MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Microcoleus sp. PCC 7113 chromosome

Total Repeats: 87966

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_019738	AGA	2	6	87790	87795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_019738	CCG	2	6	87798	87803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1003	NC_019738	GTT	2	6	87868	87873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_019738	TTG	2	6	88120	88125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_019738	TGC	2	6	88234	88239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_019738	TCA	2	6	88397	88402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_019738	AGA	2	6	88493	88498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_019738	TAT	2	6	88621	88626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_019738	GAT	2	6	88628	88633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308453
1010	NC_019738	TTG	2	6	88728	88733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308453
1011	NC_019738	ATG	2	6	88741	88746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308453
1012	NC_019738	AGG	2	6	88811	88816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428308453
1013	NC_019738	ACT	2	6	88831	88836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308453
1014	NC_019738	ATG	2	6	88894	88899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308453
1015	NC_019738	AAT	2	6	88962	88967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308453
1016	NC_019738	AGG	2	6	89117	89122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428308453
1017	NC_019738	CCT	2	6	89491	89496	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1018	NC_019738	ACG	2	6	89578	89583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308454
1019	NC_019738	TTG	2	6	89682	89687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308454
1020	NC_019738	TCT	2	6	89701	89706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308454
1021	NC_019738	TGA	2	6	90148	90153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308454
1022	NC_019738	TGA	2	6	90207	90212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308454
1023	NC_019738	CTG	2	6	90219	90224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308454
1024	NC_019738	AAT	2	6	90235	90240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308454
1025	NC_019738	CTG	2	6	90482	90487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_019738	TAT	2	6	90503	90508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_019738	CAG	2	6	90621	90626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_019738	AAT	2	6	90632	90637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_019738	ATT	2	6	90654	90659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_019738	CTT	2	6	90854	90859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308455
1031	NC_019738	TCA	2	6	90865	90870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308455
1032	NC_019738	CTA	2	6	90931	90936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308455
1033	NC_019738	GTC	2	6	90976	90981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308455
1034	NC_019738	CTA	2	6	91175	91180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308455
1035	NC_019738	CTT	3	9	91256	91264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308455
1036	NC_019738	CAA	2	6	91265	91270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308455
1037	NC_019738	TCG	2	6	91382	91387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308455
1038	NC_019738	TTC	2	6	91389	91394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308455
1039	NC_019738	GTT	2	6	91408	91413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308455
1040	NC_019738	CAA	2	6	91613	91618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308455
1041	NC_019738	AAT	2	6	91704	91709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_019738	CAA	2	6	91720	91725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_019738	CTG	2	6	91726	91731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_019738	GCA	2	6	91820	91825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_019738	CTG	2	6	91958	91963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_019738	CCG	2	6	92161	92166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428308456
1047	NC_019738	AGC	2	6	92418	92423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308456
1048	NC_019738	TAT	2	6	92563	92568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308457
1049	NC_019738	CGC	2	6	92623	92628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428308457
1050	NC_019738	GTA	2	6	92709	92714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308457
1051	NC_019738	ATT	2	6	92720	92725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308457
1052	NC_019738	AGA	2	6	92752	92757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308457
1053	NC_019738	CAG	2	6	92772	92777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308457
1054	NC_019738	GTC	2	6	92780	92785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308457
1055	NC_019738	CAA	2	6	92858	92863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308457
1056	NC_019738	TGA	2	6	93058	93063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308457
1057	NC_019738	TGA	2	6	93102	93107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308457
1058	NC_019738	GCA	3	9	93149	93157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308457
1059	NC_019738	AGC	2	6	93490	93495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308457
1060	NC_019738	GGA	2	6	93583	93588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428308457
1061	NC_019738	GGA	2	6	93593	93598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428308457
1062	NC_019738	TGT	2	6	93636	93641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308457
1063	NC_019738	ACA	2	6	93709	93714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308457
1064	NC_019738	TTG	2	6	93785	93790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308457
1065	NC_019738	GTG	2	6	93836	93841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308457
1066	NC_019738	TCC	2	6	93924	93929	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308457
1067	NC_019738	CAT	2	6	93965	93970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308457
1068	NC_019738	GAC	2	6	94057	94062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_019738	ACC	2	6	94250	94255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308458
1070	NC_019738	GAT	2	6	94353	94358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308458
1071	NC_019738	GAA	2	6	94464	94469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308458
1072	NC_019738	GAG	2	6	94477	94482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428308458
1073	NC_019738	GAG	2	6	94555	94560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428308458
1074	NC_019738	CTC	2	6	94573	94578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308458
1075	NC_019738	GGC	2	6	94587	94592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428308458
1076	NC_019738	GCG	2	6	94664	94669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428308458
1077	NC_019738	GAC	2	6	94859	94864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308459
1078	NC_019738	AGC	2	6	94916	94921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308459
1079	NC_019738	GAT	2	6	94925	94930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308459
1080	NC_019738	CTA	2	6	94936	94941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308459
1081	NC_019738	CAA	3	9	94963	94971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308459
1082	NC_019738	AAT	2	6	95135	95140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308459
1083	NC_019738	CTC	2	6	95167	95172	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1084	NC_019738	GAT	2	6	95276	95281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_019738	AAG	2	6	95302	95307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_019738	CAT	2	6	95346	95351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_019738	GGA	2	6	95380	95385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_019738	TCT	2	6	95432	95437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_019738	ATA	2	6	95504	95509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_019738	AAT	2	6	95510	95515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_019738	CAA	2	6	95536	95541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_019738	ATA	2	6	95587	95592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_019738	GGC	2	6	95627	95632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_019738	AAT	2	6	95713	95718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_019738	AAT	2	6	95720	95725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_019738	CTT	2	6	95750	95755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308460
1097	NC_019738	TGG	2	6	95909	95914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308460
1098	NC_019738	GAT	2	6	95920	95925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308460
1099	NC_019738	AGC	2	6	95946	95951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308460
1100	NC_019738	ATA	2	6	95975	95980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308460
1101	NC_019738	TAA	2	6	96054	96059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_019738	ATG	2	6	96161	96166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_019738	ATT	2	6	96233	96238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_019738	ATT	2	6	96250	96255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_019738	TAA	2	6	96321	96326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_019738	TAA	2	6	96335	96340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_019738	CAG	2	6	96370	96375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_019738	TCG	2	6	96399	96404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308461
1109	NC_019738	ATG	2	6	96630	96635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308461
1110	NC_019738	ACA	2	6	96663	96668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308461
1111	NC_019738	GGC	2	6	96713	96718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428308461
1112	NC_019738	CAA	2	6	96950	96955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308461
1113	NC_019738	TCC	2	6	96967	96972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308461
1114	NC_019738	CAG	2	6	97015	97020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308461
1115	NC_019738	TGC	2	6	97152	97157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308461
1116	NC_019738	CAG	2	6	97217	97222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308461
1117	NC_019738	CAC	2	6	97504	97509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308461
1118	NC_019738	TGC	2	6	97638	97643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308461
1119	NC_019738	TGG	2	6	97676	97681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308461
1120	NC_019738	CTG	2	6	97836	97841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308461
1121	NC_019738	TAG	2	6	97875	97880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308461
1122	NC_019738	GTC	2	6	98178	98183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308461
1123	NC_019738	TGG	2	6	98281	98286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308461
1124	NC_019738	TGG	2	6	98318	98323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308461
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1126	NC_019738	GAT	2	6	98522	98527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308461
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1487	NC_019738	TTC	2	6	129349	129354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308483
1488	NC_019738	GGC	2	6	129404	129409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428308483
1489	NC_019738	GCT	2	6	129515	129520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308483
1490	NC_019738	TGA	2	6	129523	129528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308483
1491	NC_019738	TTC	2	6	129579	129584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308483
1492	NC_019738	GGT	2	6	129675	129680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308483
1493	NC_019738	TGC	2	6	129730	129735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308483
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