MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mycobacterium sp. MCS chromosome

Total Repeats: 5151

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008146	CCCGG	2	10	571	580	0 %	0 %	40 %	60 %	108796982
2	NC_008146	ATCTC	2	10	1185	1194	20 %	40 %	0 %	40 %	108796982
3	NC_008146	GACCG	2	10	3264	3273	20 %	0 %	40 %	40 %	108796983
4	NC_008146	GTCCG	2	10	3471	3480	0 %	20 %	40 %	40 %	108796984
5	NC_008146	CCAGC	2	10	6985	6994	20 %	0 %	20 %	60 %	108796987
6	NC_008146	GCAGC	2	10	7891	7900	20 %	0 %	40 %	40 %	108796987
7	NC_008146	GCAGC	2	10	8308	8317	20 %	0 %	40 %	40 %	108796988
8	NC_008146	GGGCA	2	10	8570	8579	20 %	0 %	60 %	20 %	108796988
9	NC_008146	CCGGC	2	10	8914	8923	0 %	0 %	40 %	60 %	108796988
10	NC_008146	CCAGT	2	10	10411	10420	20 %	20 %	20 %	40 %	108796988
11	NC_008146	TGCTC	2	10	11487	11496	0 %	40 %	20 %	40 %	108796988
12	NC_008146	GGTCG	2	10	12139	12148	0 %	20 %	60 %	20 %	108796989
13	NC_008146	TCCGG	2	10	12421	12430	0 %	20 %	40 %	40 %	108796989
14	NC_008146	CGGTC	2	10	12531	12540	0 %	20 %	40 %	40 %	108796989
15	NC_008146	CGTCG	2	10	12559	12568	0 %	20 %	40 %	40 %	108796989
16	NC_008146	CACGG	2	10	13170	13179	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
17	NC_008146	GCCGG	2	10	14165	14174	0 %	0 %	60 %	40 %	108796991
18	NC_008146	GGACC	2	10	15331	15340	20 %	0 %	40 %	40 %	108796994
19	NC_008146	TCGGT	2	10	17766	17775	0 %	40 %	40 %	20 %	108796996
20	NC_008146	GTGCG	2	10	17785	17794	0 %	20 %	60 %	20 %	108796996
21	NC_008146	CACCG	2	10	18232	18241	20 %	0 %	20 %	60 %	108796996
22	NC_008146	CGGCC	2	10	18430	18439	0 %	0 %	40 %	60 %	108796996
23	NC_008146	CTCGC	2	10	20018	20027	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
24	NC_008146	CGGCG	2	10	20092	20101	0 %	0 %	60 %	40 %	108796998
25	NC_008146	ATCAG	2	10	20315	20324	40 %	20 %	20 %	20 %	108796998
26	NC_008146	GCGGT	2	10	20703	20712	0 %	20 %	60 %	20 %	108796998
27	NC_008146	GCGTT	2	10	23577	23586	0 %	40 %	40 %	20 %	108797000
28	NC_008146	CGCTG	2	10	24690	24699	0 %	20 %	40 %	40 %	108797001
29	NC_008146	GGTCA	2	10	26187	26196	20 %	20 %	40 %	20 %	108797002
30	NC_008146	GAACG	2	10	27100	27109	40 %	0 %	40 %	20 %	108797003
31	NC_008146	GTCGA	2	10	27275	27284	20 %	20 %	40 %	20 %	108797003
32	NC_008146	CGAAT	2	10	30235	30244	40 %	20 %	20 %	20 %	108797005
33	NC_008146	AGGCA	2	10	31512	31521	40 %	0 %	40 %	20 %	108797005
34	NC_008146	AACGT	2	10	32303	32312	40 %	20 %	20 %	20 %	108797005
35	NC_008146	CGGCG	2	10	32583	32592	0 %	0 %	60 %	40 %	108797005
36	NC_008146	CAACG	2	10	36548	36557	40 %	0 %	20 %	40 %	108797007
37	NC_008146	TTCAT	2	10	39801	39810	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_008146	CCGCA	2	10	40371	40380	20 %	0 %	20 %	60 %	108797012
39	NC_008146	GCTGG	2	10	41522	41531	0 %	20 %	60 %	20 %	108797013
40	NC_008146	CTGCC	2	10	42223	42232	0 %	20 %	20 %	60 %	108797013
41	NC_008146	CAACG	2	10	44279	44288	40 %	0 %	20 %	40 %	108797015
42	NC_008146	ATCGC	2	10	44809	44818	20 %	20 %	20 %	40 %	108797015
43	NC_008146	ACACC	2	10	45839	45848	40 %	0 %	0 %	60 %	108797016
44	NC_008146	GTCCG	2	10	47784	47793	0 %	20 %	40 %	40 %	108797018
45	NC_008146	CGACG	2	10	49533	49542	20 %	0 %	40 %	40 %	108797019
46	NC_008146	AGACG	2	10	49911	49920	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_008146	CGTCT	2	10	49924	49933	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
48	NC_008146	CCGGC	2	10	50318	50327	0 %	0 %	40 %	60 %	108797020
49	NC_008146	CGCTG	2	10	51335	51344	0 %	20 %	40 %	40 %	108797021
50	NC_008146	CCGCG	2	10	51737	51746	0 %	0 %	40 %	60 %	108797021
51	NC_008146	CGGCC	2	10	52279	52288	0 %	0 %	40 %	60 %	108797021
52	NC_008146	GCCGG	2	10	52950	52959	0 %	0 %	60 %	40 %	108797021
53	NC_008146	CGGTT	2	10	53611	53620	0 %	40 %	40 %	20 %	108797022
54	NC_008146	TCGGG	2	10	55642	55651	0 %	20 %	60 %	20 %	108797025
55	NC_008146	TGCGG	2	10	55982	55991	0 %	20 %	60 %	20 %	108797025
56	NC_008146	CGCGA	2	10	56010	56019	20 %	0 %	40 %	40 %	108797025
57	NC_008146	AGGCG	2	10	58154	58163	20 %	0 %	60 %	20 %	108797028
58	NC_008146	GGACA	2	10	58197	58206	40 %	0 %	40 %	20 %	108797028
59	NC_008146	TGCGC	2	10	58264	58273	0 %	20 %	40 %	40 %	108797028
60	NC_008146	ACCGC	3	15	60187	60201	20 %	0 %	20 %	60 %	108797029
61	NC_008146	GACGT	2	10	60557	60566	20 %	20 %	40 %	20 %	108797029
62	NC_008146	CCGAC	2	10	60869	60878	20 %	0 %	20 %	60 %	108797029
63	NC_008146	GCGAC	2	10	60909	60918	20 %	0 %	40 %	40 %	108797029
64	NC_008146	TGACG	2	10	61871	61880	20 %	20 %	40 %	20 %	108797029
65	NC_008146	CGGTG	2	10	62995	63004	0 %	20 %	60 %	20 %	108797030
66	NC_008146	GCCGG	2	10	65843	65852	0 %	0 %	60 %	40 %	108797034
67	NC_008146	GGTCG	2	10	66007	66016	0 %	20 %	60 %	20 %	108797034
68	NC_008146	GACAT	2	10	68927	68936	40 %	20 %	20 %	20 %	108797040
69	NC_008146	GCCCG	2	10	69143	69152	0 %	0 %	40 %	60 %	108797040
70	NC_008146	CCGCA	2	10	69454	69463	20 %	0 %	20 %	60 %	108797040
71	NC_008146	ACGCC	2	10	69726	69735	20 %	0 %	20 %	60 %	108797040
72	NC_008146	GCACC	2	10	73357	73366	20 %	0 %	20 %	60 %	108797043
73	NC_008146	CGGCG	2	10	76161	76170	0 %	0 %	60 %	40 %	108797046
74	NC_008146	ACCTC	2	10	76289	76298	20 %	20 %	0 %	60 %	108797046
75	NC_008146	TCGAC	2	10	76520	76529	20 %	20 %	20 %	40 %	108797046
76	NC_008146	CGACC	2	10	76872	76881	20 %	0 %	20 %	60 %	108797046
77	NC_008146	CACCC	2	10	77548	77557	20 %	0 %	0 %	80 %	108797047
78	NC_008146	CGGGT	2	10	80218	80227	0 %	20 %	60 %	20 %	108797048
79	NC_008146	GGTGC	2	10	82740	82749	0 %	20 %	60 %	20 %	108797050
80	NC_008146	CGGCG	2	10	83162	83171	0 %	0 %	60 %	40 %	108797050
81	NC_008146	TGGCC	2	10	84589	84598	0 %	20 %	40 %	40 %	108797053
82	NC_008146	CCGCG	2	10	85984	85993	0 %	0 %	40 %	60 %	108797054
83	NC_008146	CGGCG	2	10	87028	87037	0 %	0 %	60 %	40 %	108797054
84	NC_008146	CGGAC	2	10	89665	89674	20 %	0 %	40 %	40 %	108797058
85	NC_008146	GCCGA	2	10	89784	89793	20 %	0 %	40 %	40 %	108797058
86	NC_008146	CGTGC	2	10	91783	91792	0 %	20 %	40 %	40 %	108797059
87	NC_008146	ACCCG	2	10	92142	92151	20 %	0 %	20 %	60 %	108797059
88	NC_008146	GCCGA	2	10	92574	92583	20 %	0 %	40 %	40 %	108797060
89	NC_008146	TGGGG	2	10	92623	92632	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008146	GCACC	2	10	93536	93545	20 %	0 %	20 %	60 %	108797061
91	NC_008146	GCGCG	2	10	94493	94502	0 %	0 %	60 %	40 %	108797061
92	NC_008146	CCGGT	2	10	94914	94923	0 %	20 %	40 %	40 %	108797062
93	NC_008146	GCGCC	2	10	95323	95332	0 %	0 %	40 %	60 %	108797062
94	NC_008146	CGGAA	2	10	95415	95424	40 %	0 %	40 %	20 %	108797062
95	NC_008146	GCACC	2	10	95569	95578	20 %	0 %	20 %	60 %	108797062
96	NC_008146	GCACC	2	10	96240	96249	20 %	0 %	20 %	60 %	108797063
97	NC_008146	CCGGC	2	10	96609	96618	0 %	0 %	40 %	60 %	108797064
98	NC_008146	CCGCG	2	10	96729	96738	0 %	0 %	40 %	60 %	108797064
99	NC_008146	ACGGC	2	10	97202	97211	20 %	0 %	40 %	40 %	108797064
100	NC_008146	GGGCC	2	10	97298	97307	0 %	0 %	60 %	40 %	108797064
101	NC_008146	CGCGG	2	10	97365	97374	0 %	0 %	60 %	40 %	108797064
102	NC_008146	ACCGA	2	10	97444	97453	40 %	0 %	20 %	40 %	108797064
103	NC_008146	ATCCG	2	10	98969	98978	20 %	20 %	20 %	40 %	108797065
104	NC_008146	CCGCC	2	10	99051	99060	0 %	0 %	20 %	80 %	108797065
105	NC_008146	CCTGC	2	10	99926	99935	0 %	20 %	20 %	60 %	108797066
106	NC_008146	CCGAA	2	10	99965	99974	40 %	0 %	20 %	40 %	108797066
107	NC_008146	GCGGG	2	10	100878	100887	0 %	0 %	80 %	20 %	108797066
108	NC_008146	TGCGG	2	10	101095	101104	0 %	20 %	60 %	20 %	108797066
109	NC_008146	ACCGA	2	10	101212	101221	40 %	0 %	20 %	40 %	108797066
110	NC_008146	TCGTG	2	10	102584	102593	0 %	40 %	40 %	20 %	108797068
111	NC_008146	ACCCG	2	10	106031	106040	20 %	0 %	20 %	60 %	108797071
112	NC_008146	GGCCG	2	10	106372	106381	0 %	0 %	60 %	40 %	108797072
113	NC_008146	GGCCA	2	10	106660	106669	20 %	0 %	40 %	40 %	108797072
114	NC_008146	CGCAG	2	10	107013	107022	20 %	0 %	40 %	40 %	108797072
115	NC_008146	GGTCT	2	10	107088	107097	0 %	40 %	40 %	20 %	108797073
116	NC_008146	CGGTC	2	10	107248	107257	0 %	20 %	40 %	40 %	108797073
117	NC_008146	CGGGC	2	10	108419	108428	0 %	0 %	60 %	40 %	108797074
118	NC_008146	CCGAT	2	10	108553	108562	20 %	20 %	20 %	40 %	108797074
119	NC_008146	CCGGT	2	10	111236	111245	0 %	20 %	40 %	40 %	108797078
120	NC_008146	CCCGG	2	10	111507	111516	0 %	0 %	40 %	60 %	108797078
121	NC_008146	GCCGT	2	10	111517	111526	0 %	20 %	40 %	40 %	108797078
122	NC_008146	GCGCG	2	10	111582	111591	0 %	0 %	60 %	40 %	108797078
123	NC_008146	CCAGC	2	10	115016	115025	20 %	0 %	20 %	60 %	108797081
124	NC_008146	TGACC	2	10	116725	116734	20 %	20 %	20 %	40 %	108797082
125	NC_008146	GGCGA	2	10	117577	117586	20 %	0 %	60 %	20 %	108797083
126	NC_008146	GCCGA	2	10	119115	119124	20 %	0 %	40 %	40 %	108797084
127	NC_008146	CGCCC	2	10	119483	119492	0 %	0 %	20 %	80 %	108797084
128	NC_008146	CGCGC	2	10	119897	119906	0 %	0 %	40 %	60 %	108797085
129	NC_008146	GTCAG	2	10	122227	122236	20 %	20 %	40 %	20 %	108797087
130	NC_008146	CGGCG	2	10	124106	124115	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
131	NC_008146	ACCGC	2	10	125107	125116	20 %	0 %	20 %	60 %	108797090
132	NC_008146	GCAGG	2	10	125233	125242	20 %	0 %	60 %	20 %	108797090
133	NC_008146	GGGCG	2	10	125635	125644	0 %	0 %	80 %	20 %	108797090
134	NC_008146	GGACC	2	10	125968	125977	20 %	0 %	40 %	40 %	108797090
135	NC_008146	CGGGG	2	10	126243	126252	0 %	0 %	80 %	20 %	108797091
136	NC_008146	ACGCG	2	10	127468	127477	20 %	0 %	40 %	40 %	108797092
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