MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-SAM-185

Total Repeats: 30843

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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30502	NC_020834	CAA	2	6	2516792	2516797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472337755
30503	NC_020834	CAA	2	6	2516872	2516877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472337755
30504	NC_020834	GAT	2	6	2516929	2516934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472337755
30505	NC_020834	GAA	2	6	2516986	2516991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472337755
30506	NC_020834	CGC	2	6	2517035	2517040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472337755
30507	NC_020834	TGA	2	6	2517187	2517192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472337755
30508	NC_020834	TTA	2	6	2517194	2517199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472337755
30509	NC_020834	GGT	2	6	2517328	2517333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472337756
30510	NC_020834	ACT	2	6	2517334	2517339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472337756
30511	NC_020834	CCA	2	6	2517385	2517390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472337756
30512	NC_020834	GAC	2	6	2517410	2517415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472337756
30513	NC_020834	CAA	2	6	2517539	2517544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472337756
30514	NC_020834	CCA	2	6	2517577	2517582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472337756
30515	NC_020834	ACT	2	6	2517823	2517828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472337756
30516	NC_020834	GCA	2	6	2517841	2517846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472337756
30517	NC_020834	AGA	2	6	2517904	2517909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472337756
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30519	NC_020834	GCC	2	6	2518008	2518013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472337756
30520	NC_020834	CAA	2	6	2518145	2518150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472337756
30521	NC_020834	CCG	2	6	2518184	2518189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472337756
30522	NC_020834	GTA	2	6	2518196	2518201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472337756
30523	NC_020834	TAT	2	6	2518246	2518251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472337756
30524	NC_020834	CAA	3	9	2518256	2518264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472337756
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30526	NC_020834	TGA	2	6	2518513	2518518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472337757
30527	NC_020834	GGT	2	6	2518560	2518565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472337757
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30530	NC_020834	CTG	2	6	2518773	2518778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472337757
30531	NC_020834	ATT	2	6	2518779	2518784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472337757
30532	NC_020834	AAT	2	6	2518826	2518831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472337757
30533	NC_020834	CCT	2	6	2518835	2518840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472337757
30534	NC_020834	CAC	2	6	2518887	2518892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472337757
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30541	NC_020834	ATT	2	6	2519496	2519501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30542	NC_020834	CAC	2	6	2519620	2519625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30543	NC_020834	TAA	2	6	2519751	2519756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30544	NC_020834	CGA	2	6	2519779	2519784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30545	NC_020834	CAC	2	6	2519808	2519813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30546	NC_020834	GTC	2	6	2519883	2519888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30547	NC_020834	TCT	2	6	2519991	2519996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30548	NC_020834	TTC	3	9	2520006	2520014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30549	NC_020834	CGT	2	6	2520126	2520131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30550	NC_020834	CAA	2	6	2520138	2520143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30551	NC_020834	AGC	2	6	2520303	2520308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30552	NC_020834	ACG	2	6	2520357	2520362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30553	NC_020834	TGA	2	6	2520437	2520442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30554	NC_020834	CCG	2	6	2520465	2520470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30555	NC_020834	ACC	2	6	2520552	2520557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30556	NC_020834	CTC	2	6	2520671	2520676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30557	NC_020834	GAG	2	6	2520690	2520695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30558	NC_020834	CCA	2	6	2520715	2520720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30559	NC_020834	GGT	2	6	2520775	2520780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30560	NC_020834	CAT	2	6	2520970	2520975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30561	NC_020834	GCC	2	6	2521045	2521050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30562	NC_020834	TAA	2	6	2521170	2521175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30563	NC_020834	ACC	2	6	2521328	2521333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30564	NC_020834	TAA	2	6	2521358	2521363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30565	NC_020834	TCA	2	6	2521427	2521432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30566	NC_020834	TTA	2	6	2521539	2521544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30567	NC_020834	CAG	2	6	2521717	2521722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30568	NC_020834	TGG	2	6	2521871	2521876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30569	NC_020834	GTT	2	6	2521966	2521971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30570	NC_020834	GGA	2	6	2522529	2522534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30571	NC_020834	TTG	2	6	2522579	2522584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30572	NC_020834	CTA	2	6	2522707	2522712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30573	NC_020834	TAG	2	6	2522803	2522808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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30583	NC_020834	GTG	2	6	2523399	2523404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30584	NC_020834	ACC	2	6	2523422	2523427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30585	NC_020834	ACC	2	6	2523457	2523462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30586	NC_020834	TCT	2	6	2523500	2523505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30587	NC_020834	AGG	2	6	2523555	2523560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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30591	NC_020834	CAA	2	6	2523968	2523973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30592	NC_020834	GAC	2	6	2524029	2524034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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30594	NC_020834	TTC	2	6	2524117	2524122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30595	NC_020834	TCC	2	6	2524378	2524383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30596	NC_020834	AAC	2	6	2524500	2524505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30597	NC_020834	GCT	2	6	2524568	2524573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30598	NC_020834	CTT	2	6	2524593	2524598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30599	NC_020834	CTT	2	6	2524677	2524682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30600	NC_020834	CTG	2	6	2524736	2524741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30601	NC_020834	AGT	2	6	2524936	2524941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30602	NC_020834	GCC	2	6	2525050	2525055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30603	NC_020834	CTG	2	6	2525114	2525119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30604	NC_020834	ACG	2	6	2525292	2525297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30605	NC_020834	CGT	2	6	2525333	2525338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30606	NC_020834	TAT	2	6	2525350	2525355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30607	NC_020834	ATT	2	6	2525459	2525464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472337759
30608	NC_020834	TTG	2	6	2525552	2525557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472337759
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.