MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Ra chromosome

Total Repeats: 83600

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_009525	CCA	2	6	273571	273576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148659991
5003	NC_009525	TCC	2	6	273639	273644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148659991
5004	NC_009525	TCT	3	9	273703	273711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148659991
5005	NC_009525	CGT	2	6	273742	273747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659991
5006	NC_009525	CGG	2	6	273767	273772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659991
5007	NC_009525	GCC	2	6	273809	273814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659991
5008	NC_009525	GTC	2	6	273824	273829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659991
5009	NC_009525	CGA	2	6	273871	273876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659991
5010	NC_009525	CAG	3	9	273881	273889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659991
5011	NC_009525	CTG	2	6	274113	274118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659991
5012	NC_009525	CAG	3	9	274133	274141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659991
5013	NC_009525	GGC	2	6	274142	274147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659991
5014	NC_009525	GGC	2	6	274157	274162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659991
5015	NC_009525	GTG	2	6	274242	274247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_009525	TCG	2	6	274298	274303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5017	NC_009525	CCT	2	6	274328	274333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5018	NC_009525	TCG	2	6	274348	274353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_009525	CAG	2	6	274406	274411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5020	NC_009525	CGG	2	6	274424	274429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659992
5021	NC_009525	GGT	2	6	274497	274502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659992
5022	NC_009525	CCG	2	6	274526	274531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659992
5023	NC_009525	CGT	2	6	274563	274568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659992
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5025	NC_009525	TTG	2	6	274675	274680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148659992
5026	NC_009525	CGC	2	6	274692	274697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659992
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5028	NC_009525	TGG	2	6	274778	274783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659992
5029	NC_009525	GGT	2	6	274785	274790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659992
5030	NC_009525	CTG	2	6	274804	274809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659992
5031	NC_009525	GGC	2	6	274891	274896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659992
5032	NC_009525	GCG	2	6	274939	274944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659992
5033	NC_009525	GCC	2	6	274967	274972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659992
5034	NC_009525	GGC	2	6	275013	275018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659992
5035	NC_009525	GCC	2	6	275082	275087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659992
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5037	NC_009525	CGC	2	6	275106	275111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659992
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5039	NC_009525	GCT	2	6	275199	275204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659992
5040	NC_009525	TGG	2	6	275213	275218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659992
5041	NC_009525	CGG	2	6	275261	275266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659992
5042	NC_009525	TGG	2	6	275315	275320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659992
5043	NC_009525	CGC	2	6	275321	275326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659992
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5052	NC_009525	GCG	3	9	276127	276135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659993
5053	NC_009525	TCG	3	9	276194	276202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659993
5054	NC_009525	TCG	2	6	276238	276243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659993
5055	NC_009525	CGA	2	6	276248	276253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659993
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5058	NC_009525	CGA	2	6	276389	276394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659994
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5060	NC_009525	TGC	2	6	276427	276432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659994
5061	NC_009525	CGT	2	6	276449	276454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659994
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5068	NC_009525	CTC	2	6	276738	276743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148659994
5069	NC_009525	TCG	2	6	276877	276882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659994
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5074	NC_009525	TCG	2	6	277198	277203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659994
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5077	NC_009525	TCG	2	6	277385	277390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5078	NC_009525	TGC	2	6	277421	277426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659995
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5089	NC_009525	CGC	2	6	278136	278141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659995
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5091	NC_009525	GCT	2	6	278286	278291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659995
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5102	NC_009525	CGA	2	6	278928	278933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659995
5103	NC_009525	AGG	2	6	279251	279256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5118	NC_009525	CGA	2	6	280321	280326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659997
5119	NC_009525	TCT	2	6	280347	280352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148659997
5120	NC_009525	GCC	2	6	280403	280408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659997
5121	NC_009525	CTA	2	6	280468	280473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148659997
5122	NC_009525	GAC	2	6	280544	280549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659997
5123	NC_009525	CGC	2	6	280597	280602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659997
5124	NC_009525	CGA	2	6	280603	280608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659997
5125	NC_009525	GAG	2	6	280673	280678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148659997
5126	NC_009525	ACT	2	6	280818	280823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148659997
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5128	NC_009525	CGA	2	6	280852	280857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659997
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5130	NC_009525	GTC	2	6	281117	281122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659998
5131	NC_009525	CGT	2	6	281130	281135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659998
5132	NC_009525	TCG	2	6	281145	281150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659998
5133	NC_009525	GGT	2	6	281180	281185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659998
5134	NC_009525	TCG	2	6	281208	281213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659998
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5148	NC_009525	AGC	2	6	281794	281799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659998
5149	NC_009525	GCC	2	6	281810	281815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659998
5150	NC_009525	GCG	2	6	281907	281912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659998
5151	NC_009525	GCC	2	6	281991	281996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659998
5152	NC_009525	CGG	2	6	282019	282024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659998
5153	NC_009525	TCG	2	6	282027	282032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659998
5154	NC_009525	GTA	2	6	282059	282064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148659998
5155	NC_009525	TCA	2	6	282133	282138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148659998
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5157	NC_009525	CGG	2	6	282175	282180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659998
5158	NC_009525	CCG	2	6	282236	282241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659998
5159	NC_009525	CGC	2	6	282281	282286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659998
5160	NC_009525	TGG	2	6	282325	282330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659998
5161	NC_009525	AGG	2	6	282420	282425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148659998
5162	NC_009525	CCT	2	6	282434	282439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148659998
5163	NC_009525	TCG	2	6	282505	282510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5164	NC_009525	CGG	2	6	282567	282572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659999
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5169	NC_009525	TCG	2	6	282919	282924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659999
5170	NC_009525	CGG	2	6	282946	282951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659999
5171	NC_009525	TGC	2	6	282962	282967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659999
5172	NC_009525	TGA	2	6	283024	283029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148659999
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5174	NC_009525	CCG	2	6	283073	283078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659999
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5183	NC_009525	GTG	2	6	283419	283424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659999
5184	NC_009525	GTA	2	6	283425	283430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148659999
5185	NC_009525	CGC	2	6	283460	283465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659999
5186	NC_009525	CAG	2	6	283503	283508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659999
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5189	NC_009525	ATC	2	6	283567	283572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148659999
5190	NC_009525	CAG	3	9	283587	283595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659999
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5204	NC_009525	GTG	2	6	284343	284348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148660000
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5234	NC_009525	GGC	2	6	285739	285744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148660000
5235	NC_009525	GCG	2	6	285785	285790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148660000
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5352	NC_009525	GTT	2	6	291569	291574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148660006
5353	NC_009525	CGT	2	6	291585	291590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148660006
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