MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Methanoplanus petrolearius DSM 11571 chromosome

Total Repeats: 2103

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014507	TTTTG	2	10	382	391	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014507	GAGGG	2	10	441	450	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014507	AGATC	2	10	614	623	40 %	20 %	20 %	20 %	307352169
4	NC_014507	GAAAC	2	10	658	667	60 %	0 %	20 %	20 %	307352169
5	NC_014507	TGCAG	2	10	3112	3121	20 %	20 %	40 %	20 %	307352171
6	NC_014507	CCTGC	2	10	3279	3288	0 %	20 %	20 %	60 %	307352171
7	NC_014507	TTATA	2	10	6696	6705	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014507	TCGAT	2	10	7693	7702	20 %	40 %	20 %	20 %	307352174
9	NC_014507	ATTTT	2	10	8056	8065	20 %	80 %	0 %	0 %	307352174
10	NC_014507	ATAAG	2	10	9860	9869	60 %	20 %	20 %	0 %	307352175
11	NC_014507	ATATT	2	10	11708	11717	40 %	60 %	0 %	0 %	307352179
12	NC_014507	GAAGA	2	10	13879	13888	60 %	0 %	40 %	0 %	307352181
13	NC_014507	AATTC	2	10	16200	16209	40 %	40 %	0 %	20 %	307352183
14	NC_014507	GGATT	2	10	18037	18046	20 %	40 %	40 %	0 %	307352185
15	NC_014507	GATTT	2	10	18829	18838	20 %	60 %	20 %	0 %	307352186
16	NC_014507	TCATC	2	10	18881	18890	20 %	40 %	0 %	40 %	307352186
17	NC_014507	TTTTA	2	10	20966	20975	20 %	80 %	0 %	0 %	307352187
18	NC_014507	GGGGA	2	10	24961	24970	20 %	0 %	80 %	0 %	307352191
19	NC_014507	GGGAC	2	10	25043	25052	20 %	0 %	60 %	20 %	307352191
20	NC_014507	GGACC	2	10	25359	25368	20 %	0 %	40 %	40 %	307352191
21	NC_014507	CGAAC	2	10	27257	27266	40 %	0 %	20 %	40 %	307352192
22	NC_014507	TATTG	2	10	29090	29099	20 %	60 %	20 %	0 %	307352192
23	NC_014507	AAAGG	2	10	29828	29837	60 %	0 %	40 %	0 %	307352192
24	NC_014507	TCGAT	2	10	30115	30124	20 %	40 %	20 %	20 %	307352192
25	NC_014507	ATTTT	2	10	30743	30752	20 %	80 %	0 %	0 %	307352192
26	NC_014507	CAACA	2	10	34898	34907	60 %	0 %	0 %	40 %	307352195
27	NC_014507	ACCGG	2	10	35227	35236	20 %	0 %	40 %	40 %	307352195
28	NC_014507	GTATC	2	10	35333	35342	20 %	40 %	20 %	20 %	307352195
29	NC_014507	AAGAT	2	10	35741	35750	60 %	20 %	20 %	0 %	307352195
30	NC_014507	GGACA	2	10	35995	36004	40 %	0 %	40 %	20 %	307352195
31	NC_014507	CCCCT	2	10	36140	36149	0 %	20 %	0 %	80 %	307352195
32	NC_014507	AAGGC	2	10	36710	36719	40 %	0 %	40 %	20 %	307352195
33	NC_014507	TGGAC	2	10	36854	36863	20 %	20 %	40 %	20 %	307352195
34	NC_014507	GACCT	2	10	38902	38911	20 %	20 %	20 %	40 %	307352195
35	NC_014507	CGGCA	2	10	39948	39957	20 %	0 %	40 %	40 %	307352195
36	NC_014507	CGGAG	2	10	41098	41107	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
37	NC_014507	AGGGT	2	10	42202	42211	20 %	20 %	60 %	0 %	307352196
38	NC_014507	GGGCA	2	10	44926	44935	20 %	0 %	60 %	20 %	307352200
39	NC_014507	TTGTA	2	10	45316	45325	20 %	60 %	20 %	0 %	307352200
40	NC_014507	AGGGA	2	10	46980	46989	40 %	0 %	60 %	0 %	307352201
41	NC_014507	CTTTT	2	10	47378	47387	0 %	80 %	0 %	20 %	307352201
42	NC_014507	CCGAT	2	10	47977	47986	20 %	20 %	20 %	40 %	307352201
43	NC_014507	TGTAG	2	10	51081	51090	20 %	40 %	40 %	0 %	307352205
44	NC_014507	GTCTG	2	10	51124	51133	0 %	40 %	40 %	20 %	307352205
45	NC_014507	ATATT	2	10	52240	52249	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014507	TAAAA	2	10	52910	52919	80 %	20 %	0 %	0 %	307352208
47	NC_014507	GAAGT	2	10	53652	53661	40 %	20 %	40 %	0 %	307352209
48	NC_014507	CTTCT	2	10	53759	53768	0 %	60 %	0 %	40 %	307352209
49	NC_014507	TGAAG	2	10	56861	56870	40 %	20 %	40 %	0 %	307352211
50	NC_014507	TCCTT	2	10	58170	58179	0 %	60 %	0 %	40 %	307352214
51	NC_014507	CTTCT	2	10	58391	58400	0 %	60 %	0 %	40 %	307352214
52	NC_014507	CCGGC	2	10	66526	66535	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
53	NC_014507	CCCGG	2	10	66631	66640	0 %	0 %	40 %	60 %	307352226
54	NC_014507	TTTTC	2	10	68092	68101	0 %	80 %	0 %	20 %	307352227
55	NC_014507	TCACC	2	10	69345	69354	20 %	20 %	0 %	60 %	307352229
56	NC_014507	GATGA	2	10	70727	70736	40 %	20 %	40 %	0 %	307352229
57	NC_014507	GATAC	2	10	72086	72095	40 %	20 %	20 %	20 %	307352229
58	NC_014507	CCTGA	2	10	77027	77036	20 %	20 %	20 %	40 %	307352234
59	NC_014507	GTCCC	2	10	77999	78008	0 %	20 %	20 %	60 %	307352236
60	NC_014507	TATTT	2	10	79067	79076	20 %	80 %	0 %	0 %	307352237
61	NC_014507	TCCGA	2	10	79289	79298	20 %	20 %	20 %	40 %	307352237
62	NC_014507	TCGGT	2	10	80924	80933	0 %	40 %	40 %	20 %	307352238
63	NC_014507	GTGGA	2	10	84823	84832	20 %	20 %	60 %	0 %	307352242
64	NC_014507	ACCAG	2	10	85345	85354	40 %	0 %	20 %	40 %	307352243
65	NC_014507	ATTAT	2	10	89975	89984	40 %	60 %	0 %	0 %	307352246
66	NC_014507	GATCC	2	10	90608	90617	20 %	20 %	20 %	40 %	307352246
67	NC_014507	CCCTT	2	10	91123	91132	0 %	40 %	0 %	60 %	307352246
68	NC_014507	GTTCC	2	10	92151	92160	0 %	40 %	20 %	40 %	307352247
69	NC_014507	GAAGA	2	10	94911	94920	60 %	0 %	40 %	0 %	307352249
70	NC_014507	AGGAA	2	10	95969	95978	60 %	0 %	40 %	0 %	307352250
71	NC_014507	CGAAA	2	10	96124	96133	60 %	0 %	20 %	20 %	307352250
72	NC_014507	AGATG	2	10	97548	97557	40 %	20 %	40 %	0 %	307352251
73	NC_014507	TCGTT	2	10	97986	97995	0 %	60 %	20 %	20 %	307352251
74	NC_014507	TTTAT	2	10	98631	98640	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014507	GTACG	2	10	98937	98946	20 %	20 %	40 %	20 %	307352252
76	NC_014507	CTGGC	2	10	99731	99740	0 %	20 %	40 %	40 %	307352252
77	NC_014507	GGACG	2	10	102491	102500	20 %	0 %	60 %	20 %	307352253
78	NC_014507	AGGCA	2	10	102858	102867	40 %	0 %	40 %	20 %	307352254
79	NC_014507	AATTA	2	10	103646	103655	60 %	40 %	0 %	0 %	307352256
80	NC_014507	TCTGC	2	10	107684	107693	0 %	40 %	20 %	40 %	307352262
81	NC_014507	GCAGG	2	10	108177	108186	20 %	0 %	60 %	20 %	307352263
82	NC_014507	CGAGG	2	10	109625	109634	20 %	0 %	60 %	20 %	307352265
83	NC_014507	TGACC	2	10	109739	109748	20 %	20 %	20 %	40 %	307352265
84	NC_014507	ATAGT	2	10	110189	110198	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014507	CCGTT	2	10	110663	110672	0 %	40 %	20 %	40 %	307352266
86	NC_014507	TGGTT	2	10	113681	113690	0 %	60 %	40 %	0 %	307352268
87	NC_014507	TATTT	2	10	113887	113896	20 %	80 %	0 %	0 %	307352268
88	NC_014507	ATTGA	2	10	115167	115176	40 %	40 %	20 %	0 %	307352270
89	NC_014507	CAAAA	2	10	115218	115227	80 %	0 %	0 %	20 %	307352270
90	NC_014507	TTTCT	2	10	115575	115584	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_014507	TGCGG	2	10	117878	117887	0 %	20 %	60 %	20 %	307352273
92	NC_014507	TCGGT	2	10	119525	119534	0 %	40 %	40 %	20 %	307352275
93	NC_014507	CCCTT	2	10	121511	121520	0 %	40 %	0 %	60 %	307352276
94	NC_014507	CTTCC	2	10	122494	122503	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
95	NC_014507	TGGAA	2	10	122610	122619	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014507	CATAC	2	10	123019	123028	40 %	20 %	0 %	40 %	307352277
97	NC_014507	ATGAT	2	10	125728	125737	40 %	40 %	20 %	0 %	307352281
98	NC_014507	TTCTT	2	10	129469	129478	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_014507	TGAAC	2	10	129969	129978	40 %	20 %	20 %	20 %	307352285
100	NC_014507	TCTCC	2	10	131675	131684	0 %	40 %	0 %	60 %	307352287
101	NC_014507	TTCCG	2	10	132626	132635	0 %	40 %	20 %	40 %	307352288
102	NC_014507	GGTCA	2	10	133664	133673	20 %	20 %	40 %	20 %	307352288
103	NC_014507	TAAAG	2	10	134038	134047	60 %	20 %	20 %	0 %	307352288
104	NC_014507	CTTTC	2	10	135504	135513	0 %	60 %	0 %	40 %	307352289
105	NC_014507	AGGAG	2	10	135581	135590	40 %	0 %	60 %	0 %	307352289
106	NC_014507	GCCAG	2	10	137112	137121	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
107	NC_014507	CTGGT	2	10	138984	138993	0 %	40 %	40 %	20 %	307352291
108	NC_014507	TGTCA	2	10	139321	139330	20 %	40 %	20 %	20 %	307352291
109	NC_014507	TCGTA	2	10	139912	139921	20 %	40 %	20 %	20 %	307352292
110	NC_014507	CCGCA	2	10	140023	140032	20 %	0 %	20 %	60 %	307352292
111	NC_014507	GGGGC	2	10	143828	143837	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
112	NC_014507	AGGAA	2	10	143945	143954	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014507	TCCTG	2	10	144048	144057	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
114	NC_014507	TCGGG	2	10	144306	144315	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
115	NC_014507	GGCCT	2	10	149137	149146	0 %	20 %	40 %	40 %	307352299
116	NC_014507	TGCTC	2	10	153895	153904	0 %	40 %	20 %	40 %	307352301
117	NC_014507	CCCCG	2	10	155340	155349	0 %	0 %	20 %	80 %	307352302
118	NC_014507	AAGGC	2	10	155524	155533	40 %	0 %	40 %	20 %	307352302
119	NC_014507	CGGTG	2	10	156075	156084	0 %	20 %	60 %	20 %	307352303
120	NC_014507	CCTGC	2	10	156467	156476	0 %	20 %	20 %	60 %	307352304
121	NC_014507	ATCGC	2	10	160177	160186	20 %	20 %	20 %	40 %	307352308
122	NC_014507	GGGAT	2	10	161083	161092	20 %	20 %	60 %	0 %	307352308
123	NC_014507	CCGTG	2	10	161957	161966	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
124	NC_014507	TTGAT	2	10	162013	162022	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014507	GGAGA	2	10	163604	163613	40 %	0 %	60 %	0 %	307352311
126	NC_014507	TTCGA	2	10	163805	163814	20 %	40 %	20 %	20 %	307352311
127	NC_014507	TTATT	2	10	165830	165839	20 %	80 %	0 %	0 %	307352315
128	NC_014507	TCATC	2	10	166081	166090	20 %	40 %	0 %	40 %	307352316
129	NC_014507	CTCTT	2	10	166680	166689	0 %	60 %	0 %	40 %	307352316
130	NC_014507	TGAAA	2	10	170032	170041	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014507	GAAGG	2	10	172404	172413	40 %	0 %	60 %	0 %	307352323
132	NC_014507	ATTAT	2	10	173312	173321	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014507	AGGGA	2	10	175444	175453	40 %	0 %	60 %	0 %	307352327
134	NC_014507	CAGGA	2	10	175606	175615	40 %	0 %	40 %	20 %	307352327
135	NC_014507	GATAC	2	10	175684	175693	40 %	20 %	20 %	20 %	307352327
136	NC_014507	TCGAT	2	10	175790	175799	20 %	40 %	20 %	20 %	307352327
137	NC_014507	TGTCC	2	10	176547	176556	0 %	40 %	20 %	40 %	307352328
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270	NC_014507	ATCAG	2	10	353252	353261	40 %	20 %	20 %	20 %	307352506
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