MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Methanosarcina mazei Go1 chromosome

Total Repeats: 3355

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_003901	ATTAT	2	10	1208074	1208083	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_003901	TGCCT	2	10	1208728	1208737	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1003	NC_003901	TTTCT	2	10	1209340	1209349	0 %	80 %	0 %	20 %	21227135
1004	NC_003901	ACTCC	2	10	1211114	1211123	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1005	NC_003901	TTTCA	2	10	1211360	1211369	20 %	60 %	0 %	20 %	21227136
1006	NC_003901	GAAAG	2	10	1214069	1214078	60 %	0 %	40 %	0 %	21227139
1007	NC_003901	AGAAA	2	10	1215035	1215044	80 %	0 %	20 %	0 %	21227140
1008	NC_003901	AAAAG	2	10	1215520	1215529	80 %	0 %	20 %	0 %	21227140
1009	NC_003901	CCTTA	2	10	1216948	1216957	20 %	40 %	0 %	40 %	21227143
1010	NC_003901	TCCGT	2	10	1217045	1217054	0 %	40 %	20 %	40 %	21227143
1011	NC_003901	AGCAG	2	10	1218239	1218248	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1012	NC_003901	GGCTT	2	10	1218727	1218736	0 %	40 %	40 %	20 %	21227144
1013	NC_003901	TGAAT	2	10	1219302	1219311	40 %	40 %	20 %	0 %	21227145
1014	NC_003901	TGGCA	2	10	1220199	1220208	20 %	20 %	40 %	20 %	21227146
1015	NC_003901	AAGAG	2	10	1221105	1221114	60 %	0 %	40 %	0 %	21227147
1016	NC_003901	AAAAG	2	10	1225124	1225133	80 %	0 %	20 %	0 %	21227149
1017	NC_003901	AAAAG	2	10	1225698	1225707	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_003901	CAAAT	2	10	1225849	1225858	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1019	NC_003901	TCTTT	2	10	1226100	1226109	0 %	80 %	0 %	20 %	21227150
1020	NC_003901	AGGCA	2	10	1226777	1226786	40 %	0 %	40 %	20 %	21227150
1021	NC_003901	ACCTG	2	10	1227635	1227644	20 %	20 %	20 %	40 %	21227150
1022	NC_003901	CGGAC	2	10	1227908	1227917	20 %	0 %	40 %	40 %	21227150
1023	NC_003901	GAAAA	2	10	1229245	1229254	80 %	0 %	20 %	0 %	21227151
1024	NC_003901	CAAAA	2	10	1230356	1230365	80 %	0 %	0 %	20 %	21227153
1025	NC_003901	GAGAA	2	10	1230505	1230514	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_003901	TAAAG	2	10	1230804	1230813	60 %	20 %	20 %	0 %	21227154
1027	NC_003901	ATTAT	2	10	1231967	1231976	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_003901	ACTAT	2	10	1232684	1232693	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1029	NC_003901	ATATA	2	10	1232853	1232862	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_003901	TTCAA	2	10	1232920	1232929	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1031	NC_003901	CGGAA	2	10	1235676	1235685	40 %	0 %	40 %	20 %	21227156
1032	NC_003901	AGAAA	2	10	1237843	1237852	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_003901	AAGGA	2	10	1239119	1239128	60 %	0 %	40 %	0 %	21227158
1034	NC_003901	TGTCA	2	10	1239530	1239539	20 %	40 %	20 %	20 %	21227158
1035	NC_003901	CATGC	2	10	1239866	1239875	20 %	20 %	20 %	40 %	21227159
1036	NC_003901	TATCC	2	10	1240393	1240402	20 %	40 %	0 %	40 %	21227159
1037	NC_003901	TCTCT	2	10	1242378	1242387	0 %	60 %	0 %	40 %	21227161
1038	NC_003901	CTTTT	2	10	1242796	1242805	0 %	80 %	0 %	20 %	21227161
1039	NC_003901	TTTTC	2	10	1245099	1245108	0 %	80 %	0 %	20 %	21227162
1040	NC_003901	CTTTT	2	10	1245526	1245535	0 %	80 %	0 %	20 %	21227163
1041	NC_003901	CCTGC	2	10	1246419	1246428	0 %	20 %	20 %	60 %	21227164
1042	NC_003901	CTGAA	2	10	1247170	1247179	40 %	20 %	20 %	20 %	21227164
1043	NC_003901	ATTTT	2	10	1247294	1247303	20 %	80 %	0 %	0 %	21227164
1044	NC_003901	TAAGG	2	10	1248871	1248880	40 %	20 %	40 %	0 %	21227165
1045	NC_003901	AAGTA	2	10	1250377	1250386	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_003901	GGAAA	2	10	1250420	1250429	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_003901	TAAAA	2	10	1251455	1251464	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_003901	TTCTT	2	10	1252244	1252253	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1049	NC_003901	CTGGA	2	10	1253342	1253351	20 %	20 %	40 %	20 %	21227171
1050	NC_003901	ACTTA	2	10	1255345	1255354	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1051	NC_003901	GCAAA	2	10	1258326	1258335	60 %	0 %	20 %	20 %	21227173
1052	NC_003901	GGCAT	2	10	1258416	1258425	20 %	20 %	40 %	20 %	21227173
1053	NC_003901	CTTTT	2	10	1258936	1258945	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1054	NC_003901	AAAGA	2	10	1260608	1260617	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_003901	AAATA	2	10	1261508	1261517	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_003901	TGGGC	2	10	1264762	1264771	0 %	20 %	60 %	20 %	21227177
1057	NC_003901	ACAGC	2	10	1265550	1265559	40 %	0 %	20 %	40 %	21227178
1058	NC_003901	AAAAT	2	10	1266466	1266475	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_003901	AGAGA	2	10	1268272	1268281	60 %	0 %	40 %	0 %	21227179
1060	NC_003901	AGAGA	2	10	1268509	1268518	60 %	0 %	40 %	0 %	21227179
1061	NC_003901	GAAAA	2	10	1268587	1268596	80 %	0 %	20 %	0 %	21227179
1062	NC_003901	GGAAA	2	10	1268622	1268631	60 %	0 %	40 %	0 %	21227179
1063	NC_003901	TATGT	2	10	1273072	1273081	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_003901	ATAAA	2	10	1276969	1276978	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_003901	TGGGA	2	10	1278601	1278610	20 %	20 %	60 %	0 %	21227188
1066	NC_003901	TTATT	2	10	1279419	1279428	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_003901	AGAGC	2	10	1281247	1281256	40 %	0 %	40 %	20 %	21227190
1068	NC_003901	TTCTT	2	10	1282011	1282020	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1069	NC_003901	CAAAA	2	10	1282110	1282119	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1070	NC_003901	GTTCT	2	10	1282868	1282877	0 %	60 %	20 %	20 %	21227192
1071	NC_003901	CCAGA	2	10	1283381	1283390	40 %	0 %	20 %	40 %	21227192
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1073	NC_003901	TTGGA	2	10	1285849	1285858	20 %	40 %	40 %	0 %	21227195
1074	NC_003901	TTCTC	2	10	1286912	1286921	0 %	60 %	0 %	40 %	21227195
1075	NC_003901	TCCTG	2	10	1295269	1295278	0 %	40 %	20 %	40 %	21227203
1076	NC_003901	ACTAT	2	10	1296266	1296275	40 %	40 %	0 %	20 %	21227204
1077	NC_003901	CCACC	2	10	1297294	1297303	20 %	0 %	0 %	80 %	21227206
1078	NC_003901	GACAA	2	10	1297447	1297456	60 %	0 %	20 %	20 %	21227206
1079	NC_003901	CAGGA	2	10	1297506	1297515	40 %	0 %	40 %	20 %	21227206
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1081	NC_003901	CTTCT	2	10	1297628	1297637	0 %	60 %	0 %	40 %	21227206
1082	NC_003901	GGATA	2	10	1298000	1298009	40 %	20 %	40 %	0 %	21227206
1083	NC_003901	CTCTG	2	10	1300194	1300203	0 %	40 %	20 %	40 %	21227208
1084	NC_003901	CTCTT	2	10	1300723	1300732	0 %	60 %	0 %	40 %	21227208
1085	NC_003901	CTTTG	2	10	1301083	1301092	0 %	60 %	20 %	20 %	21227209
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1087	NC_003901	CTTTT	2	10	1303239	1303248	0 %	80 %	0 %	20 %	21227211
1088	NC_003901	CTTTT	2	10	1304683	1304692	0 %	80 %	0 %	20 %	21227213
1089	NC_003901	CTTTT	2	10	1305321	1305330	0 %	80 %	0 %	20 %	21227214
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1091	NC_003901	GAAGC	2	10	1308088	1308097	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1092	NC_003901	GGAAG	2	10	1309907	1309916	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_003901	TTTTC	2	10	1310211	1310220	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1094	NC_003901	ATCCA	2	10	1313308	1313317	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1095	NC_003901	CCCAA	2	10	1313589	1313598	40 %	0 %	0 %	60 %	21227220
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1097	NC_003901	TAATG	2	10	1314451	1314460	40 %	40 %	20 %	0 %	21227220
1098	NC_003901	GTTCT	2	10	1315993	1316002	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1099	NC_003901	ATGGA	2	10	1317408	1317417	40 %	20 %	40 %	0 %	21227221
1100	NC_003901	AATAA	2	10	1318699	1318708	80 %	20 %	0 %	0 %	21227222
1101	NC_003901	CAAAA	2	10	1320082	1320091	80 %	0 %	0 %	20 %	21227222
1102	NC_003901	TTTCT	2	10	1320422	1320431	0 %	80 %	0 %	20 %	21227223
1103	NC_003901	CTGGT	2	10	1325674	1325683	0 %	40 %	40 %	20 %	21227225
1104	NC_003901	ATCAG	2	10	1328423	1328432	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1105	NC_003901	TATAA	2	10	1328693	1328702	60 %	40 %	0 %	0 %	21227227
1106	NC_003901	AGATG	2	10	1328785	1328794	40 %	20 %	40 %	0 %	21227227
1107	NC_003901	ATTCA	2	10	1330464	1330473	40 %	40 %	0 %	20 %	21227228
1108	NC_003901	CTTTT	2	10	1332235	1332244	0 %	80 %	0 %	20 %	21227230
1109	NC_003901	ATATC	2	10	1332349	1332358	40 %	40 %	0 %	20 %	21227230
1110	NC_003901	TAAGG	2	10	1332449	1332458	40 %	20 %	40 %	0 %	21227230
1111	NC_003901	AAACA	2	10	1334668	1334677	80 %	0 %	0 %	20 %	21227233
1112	NC_003901	AAGAG	2	10	1337003	1337012	60 %	0 %	40 %	0 %	21227235
1113	NC_003901	GATCA	2	10	1338498	1338507	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1114	NC_003901	ATTCT	2	10	1339316	1339325	20 %	60 %	0 %	20 %	21227237
1115	NC_003901	ACATC	2	10	1340166	1340175	40 %	20 %	0 %	40 %	21227237
1116	NC_003901	TGTTA	2	10	1341457	1341466	20 %	60 %	20 %	0 %	21227238
1117	NC_003901	ATTAT	2	10	1343051	1343060	40 %	60 %	0 %	0 %	21227238
1118	NC_003901	AAATA	2	10	1344463	1344472	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_003901	GGATT	2	10	1344771	1344780	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_003901	AACTC	2	10	1345406	1345415	40 %	20 %	0 %	40 %	21227239
1121	NC_003901	CCATA	2	10	1348136	1348145	40 %	20 %	0 %	40 %	21227241
1122	NC_003901	GAGAA	2	10	1348318	1348327	60 %	0 %	40 %	0 %	21227241
1123	NC_003901	TTTCA	2	10	1348767	1348776	20 %	60 %	0 %	20 %	21227241
1124	NC_003901	AAACA	2	10	1349361	1349370	80 %	0 %	0 %	20 %	21227242
1125	NC_003901	TAAAA	2	10	1350463	1350472	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_003901	GTTAT	2	10	1350596	1350605	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_003901	AATGT	2	10	1351323	1351332	40 %	40 %	20 %	0 %	21227243
1128	NC_003901	ACACC	2	10	1351559	1351568	40 %	0 %	0 %	60 %	21227243
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