MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 1435 chromosome

Total Repeats: 83327

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012943	ACG	2	6	28871	28876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796939
502	NC_012943	GGC	2	6	28883	28888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796939
503	NC_012943	CGC	2	6	28988	28993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796939
504	NC_012943	CAC	2	6	29105	29110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253796939
505	NC_012943	CAA	2	6	29210	29215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253796939
506	NC_012943	GTC	2	6	29220	29225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796939
507	NC_012943	CAA	2	6	29270	29275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253796939
508	NC_012943	ACG	2	6	29414	29419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796940
509	NC_012943	AGC	2	6	29603	29608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796940
510	NC_012943	GTC	2	6	29623	29628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796940
511	NC_012943	GCC	3	9	29629	29637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796940
512	NC_012943	GGT	2	6	29946	29951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253796941
513	NC_012943	CGC	2	6	30057	30062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796941
514	NC_012943	AGC	2	6	30084	30089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796941
515	NC_012943	GTC	2	6	30133	30138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796941
516	NC_012943	GGT	2	6	30306	30311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253796941
517	NC_012943	GCC	2	6	30355	30360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796941
518	NC_012943	GCG	2	6	30437	30442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796941
519	NC_012943	CAG	2	6	30463	30468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796941
520	NC_012943	CCT	2	6	30501	30506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253796941
521	NC_012943	GCT	3	9	30513	30521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796941
522	NC_012943	CGT	2	6	30590	30595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796941
523	NC_012943	CTG	2	6	30703	30708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796941
524	NC_012943	CGA	2	6	30744	30749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796941
525	NC_012943	AAG	2	6	30758	30763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253796941
526	NC_012943	CGA	2	6	30816	30821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796941
527	NC_012943	CGA	2	6	30834	30839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796941
528	NC_012943	CGA	2	6	30881	30886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796941
529	NC_012943	CGC	2	6	30936	30941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796941
530	NC_012943	GGC	3	9	30951	30959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796941
531	NC_012943	CAA	2	6	30988	30993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253796941
532	NC_012943	GCG	2	6	31185	31190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_012943	CGG	2	6	31237	31242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_012943	CAA	2	6	31272	31277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_012943	GAG	2	6	31278	31283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
536	NC_012943	CAG	2	6	31348	31353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796942
537	NC_012943	CCG	2	6	31355	31360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796942
538	NC_012943	CGT	2	6	31379	31384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796942
539	NC_012943	ACG	2	6	31388	31393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796942
540	NC_012943	GCT	2	6	31458	31463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796942
541	NC_012943	CAG	2	6	31486	31491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796942
542	NC_012943	AGC	2	6	31550	31555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796942
543	NC_012943	CAT	2	6	31587	31592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253796942
544	NC_012943	GGC	2	6	31717	31722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796943
545	NC_012943	CCG	2	6	31767	31772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796943
546	NC_012943	GGC	2	6	31819	31824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796943
547	NC_012943	GCT	2	6	31885	31890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796943
548	NC_012943	GCC	2	6	31905	31910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796943
549	NC_012943	GGC	2	6	31975	31980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796944
550	NC_012943	TCG	2	6	32035	32040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796944
551	NC_012943	TGC	3	9	32044	32052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796944
552	NC_012943	CAC	2	6	32107	32112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
553	NC_012943	GAT	2	6	32136	32141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
554	NC_012943	CTC	2	6	32239	32244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253796945
555	NC_012943	CAC	2	6	32254	32259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253796945
556	NC_012943	CCG	2	6	32304	32309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796945
557	NC_012943	ACG	2	6	32370	32375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796945
558	NC_012943	AGA	3	9	32425	32433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253796945
559	NC_012943	GCG	2	6	32541	32546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796945
560	NC_012943	CGG	2	6	32548	32553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796945
561	NC_012943	GCC	3	9	32636	32644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796945
562	NC_012943	CCT	2	6	32671	32676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253796945
563	NC_012943	ACG	2	6	32738	32743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796945
564	NC_012943	TTG	2	6	32810	32815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253796945
565	NC_012943	ACG	2	6	32861	32866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796945
566	NC_012943	ACG	2	6	33003	33008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796945
567	NC_012943	CGG	2	6	33039	33044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796945
568	NC_012943	GCC	3	9	33056	33064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796945
569	NC_012943	CCA	2	6	33106	33111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253796945
570	NC_012943	TGT	2	6	33162	33167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253796945
571	NC_012943	GCC	2	6	33170	33175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796945
572	NC_012943	TGG	2	6	33301	33306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
573	NC_012943	TCG	2	6	33381	33386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796946
574	NC_012943	TTC	2	6	33393	33398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253796946
575	NC_012943	GGC	2	6	33412	33417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796946
576	NC_012943	TGA	2	6	33540	33545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253796946
577	NC_012943	CGA	2	6	33604	33609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796946
578	NC_012943	CGG	2	6	33637	33642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796946
579	NC_012943	CGG	2	6	34016	34021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_012943	GCG	2	6	34037	34042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_012943	TGG	2	6	34098	34103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
582	NC_012943	CGG	2	6	34169	34174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_012943	GGT	2	6	34231	34236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
584	NC_012943	CCA	2	6	34253	34258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
585	NC_012943	CCA	2	6	34542	34547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253796947
586	NC_012943	GGT	2	6	34590	34595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253796947
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588	NC_012943	TGA	2	6	34752	34757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253796947
589	NC_012943	CGA	2	6	34969	34974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796947
590	NC_012943	TTC	2	6	35066	35071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253796947
591	NC_012943	GCG	2	6	35072	35077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796947
592	NC_012943	GTT	2	6	35113	35118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253796947
593	NC_012943	CTT	2	6	35143	35148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253796947
594	NC_012943	GCG	2	6	35243	35248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796947
595	NC_012943	ATG	3	9	35414	35422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253796947
596	NC_012943	CGA	2	6	35449	35454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796947
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598	NC_012943	CGG	2	6	35572	35577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796947
599	NC_012943	GGT	2	6	35698	35703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253796947
600	NC_012943	CGG	2	6	35712	35717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796947
601	NC_012943	GCT	2	6	35742	35747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796947
602	NC_012943	CGC	2	6	35827	35832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796947
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606	NC_012943	CGC	2	6	35941	35946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796947
607	NC_012943	ACC	2	6	35994	35999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253796947
608	NC_012943	CGC	2	6	36014	36019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796947
609	NC_012943	GCC	2	6	36030	36035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796947
610	NC_012943	ATC	2	6	36038	36043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253796947
611	NC_012943	CCA	2	6	36090	36095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253796947
612	NC_012943	GAG	2	6	36177	36182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253796947
613	NC_012943	GTG	2	6	36218	36223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253796947
614	NC_012943	CGG	2	6	36256	36261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796947
615	NC_012943	CGT	2	6	36283	36288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796947
616	NC_012943	GCC	2	6	36337	36342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796947
617	NC_012943	GCC	2	6	36344	36349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253796947
618	NC_012943	CGG	2	6	36398	36403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253796947
619	NC_012943	GGA	2	6	36590	36595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253796947
620	NC_012943	ACC	2	6	36628	36633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253796947
621	NC_012943	CCA	2	6	36729	36734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253796948
622	NC_012943	TCG	2	6	36783	36788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253796948
623	NC_012943	AGA	2	6	36838	36843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253796948
624	NC_012943	CGA	2	6	36975	36980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253796949
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