MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Methanosarcina mazei Go1 chromosome

Total Repeats: 3355

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003901	ACTAT	2	10	778	787	40 %	40 %	0 %	20 %	21226103
2	NC_003901	GGGAC	2	10	1960	1969	20 %	0 %	60 %	20 %	21226103
3	NC_003901	TGGAA	2	10	2107	2116	40 %	20 %	40 %	0 %	21226103
4	NC_003901	CCAGT	2	10	3123	3132	20 %	20 %	20 %	40 %	21226104
5	NC_003901	GTACT	2	10	5916	5925	20 %	40 %	20 %	20 %	21226107
6	NC_003901	CAGAG	2	10	6118	6127	40 %	0 %	40 %	20 %	21226107
7	NC_003901	TGGAT	2	10	7098	7107	20 %	40 %	40 %	0 %	21226108
8	NC_003901	ACCCT	2	10	8212	8221	20 %	20 %	0 %	60 %	21226110
9	NC_003901	CCTGC	2	10	8298	8307	0 %	20 %	20 %	60 %	21226110
10	NC_003901	TACAG	2	10	9426	9435	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_003901	AATAA	2	10	10939	10948	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_003901	AGTAA	2	10	11415	11424	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_003901	AATAA	2	10	11450	11459	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_003901	CTGTA	2	10	11581	11590	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_003901	CATGG	2	10	11837	11846	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_003901	GAAAA	2	10	13801	13810	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_003901	ATGGG	2	10	13863	13872	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
18	NC_003901	GTATC	2	10	15209	15218	20 %	40 %	20 %	20 %	21226115
19	NC_003901	GAAAA	2	10	15414	15423	80 %	0 %	20 %	0 %	21226115
20	NC_003901	TTTCT	2	10	17830	17839	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_003901	TAATT	2	10	18552	18561	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_003901	TCTTT	2	10	18582	18591	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_003901	TTTCA	2	10	19529	19538	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_003901	TCAAT	2	10	24130	24139	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_003901	CCGAT	2	10	28118	28127	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_003901	TAAAC	2	10	30013	30022	60 %	20 %	0 %	20 %	21226129
27	NC_003901	CAATT	2	10	33206	33215	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_003901	CAATT	2	10	33477	33486	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_003901	AAAAT	2	10	33502	33511	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_003901	TTACC	2	10	34131	34140	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
31	NC_003901	ATGAT	2	10	34889	34898	40 %	40 %	20 %	0 %	21226132
32	NC_003901	ATGAA	2	10	36081	36090	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_003901	CTTTC	2	10	37319	37328	0 %	60 %	0 %	40 %	21226135
34	NC_003901	TTTCA	2	10	38490	38499	20 %	60 %	0 %	20 %	21226136
35	NC_003901	ATTTT	2	10	39026	39035	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_003901	GCAAT	2	10	41293	41302	40 %	20 %	20 %	20 %	21226137
37	NC_003901	AAGTT	2	10	44529	44538	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_003901	CCGCC	2	10	46047	46056	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
39	NC_003901	CTTTA	2	10	46157	46166	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_003901	GTCCT	2	10	46226	46235	0 %	40 %	20 %	40 %	21226140
41	NC_003901	GGTCA	2	10	49879	49888	20 %	20 %	40 %	20 %	21226141
42	NC_003901	ATTTT	2	10	50741	50750	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_003901	CTCAG	2	10	51918	51927	20 %	20 %	20 %	40 %	21226142
44	NC_003901	CAATT	2	10	54767	54776	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_003901	ACTGA	2	10	55251	55260	40 %	20 %	20 %	20 %	21226145
46	NC_003901	TATTG	2	10	56830	56839	20 %	60 %	20 %	0 %	21226145
47	NC_003901	ATTTT	2	10	57092	57101	20 %	80 %	0 %	0 %	21226145
48	NC_003901	ATATA	2	10	57716	57725	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_003901	AGGAA	2	10	58426	58435	60 %	0 %	40 %	0 %	21226146
50	NC_003901	GGAAA	2	10	58851	58860	60 %	0 %	40 %	0 %	21226146
51	NC_003901	TGAAA	2	10	59068	59077	60 %	20 %	20 %	0 %	21226146
52	NC_003901	AAGGA	2	10	62173	62182	60 %	0 %	40 %	0 %	21226149
53	NC_003901	GAATT	2	10	62972	62981	40 %	40 %	20 %	0 %	21226149
54	NC_003901	AATAG	2	10	64774	64783	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_003901	ACATA	2	10	68659	68668	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_003901	AAATG	2	10	73551	73560	60 %	20 %	20 %	0 %	21226157
57	NC_003901	GCTCG	2	10	74706	74715	0 %	20 %	40 %	40 %	21226158
58	NC_003901	TAAGG	2	10	75917	75926	40 %	20 %	40 %	0 %	21226158
59	NC_003901	TATAA	2	10	76257	76266	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_003901	AAGAT	2	10	77030	77039	60 %	20 %	20 %	0 %	21226159
61	NC_003901	TAAAT	2	10	77724	77733	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_003901	TCTGC	2	10	81490	81499	0 %	40 %	20 %	40 %	21226165
63	NC_003901	TATTT	2	10	85583	85592	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_003901	TAAAA	2	10	85828	85837	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_003901	ATTTC	2	10	88257	88266	20 %	60 %	0 %	20 %	21226168
66	NC_003901	TTATT	2	10	89192	89201	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_003901	TAAAA	2	10	89461	89470	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_003901	CCTGC	2	10	90351	90360	0 %	20 %	20 %	60 %	21226169
69	NC_003901	GTCCC	2	10	90596	90605	0 %	20 %	20 %	60 %	21226169
70	NC_003901	TTCCC	2	10	92637	92646	0 %	40 %	0 %	60 %	21226170
71	NC_003901	GCTGT	2	10	92890	92899	0 %	40 %	40 %	20 %	21226170
72	NC_003901	TCAGG	2	10	96110	96119	20 %	20 %	40 %	20 %	21226173
73	NC_003901	AAGGG	2	10	96165	96174	40 %	0 %	60 %	0 %	21226173
74	NC_003901	CCCTG	2	10	97253	97262	0 %	20 %	20 %	60 %	21226174
75	NC_003901	CATGT	2	10	97880	97889	20 %	40 %	20 %	20 %	21226174
76	NC_003901	AGGGA	2	10	99582	99591	40 %	0 %	60 %	0 %	21226176
77	NC_003901	GGCAT	2	10	99678	99687	20 %	20 %	40 %	20 %	21226176
78	NC_003901	AGAAA	2	10	101165	101174	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_003901	GGGAA	2	10	103079	103088	40 %	0 %	60 %	0 %	21226179
80	NC_003901	TATTT	2	10	103953	103962	20 %	80 %	0 %	0 %	21226180
81	NC_003901	AGGTC	2	10	104445	104454	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_003901	TTATT	2	10	104713	104722	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_003901	AGCAT	2	10	105719	105728	40 %	20 %	20 %	20 %	21226181
84	NC_003901	TCAGG	2	10	106316	106325	20 %	20 %	40 %	20 %	21226182
85	NC_003901	TTACC	2	10	106433	106442	20 %	40 %	0 %	40 %	21226182
86	NC_003901	TGAAA	2	10	107518	107527	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_003901	TGAAA	2	10	107552	107561	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_003901	AGATG	2	10	107583	107592	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
89	NC_003901	TGAAA	2	10	107603	107612	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_003901	CTGAA	2	10	107801	107810	40 %	20 %	20 %	20 %	21226183
91	NC_003901	GGAAT	2	10	108697	108706	40 %	20 %	40 %	0 %	21226183
92	NC_003901	TTTCC	2	10	109900	109909	0 %	60 %	0 %	40 %	21226186
93	NC_003901	ATGTT	2	10	110341	110350	20 %	60 %	20 %	0 %	21226186
94	NC_003901	CTGTT	2	10	110624	110633	0 %	60 %	20 %	20 %	21226187
95	NC_003901	GCCCG	2	10	112675	112684	0 %	0 %	40 %	60 %	21226189
96	NC_003901	AGATA	2	10	113738	113747	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_003901	AATAA	2	10	115260	115269	80 %	20 %	0 %	0 %	21226191
98	NC_003901	CTGAA	2	10	115790	115799	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_003901	GAAAA	2	10	116454	116463	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_003901	GCTTT	2	10	119317	119326	0 %	60 %	20 %	20 %	21226194
101	NC_003901	CTATC	2	10	121864	121873	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
102	NC_003901	AATTT	2	10	128975	128984	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_003901	TAAAA	2	10	132343	132352	80 %	20 %	0 %	0 %	21226206
104	NC_003901	AAATA	2	10	132441	132450	80 %	20 %	0 %	0 %	21226206
105	NC_003901	GAAAA	2	10	132528	132537	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_003901	CATTT	2	10	133260	133269	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_003901	GAATA	2	10	133463	133472	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_003901	ACTTC	2	10	135891	135900	20 %	40 %	0 %	40 %	21226211
109	NC_003901	AAGGA	2	10	136513	136522	60 %	0 %	40 %	0 %	21226211
110	NC_003901	AAAAC	2	10	142575	142584	80 %	0 %	0 %	20 %	21226217
111	NC_003901	TCTTT	2	10	146314	146323	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_003901	TTATT	2	10	147779	147788	20 %	80 %	0 %	0 %	21226220
113	NC_003901	TGTTT	2	10	149728	149737	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_003901	AAAAC	2	10	150709	150718	80 %	0 %	0 %	20 %	21226223
115	NC_003901	ATGCA	2	10	151767	151776	40 %	20 %	20 %	20 %	21226223
116	NC_003901	AAAAG	2	10	152197	152206	80 %	0 %	20 %	0 %	21226223
117	NC_003901	GAAAG	2	10	154825	154834	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
118	NC_003901	ATTAA	2	10	155193	155202	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_003901	ACCTG	2	10	161112	161121	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
120	NC_003901	AAAAG	2	10	161531	161540	80 %	0 %	20 %	0 %	21226231
121	NC_003901	TGATC	2	10	161592	161601	20 %	40 %	20 %	20 %	21226231
122	NC_003901	CTGCC	2	10	162417	162426	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
123	NC_003901	AGCGA	2	10	163642	163651	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
124	NC_003901	AGAAA	2	10	164104	164113	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_003901	GGGAA	2	10	164228	164237	40 %	0 %	60 %	0 %	21226234
126	NC_003901	ATTCC	2	10	165063	165072	20 %	40 %	0 %	40 %	21226235
127	NC_003901	GAAGG	2	10	165533	165542	40 %	0 %	60 %	0 %	21226235
128	NC_003901	AAGAG	2	10	165912	165921	60 %	0 %	40 %	0 %	21226235
129	NC_003901	CCCTG	2	10	166360	166369	0 %	20 %	20 %	60 %	21226236
130	NC_003901	CTTTT	2	10	169630	169639	0 %	80 %	0 %	20 %	21226238
131	NC_003901	GGCAA	2	10	169645	169654	40 %	0 %	40 %	20 %	21226238
132	NC_003901	AGAAA	2	10	171537	171546	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_003901	GAAAG	2	10	171551	171560	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
134	NC_003901	AAAGG	2	10	172439	172448	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
135	NC_003901	AAAGA	2	10	172526	172535	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_003901	GATTT	2	10	172611	172620	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_003901	CCAGA	2	10	174909	174918	40 %	0 %	20 %	40 %	21226241
138	NC_003901	CTGCC	2	10	179007	179016	0 %	20 %	20 %	60 %	21226246
139	NC_003901	TGCAG	2	10	179271	179280	20 %	20 %	40 %	20 %	21226246
140	NC_003901	AAACA	2	10	180024	180033	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_003901	AGCAG	2	10	180804	180813	40 %	0 %	40 %	20 %	161485684
142	NC_003901	TATTT	2	10	181254	181263	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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192	NC_003901	AAAAC	2	10	231270	231279	80 %	0 %	0 %	20 %	21226275
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269	NC_003901	TCACA	2	10	327128	327137	40 %	20 %	0 %	40 %	21226347
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271	NC_003901	CCTTT	2	10	329535	329544	0 %	60 %	0 %	40 %	21226349
272	NC_003901	TATCA	2	10	330697	330706	40 %	40 %	0 %	20 %	21226350
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274	NC_003901	ATCTG	2	10	335052	335061	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
275	NC_003901	GTTAA	2	10	335314	335323	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
276	NC_003901	ACAGC	2	10	336168	336177	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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