MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 1435 chromosome

Total Repeats: 83327

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012943	CAA	2	6	37	42	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_012943	CGT	2	6	98	103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796916
3	NC_012943	CAC	2	6	129	134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253796916
4	NC_012943	GTC	2	6	148	153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796916
5	NC_012943	GAC	2	6	181	186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796916
6	NC_012943	CAG	2	6	192	197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796916
7	NC_012943	TCG	2	6	269	274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796916
8	NC_012943	AGC	2	6	301	306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796916
9	NC_012943	GCC	2	6	362	367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796916
10	NC_012943	CCG	2	6	406	411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796916
11	NC_012943	CGA	2	6	426	431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796916
12	NC_012943	GCC	2	6	441	446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796916
13	NC_012943	ACG	2	6	491	496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796916
14	NC_012943	TGA	2	6	501	506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253796916
15	NC_012943	CGC	3	9	663	671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796916
16	NC_012943	GTT	2	6	783	788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253796916
17	NC_012943	CGA	2	6	912	917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796916
18	NC_012943	TTC	2	6	958	963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253796916
19	NC_012943	CAA	2	6	990	995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253796916
20	NC_012943	AGC	2	6	1028	1033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796916
21	NC_012943	ACC	2	6	1095	1100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253796916
22	NC_012943	CGA	2	6	1164	1169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796916
23	NC_012943	CAG	2	6	1188	1193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796916
24	NC_012943	GCG	2	6	1339	1344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796916
25	NC_012943	CCG	2	6	1361	1366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796916
26	NC_012943	CAC	2	6	1593	1598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253796916
27	NC_012943	TTC	2	6	1636	1641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_012943	CGG	2	6	1745	1750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_012943	TCG	2	6	1903	1908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_012943	ACC	2	6	1950	1955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_012943	TCG	2	6	1968	1973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_012943	ATG	2	6	1991	1996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012943	GTT	3	9	2027	2035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012943	CTG	2	6	2039	2044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_012943	CGT	2	6	2052	2057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_012943	TCG	2	6	2081	2086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_012943	GTT	2	6	2288	2293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253796917
38	NC_012943	CCG	2	6	2344	2349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796917
39	NC_012943	TTG	2	6	2406	2411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253796917
40	NC_012943	CGA	2	6	2509	2514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796917
41	NC_012943	TTG	2	6	2565	2570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253796917
42	NC_012943	ATT	2	6	2579	2584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253796917
43	NC_012943	CGC	2	6	2612	2617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796917
44	NC_012943	GAC	2	6	2625	2630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796917
45	NC_012943	GGT	2	6	2678	2683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253796917
46	NC_012943	CGT	2	6	2737	2742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796917
47	NC_012943	GCC	2	6	2793	2798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796917
48	NC_012943	CGG	2	6	2810	2815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796917
49	NC_012943	GCA	2	6	2896	2901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796917
50	NC_012943	CTT	2	6	2910	2915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253796917
51	NC_012943	CCA	2	6	2971	2976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253796917
52	NC_012943	GAT	2	6	3090	3095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253796917
53	NC_012943	TTG	3	9	3118	3126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253796917
54	NC_012943	CGG	2	6	3307	3312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796917
55	NC_012943	TTG	2	6	3464	3469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253796918
56	NC_012943	CGA	2	6	3518	3523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796918
57	NC_012943	GTG	2	6	3601	3606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253796918
58	NC_012943	ACG	2	6	3608	3613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796918
59	NC_012943	CAA	2	6	3657	3662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253796918
60	NC_012943	ATC	2	6	3678	3683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253796918
61	NC_012943	TGT	2	6	3725	3730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253796918
62	NC_012943	CGG	2	6	3775	3780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796918
63	NC_012943	GAT	2	6	3790	3795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253796918
64	NC_012943	TGG	2	6	3971	3976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253796918
65	NC_012943	GAA	2	6	4017	4022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253796918
66	NC_012943	AGC	2	6	4131	4136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796918
67	NC_012943	GGC	2	6	4146	4151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796918
68	NC_012943	GGC	2	6	4155	4160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796918
69	NC_012943	GAC	2	6	4213	4218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796918
70	NC_012943	GGC	2	6	4302	4307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796918
71	NC_012943	TGG	2	6	4329	4334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253796918
72	NC_012943	GTT	2	6	4344	4349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253796918
73	NC_012943	CGA	2	6	4353	4358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796918
74	NC_012943	CGG	2	6	4403	4408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796918
75	NC_012943	CCG	2	6	4415	4420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796918
76	NC_012943	CCG	2	6	4460	4465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796918
77	NC_012943	GGT	2	6	4524	4529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253796918
78	NC_012943	TGC	3	9	4634	4642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796919
79	NC_012943	CGA	2	6	4713	4718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796919
80	NC_012943	GGT	2	6	4847	4852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253796919
81	NC_012943	CCA	2	6	4856	4861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253796919
82	NC_012943	ACG	2	6	4894	4899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796919
83	NC_012943	CGC	2	6	4979	4984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796919
84	NC_012943	CGG	2	6	5029	5034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796919
85	NC_012943	GAA	2	6	5193	5198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012943	AGA	2	6	5243	5248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253796920
87	NC_012943	GTG	2	6	5276	5281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253796920
88	NC_012943	GCG	2	6	5293	5298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796920
89	NC_012943	GAG	2	6	5324	5329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253796920
90	NC_012943	AAG	2	6	5357	5362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253796920
91	NC_012943	GGT	2	6	5485	5490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253796920
92	NC_012943	CGA	2	6	5503	5508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796920
93	NC_012943	TGC	2	6	5544	5549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796920
94	NC_012943	CGA	2	6	5575	5580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796920
95	NC_012943	GTG	2	6	5633	5638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253796920
96	NC_012943	CGG	2	6	5656	5661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796920
97	NC_012943	TGG	2	6	5692	5697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253796920
98	NC_012943	GGT	2	6	5719	5724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253796920
99	NC_012943	AAG	2	6	5834	5839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253796920
100	NC_012943	CAA	2	6	5941	5946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253796920
101	NC_012943	CGA	2	6	5968	5973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796920
102	NC_012943	GTC	2	6	5993	5998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796920
103	NC_012943	TGG	2	6	6111	6116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253796920
104	NC_012943	AGC	2	6	6158	6163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796920
105	NC_012943	GGC	2	6	6278	6283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796920
106	NC_012943	GGT	2	6	6319	6324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253796920
107	NC_012943	GCG	2	6	6622	6627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796920
108	NC_012943	ATC	2	6	6794	6799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253796920
109	NC_012943	ATC	2	6	6854	6859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253796920
110	NC_012943	ACG	2	6	6882	6887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796920
111	NC_012943	TGT	2	6	6969	6974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253796920
112	NC_012943	GTT	3	9	6979	6987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253796920
113	NC_012943	CCG	2	6	7037	7042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796920
114	NC_012943	CTG	2	6	7109	7114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796920
115	NC_012943	GAA	2	6	7135	7140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253796920
116	NC_012943	CAA	2	6	7144	7149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253796920
117	NC_012943	ACC	2	6	7211	7216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253796920
118	NC_012943	GAC	2	6	7256	7261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796920
119	NC_012943	GCC	4	12	7262	7273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796920
120	NC_012943	GTT	2	6	7279	7284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253796920
121	NC_012943	GCC	2	6	7421	7426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796921
122	NC_012943	GAC	2	6	7428	7433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796921
123	NC_012943	CAG	2	6	7464	7469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796921
124	NC_012943	TCG	2	6	7510	7515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796921
125	NC_012943	ACC	2	6	7654	7659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253796921
126	NC_012943	TGG	2	6	7729	7734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253796921
127	NC_012943	CGG	2	6	7774	7779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796921
128	NC_012943	CGA	2	6	7838	7843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796921
129	NC_012943	ACG	2	6	7870	7875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796921
130	NC_012943	CTG	2	6	7920	7925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796921
131	NC_012943	GGC	2	6	7938	7943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796921
132	NC_012943	CGC	2	6	7972	7977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796921
133	NC_012943	ACG	2	6	8026	8031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796921
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136	NC_012943	TCG	2	6	8104	8109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796921
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250	NC_012943	CAT	2	6	14706	14711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253796927
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254	NC_012943	GCT	2	6	14818	14823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796927
255	NC_012943	GAA	2	6	14890	14895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253796927
256	NC_012943	ACT	2	6	14972	14977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253796927
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382	NC_012943	TCA	2	6	22134	22139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253796933
383	NC_012943	ATG	2	6	22268	22273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253796933
384	NC_012943	GTA	2	6	22300	22305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253796933
385	NC_012943	TGC	2	6	22308	22313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796933
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402	NC_012943	GTC	2	6	23439	23444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796934
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497	NC_012943	CGA	2	6	28745	28750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796939
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500	NC_012943	CGA	2	6	28860	28865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796939

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