MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-USMARC-183

Total Repeats: 32182

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
32001	NC_020833	AAG	2	6	2644854	2644859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32002	NC_020833	ATT	2	6	2645134	2645139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335228
32003	NC_020833	TGG	2	6	2645150	2645155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335228
32004	NC_020833	TAT	2	6	2645189	2645194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335228
32005	NC_020833	CCA	2	6	2645249	2645254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335228
32006	NC_020833	ATG	2	6	2645406	2645411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335228
32007	NC_020833	GCG	2	6	2645490	2645495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335228
32008	NC_020833	GTG	2	6	2645554	2645559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335228
32009	NC_020833	TAA	2	6	2645738	2645743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335228
32010	NC_020833	AAG	2	6	2645815	2645820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335228
32011	NC_020833	CGC	2	6	2645831	2645836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335228
32012	NC_020833	TGC	2	6	2645840	2645845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335228
32013	NC_020833	ACA	2	6	2645849	2645854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335228
32014	NC_020833	AAG	2	6	2645905	2645910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335228
32015	NC_020833	ATG	2	6	2645944	2645949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335228
32016	NC_020833	GAG	2	6	2645985	2645990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472335228
32017	NC_020833	TCA	2	6	2646250	2646255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32018	NC_020833	ACA	2	6	2646295	2646300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335229
32019	NC_020833	TGA	2	6	2646409	2646414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335229
32020	NC_020833	TGC	2	6	2646433	2646438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335229
32021	NC_020833	GCC	2	6	2646443	2646448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335229
32022	NC_020833	AAG	2	6	2646450	2646455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335229
32023	NC_020833	GAA	2	6	2646554	2646559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335229
32024	NC_020833	ACT	2	6	2646609	2646614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335229
32025	NC_020833	CAC	2	6	2646715	2646720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335229
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32028	NC_020833	GTC	2	6	2646890	2646895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335229
32029	NC_020833	GCC	2	6	2646998	2647003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335229
32030	NC_020833	TGC	2	6	2647084	2647089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335229
32031	NC_020833	GTA	2	6	2647097	2647102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335229
32032	NC_020833	ATC	2	6	2647112	2647117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335229
32033	NC_020833	AAC	2	6	2647236	2647241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335229
32034	NC_020833	AGG	2	6	2647321	2647326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472335229
32035	NC_020833	GGT	2	6	2647340	2647345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335229
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32037	NC_020833	TAT	2	6	2647384	2647389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335229
32038	NC_020833	TGA	2	6	2647471	2647476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335229
32039	NC_020833	GGT	2	6	2647699	2647704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335229
32040	NC_020833	TGA	2	6	2647717	2647722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335229
32041	NC_020833	TTC	2	6	2647734	2647739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32042	NC_020833	TAA	2	6	2647837	2647842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335230
32043	NC_020833	CAA	2	6	2648000	2648005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335231
32044	NC_020833	CCG	2	6	2648017	2648022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335231
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32046	NC_020833	TAT	2	6	2648062	2648067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335231
32047	NC_020833	GCT	2	6	2648135	2648140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335231
32048	NC_020833	GCA	2	6	2648174	2648179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335231
32049	NC_020833	CAC	2	6	2648238	2648243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335231
32050	NC_020833	AGC	2	6	2648284	2648289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335231
32051	NC_020833	ATC	2	6	2648426	2648431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335231
32052	NC_020833	ACC	2	6	2648479	2648484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335231
32053	NC_020833	TCG	2	6	2648563	2648568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335231
32054	NC_020833	AAT	2	6	2648837	2648842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335232
32055	NC_020833	TGG	2	6	2648866	2648871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335232
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32057	NC_020833	CTT	2	6	2648890	2648895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335232
32058	NC_020833	CAC	2	6	2648903	2648908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335232
32059	NC_020833	CAA	2	6	2648914	2648919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335232
32060	NC_020833	GTC	2	6	2648953	2648958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335232
32061	NC_020833	GAA	2	6	2649030	2649035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335232
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32063	NC_020833	TTG	2	6	2649089	2649094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335232
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32065	NC_020833	CAG	2	6	2649194	2649199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335232
32066	NC_020833	ATA	2	6	2649207	2649212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335232
32067	NC_020833	TCA	3	9	2649219	2649227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335232
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32069	NC_020833	TCT	2	6	2649387	2649392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335232
32070	NC_020833	TCA	2	6	2649522	2649527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335232
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32086	NC_020833	TGT	2	6	2650925	2650930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335233
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32100	NC_020833	TGC	2	6	2651696	2651701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335234
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32103	NC_020833	AAT	2	6	2651827	2651832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335234
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32105	NC_020833	TTC	2	6	2652438	2652443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335235
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32109	NC_020833	CCA	2	6	2652728	2652733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335235
32110	NC_020833	TGC	2	6	2652765	2652770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335235
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32114	NC_020833	CTG	2	6	2653079	2653084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335235
32115	NC_020833	GAA	2	6	2653194	2653199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335235
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.