MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mannheimia haemolytica USMARC_2286

Total Repeats: 32021

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021883	GCC	2	6	40585	40590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526467433
502	NC_021883	GCG	2	6	40810	40815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526467433
503	NC_021883	TCA	2	6	40886	40891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467433
504	NC_021883	CTT	2	6	40929	40934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526467433
505	NC_021883	AAT	2	6	41104	41109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526467433
506	NC_021883	TTG	2	6	41164	41169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526467433
507	NC_021883	TGA	2	6	41258	41263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_021883	GAG	2	6	41383	41388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
509	NC_021883	ATT	2	6	41559	41564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467434
510	NC_021883	ATT	2	6	41628	41633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467434
511	NC_021883	GTT	2	6	41691	41696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526467434
512	NC_021883	ATT	2	6	41719	41724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467434
513	NC_021883	TTA	2	6	41731	41736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467434
514	NC_021883	TGA	2	6	41798	41803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467434
515	NC_021883	CTA	2	6	41947	41952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_021883	GCG	2	6	41993	41998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526467435
517	NC_021883	CAT	2	6	42000	42005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467435
518	NC_021883	ATA	2	6	42074	42079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526467435
519	NC_021883	CAA	2	6	42146	42151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526467436
520	NC_021883	ATG	2	6	42152	42157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467436
521	NC_021883	TTC	2	6	42165	42170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526467436
522	NC_021883	ATT	2	6	42192	42197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467436
523	NC_021883	CTT	2	6	42254	42259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526467436
524	NC_021883	CAA	2	6	42260	42265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526467436
525	NC_021883	CTG	2	6	42331	42336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526467436
526	NC_021883	TGC	2	6	42545	42550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526467436
527	NC_021883	TGA	2	6	42554	42559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467436
528	NC_021883	ATT	2	6	42637	42642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_021883	TAG	2	6	42699	42704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_021883	CAG	2	6	42768	42773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526467437
531	NC_021883	TGG	2	6	42776	42781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526467437
532	NC_021883	CAG	2	6	42782	42787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526467437
533	NC_021883	ATG	2	6	42854	42859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467437
534	NC_021883	CAA	2	6	42883	42888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526467437
535	NC_021883	TTA	2	6	42901	42906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467437
536	NC_021883	GAT	2	6	43057	43062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467437
537	NC_021883	ACC	2	6	43097	43102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526467437
538	NC_021883	ATT	2	6	43403	43408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467437
539	NC_021883	ATT	2	6	43894	43899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467437
540	NC_021883	TTA	2	6	44050	44055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467437
541	NC_021883	TTA	2	6	44116	44121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467437
542	NC_021883	CAA	2	6	44170	44175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526467437
543	NC_021883	ATC	2	6	44495	44500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_021883	TAA	2	6	44690	44695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526467232
545	NC_021883	CAC	2	6	44713	44718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526467232
546	NC_021883	TGA	2	6	44834	44839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467232
547	NC_021883	AGT	2	6	44883	44888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467232
548	NC_021883	GTT	2	6	44966	44971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526467439
549	NC_021883	CAA	2	6	44985	44990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526467439
550	NC_021883	ATC	2	6	45358	45363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467439
551	NC_021883	TTA	2	6	45416	45421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467439
552	NC_021883	ATT	2	6	45448	45453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467439
553	NC_021883	ATT	2	6	45499	45504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467439
554	NC_021883	TTA	2	6	45578	45583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467439
555	NC_021883	ATT	2	6	45661	45666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467439
556	NC_021883	TTG	2	6	45680	45685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526467439
557	NC_021883	ATT	2	6	45793	45798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467439
558	NC_021883	GTC	2	6	45860	45865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526467439
559	NC_021883	ACA	2	6	46124	46129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526467439
560	NC_021883	CAT	2	6	46158	46163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467439
561	NC_021883	AAT	2	6	46227	46232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526467439
562	NC_021883	TTG	2	6	46349	46354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526467439
563	NC_021883	TCA	2	6	46418	46423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467439
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565	NC_021883	ATT	3	9	46501	46509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467439
566	NC_021883	CAA	2	6	46512	46517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526467439
567	NC_021883	CAT	2	6	46530	46535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467439
568	NC_021883	TGT	2	6	46582	46587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526467439
569	NC_021883	CCA	2	6	46608	46613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526467439
570	NC_021883	TTG	2	6	46825	46830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526467439
571	NC_021883	CAG	2	6	46869	46874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526467439
572	NC_021883	TCA	2	6	46947	46952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467439
573	NC_021883	ATC	2	6	47103	47108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467440
574	NC_021883	ATC	2	6	47361	47366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467440
575	NC_021883	TAA	2	6	47502	47507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526467440
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577	NC_021883	CTT	2	6	47635	47640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526467441
578	NC_021883	TTG	2	6	47651	47656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526467441
579	NC_021883	GAG	2	6	47661	47666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526467441
580	NC_021883	TCT	2	6	47802	47807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526467441
581	NC_021883	GCT	2	6	47844	47849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526467441
582	NC_021883	GCA	2	6	47970	47975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526467441
583	NC_021883	CTG	2	6	47977	47982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526467441
584	NC_021883	TCA	2	6	48001	48006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467441
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586	NC_021883	GCT	2	6	48300	48305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526467441
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588	NC_021883	CGG	2	6	48376	48381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526467441
589	NC_021883	CGG	2	6	48668	48673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526467442
590	NC_021883	AGT	2	6	48832	48837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467443
591	NC_021883	TGC	2	6	48909	48914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526467443
592	NC_021883	ATT	2	6	49098	49103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467443
593	NC_021883	GTA	2	6	49181	49186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467444
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595	NC_021883	TAA	2	6	49586	49591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526467445
596	NC_021883	TGG	2	6	49765	49770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526467445
597	NC_021883	TCA	2	6	49791	49796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467445
598	NC_021883	GTA	2	6	49821	49826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467445
599	NC_021883	CCA	2	6	49855	49860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526467445
600	NC_021883	TCT	2	6	49980	49985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526467446
601	NC_021883	TTG	2	6	50005	50010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526467446
602	NC_021883	CAC	2	6	50011	50016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526467446
603	NC_021883	ATC	2	6	50207	50212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467446
604	NC_021883	CAG	2	6	50340	50345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526467446
605	NC_021883	ACC	2	6	50430	50435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526467446
606	NC_021883	CAC	2	6	50437	50442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526467446
607	NC_021883	GTT	2	6	50469	50474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526467446
608	NC_021883	CAG	2	6	50538	50543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526467446
609	NC_021883	GAA	2	6	50544	50549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526467446
610	NC_021883	CGC	2	6	50619	50624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526467446
611	NC_021883	TTC	2	6	50772	50777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_021883	TTA	2	6	50818	50823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467447
613	NC_021883	CTG	2	6	50858	50863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526467447
614	NC_021883	TTA	2	6	51245	51250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_021883	TGA	2	6	51556	51561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467448
616	NC_021883	CAG	2	6	51603	51608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526467448
617	NC_021883	CTG	2	6	51671	51676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526467448
618	NC_021883	GCG	2	6	51705	51710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526467448
619	NC_021883	GTG	2	6	51795	51800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526467448
620	NC_021883	CCG	2	6	51918	51923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526467448
621	NC_021883	AAG	2	6	51924	51929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526467448
622	NC_021883	ATC	2	6	51944	51949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467448
623	NC_021883	CTC	2	6	52239	52244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526467449
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625	NC_021883	CAA	2	6	52311	52316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526467449
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