MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 1435 chromosome

Total Repeats: 83327

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_012943	GGC	2	6	272736	272741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797149
5002	NC_012943	GTG	2	6	272821	272826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_012943	TCG	2	6	272877	272882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_012943	CCT	2	6	272907	272912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5005	NC_012943	TCG	2	6	272927	272932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5006	NC_012943	CAG	2	6	272985	272990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5007	NC_012943	CGG	2	6	273003	273008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797150
5008	NC_012943	GGT	2	6	273076	273081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253797150
5009	NC_012943	CCG	2	6	273105	273110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797150
5010	NC_012943	CGT	2	6	273142	273147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797150
5011	NC_012943	TTC	2	6	273233	273238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253797150
5012	NC_012943	TTG	2	6	273254	273259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253797150
5013	NC_012943	CGC	2	6	273271	273276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797150
5014	NC_012943	GCG	2	6	273278	273283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797150
5015	NC_012943	TGG	2	6	273357	273362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253797150
5016	NC_012943	GGT	2	6	273364	273369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253797150
5017	NC_012943	CTG	2	6	273383	273388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797150
5018	NC_012943	GGC	2	6	273470	273475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797150
5019	NC_012943	GCG	2	6	273518	273523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797150
5020	NC_012943	GCC	2	6	273546	273551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797150
5021	NC_012943	GGC	2	6	273592	273597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797150
5022	NC_012943	GCC	2	6	273661	273666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797150
5023	NC_012943	TTC	2	6	273671	273676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253797150
5024	NC_012943	CGC	2	6	273685	273690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797150
5025	NC_012943	CGC	3	9	273749	273757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797150
5026	NC_012943	GCT	2	6	273778	273783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797150
5027	NC_012943	TGG	2	6	273792	273797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253797150
5028	NC_012943	CGG	2	6	273840	273845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797150
5029	NC_012943	TGG	2	6	273894	273899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253797150
5030	NC_012943	CGC	2	6	273900	273905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797150
5031	NC_012943	GCT	2	6	273937	273942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797150
5032	NC_012943	CGC	2	6	274102	274107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797150
5033	NC_012943	CGG	2	6	274297	274302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797151
5034	NC_012943	CGT	2	6	274321	274326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797151
5035	NC_012943	GAT	2	6	274441	274446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253797151
5036	NC_012943	CCA	2	6	274486	274491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253797151
5037	NC_012943	CGG	2	6	274603	274608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797151
5038	NC_012943	GCG	2	6	274685	274690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797152
5039	NC_012943	GCG	3	9	274706	274714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797152
5040	NC_012943	TCG	3	9	274773	274781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797152
5041	NC_012943	TCG	2	6	274817	274822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797152
5042	NC_012943	CGA	2	6	274827	274832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797152
5043	NC_012943	GCC	2	6	274933	274938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797153
5044	NC_012943	GCG	2	6	274954	274959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797153
5045	NC_012943	CGA	2	6	274968	274973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797153
5046	NC_012943	GCT	2	6	274986	274991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797153
5047	NC_012943	TGC	2	6	275006	275011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797153
5048	NC_012943	CGT	2	6	275028	275033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797153
5049	NC_012943	CTC	2	6	275080	275085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253797153
5050	NC_012943	AGC	2	6	275103	275108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797153
5051	NC_012943	CGT	2	6	275112	275117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797153
5052	NC_012943	CGG	2	6	275235	275240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797153
5053	NC_012943	CGC	2	6	275277	275282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797153
5054	NC_012943	ACC	2	6	275294	275299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253797153
5055	NC_012943	CTC	2	6	275317	275322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253797153
5056	NC_012943	TCG	2	6	275456	275461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797153
5057	NC_012943	CGT	2	6	275598	275603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797153
5058	NC_012943	ACG	2	6	275627	275632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797153
5059	NC_012943	CGA	2	6	275706	275711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797153
5060	NC_012943	CGC	2	6	275721	275726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797153
5061	NC_012943	TCG	2	6	275777	275782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797153
5062	NC_012943	GGT	2	6	275815	275820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253797153
5063	NC_012943	ATG	2	6	275822	275827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253797153
5064	NC_012943	TCG	2	6	275964	275969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5065	NC_012943	TGC	2	6	276000	276005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797154
5066	NC_012943	CTT	2	6	276076	276081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253797154
5067	NC_012943	ACG	2	6	276111	276116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797154
5068	NC_012943	TCG	2	6	276153	276158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797154
5069	NC_012943	CCT	2	6	276195	276200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253797154
5070	NC_012943	GAT	2	6	276209	276214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253797154
5071	NC_012943	GCC	2	6	276356	276361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797154
5072	NC_012943	CGG	2	6	276460	276465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797154
5073	NC_012943	TAC	2	6	276488	276493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253797154
5074	NC_012943	TCT	2	6	276570	276575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253797154
5075	NC_012943	TCG	2	6	276576	276581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797154
5076	NC_012943	CGC	2	6	276715	276720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797154
5077	NC_012943	GCG	2	6	276859	276864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797154
5078	NC_012943	GCT	2	6	276865	276870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797154
5079	NC_012943	GCC	2	6	276947	276952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797154
5080	NC_012943	TCA	2	6	277017	277022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253797154
5081	NC_012943	CTG	2	6	277100	277105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797154
5082	NC_012943	CGA	2	6	277210	277215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797154
5083	NC_012943	CGC	2	6	277216	277221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797154
5084	NC_012943	CTG	2	6	277331	277336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797154
5085	NC_012943	GCT	2	6	277363	277368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797154
5086	NC_012943	CAG	2	6	277394	277399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797154
5087	NC_012943	GGA	2	6	277468	277473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253797154
5088	NC_012943	CGA	2	6	277492	277497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797154
5089	NC_012943	CGA	2	6	277507	277512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797154
5090	NC_012943	AGG	2	6	277830	277835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_012943	GCC	2	6	277882	277887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797155
5092	NC_012943	GTG	2	6	277888	277893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253797155
5093	NC_012943	GCC	2	6	277897	277902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797155
5094	NC_012943	GGA	2	6	278064	278069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253797155
5095	NC_012943	TTC	2	6	278101	278106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253797155
5096	NC_012943	TGC	2	6	278178	278183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797155
5097	NC_012943	GCT	4	12	278331	278342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797155
5098	NC_012943	CGA	2	6	278403	278408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797155
5099	NC_012943	AGC	2	6	278420	278425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797155
5100	NC_012943	GGC	3	9	278460	278468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797155
5101	NC_012943	GGA	2	6	278514	278519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253797155
5102	NC_012943	GAC	2	6	278676	278681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797156
5103	NC_012943	GAG	2	6	278727	278732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253797156
5104	NC_012943	CGA	2	6	278792	278797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797156
5105	NC_012943	CGA	2	6	278900	278905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797156
5106	NC_012943	TCT	2	6	278926	278931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253797156
5107	NC_012943	GCC	2	6	278982	278987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797156
5108	NC_012943	CTA	2	6	279047	279052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253797156
5109	NC_012943	GAC	2	6	279123	279128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797156
5110	NC_012943	CGC	2	6	279176	279181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797156
5111	NC_012943	CGA	2	6	279182	279187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797156
5112	NC_012943	GAG	2	6	279252	279257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253797156
5113	NC_012943	ACT	2	6	279397	279402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253797156
5114	NC_012943	GGA	2	6	279416	279421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253797156
5115	NC_012943	CGA	2	6	279431	279436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797156
5116	NC_012943	CCG	2	6	279631	279636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797157
5117	NC_012943	GTC	2	6	279696	279701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797157
5118	NC_012943	CGT	2	6	279709	279714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797157
5119	NC_012943	TCG	2	6	279724	279729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797157
5120	NC_012943	GGT	2	6	279759	279764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253797157
5121	NC_012943	TCG	2	6	279787	279792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797157
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5124	NC_012943	CGG	2	6	279882	279887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797157
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5144	NC_012943	CGG	2	6	280754	280759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797157
5145	NC_012943	CCG	2	6	280815	280820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797157
5146	NC_012943	CGC	2	6	280860	280865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797157
5147	NC_012943	TGG	2	6	280904	280909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253797157
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5150	NC_012943	TCG	2	6	281084	281089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5151	NC_012943	CGG	2	6	281146	281151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797158
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5234	NC_012943	GCA	2	6	284923	284928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797159
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