MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Methanosarcina mazei Go1 chromosome

Total Repeats: 46678

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003901	CAA	2	6	161	166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_003901	GAT	2	6	179	184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_003901	TAT	2	6	219	224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_003901	GTA	2	6	354	359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_003901	TAA	2	6	422	427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_003901	AGG	2	6	434	439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_003901	CAG	2	6	459	464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_003901	AAT	2	6	482	487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_003901	AGC	2	6	497	502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_003901	ATT	2	6	507	512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_003901	GCA	2	6	534	539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21226103
12	NC_003901	GAA	2	6	600	605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21226103
13	NC_003901	GAT	2	6	792	797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21226103
14	NC_003901	ATG	2	6	841	846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21226103
15	NC_003901	GCA	2	6	891	896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21226103
16	NC_003901	CAG	2	6	940	945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21226103
17	NC_003901	GAT	2	6	948	953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21226103
18	NC_003901	TCA	2	6	994	999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21226103
19	NC_003901	CAG	2	6	1066	1071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21226103
20	NC_003901	GCA	2	6	1109	1114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21226103
21	NC_003901	TGC	2	6	1196	1201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21226103
22	NC_003901	GAA	3	9	1470	1478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21226103
23	NC_003901	TAA	2	6	1508	1513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21226103
24	NC_003901	GGC	2	6	1569	1574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21226103
25	NC_003901	TTG	2	6	1600	1605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21226103
26	NC_003901	GAA	2	6	1689	1694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21226103
27	NC_003901	TAC	2	6	1821	1826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21226103
28	NC_003901	TAA	2	6	1853	1858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21226103
29	NC_003901	TAA	2	6	1861	1866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21226103
30	NC_003901	ACA	2	6	1870	1875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21226103
31	NC_003901	CTG	2	6	1879	1884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21226103
32	NC_003901	AGC	2	6	1928	1933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21226103
33	NC_003901	CAA	2	6	1934	1939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21226103
34	NC_003901	GCA	2	6	2098	2103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21226103
35	NC_003901	ATA	2	6	2267	2272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_003901	ATT	2	6	2476	2481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_003901	TAA	2	6	2556	2561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_003901	AGG	2	6	2565	2570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_003901	ATT	2	6	2632	2637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_003901	TAT	2	6	2640	2645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_003901	GTA	2	6	2764	2769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21226104
42	NC_003901	GAT	2	6	2881	2886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21226104
43	NC_003901	GAT	2	6	2965	2970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21226104
44	NC_003901	ACA	2	6	3249	3254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21226104
45	NC_003901	CAA	2	6	3516	3521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21226104
46	NC_003901	GAA	2	6	3682	3687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21226104
47	NC_003901	CAG	2	6	3927	3932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21226104
48	NC_003901	GAT	2	6	3979	3984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21226104
49	NC_003901	TGT	2	6	4017	4022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21226104
50	NC_003901	TAA	2	6	4365	4370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21226105
51	NC_003901	GAA	2	6	4445	4450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21226105
52	NC_003901	ATA	2	6	4548	4553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_003901	AAT	2	6	4565	4570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_003901	TTA	2	6	4583	4588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_003901	AAT	2	6	4598	4603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_003901	TCT	2	6	4674	4679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21226106
57	NC_003901	GAA	2	6	4789	4794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21226106
58	NC_003901	CTC	2	6	4811	4816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21226106
59	NC_003901	GGT	2	6	5114	5119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21226106
60	NC_003901	GGA	2	6	5404	5409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21226106
61	NC_003901	TTG	2	6	5417	5422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21226106
62	NC_003901	GCA	2	6	5455	5460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21226106
63	NC_003901	AGC	2	6	5463	5468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21226106
64	NC_003901	CAG	2	6	5587	5592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21226106
65	NC_003901	AGG	2	6	5617	5622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_003901	CTG	2	6	5637	5642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21226107
67	NC_003901	AGA	2	6	5688	5693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21226107
68	NC_003901	CTG	2	6	5696	5701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21226107
69	NC_003901	TGC	2	6	5724	5729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21226107
70	NC_003901	CTT	2	6	6017	6022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21226107
71	NC_003901	GGA	3	9	6050	6058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21226107
72	NC_003901	AGC	2	6	6132	6137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21226107
73	NC_003901	TGG	2	6	6188	6193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21226107
74	NC_003901	TGG	2	6	6377	6382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21226107
75	NC_003901	AAT	2	6	6457	6462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21226107
76	NC_003901	AAT	2	6	6541	6546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21226108
77	NC_003901	GAA	2	6	6550	6555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21226108
78	NC_003901	TGT	2	6	6693	6698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21226108
79	NC_003901	CTT	2	6	6724	6729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21226108
80	NC_003901	CCT	2	6	6754	6759	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21226108
81	NC_003901	GGA	2	6	6915	6920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21226108
82	NC_003901	TGA	2	6	6935	6940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21226108
83	NC_003901	AGA	2	6	7030	7035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21226108
84	NC_003901	TGC	2	6	7260	7265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21226108
85	NC_003901	GGA	2	6	7468	7473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21226108
86	NC_003901	AAT	2	6	7486	7491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21226108
87	NC_003901	AAG	2	6	7567	7572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21226109
88	NC_003901	GAG	2	6	7866	7871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21226109
89	NC_003901	TGT	2	6	8068	8073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21226109
90	NC_003901	TGA	2	6	8142	8147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_003901	CTG	2	6	8195	8200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21226110
92	NC_003901	TCA	2	6	8259	8264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21226110
93	NC_003901	CTG	2	6	8447	8452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21226110
94	NC_003901	AAT	2	6	8669	8674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21226110
95	NC_003901	CAG	2	6	8680	8685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21226110
96	NC_003901	TGC	2	6	8717	8722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21226110
97	NC_003901	GGC	2	6	8889	8894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21226110
98	NC_003901	TAA	2	6	8986	8991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21226110
99	NC_003901	AAC	2	6	9005	9010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21226110
100	NC_003901	TTG	2	6	9073	9078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21226110
101	NC_003901	CCG	2	6	9099	9104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21226110
102	NC_003901	AGG	2	6	9152	9157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21226110
103	NC_003901	TCT	2	6	9165	9170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21226110
104	NC_003901	AGG	2	6	9335	9340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21226110
105	NC_003901	TAT	3	9	9502	9510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_003901	GCA	3	9	9533	9541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_003901	TAA	2	6	9574	9579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_003901	AAG	2	6	9598	9603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_003901	AGG	2	6	9704	9709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21226111
110	NC_003901	CCT	2	6	9712	9717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21226111
111	NC_003901	AGA	2	6	9974	9979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21226111
112	NC_003901	GCT	2	6	9993	9998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21226111
113	NC_003901	TAT	2	6	10202	10207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21226111
114	NC_003901	TTG	2	6	10495	10500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21226111
115	NC_003901	CCG	2	6	10521	10526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21226111
116	NC_003901	TTC	2	6	10607	10612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21226111
117	NC_003901	GCT	2	6	10639	10644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21226111
118	NC_003901	AGG	2	6	10757	10762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21226111
119	NC_003901	TTC	2	6	10795	10800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21226111
120	NC_003901	ATA	2	6	10899	10904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21226111
121	NC_003901	AAT	2	6	10920	10925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_003901	TAT	2	6	10926	10931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_003901	TAG	2	6	10984	10989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_003901	ATG	2	6	11208	11213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21226112
125	NC_003901	TAA	2	6	11214	11219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21226112
126	NC_003901	TCC	2	6	11243	11248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21226112
127	NC_003901	AAT	2	6	11263	11268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21226112
128	NC_003901	CTG	2	6	11302	11307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_003901	GTG	2	6	11444	11449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_003901	TAA	2	6	11527	11532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_003901	TTA	2	6	11614	11619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_003901	GCA	2	6	11643	11648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_003901	CTT	2	6	11676	11681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_003901	CTT	2	6	12052	12057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_003901	GAA	2	6	12150	12155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_003901	GAA	2	6	12176	12181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_003901	CAA	2	6	12282	12287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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142	NC_003901	GAA	2	6	12498	12503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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269	NC_003901	TCC	2	6	24719	24724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21226122
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393	NC_003901	TAA	2	6	35734	35739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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399	NC_003901	CGG	2	6	36135	36140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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