MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Microcoleus sp. PCC 7113 chromosome

Total Repeats: 87966

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019738	ATT	2	6	104	109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019738	GCG	2	6	115	120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_019738	AGA	2	6	282	287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019738	CCA	2	6	293	298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_019738	TAC	2	6	489	494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308378
6	NC_019738	GAT	2	6	570	575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308378
7	NC_019738	GCA	2	6	622	627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308378
8	NC_019738	CCG	2	6	654	659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428308378
9	NC_019738	TGT	2	6	701	706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308378
10	NC_019738	TAA	2	6	713	718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308378
11	NC_019738	GCG	2	6	912	917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428308378
12	NC_019738	GAT	2	6	981	986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308378
13	NC_019738	AAG	2	6	1018	1023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308378
14	NC_019738	TCC	2	6	1088	1093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308378
15	NC_019738	TGG	2	6	1559	1564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308378
16	NC_019738	TAC	2	6	1574	1579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308378
17	NC_019738	TGA	2	6	2058	2063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308379
18	NC_019738	ATT	2	6	2106	2111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308379
19	NC_019738	TTA	2	6	2245	2250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308380
20	NC_019738	GCG	2	6	2323	2328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428308380
21	NC_019738	GCA	2	6	2661	2666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308380
22	NC_019738	AGA	2	6	2775	2780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308380
23	NC_019738	ATT	2	6	2932	2937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308380
24	NC_019738	ATC	2	6	2996	3001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308380
25	NC_019738	TGT	2	6	3102	3107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308380
26	NC_019738	GAT	2	6	3339	3344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308380
27	NC_019738	TAG	2	6	3461	3466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019738	GAT	2	6	3584	3589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308381
29	NC_019738	AAC	2	6	3756	3761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308381
30	NC_019738	CTG	2	6	3846	3851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308381
31	NC_019738	GAA	2	6	3887	3892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308381
32	NC_019738	TAA	2	6	3918	3923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308381
33	NC_019738	AAC	2	6	3960	3965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308381
34	NC_019738	CAA	2	6	3968	3973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308381
35	NC_019738	AAG	2	6	4014	4019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308381
36	NC_019738	AAC	2	6	4086	4091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308381
37	NC_019738	TGT	2	6	4119	4124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308381
38	NC_019738	CCT	2	6	4143	4148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308381
39	NC_019738	GAG	2	6	4239	4244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428308381
40	NC_019738	CAA	2	6	4367	4372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308381
41	NC_019738	TGG	2	6	4451	4456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308381
42	NC_019738	ATC	2	6	4489	4494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308381
43	NC_019738	GCC	2	6	4500	4505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428308381
44	NC_019738	TGA	2	6	4567	4572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308381
45	NC_019738	ACA	2	6	4638	4643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308381
46	NC_019738	TGA	2	6	4780	4785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308381
47	NC_019738	ACC	2	6	4824	4829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308381
48	NC_019738	TTC	2	6	4839	4844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308381
49	NC_019738	AGG	2	6	4864	4869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428308381
50	NC_019738	AAC	2	6	4931	4936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308381
51	NC_019738	TCG	2	6	4964	4969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308381
52	NC_019738	TCT	2	6	4988	4993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308381
53	NC_019738	ATC	2	6	5042	5047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308381
54	NC_019738	GTA	2	6	5198	5203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308381
55	NC_019738	TTG	2	6	5246	5251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308381
56	NC_019738	TGC	2	6	6049	6054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308383
57	NC_019738	TAT	3	9	6109	6117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308383
58	NC_019738	TCT	2	6	6344	6349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308383
59	NC_019738	TGG	2	6	6400	6405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308383
60	NC_019738	TAC	2	6	6477	6482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308383
61	NC_019738	TTC	2	6	6501	6506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308383
62	NC_019738	TTA	2	6	6576	6581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308383
63	NC_019738	TGG	2	6	6652	6657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308383
64	NC_019738	ATG	2	6	6669	6674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308383
65	NC_019738	CTT	2	6	6781	6786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308383
66	NC_019738	CTG	2	6	6813	6818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308383
67	NC_019738	GGA	2	6	6891	6896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019738	ATT	2	6	7050	7055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019738	TAG	2	6	7115	7120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019738	TGA	2	6	7123	7128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019738	TGA	2	6	7234	7239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019738	CAC	2	6	7354	7359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308384
73	NC_019738	CTG	3	9	7395	7403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308384
74	NC_019738	TCG	2	6	7446	7451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308384
75	NC_019738	GGC	2	6	7503	7508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428308384
76	NC_019738	ATC	2	6	7542	7547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308384
77	NC_019738	GAA	2	6	7548	7553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308384
78	NC_019738	CCT	2	6	7622	7627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308384
79	NC_019738	GAT	2	6	7686	7691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308384
80	NC_019738	GGC	2	6	7733	7738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428308384
81	NC_019738	ACA	2	6	7880	7885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308384
82	NC_019738	CAA	2	6	7920	7925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308384
83	NC_019738	AAC	2	6	7960	7965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308384
84	NC_019738	AGC	2	6	7973	7978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308384
85	NC_019738	AGG	2	6	8114	8119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428308384
86	NC_019738	ACG	2	6	8292	8297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308384
87	NC_019738	GTG	2	6	8400	8405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308384
88	NC_019738	GTC	2	6	8505	8510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308384
89	NC_019738	GCA	2	6	8560	8565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308384
90	NC_019738	AGC	2	6	8698	8703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308384
91	NC_019738	TTG	2	6	8837	8842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308385
92	NC_019738	GGA	2	6	8911	8916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428308385
93	NC_019738	GGA	2	6	8932	8937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428308385
94	NC_019738	GTG	2	6	8960	8965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308385
95	NC_019738	TTG	2	6	9096	9101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308385
96	NC_019738	TGA	2	6	9202	9207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308385
97	NC_019738	GCA	2	6	9245	9250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308385
98	NC_019738	AAG	3	9	9273	9281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308385
99	NC_019738	TGG	2	6	9376	9381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308385
100	NC_019738	GAG	3	9	9390	9398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428308385
101	NC_019738	TCG	2	6	9550	9555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308385
102	NC_019738	AAC	2	6	9600	9605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308385
103	NC_019738	GTC	2	6	9683	9688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308385
104	NC_019738	ACA	2	6	9806	9811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308385
105	NC_019738	AGC	2	6	9835	9840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308385
106	NC_019738	ATT	2	6	9884	9889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308385
107	NC_019738	ATT	2	6	9923	9928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308385
108	NC_019738	GTC	2	6	9998	10003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308385
109	NC_019738	AGG	2	6	10122	10127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428308385
110	NC_019738	ACT	2	6	10154	10159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308385
111	NC_019738	TGG	2	6	10192	10197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308385
112	NC_019738	CTT	2	6	10198	10203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308385
113	NC_019738	GCT	2	6	10207	10212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308385
114	NC_019738	CGC	2	6	10249	10254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428308385
115	NC_019738	TTA	2	6	10259	10264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308385
116	NC_019738	CCT	2	6	10300	10305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308385
117	NC_019738	GGC	2	6	10372	10377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428308385
118	NC_019738	GCG	2	6	10458	10463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428308385
119	NC_019738	TCC	2	6	10546	10551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308385
120	NC_019738	CAA	2	6	10566	10571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308385
121	NC_019738	TGA	2	6	10581	10586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308385
122	NC_019738	GTG	2	6	10589	10594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308385
123	NC_019738	ACA	2	6	10609	10614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308385
124	NC_019738	ACC	2	6	10637	10642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308385
125	NC_019738	GGT	2	6	10646	10651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308385
126	NC_019738	GCA	2	6	10662	10667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308385
127	NC_019738	TTG	2	6	10737	10742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308385
128	NC_019738	CAA	2	6	10895	10900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308385
129	NC_019738	GAC	2	6	10905	10910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308385
130	NC_019738	ATC	2	6	11513	11518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308385
131	NC_019738	TTG	2	6	11609	11614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308385
132	NC_019738	GTC	2	6	11624	11629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308385
133	NC_019738	CAT	3	9	11638	11646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308385
134	NC_019738	ATG	2	6	11738	11743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308385
135	NC_019738	ACG	2	6	11753	11758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308385
136	NC_019738	GTT	2	6	11825	11830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308385
137	NC_019738	ATC	2	6	11873	11878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308385
138	NC_019738	TGC	3	9	11892	11900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308385
139	NC_019738	AAG	2	6	11918	11923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308385
140	NC_019738	GCG	2	6	11935	11940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428308385
141	NC_019738	TCC	2	6	12311	12316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308386
142	NC_019738	CAA	2	6	12325	12330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308386
143	NC_019738	CTG	2	6	12404	12409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308386
144	NC_019738	CCT	2	6	12413	12418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308386
145	NC_019738	GGT	2	6	12475	12480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308386
146	NC_019738	CTG	2	6	12577	12582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308386
147	NC_019738	CAA	2	6	12774	12779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308386
148	NC_019738	TGC	2	6	12810	12815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308386
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152	NC_019738	GGT	2	6	13114	13119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308386
153	NC_019738	AGA	2	6	13349	13354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
154	NC_019738	GTT	2	6	13409	13414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
155	NC_019738	CTT	2	6	13418	13423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_019738	ACT	2	6	13496	13501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_019738	TAT	2	6	13564	13569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308387
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159	NC_019738	ACA	2	6	13695	13700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308387
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162	NC_019738	CTA	2	6	13894	13899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_019738	ATC	2	6	13955	13960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308388
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166	NC_019738	TGA	2	6	14268	14273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308388
167	NC_019738	TCC	2	6	14277	14282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308388
168	NC_019738	GTA	2	6	14315	14320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308388
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170	NC_019738	CTT	2	6	14364	14369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
171	NC_019738	GCA	2	6	14498	14503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
172	NC_019738	TGA	2	6	14549	14554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
173	NC_019738	ACA	2	6	14581	14586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
174	NC_019738	ATT	2	6	14659	14664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_019738	CTC	2	6	14775	14780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
176	NC_019738	CGG	2	6	14823	14828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
177	NC_019738	TAA	2	6	14938	14943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_019738	GCA	2	6	14955	14960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308389
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182	NC_019738	TAC	2	6	15368	15373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308389
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184	NC_019738	ATT	2	6	15440	15445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308389
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209	NC_019738	TGC	2	6	17742	17747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308390
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219	NC_019738	TGG	2	6	18746	18751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
220	NC_019738	ATT	2	6	19114	19119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308391
221	NC_019738	AGG	2	6	19228	19233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
222	NC_019738	TAG	2	6	19258	19263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308392
223	NC_019738	GAA	2	6	19326	19331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308392
224	NC_019738	GCT	2	6	19332	19337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308392
225	NC_019738	TGT	2	6	19342	19347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308392
226	NC_019738	AGT	2	6	19650	19655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308392
227	NC_019738	TCA	2	6	19664	19669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308392
228	NC_019738	AGC	2	6	19730	19735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308392
229	NC_019738	CAT	2	6	19768	19773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
230	NC_019738	TTC	2	6	19929	19934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308393
231	NC_019738	CTC	2	6	20107	20112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308393
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233	NC_019738	CTC	2	6	20368	20373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308393
234	NC_019738	TCT	2	6	20445	20450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308393
235	NC_019738	TAC	2	6	20522	20527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308393
236	NC_019738	ATT	2	6	20597	20602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
237	NC_019738	ACA	2	6	20614	20619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
238	NC_019738	ATT	2	6	20631	20636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
239	NC_019738	TCG	2	6	20841	20846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308394
240	NC_019738	GTC	2	6	21072	21077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308394
241	NC_019738	TCG	2	6	21205	21210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308394
242	NC_019738	CCA	2	6	21464	21469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308394
243	NC_019738	TCC	2	6	21484	21489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308394
244	NC_019738	TCC	2	6	21493	21498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308394
245	NC_019738	AAC	2	6	21544	21549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308394
246	NC_019738	ACC	2	6	21712	21717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308394
247	NC_019738	GCA	2	6	21722	21727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308394
248	NC_019738	CCG	2	6	21845	21850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428308394
249	NC_019738	GTC	2	6	21949	21954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308394
250	NC_019738	AAC	2	6	21976	21981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308394
251	NC_019738	GAA	2	6	22015	22020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308394
252	NC_019738	GGT	2	6	22021	22026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308394
253	NC_019738	CTC	2	6	22140	22145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
254	NC_019738	GCA	2	6	22326	22331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308395
255	NC_019738	ATC	2	6	22350	22355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308395
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257	NC_019738	AGA	2	6	22486	22491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308395
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