MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Methanoplanus petrolearius DSM 11571 chromosome

Total Repeats: 2103

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_014507	ACTCA	2	10	2699355	2699364	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
2002	NC_014507	GAGAA	2	10	2700428	2700437	60 %	0 %	40 %	0 %	307354817
2003	NC_014507	TTATC	2	10	2701941	2701950	20 %	60 %	0 %	20 %	307354819
2004	NC_014507	AGGCC	2	10	2706367	2706376	20 %	0 %	40 %	40 %	307354823
2005	NC_014507	TCCTG	2	10	2706782	2706791	0 %	40 %	20 %	40 %	307354824
2006	NC_014507	AGAGA	2	10	2706903	2706912	60 %	0 %	40 %	0 %	307354824
2007	NC_014507	CGCCC	2	10	2707235	2707244	0 %	0 %	20 %	80 %	307354825
2008	NC_014507	GAAGA	2	10	2707659	2707668	60 %	0 %	40 %	0 %	307354826
2009	NC_014507	GTGGA	2	10	2710887	2710896	20 %	20 %	60 %	0 %	307354829
2010	NC_014507	CGAAG	2	10	2714928	2714937	40 %	0 %	40 %	20 %	307354833
2011	NC_014507	TGCCC	2	10	2716679	2716688	0 %	20 %	20 %	60 %	307354835
2012	NC_014507	CCTCG	2	10	2717581	2717590	0 %	20 %	20 %	60 %	307354836
2013	NC_014507	CTGTA	2	10	2717650	2717659	20 %	40 %	20 %	20 %	307354836
2014	NC_014507	TGCAA	2	10	2717756	2717765	40 %	20 %	20 %	20 %	307354836
2015	NC_014507	CCCGC	2	10	2721110	2721119	0 %	0 %	20 %	80 %	307354839
2016	NC_014507	ATATT	2	10	2721608	2721617	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2017	NC_014507	AAATA	2	10	2721627	2721636	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2018	NC_014507	GTTCA	2	10	2722884	2722893	20 %	40 %	20 %	20 %	307354841
2019	NC_014507	TGATA	2	10	2722985	2722994	40 %	40 %	20 %	0 %	307354841
2020	NC_014507	TCCAA	2	10	2725185	2725194	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
2021	NC_014507	TGTCC	2	10	2726172	2726181	0 %	40 %	20 %	40 %	307354845
2022	NC_014507	AGAGA	2	10	2726268	2726277	60 %	0 %	40 %	0 %	307354845
2023	NC_014507	TGGCA	2	10	2730003	2730012	20 %	20 %	40 %	20 %	307354849
2024	NC_014507	ACGCT	2	10	2731413	2731422	20 %	20 %	20 %	40 %	307354851
2025	NC_014507	CTTCA	2	10	2731635	2731644	20 %	40 %	0 %	40 %	307354852
2026	NC_014507	CGGAA	2	10	2733312	2733321	40 %	0 %	40 %	20 %	307354855
2027	NC_014507	GTCTG	2	10	2734870	2734879	0 %	40 %	40 %	20 %	307354857
2028	NC_014507	AATGC	2	10	2735293	2735302	40 %	20 %	20 %	20 %	307354857
2029	NC_014507	GCCCT	2	10	2736762	2736771	0 %	20 %	20 %	60 %	307354858
2030	NC_014507	GGTCT	2	10	2738936	2738945	0 %	40 %	40 %	20 %	307354860
2031	NC_014507	GACTC	2	10	2739127	2739136	20 %	20 %	20 %	40 %	307354860
2032	NC_014507	CGATT	2	10	2741024	2741033	20 %	40 %	20 %	20 %	307354861
2033	NC_014507	ACAGC	2	10	2741191	2741200	40 %	0 %	20 %	40 %	307354861
2034	NC_014507	CAGGG	2	10	2741554	2741563	20 %	0 %	60 %	20 %	307354861
2035	NC_014507	AAACG	2	10	2742740	2742749	60 %	0 %	20 %	20 %	307354862
2036	NC_014507	GAAGA	2	10	2746684	2746693	60 %	0 %	40 %	0 %	307354865
2037	NC_014507	TGCCC	2	10	2750550	2750559	0 %	20 %	20 %	60 %	307354871
2038	NC_014507	AGATC	2	10	2751753	2751762	40 %	20 %	20 %	20 %	307354873
2039	NC_014507	AGATG	2	10	2751840	2751849	40 %	20 %	40 %	0 %	307354873
2040	NC_014507	TCCAG	2	10	2752864	2752873	20 %	20 %	20 %	40 %	307354874
2041	NC_014507	ATTAA	2	10	2754334	2754343	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2042	NC_014507	TCAGG	2	10	2754587	2754596	20 %	20 %	40 %	20 %	307354875
2043	NC_014507	ATCCA	2	10	2754963	2754972	40 %	20 %	0 %	40 %	307354876
2044	NC_014507	GAAAT	2	10	2755529	2755538	60 %	20 %	20 %	0 %	307354876
2045	NC_014507	TTCGA	2	10	2755550	2755559	20 %	40 %	20 %	20 %	307354876
2046	NC_014507	AGGAA	2	10	2757774	2757783	60 %	0 %	40 %	0 %	307354877
2047	NC_014507	GCCCC	2	10	2760139	2760148	0 %	0 %	20 %	80 %	307354879
2048	NC_014507	CCGGT	2	10	2760334	2760343	0 %	20 %	40 %	40 %	307354879
2049	NC_014507	GAGAA	2	10	2760573	2760582	60 %	0 %	40 %	0 %	307354879
2050	NC_014507	TATTT	2	10	2764141	2764150	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2051	NC_014507	TCCCC	2	10	2764937	2764946	0 %	20 %	0 %	80 %	307354882
2052	NC_014507	GGAGA	2	10	2765509	2765518	40 %	0 %	60 %	0 %	307354883
2053	NC_014507	GGGCA	2	10	2765616	2765625	20 %	0 %	60 %	20 %	307354883
2054	NC_014507	AGCAT	2	10	2767253	2767262	40 %	20 %	20 %	20 %	307354884
2055	NC_014507	ATTTC	2	10	2767669	2767678	20 %	60 %	0 %	20 %	307354885
2056	NC_014507	TTCAC	2	10	2767730	2767739	20 %	40 %	0 %	40 %	307354885
2057	NC_014507	AAGCG	2	10	2768340	2768349	40 %	0 %	40 %	20 %	307354885
2058	NC_014507	CTTTT	2	10	2769160	2769169	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2059	NC_014507	ATGTG	2	10	2769363	2769372	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
2060	NC_014507	TTTTC	2	10	2769434	2769443	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2061	NC_014507	GAAGA	2	10	2770018	2770027	60 %	0 %	40 %	0 %	307354886
2062	NC_014507	CCGAT	2	10	2770148	2770157	20 %	20 %	20 %	40 %	307354886
2063	NC_014507	CTTCT	2	10	2771480	2771489	0 %	60 %	0 %	40 %	307354886
2064	NC_014507	AGAGG	2	10	2772382	2772391	40 %	0 %	60 %	0 %	307354887
2065	NC_014507	GGGAC	2	10	2774307	2774316	20 %	0 %	60 %	20 %	307354889
2066	NC_014507	TTTTG	2	10	2780229	2780238	0 %	80 %	20 %	0 %	307354896
2067	NC_014507	CTTTC	2	10	2780305	2780314	0 %	60 %	0 %	40 %	307354896
2068	NC_014507	CTTCC	2	10	2781368	2781377	0 %	40 %	0 %	60 %	307354897
2069	NC_014507	TGCGG	2	10	2785303	2785312	0 %	20 %	60 %	20 %	307354900
2070	NC_014507	TTTGA	2	10	2786622	2786631	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2071	NC_014507	GGCCT	2	10	2788858	2788867	0 %	20 %	40 %	40 %	307354905
2072	NC_014507	AACGG	2	10	2789824	2789833	40 %	0 %	40 %	20 %	307354905
2073	NC_014507	CTCTC	2	10	2792581	2792590	0 %	40 %	0 %	60 %	307354907
2074	NC_014507	TTTCA	2	10	2793353	2793362	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2075	NC_014507	TCCGT	2	10	2794182	2794191	0 %	40 %	20 %	40 %	307354908
2076	NC_014507	AGACC	2	10	2794909	2794918	40 %	0 %	20 %	40 %	307354909
2077	NC_014507	AAGTA	2	10	2801367	2801376	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2078	NC_014507	CCTCG	2	10	2803749	2803758	0 %	20 %	20 %	60 %	307354919
2079	NC_014507	CTGGA	2	10	2803930	2803939	20 %	20 %	40 %	20 %	307354919
2080	NC_014507	GCGGA	2	10	2804324	2804333	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
2081	NC_014507	GAAGA	2	10	2806542	2806551	60 %	0 %	40 %	0 %	307354922
2082	NC_014507	GGAGA	2	10	2807970	2807979	40 %	0 %	60 %	0 %	307354924
2083	NC_014507	GATGC	2	10	2812618	2812627	20 %	20 %	40 %	20 %	307354928
2084	NC_014507	TTCCC	2	10	2813099	2813108	0 %	40 %	0 %	60 %	307354929
2085	NC_014507	AGGAG	2	10	2813321	2813330	40 %	0 %	60 %	0 %	307354929
2086	NC_014507	ACTGC	2	10	2817681	2817690	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2087	NC_014507	CCCGA	2	10	2818391	2818400	20 %	0 %	20 %	60 %	307354932
2088	NC_014507	CGTTC	2	10	2822222	2822231	0 %	40 %	20 %	40 %	307354934
2089	NC_014507	ACTGC	2	10	2824374	2824383	20 %	20 %	20 %	40 %	307354937
2090	NC_014507	TGTTT	2	10	2828112	2828121	0 %	80 %	20 %	0 %	307354940
2091	NC_014507	TTTTA	2	10	2829230	2829239	20 %	80 %	0 %	0 %	307354941
2092	NC_014507	ATTAT	2	10	2830114	2830123	40 %	60 %	0 %	0 %	307354942
2093	NC_014507	ACGTT	2	10	2831842	2831851	20 %	40 %	20 %	20 %	307354945
2094	NC_014507	TAAAA	2	10	2833748	2833757	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2095	NC_014507	ACCGC	2	10	2835935	2835944	20 %	0 %	20 %	60 %	307354947
2096	NC_014507	AAGGC	2	10	2836559	2836568	40 %	0 %	40 %	20 %	307354948
2097	NC_014507	ATCTT	2	10	2836604	2836613	20 %	60 %	0 %	20 %	307354948
2098	NC_014507	TCCAA	2	10	2836880	2836889	40 %	20 %	0 %	40 %	307354948
2099	NC_014507	TTATT	2	10	2838211	2838220	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2100	NC_014507	TTATA	2	10	2839340	2839349	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2101	NC_014507	GACGT	2	10	2841287	2841296	20 %	20 %	40 %	20 %	307354952
2102	NC_014507	TCTCT	2	10	2842712	2842721	0 %	60 %	0 %	40 %	307354953
2103	NC_014507	TGTTT	2	10	2843093	2843102	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.