MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Methanosarcina acetivorans C2A chromosome

Total Repeats: 2265

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_003552	CGTCAA	2	12	1344907	1344918	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	20090003
502	NC_003552	ACTCCG	2	12	1346361	1346372	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	20090005
503	NC_003552	TTTGTT	2	12	1353722	1353733	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	20090011
504	NC_003552	CATGGA	2	12	1353921	1353932	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	20090011
505	NC_003552	ATCCTG	2	12	1357362	1357373	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	20090013
506	NC_003552	TTTCAA	2	12	1359720	1359731	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	20090015
507	NC_003552	TGAAGG	2	12	1359804	1359815	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	20090015
508	NC_003552	AACAGA	2	12	1362186	1362197	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	20090015
509	NC_003552	TTGATA	2	12	1365022	1365033	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	20090018
510	NC_003552	GATAAT	2	12	1370841	1370852	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	20090021
511	NC_003552	AAAATG	2	12	1371108	1371119	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	20090022
512	NC_003552	CATCTG	2	12	1371637	1371648	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	20090022
513	NC_003552	AATTGC	2	12	1373040	1373051	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	20090024
514	NC_003552	ATATTT	2	12	1373387	1373398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	20090025
515	NC_003552	CTGCAA	2	12	1374603	1374614	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	20090027
516	NC_003552	AAATTG	2	12	1376214	1376225	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	20090028
517	NC_003552	GGACTG	2	12	1377548	1377559	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	20090029
518	NC_003552	GAAAAA	2	12	1379957	1379968	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	20090030
519	NC_003552	GGCATC	2	12	1386931	1386942	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	20090036
520	NC_003552	CCCATT	2	12	1387013	1387024	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	20090036
521	NC_003552	ACCCCG	2	12	1389239	1389250	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	20090037
522	NC_003552	TCAACA	2	12	1389599	1389610	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	20090037
523	NC_003552	AATTTA	2	12	1395430	1395441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_003552	ATGATT	2	12	1395698	1395709	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	20090041
525	NC_003552	ATTTAC	2	12	1403522	1403533	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	20090046
526	NC_003552	TCTCCT	2	12	1406650	1406661	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
527	NC_003552	CCAATC	2	12	1409263	1409274	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	20090049
528	NC_003552	TGAAGA	2	12	1411341	1411352	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	20090051
529	NC_003552	GCAATA	2	12	1414305	1414316	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	20090053
530	NC_003552	CTCTGC	2	12	1415707	1415718	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
531	NC_003552	CTGTAC	2	12	1423972	1423983	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	20090061
532	NC_003552	TTCCGT	2	12	1424540	1424551	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	20090061
533	NC_003552	TACTTT	2	12	1427683	1427694	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	20090063
534	NC_003552	CTGTTT	2	12	1439100	1439111	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	20090070
535	NC_003552	TATATT	2	12	1440030	1440041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_003552	TTTCGA	2	12	1441173	1441184	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	20090072
537	NC_003552	CGTTCT	2	12	1441763	1441774	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	20090072
538	NC_003552	TTTCCT	2	12	1441796	1441807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20090073
539	NC_003552	AAAATT	2	12	1445362	1445373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_003552	CATGAT	2	12	1447369	1447380	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	20090078
541	NC_003552	TGACAA	2	12	1448220	1448231	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	20090080
542	NC_003552	AATAAA	2	12	1457825	1457836	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_003552	GCCAGG	2	12	1458101	1458112	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	20090089
544	NC_003552	ATTCCG	2	12	1459206	1459217	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	20090090
545	NC_003552	TAAAAA	2	12	1462121	1462132	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	20090093
546	NC_003552	CATCCA	2	12	1466366	1466377	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	20090097
547	NC_003552	TAGAAA	2	12	1468427	1468438	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
548	NC_003552	TATTTT	2	12	1472226	1472237	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_003552	AGTTTT	2	12	1477243	1477254	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
550	NC_003552	CAAGAT	2	12	1478464	1478475	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	20090107
551	NC_003552	GAAAGT	2	12	1478542	1478553	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	20090107
552	NC_003552	AAACGA	2	12	1481910	1481921	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	20090107
553	NC_003552	CCACAG	2	12	1498548	1498559	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	20090121
554	NC_003552	GCCTGC	2	12	1499599	1499610	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	20090121
555	NC_003552	GTCCTT	2	12	1507004	1507015	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	20090128
556	NC_003552	TTCCCG	2	12	1513460	1513471	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	20090134
557	NC_003552	TTCCAG	2	12	1515475	1515486	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	20090134
558	NC_003552	TAGATG	2	12	1517962	1517973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
559	NC_003552	AAATTC	2	12	1518691	1518702	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
560	NC_003552	ATCCCT	2	12	1526138	1526149	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	20090138
561	NC_003552	ACTTTT	2	12	1536995	1537006	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	20090147
562	NC_003552	ATGAAA	2	12	1540190	1540201	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	20090150
563	NC_003552	AGAAAA	2	12	1541719	1541730	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	20090150
564	NC_003552	TCTTGT	2	12	1545475	1545486	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	20090154
565	NC_003552	TCACAC	2	12	1546606	1546617	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	20090155
566	NC_003552	TTTATG	2	12	1548203	1548214	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	20090156
567	NC_003552	TCACCG	2	12	1552961	1552972	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	20090157
568	NC_003552	CAAGGG	2	12	1555864	1555875	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	20090162
569	NC_003552	TTTTCC	2	12	1556699	1556710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20090163
570	NC_003552	CGGCTT	2	12	1557006	1557017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20090163
571	NC_003552	ATAATT	2	12	1562770	1562781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_003552	TATACA	2	12	1563484	1563495	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	20090168
573	NC_003552	CAGGGC	2	12	1568021	1568032	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	20090172
574	NC_003552	TGGTAG	2	12	1569444	1569455	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	20090172
575	NC_003552	ATGTTT	2	12	1570345	1570356	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	20090173
576	NC_003552	ATCCAG	2	12	1575926	1575937	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	20090176
577	NC_003552	AATCCT	2	12	1576096	1576107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20090177
578	NC_003552	CGATTT	2	12	1589837	1589848	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	20090183
579	NC_003552	AATTAT	2	12	1590376	1590387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_003552	ACAGGA	2	12	1592901	1592912	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	20090186
581	NC_003552	TTCGAT	2	12	1593164	1593175	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	20090186
582	NC_003552	TTACGG	2	12	1594835	1594846	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	20090188
583	NC_003552	TGGCAG	2	12	1596366	1596377	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	20090189
584	NC_003552	CAGATC	2	12	1598963	1598974	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_003552	GCTTTT	2	12	1602727	1602738	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	20090197
586	NC_003552	GGGAGA	2	12	1606925	1606936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20090203
587	NC_003552	AGCAAG	2	12	1607909	1607920	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	20090203
588	NC_003552	TTCAGG	2	12	1608195	1608206	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	20090203
589	NC_003552	CCTGTA	2	12	1615891	1615902	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	20090208
590	NC_003552	TTGTAG	2	12	1616572	1616583	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	20090208
591	NC_003552	TCAAAA	2	12	1618853	1618864	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
592	NC_003552	TCAAAA	2	12	1618917	1618928	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
593	NC_003552	TCAAAA	2	12	1618931	1618942	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
594	NC_003552	CAAGAA	2	12	1619160	1619171	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	20090212
595	NC_003552	GTTTTT	2	12	1620859	1620870	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
596	NC_003552	CTTATT	2	12	1623752	1623763	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	20090216
597	NC_003552	GAAATT	2	12	1627655	1627666	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	20090219
598	NC_003552	GTTCCC	2	12	1635378	1635389	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	20090227
599	NC_003552	AATTAG	2	12	1636224	1636235	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
600	NC_003552	GATAAA	2	12	1638311	1638322	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	20090231
601	NC_003552	GAAGCT	2	12	1638536	1638547	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	20090231
602	NC_003552	GAAAAC	2	12	1639110	1639121	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
603	NC_003552	TTCGAG	2	12	1644779	1644790	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	229017562
604	NC_003552	GGAATG	2	12	1648957	1648968	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	20090242
605	NC_003552	CTTTTT	2	12	1652331	1652342	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
606	NC_003552	TTCCCA	2	12	1652449	1652460	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	20090247
607	NC_003552	TGTAAT	2	12	1656851	1656862	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
608	NC_003552	GTCAAG	2	12	1657763	1657774	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	20090252
609	NC_003552	CTTCAA	2	12	1659445	1659456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20090254
610	NC_003552	AGGACA	2	12	1660037	1660048	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
611	NC_003552	CTCGGG	2	12	1662624	1662635	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	20090257
612	NC_003552	CAAATA	2	12	1663793	1663804	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	20090258
613	NC_003552	AATTTC	2	12	1667597	1667608	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
614	NC_003552	AGTCAA	2	12	1667664	1667675	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
615	NC_003552	GTTTCA	2	12	1673784	1673795	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	20090267
616	NC_003552	TATAAT	2	12	1673830	1673841	50 %	50 %	0 %	0 %	20090267
617	NC_003552	GGATTC	2	12	1674729	1674740	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	20090268
618	NC_003552	TATCTC	2	12	1675462	1675473	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	20090268
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620	NC_003552	CCGCAA	2	12	1678104	1678115	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	20090271
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729	NC_003552	TATTTT	2	12	1966748	1966759	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	20090495
730	NC_003552	AATTAA	2	12	1971631	1971642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	20090498
731	NC_003552	ATCCAG	2	12	1978124	1978135	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	20090502
732	NC_003552	AATCCT	2	12	1978294	1978305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20090503
733	NC_003552	AGCCTC	2	12	1987954	1987965	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	20090509
734	NC_003552	GAATTT	2	12	1988385	1988396	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
735	NC_003552	CAAAAA	2	12	1992133	1992144	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	20090513
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737	NC_003552	ATCATA	2	12	1998222	1998233	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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740	NC_003552	CTTTCT	2	12	2012819	2012830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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782	NC_003552	TATTTA	2	12	2128896	2128907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
783	NC_003552	TGTTAT	2	12	2129819	2129830	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	20090610
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825	NC_003552	CCTATG	2	12	2206478	2206489	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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839	NC_003552	TTATCT	2	12	2263392	2263403	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	20090689
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841	NC_003552	TTTTCG	2	12	2263947	2263958	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	20090689
842	NC_003552	TGCTAT	2	12	2264414	2264425	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	20090689
843	NC_003552	AAATCT	2	12	2264619	2264630	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	20090689
844	NC_003552	TCTTTG	2	12	2264715	2264726	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	20090689
845	NC_003552	TGTCTT	2	12	2265178	2265189	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	20090689
846	NC_003552	TATCTG	2	12	2265740	2265751	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	20090689
847	NC_003552	TACGGT	2	12	2268000	2268011	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	20090690
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853	NC_003552	ATCATA	2	12	2275934	2275945	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	20090694
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955	NC_003552	AAAAGA	2	12	2506786	2506797	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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