MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 1435 chromosome

Total Repeats: 83327

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_012943	GAT	2	6	165351	165356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253797056
3002	NC_012943	CGC	2	6	165413	165418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797056
3003	NC_012943	AGC	2	6	165482	165487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797056
3004	NC_012943	CGC	3	9	165616	165624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797057
3005	NC_012943	CGC	3	9	165655	165663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797057
3006	NC_012943	GCA	2	6	165688	165693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797057
3007	NC_012943	CGG	2	6	165726	165731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797057
3008	NC_012943	CAT	2	6	165733	165738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253797057
3009	NC_012943	GCC	2	6	165744	165749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797057
3010	NC_012943	GAC	2	6	165781	165786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797057
3011	NC_012943	TGG	2	6	165804	165809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253797057
3012	NC_012943	CGA	2	6	165835	165840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797057
3013	NC_012943	CGA	2	6	165912	165917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797057
3014	NC_012943	ATC	2	6	165926	165931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253797057
3015	NC_012943	GTG	2	6	165952	165957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253797057
3016	NC_012943	AAG	2	6	165963	165968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253797057
3017	NC_012943	GTG	2	6	166009	166014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253797057
3018	NC_012943	CGA	2	6	166042	166047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797057
3019	NC_012943	TCG	2	6	166152	166157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797058
3020	NC_012943	CGA	2	6	166225	166230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797058
3021	NC_012943	CGA	2	6	166300	166305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797058
3022	NC_012943	CTA	2	6	166309	166314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253797058
3023	NC_012943	CAG	2	6	166438	166443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797058
3024	NC_012943	GTC	2	6	166458	166463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797058
3025	NC_012943	GAA	2	6	166484	166489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253797058
3026	NC_012943	GGC	2	6	166537	166542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797058
3027	NC_012943	TGC	2	6	166554	166559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797058
3028	NC_012943	ACG	2	6	166569	166574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797058
3029	NC_012943	CCG	2	6	166584	166589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797058
3030	NC_012943	CGG	3	9	166615	166623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797058
3031	NC_012943	CGA	2	6	166723	166728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797058
3032	NC_012943	TGC	2	6	166729	166734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797058
3033	NC_012943	GGC	2	6	166750	166755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797058
3034	NC_012943	ATG	2	6	166799	166804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253797058
3035	NC_012943	AAG	2	6	166812	166817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253797058
3036	NC_012943	CGC	2	6	166828	166833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797058
3037	NC_012943	CGC	2	6	166851	166856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797058
3038	NC_012943	ATG	2	6	166964	166969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253797058
3039	NC_012943	GGA	2	6	167035	167040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253797058
3040	NC_012943	GCC	2	6	167054	167059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797058
3041	NC_012943	GCG	2	6	167069	167074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797058
3042	NC_012943	GGT	2	6	167263	167268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253797059
3043	NC_012943	TCG	2	6	167439	167444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797059
3044	NC_012943	ACG	2	6	167445	167450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797059
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3047	NC_012943	GAT	2	6	167610	167615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253797060
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3049	NC_012943	AGC	2	6	167848	167853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797060
3050	NC_012943	TCG	2	6	167863	167868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797060
3051	NC_012943	GTC	2	6	167925	167930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797060
3052	NC_012943	TCA	2	6	167939	167944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253797060
3053	NC_012943	GTC	2	6	167990	167995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797061
3054	NC_012943	GGT	2	6	168001	168006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253797061
3055	NC_012943	CAG	2	6	168062	168067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797061
3056	NC_012943	TGC	2	6	168117	168122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797061
3057	NC_012943	CGC	2	6	168166	168171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797061
3058	NC_012943	GAG	2	6	168200	168205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253797061
3059	NC_012943	GCC	2	6	168236	168241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797061
3060	NC_012943	GAC	2	6	168242	168247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797061
3061	NC_012943	GCC	2	6	168281	168286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797061
3062	NC_012943	CCG	2	6	168292	168297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797061
3063	NC_012943	CGG	2	6	168351	168356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797061
3064	NC_012943	AGC	2	6	168363	168368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797061
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3067	NC_012943	GTG	2	6	168545	168550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253797061
3068	NC_012943	GCG	2	6	168608	168613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797061
3069	NC_012943	GAT	2	6	168724	168729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253797061
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3072	NC_012943	GGT	2	6	168811	168816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253797061
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3074	NC_012943	ACA	3	9	169060	169068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253797062
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3078	NC_012943	CAT	2	6	169184	169189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253797062
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3086	NC_012943	GCT	2	6	169439	169444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797062
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3090	NC_012943	CAC	2	6	169601	169606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253797062
3091	NC_012943	AGT	2	6	169614	169619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253797062
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3101	NC_012943	CGT	2	6	170111	170116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797062
3102	NC_012943	GCC	2	6	170165	170170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797062
3103	NC_012943	AGA	2	6	170248	170253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253797062
3104	NC_012943	CCG	2	6	170349	170354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797062
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3107	NC_012943	CAG	2	6	170473	170478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3108	NC_012943	CCG	2	6	170514	170519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3109	NC_012943	GCG	2	6	170524	170529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3110	NC_012943	CGC	3	9	170579	170587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797063
3111	NC_012943	TCG	2	6	170588	170593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797063
3112	NC_012943	GTG	2	6	170727	170732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253797063
3113	NC_012943	CGG	2	6	170789	170794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797063
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3474	NC_012943	CGG	2	6	188529	188534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797081
3475	NC_012943	CGC	2	6	188566	188571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797081
3476	NC_012943	CGA	2	6	188632	188637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797081
3477	NC_012943	CGG	2	6	188646	188651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797081
3478	NC_012943	CAG	2	6	188659	188664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797081
3479	NC_012943	GCC	2	6	188735	188740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797081
3480	NC_012943	CCG	2	6	188824	188829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3481	NC_012943	TCA	2	6	188923	188928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253797082
3482	NC_012943	GCC	2	6	189164	189169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797082
3483	NC_012943	CGA	2	6	189196	189201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797082
3484	NC_012943	GTA	2	6	189302	189307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253797082
3485	NC_012943	GCG	2	6	189451	189456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797082
3486	NC_012943	CGT	2	6	189469	189474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797082
3487	NC_012943	CAG	2	6	189575	189580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797082
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3489	NC_012943	TTG	2	6	189594	189599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253797082
3490	NC_012943	GTT	2	6	189671	189676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253797082
3491	NC_012943	GAT	2	6	189677	189682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253797082
3492	NC_012943	TTG	2	6	189717	189722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253797082
3493	NC_012943	CGG	2	6	189745	189750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797082
3494	NC_012943	CAG	2	6	189755	189760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797082
3495	NC_012943	TTG	2	6	189888	189893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253797082
3496	NC_012943	GCC	2	6	189935	189940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797082
3497	NC_012943	CCG	2	6	189996	190001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797082
3498	NC_012943	CGG	2	6	190129	190134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797082
3499	NC_012943	CGC	2	6	190166	190171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797082
3500	NC_012943	GAC	2	6	190181	190186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797082

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