021883	GTT	2	6	5186	5191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021883	GGT	2	6	5217	5222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021883	ACT	2	6	5325	5330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_021883	GTT	2	6	5396	5401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021883	GAT	3	9	5406	5414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021883	ATC	2	6	5458	5463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_021883	TGG	2	6	5563	5568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021883	GCG	2	6	5613	5618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_021883	GGC	2	6	5622	5627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_021883	AAG	2	6	5644	5649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021883	TTA	2	6	5710	5715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021883	GTG	2	6	5782	5787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021883	GCC	2	6	5880	5885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_021883	TCA	2	6	6276	6281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_021883	ACA	2	6	6298	6303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_021883	CTT	2	6	6354	6359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_021883	GAT	2	6	6512	6517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021883	TTC	2	6	6542	6547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_021883	CAG	2	6	6600	6605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_021883	GAG	2	6	6701	6706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021883	AAC	2	6	6720	6725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526467402
83	NC_021883	CAA	2	6	6742	6747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526467402
84	NC_021883	ATC	2	6	6810	6815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467402
85	NC_021883	AAC	2	6	6887	6892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526467402
86	NC_021883	CTG	2	6	6987	6992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526467402
87	NC_021883	TTG	2	6	7023	7028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526467402
88	NC_021883	ATG	2	6	7107	7112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467402
89	NC_021883	CGG	2	6	7144	7149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526467402
90	NC_021883	TTG	2	6	7196	7201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526467402
91	NC_021883	TAT	2	6	7303	7308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467402
92	NC_021883	GAC	2	6	7376	7381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526467402
93	NC_021883	GAA	2	6	7469	7474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526467402
94	NC_021883	TGA	2	6	7530	7535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467402
95	NC_021883	CAT	2	6	7682	7687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467402
96	NC_021883	ACC	2	6	7848	7853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526467403
97	NC_021883	GCT	2	6	7978	7983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526467403
98	NC_021883	ATC	3	9	7993	8001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467403
99	NC_021883	TGT	2	6	8042	8047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526467403
100	NC_021883	AAC	2	6	8116	8121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526467403
101	NC_021883	CGG	2	6	8124	8129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526467403
102	NC_021883	AAG	2	6	8206	8211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526467403
103	NC_021883	CTT	2	6	8249	8254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526467403
104	NC_021883	TGT	2	6	8339	8344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526467403
105	NC_021883	CCA	2	6	8405	8410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526467403
106	NC_021883	TCA	2	6	8428	8433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467403
107	NC_021883	CGG	2	6	8436	8441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526467403
108	NC_021883	CCG	2	6	8584	8589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526467403
109	NC_021883	CCA	2	6	8610	8615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526467403
110	NC_021883	CCA	2	6	8619	8624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526467403
111	NC_021883	CGG	2	6	8673	8678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526467403
112	NC_021883	CGC	2	6	8709	8714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526467403
113	NC_021883	ATA	2	6	8845	8850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526467403
114	NC_021883	TCA	2	6	8923	8928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467403
115	NC_021883	ATA	2	6	8970	8975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526467403
116	NC_021883	CTG	2	6	9043	9048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526467403
117	NC_021883	CTG	2	6	9065	9070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526467403
118	NC_021883	TAC	2	6	9101	9106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_021883	CTA	2	6	9131	9136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_021883	ATT	2	6	9195	9200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021883	CTT	2	6	9231	9236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_021883	CAG	2	6	9363	9368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526467404
123	NC_021883	CCA	2	6	9515	9520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526467404
124	NC_021883	GTA	2	6	9701	9706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467404
125	NC_021883	CTT	2	6	9920	9925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526467404
126	NC_021883	TCA	2	6	10039	10044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467404
127	NC_021883	CCA	2	6	10055	10060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526467404
128	NC_021883	ATA	2	6	10062	10067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526467404
129	NC_021883	TTG	2	6	10197	10202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526467404
130	NC_021883	CAC	2	6	10256	10261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526467404
131	NC_021883	TTG	2	6	10287	10292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526467404
132	NC_021883	GCA	2	6	10330	10335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526467404
133	NC_021883	GAA	2	6	10393	10398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021883	TCT	2	6	10447	10452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526467405
135	NC_021883	CTT	2	6	10472	10477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526467405
136	NC_021883	ACC	3	9	10515	10523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526467405
137	NC_021883	ATC	2	6	10525	10530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467405
138	NC_021883	CCG	2	6	10540	10545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526467405
139	NC_021883	CTG	2	6	10562	10567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526467405
140	NC_021883	ACT	2	6	10576	10581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467405
141	NC_021883	ACC	2	6	10599	10604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526467405
142	NC_021883	CTG	3	9	10631	10639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526467405
143	NC_021883	CTG	2	6	10643	10648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526467405
144	NC_021883	CTG	2	6	10832	10837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526467405
145	NC_021883	GGT	2	6	10839	10844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526467405
146	NC_021883	GTC	2	6	11151	11156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526467405
147	NC_021883	TCA	2	6	11216	11221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467405
148	NC_021883	TGC	2	6	11250	11255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526467405
149	NC_021883	TTG	2	6	11277	11282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526467405
150	NC_021883	ACC	2	6	11426	11431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526467405
151	NC_021883	AAG	2	6	11488	11493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526467405
152	NC_021883	GAA	2	6	11769	11774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526467405
153	NC_021883	CCG	2	6	11828	11833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526467405
154	NC_021883	AAT	2	6	11940	11945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_021883	ACA	2	6	12263	12268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526467406
156	NC_021883	TAT	3	9	12287	12295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467406
157	NC_021883	GGT	2	6	12297	12302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526467406
158	NC_021883	TTA	3	9	12357	12365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467406
159	NC_021883	TAT	2	6	12530	12535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467406
160	NC_021883	TGA	2	6	12719	12724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467406
161	NC_021883	GTA	2	6	12756	12761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467406
162	NC_021883	CGG	2	6	12767	12772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526467406
163	NC_021883	ATG	2	6	13015	13020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467406
164	NC_021883	ACA	2	6	13095	13100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526467406
165	NC_021883	CTT	2	6	13120	13125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526467406
166	NC_021883	TGA	2	6	13205	13210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467406
167	NC_021883	AAG	2	6	13258	13263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526467406
168	NC_021883	AAG	2	6	13276	13281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526467406
169	NC_021883	GGT	2	6	13338	13343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526467406
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172	NC_021883	GCA	2	6	13464	13469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526467406
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179	NC_021883	TGT	2	6	13941	13946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526467407
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182	NC_021883	ATC	2	6	14317	14322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467408
183	NC_021883	ATA	2	6	14350	14355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526467408
184	NC_021883	AAT	2	6	14399	14404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526467408
185	NC_021883	ATA	2	6	14417	14422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526467408
186	NC_021883	TAA	2	6	14439	14444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526467408
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188	NC_021883	AAT	2	6	14548	14553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526467408
189	NC_021883	ATA	2	6	14619	14624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
190	NC_021883	TCT	2	6	14680	14685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526467409
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193	NC_021883	CAT	2	6	14835	14840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467409
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196	NC_021883	AAT	2	6	14909	14914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526467409
197	NC_021883	ATT	2	6	15052	15057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
198	NC_021883	TAA	2	6	15075	15080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
199	NC_021883	ATT	2	6	15101	15106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
200	NC_021883	ATT	2	6	15300	15305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467410
201	NC_021883	AGC	2	6	15368	15373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526467410
202	NC_021883	TTC	2	6	15378	15383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526467410
203	NC_021883	CCG	2	6	15457	15462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526467410
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205	NC_021883	TCA	2	6	15518	15523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467410
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208	NC_021883	GCC	2	6	15661	15666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526467410
209	NC_021883	CAC	2	6	15852	15857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526467410
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211	NC_021883	TGG	2	6	16029	16034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526467410
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217	NC_021883	ACA	2	6	16713	16718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
218	NC_021883	TAA	2	6	16777	16782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526467411
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249	NC_021883	AGT	2	6	20164	20169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467414
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251	NC_021883	TTG	2	6	20278	20283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526467414
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254	NC_021883	ACC	2	6	20400	20405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526467414
255	NC_021883	CGG	2	6	20491	20496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526467414
256	NC_021883	ATA	2	6	20702	20707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526467414
257	NC_021883	ATC	2	6	20755	20760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467414
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259	NC_021883	TTG	2	6	21364	21369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526467414
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489	NC_021883	TTA	2	6	39781	39786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467432
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496	NC_021883	CCG	3	9	40313	40321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526467433
497	NC_021883	TAA	2	6	40345	40350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526467433
498	NC_021883	TCG	2	6	40382	40387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526467433
499	NC_021883	TTC	2	6	40468	40473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526467433
500	NC_021883	TCA	2	6	40535	40540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467433

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