MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mycobacterium sp. MCS chromosome

Total Repeats: 5151

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_008146	ACGCA	2	10	2222680	2222689	40 %	0 %	20 %	40 %	108799039
2002	NC_008146	CGTCC	2	10	2223798	2223807	0 %	20 %	20 %	60 %	108799040
2003	NC_008146	CACCG	2	10	2224405	2224414	20 %	0 %	20 %	60 %	108799040
2004	NC_008146	GGCCC	2	10	2226342	2226351	0 %	0 %	40 %	60 %	108799042
2005	NC_008146	TGACC	2	10	2227429	2227438	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2006	NC_008146	GGCCC	2	10	2227890	2227899	0 %	0 %	40 %	60 %	108799043
2007	NC_008146	TCACC	2	10	2230696	2230705	20 %	20 %	0 %	60 %	108799046
2008	NC_008146	GGCGC	2	10	2232501	2232510	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2009	NC_008146	CGGCC	2	10	2232990	2232999	0 %	0 %	40 %	60 %	108799049
2010	NC_008146	GGTTC	2	10	2235575	2235584	0 %	40 %	40 %	20 %	108799050
2011	NC_008146	CGGTG	2	10	2237560	2237569	0 %	20 %	60 %	20 %	108799052
2012	NC_008146	GTGGC	2	10	2237723	2237732	0 %	20 %	60 %	20 %	108799052
2013	NC_008146	CGCGG	2	10	2239258	2239267	0 %	0 %	60 %	40 %	108799055
2014	NC_008146	CCCCG	2	10	2240908	2240917	0 %	0 %	20 %	80 %	108799058
2015	NC_008146	GGGGT	2	10	2241348	2241357	0 %	20 %	80 %	0 %	108799058
2016	NC_008146	GCAGC	2	10	2242867	2242876	20 %	0 %	40 %	40 %	108799059
2017	NC_008146	AGGCC	2	10	2242902	2242911	20 %	0 %	40 %	40 %	108799059
2018	NC_008146	CCGAG	2	10	2244140	2244149	20 %	0 %	40 %	40 %	108799060
2019	NC_008146	AGCGC	2	10	2244646	2244655	20 %	0 %	40 %	40 %	108799061
2020	NC_008146	TGGTG	2	10	2246098	2246107	0 %	40 %	60 %	0 %	108799063
2021	NC_008146	GCGAC	2	10	2246113	2246122	20 %	0 %	40 %	40 %	108799063
2022	NC_008146	CGGGT	2	10	2246612	2246621	0 %	20 %	60 %	20 %	108799064
2023	NC_008146	ACCGC	2	10	2247657	2247666	20 %	0 %	20 %	60 %	108799065
2024	NC_008146	GGGCT	2	10	2247706	2247715	0 %	20 %	60 %	20 %	108799065
2025	NC_008146	TGTTT	2	10	2248149	2248158	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
2026	NC_008146	CGCGG	2	10	2248342	2248351	0 %	0 %	60 %	40 %	108799066
2027	NC_008146	CAGCA	2	10	2251141	2251150	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
2028	NC_008146	GTCGA	2	10	2251658	2251667	20 %	20 %	40 %	20 %	108799068
2029	NC_008146	GAACT	2	10	2252276	2252285	40 %	20 %	20 %	20 %	108799068
2030	NC_008146	CGGCG	2	10	2252386	2252395	0 %	0 %	60 %	40 %	108799068
2031	NC_008146	CGCAC	2	10	2252406	2252415	20 %	0 %	20 %	60 %	108799068
2032	NC_008146	GGTGA	2	10	2253348	2253357	20 %	20 %	60 %	0 %	108799069
2033	NC_008146	CGGCA	2	10	2253980	2253989	20 %	0 %	40 %	40 %	108799071
2034	NC_008146	GCCGG	2	10	2255641	2255650	0 %	0 %	60 %	40 %	108799073
2035	NC_008146	GCCGC	2	10	2258050	2258059	0 %	0 %	40 %	60 %	108799075
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2039	NC_008146	GCGGA	2	10	2262277	2262286	20 %	0 %	60 %	20 %	108799081
2040	NC_008146	AACCC	2	10	2262618	2262627	40 %	0 %	0 %	60 %	108799082
2041	NC_008146	GCCGC	2	10	2262888	2262897	0 %	0 %	40 %	60 %	108799082
2042	NC_008146	CAGGC	2	10	2262980	2262989	20 %	0 %	40 %	40 %	108799082
2043	NC_008146	GCCGT	2	10	2264434	2264443	0 %	20 %	40 %	40 %	108799084
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2045	NC_008146	CGCGG	2	10	2264848	2264857	0 %	0 %	60 %	40 %	108799084
2046	NC_008146	CGGAC	2	10	2267535	2267544	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2047	NC_008146	CCCGG	2	10	2267722	2267731	0 %	0 %	40 %	60 %	108799088
2048	NC_008146	CGCGG	2	10	2267770	2267779	0 %	0 %	60 %	40 %	108799088
2049	NC_008146	CCGGG	2	10	2267825	2267834	0 %	0 %	60 %	40 %	108799088
2050	NC_008146	CCGTC	2	10	2267984	2267993	0 %	20 %	20 %	60 %	108799088
2051	NC_008146	CGGCG	2	10	2268128	2268137	0 %	0 %	60 %	40 %	108799088
2052	NC_008146	TCGAT	2	10	2268790	2268799	20 %	40 %	20 %	20 %	108799088
2053	NC_008146	CACCG	2	10	2269052	2269061	20 %	0 %	20 %	60 %	108799088
2054	NC_008146	ACCGA	2	10	2269326	2269335	40 %	0 %	20 %	40 %	108799088
2055	NC_008146	CGGGT	2	10	2270028	2270037	0 %	20 %	60 %	20 %	108799088
2056	NC_008146	CCGGA	2	10	2271688	2271697	20 %	0 %	40 %	40 %	108799091
2057	NC_008146	GGCCG	2	10	2271740	2271749	0 %	0 %	60 %	40 %	108799091
2058	NC_008146	GGCCA	2	10	2272771	2272780	20 %	0 %	40 %	40 %	108799093
2059	NC_008146	GTGAG	2	10	2273205	2273214	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
2060	NC_008146	ACGGC	2	10	2274115	2274124	20 %	0 %	40 %	40 %	108799095
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2063	NC_008146	CGGGG	2	10	2276502	2276511	0 %	0 %	80 %	20 %	108799099
2064	NC_008146	GGTCG	2	10	2276685	2276694	0 %	20 %	60 %	20 %	108799099
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2067	NC_008146	TGCCG	2	10	2279119	2279128	0 %	20 %	40 %	40 %	108799101
2068	NC_008146	CCCGG	2	10	2282122	2282131	0 %	0 %	40 %	60 %	108799105
2069	NC_008146	CGGCG	3	15	2282510	2282524	0 %	0 %	60 %	40 %	108799105
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2097	NC_008146	GCCCG	2	10	2309649	2309658	0 %	0 %	40 %	60 %	108799133
2098	NC_008146	CGCAG	2	10	2309882	2309891	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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2102	NC_008146	TGTCG	2	10	2319772	2319781	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2103	NC_008146	CCGGA	2	10	2322259	2322268	20 %	0 %	40 %	40 %	108799147
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2107	NC_008146	CGGTC	2	10	2323831	2323840	0 %	20 %	40 %	40 %	108799150
2108	NC_008146	CGGCC	2	10	2324743	2324752	0 %	0 %	40 %	60 %	108799151
2109	NC_008146	GGCCG	2	10	2326246	2326255	0 %	0 %	60 %	40 %	108799152
2110	NC_008146	CGCGG	2	10	2326871	2326880	0 %	0 %	60 %	40 %	108799153
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2118	NC_008146	GCTCG	2	10	2335666	2335675	0 %	20 %	40 %	40 %	108799165
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2122	NC_008146	TGGGG	2	10	2337999	2338008	0 %	20 %	80 %	0 %	108799167
2123	NC_008146	CTGGC	2	10	2338113	2338122	0 %	20 %	40 %	40 %	108799167
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2251	NC_008146	CGCGG	2	10	2470472	2470481	0 %	0 %	60 %	40 %	108799288
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2262	NC_008146	CCGCG	2	10	2486708	2486717	0 %	0 %	40 %	60 %	108799306
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2497	NC_008146	CCCGA	2	10	2710594	2710603	20 %	0 %	20 %	60 %	108799516
2498	NC_008146	GTGAC	2	10	2712700	2712709	20 %	20 %	40 %	20 %	108799518
2499	NC_008146	CTCGG	2	10	2713825	2713834	0 %	20 %	40 %	40 %	108799519
2500	NC_008146	CCGGG	2	10	2714679	2714688	0 %	0 %	60 %	40 %	108799520

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